Heatmap: Cluster_129 (Marchantia polymorpha (Mpo) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Control
Cold (3°C)
Dark (3 days)
Heat (33°C)
Light (435 uEm-2s-1)
Osmotic (100 mM mannitol)
Nitrogen deficiency (0 mM KNO3)
Salt (40 mM NaCl)
Cold-Dark
Cold-Light
Cold-Mannitol
Cold-Nitrogen deficiency
Cold-Salt
Heat-Dark
Heat-Mannitol
Heat-Nitrogen deficiency
Heat-Salt
Light-Salt
Mannitol-Dark
Mannitol-Light
Mannitol-Nitrogen deficiency
Nitrogen deficiency-Dark
Nitrogen deficiency-Light
Salt-Dark
Salt-Mannitol
Salt-Nitrogen deficiency
ZT2 (2 hours after light)
ZT6 (6 hours after light)
ZT10 (10 hours after light)
ZT14 (2 hours after dark)
ZT18 (6 hours after dark)
ZT22 (10 hours after dark)
Mp1g03340.1 (RBK2)
15.99 18.17 11.35 10.54 11.3 21.33 13.7 18.68 41.94 14.38 22.68 21.31 17.83 19.34 14.57 9.91 11.01 19.33 21.77 18.66 17.82 16.6 13.82 17.65 20.02 18.77 14.77 18.1 20.64 12.02 13.69 10.31
Mp1g03350.1 (CYP81H1)
10.45 10.31 5.93 6.37 6.88 13.75 8.79 11.09 25.79 10.02 14.96 13.66 12.04 8.88 8.95 5.29 6.24 12.63 12.08 10.83 11.69 9.22 8.9 7.98 12.15 13.04 8.78 11.18 12.97 7.72 9.29 6.96
Mp1g04100.1 (TEL1)
5.24 5.66 5.8 6.16 5.39 5.44 4.59 4.51 6.04 3.65 9.25 7.43 6.57 8.49 6.11 4.86 5.0 4.03 13.39 6.14 5.23 8.77 5.7 8.93 6.54 6.03 5.57 5.79 5.94 4.51 5.29 4.45
Mp1g08380.1 (D6PKL1)
22.34 33.23 28.93 32.05 24.78 24.59 33.42 19.0 42.18 28.33 43.92 48.85 40.7 36.06 30.69 49.54 27.69 26.6 45.77 30.19 28.45 41.31 33.27 44.48 27.39 26.48 18.23 18.21 20.77 25.44 29.31 25.78
3.6 3.19 5.9 5.08 3.96 3.14 3.73 3.07 6.46 4.01 4.78 3.78 4.09 5.08 4.59 5.53 4.8 3.67 7.67 3.59 3.26 7.05 4.65 6.26 3.19 3.97 3.0 3.63 3.55 4.26 4.98 4.49
17.8 19.91 23.88 17.05 18.73 17.89 24.12 16.45 28.81 21.59 22.83 22.74 17.81 18.63 13.78 18.93 14.06 17.27 22.77 17.14 15.06 24.3 22.98 20.56 15.79 18.39 15.47 18.12 20.79 17.34 18.07 18.28
Mp1g11270.1 (SR34a)
2.57 1.64 2.36 2.81 1.75 1.86 2.07 1.45 4.58 2.26 3.66 3.3 2.39 4.05 1.84 2.59 2.29 2.31 2.47 1.69 1.81 3.22 3.55 2.39 1.68 2.58 2.38 2.53 2.23 1.31 2.2 1.78
Mp1g11510.1 (CTL07)
16.71 20.09 17.21 19.01 16.52 14.37 18.26 14.89 26.18 17.68 21.4 19.98 20.46 19.23 15.42 21.42 17.8 17.23 20.44 17.48 13.06 21.98 20.7 18.0 13.82 15.93 16.57 16.32 15.36 16.11 15.46 16.35
2.89 3.28 3.67 3.42 3.04 2.8 2.72 2.95 4.32 2.65 4.36 3.38 3.56 2.87 4.05 3.53 3.76 3.64 4.26 3.16 2.98 4.07 3.63 3.83 2.64 3.25 2.44 2.96 2.84 2.73 3.07 2.73
Mp1g14790.1 (FGT1)
8.08 7.73 8.99 8.52 6.9 7.08 7.88 6.99 10.68 6.52 9.93 8.74 8.87 9.73 7.43 8.72 7.82 7.54 11.71 7.85 7.32 10.63 8.84 9.22 7.18 8.09 8.19 8.32 8.14 6.98 7.84 7.06
29.25 30.71 29.64 34.76 30.18 34.51 35.35 31.18 42.07 32.92 36.41 36.99 36.06 36.97 36.46 39.46 35.6 35.82 40.14 33.71 33.97 36.68 39.65 37.62 35.64 35.87 27.9 28.51 28.75 29.03 28.87 27.7
Mp1g20320.1 (THO2)
11.91 11.83 13.79 13.52 11.42 9.91 11.62 9.62 17.2 10.42 18.66 14.51 15.63 14.4 13.0 14.64 14.3 11.89 18.86 11.21 10.78 18.51 15.29 15.79 10.18 12.95 11.13 12.14 11.91 10.75 12.0 11.99
Mp1g21580.1 (SMA1)
18.37 15.98 18.08 22.01 19.25 16.52 18.92 17.05 23.89 18.68 24.25 19.57 21.13 24.16 19.75 22.49 22.82 21.97 25.11 18.63 17.88 23.77 25.52 21.26 17.33 21.04 16.92 18.09 18.82 15.81 15.59 15.28
0.44 6.32 8.89 2.89 2.83 3.25 2.84 2.69 15.42 3.83 15.33 9.59 11.96 3.78 7.84 6.86 5.96 7.14 27.1 7.88 4.29 13.35 4.63 19.66 6.03 2.99 1.45 0.39 0.48 0.16 0.24 0.2
Mp1g27050.1 (CML37)
1.34 29.16 29.8 9.08 11.62 13.51 12.34 10.11 55.35 16.9 69.51 36.7 52.02 10.73 25.82 20.27 18.95 24.72 91.28 28.22 15.69 43.64 17.66 73.88 25.02 11.4 3.64 1.93 2.04 1.02 0.68 0.66
Mp2g09110.1 (ABO1)
3.01 3.19 3.62 4.36 3.75 3.55 3.39 3.35 4.27 2.65 4.71 3.37 4.34 3.71 4.57 4.27 4.37 4.14 4.61 4.43 3.45 4.28 4.24 4.12 3.69 3.61 2.91 3.18 3.4 3.12 2.94 2.54
Mp2g14160.1 (DOB1)
24.52 25.75 24.99 16.28 19.79 21.35 27.84 22.14 38.5 24.25 34.93 47.06 32.73 29.68 16.16 21.84 15.93 23.26 33.42 20.29 23.22 30.29 27.3 33.33 21.97 26.44 20.09 21.2 22.34 28.17 30.91 27.0
Mp2g14640.1 (MSH6)
2.98 2.62 2.75 3.59 2.67 2.81 2.54 2.7 4.85 2.94 3.78 3.06 3.28 2.75 3.26 3.5 3.68 2.86 3.54 2.71 2.59 3.2 3.5 3.29 2.64 3.03 2.56 2.64 2.88 2.79 3.02 2.75
8.14 11.6 10.15 10.13 8.08 7.72 9.11 7.82 19.69 11.49 12.94 13.68 13.35 10.83 10.94 13.25 10.58 10.68 15.34 10.43 9.18 14.52 11.93 14.38 8.97 9.64 7.46 8.13 8.6 7.65 8.12 8.52
Mp2g22480.1 (HAC1)
5.56 5.29 6.68 6.32 6.38 4.64 5.26 4.83 7.8 5.6 7.63 6.79 7.53 7.77 5.37 6.73 6.02 5.63 8.75 5.17 4.67 9.01 7.27 7.92 4.38 5.78 5.35 5.65 5.59 5.24 5.73 5.37
Mp2g23150.1 (UPS4)
6.84 5.69 9.16 8.32 8.09 6.08 7.11 5.73 8.0 6.05 7.17 7.47 7.24 9.4 8.41 8.91 8.42 8.1 12.29 7.45 6.48 11.64 9.96 10.74 6.5 7.58 5.16 6.42 6.54 6.63 8.27 7.49
Mp2g24350.1 (ADL2)
16.79 18.83 19.38 17.68 17.74 18.11 21.18 17.4 19.25 17.22 24.5 22.33 23.78 17.99 18.39 23.43 18.22 20.62 27.0 20.07 17.73 22.13 22.05 23.01 19.09 19.83 16.49 16.81 17.59 15.95 17.75 15.37
Mp2g25250.1 (VSR3)
6.53 10.8 10.1 10.52 8.92 7.1 9.83 6.02 14.71 11.59 15.76 13.83 14.48 16.62 9.5 15.22 9.21 7.61 18.08 10.43 8.55 16.34 11.38 15.28 7.8 9.03 5.07 6.82 7.57 8.37 8.6 7.24
21.89 28.63 31.82 24.81 22.46 27.0 26.61 23.21 31.74 28.38 38.73 30.8 36.99 41.38 25.51 28.26 24.51 27.63 48.31 27.88 29.51 35.32 24.75 40.24 35.21 29.59 19.13 21.37 24.4 22.23 25.16 23.26
0.92 1.71 1.62 1.0 0.69 1.96 2.55 1.61 0.97 0.98 4.8 4.78 3.02 0.52 1.36 1.18 1.34 3.0 3.73 3.36 3.37 4.04 5.84 3.38 2.95 3.13 1.79 0.96 0.87 0.6 0.83 0.79
4.05 4.13 4.35 6.02 5.23 4.46 3.75 4.35 4.33 2.89 5.89 3.81 5.18 5.17 5.89 6.58 6.05 5.32 5.56 5.71 4.18 4.42 5.25 5.43 4.43 4.04 4.29 4.36 4.04 3.33 3.48 3.52
14.43 13.15 16.42 16.09 11.04 12.42 15.14 11.72 19.32 10.17 16.19 15.65 14.33 22.28 13.42 17.26 13.5 12.59 21.72 11.24 12.31 21.14 16.23 19.15 11.05 14.85 13.53 14.45 14.23 14.28 15.48 14.04
22.19 21.8 28.46 20.32 20.39 22.99 21.24 19.36 37.46 18.56 30.49 19.49 24.66 18.42 19.54 21.39 20.98 20.85 26.43 21.69 20.9 27.28 24.3 22.71 21.14 22.94 21.16 23.89 23.36 15.69 16.31 15.58
11.88 16.21 15.36 15.07 19.67 13.0 12.79 11.87 14.17 15.22 17.53 15.42 16.8 20.77 13.25 14.94 12.58 15.8 26.01 16.98 11.75 20.38 19.04 22.06 12.33 12.55 10.63 12.22 13.22 8.98 10.24 9.71
Mp3g15890.1 (BRD13)
6.97 10.31 12.11 8.42 7.89 6.94 6.97 6.4 10.14 9.18 15.47 11.04 13.16 13.04 8.19 8.65 7.83 7.81 16.74 9.3 7.22 14.92 9.5 15.21 7.58 7.46 6.43 6.94 7.09 7.72 8.76 9.0
8.1 17.31 16.69 13.42 7.52 8.69 7.47 7.97 23.14 14.88 26.02 16.7 20.39 19.83 12.53 16.54 11.95 7.97 30.08 11.23 10.33 25.26 9.9 25.43 9.68 9.23 7.99 8.11 7.87 9.38 10.77 9.06
1.8 1.68 2.95 2.69 1.41 1.59 1.51 1.55 3.06 1.89 2.6 1.56 1.99 1.86 2.08 2.37 2.15 1.36 3.96 1.38 1.5 3.52 1.77 3.27 1.28 1.75 1.35 1.58 1.64 1.45 1.88 1.96
Mp3g23650.1 (DUF569)
8.29 11.75 9.3 7.76 4.35 7.01 4.05 6.21 9.14 3.06 14.61 5.73 13.19 12.58 9.32 5.83 5.63 6.09 21.66 6.62 5.03 10.82 4.6 13.99 8.34 5.64 7.4 8.33 9.54 12.23 11.8 9.54
8.13 9.47 8.1 8.11 8.09 8.85 8.93 8.16 8.65 7.93 10.87 9.92 10.6 8.64 7.84 9.93 7.91 9.14 10.68 8.83 7.94 9.59 9.51 9.57 8.64 9.34 7.69 8.53 9.07 8.68 8.18 7.72
Mp4g05100.1 (CYP71B13)
3.21 3.52 3.74 4.09 4.34 2.9 3.59 3.08 5.62 3.12 4.74 4.12 4.63 5.33 3.45 4.0 4.14 4.08 4.86 3.55 3.11 4.83 4.91 4.63 3.07 4.19 3.27 3.95 3.87 2.62 2.84 2.56
Mp4g07110.1 (MON1)
8.47 11.94 10.63 11.93 11.94 7.84 10.13 7.8 14.21 12.83 13.35 13.14 14.06 11.44 10.47 11.72 10.7 11.04 15.75 11.49 8.85 13.11 15.08 15.69 9.16 10.13 8.92 9.32 9.22 8.04 7.69 7.16
Mp4g08560.1 (PUB60)
22.85 33.19 30.96 29.43 23.36 23.15 25.93 21.14 31.77 26.42 41.86 35.89 37.83 32.47 30.03 34.44 27.43 22.39 49.51 27.21 24.71 38.85 28.8 38.58 23.94 25.44 20.55 23.25 27.26 27.55 29.55 24.74
Mp4g08680.1 (RPN1A)
5.68 8.57 6.91 5.39 6.51 6.04 6.71 4.47 14.49 8.8 13.08 9.41 8.81 5.3 5.88 7.61 5.65 6.11 8.86 5.73 5.35 8.43 8.05 5.48 4.87 6.39 5.72 7.11 7.19 4.15 4.83 5.32
5.17 4.95 5.32 5.64 5.6 4.8 5.33 4.64 6.42 4.08 6.51 5.36 6.11 6.41 5.56 6.22 5.75 5.17 6.41 5.17 5.03 6.11 6.36 5.77 4.7 5.37 5.14 5.39 5.27 4.38 4.75 4.43
7.68 7.87 8.15 7.67 8.7 7.32 8.8 6.94 11.78 8.58 10.7 9.54 9.15 9.69 7.2 9.04 7.52 9.39 10.78 8.74 7.95 9.86 10.88 10.25 7.57 8.73 7.36 8.28 8.09 6.66 6.95 6.48
11.86 16.35 12.26 13.07 15.44 12.46 16.07 12.76 18.55 14.73 19.14 19.22 18.63 19.07 13.05 15.87 12.78 15.14 19.03 18.22 13.53 15.48 19.62 16.16 14.17 14.43 12.76 12.19 12.63 11.53 12.67 11.87
Mp4g17240.1 (FUS5)
36.1 43.9 40.52 35.14 33.66 35.21 45.07 34.58 54.4 39.79 58.84 54.14 55.73 42.68 34.96 51.06 34.33 38.52 65.53 40.83 42.45 55.35 44.05 57.34 42.07 43.9 36.07 34.58 35.79 36.56 37.62 35.42
112.43 128.46 139.71 154.23 95.04 125.06 123.84 114.15 134.08 107.59 177.06 146.66 151.44 192.01 163.99 140.84 151.02 126.69 191.58 148.12 140.79 168.94 123.2 207.61 149.71 141.73 123.61 130.09 138.32 123.61 144.09 138.48
Mp5g09520.1 (HAC8)
10.13 9.02 10.94 14.77 9.7 10.07 11.65 9.6 17.83 7.88 12.46 11.3 11.34 8.59 12.33 15.12 13.34 11.61 13.66 11.45 11.17 12.3 13.3 12.52 10.46 11.99 10.63 10.42 10.13 9.36 10.19 8.66
Mp5g17010.1 (SMU2)
6.97 6.07 6.07 7.02 6.69 7.02 8.07 7.09 7.89 5.66 9.49 7.87 8.36 5.61 7.4 8.5 7.36 7.92 8.83 8.25 8.23 8.61 9.63 7.74 8.29 8.98 8.04 7.3 7.65 6.29 6.66 5.99
7.38 9.53 8.7 6.66 7.51 6.88 8.03 6.42 12.89 7.09 12.3 13.74 11.11 7.25 7.5 8.42 6.71 7.65 11.32 7.18 7.08 9.54 9.34 12.72 6.73 7.54 6.31 6.29 6.88 7.44 8.23 7.34
Mp5g23620.1 (TRA1a)
5.06 3.86 6.93 7.02 5.42 4.27 4.57 3.94 7.27 3.84 6.78 4.81 5.06 8.23 5.71 6.96 6.56 5.05 9.46 4.74 4.39 9.5 6.63 7.97 4.18 5.66 4.36 5.41 5.49 4.52 5.49 5.01
Mp5g24200.1 (ELF8)
6.87 6.21 6.77 8.99 7.53 7.03 8.67 6.42 10.95 7.18 10.83 8.15 8.7 6.91 8.65 11.22 9.07 8.5 9.37 9.03 8.21 8.87 10.65 7.99 7.98 9.21 6.62 7.15 7.22 6.19 6.3 5.68
6.94 6.71 7.09 7.78 7.33 6.79 7.8 6.33 13.65 5.91 10.95 10.69 10.79 5.56 7.65 9.7 8.19 9.76 10.38 8.91 8.14 9.43 10.55 10.6 7.4 8.64 7.81 8.0 7.64 6.54 6.52 6.25
Mp6g05370.1 (TOP1)
13.32 12.32 12.88 15.72 14.93 12.6 13.01 11.93 22.82 16.92 18.38 16.14 15.19 12.75 14.27 16.33 14.32 15.67 20.73 15.46 12.89 16.91 18.0 19.04 13.5 14.82 12.9 13.64 14.39 11.9 12.76 11.7
4.96 4.87 4.37 5.58 5.0 5.92 5.89 5.59 6.04 4.31 7.25 5.49 6.47 4.29 6.57 6.04 5.6 6.64 6.91 6.79 7.16 5.76 6.26 5.36 7.37 6.9 5.51 5.43 5.69 5.76 5.24 4.79
Mp7g00210.1 (PosF21)
26.46 22.91 25.15 23.36 19.91 19.87 24.86 21.1 40.74 19.91 29.59 25.66 23.72 34.58 21.95 23.28 23.37 22.76 40.74 20.23 20.83 34.73 26.83 31.03 20.37 25.43 24.4 28.29 28.79 27.07 24.72 23.37
Mp7g04090.1 (DCAF1)
10.24 8.0 12.28 11.36 9.65 8.96 9.52 8.45 11.8 7.54 11.82 10.0 10.86 12.51 10.86 11.71 11.55 10.98 16.3 10.82 9.46 15.81 12.93 13.46 9.76 11.49 8.57 9.56 10.24 10.17 11.6 10.52
Mp7g05740.1 (TRN1)
19.65 18.85 21.31 18.82 20.75 17.21 22.23 16.52 26.09 19.75 21.51 22.71 19.69 22.31 15.83 20.81 17.15 17.19 23.33 18.7 15.86 24.56 23.4 20.81 16.22 19.1 16.5 17.34 18.11 17.62 18.15 17.01
Mp7g12190.1 (AtSEC23F)
18.12 20.42 20.51 19.4 18.34 20.41 21.66 19.01 26.04 19.01 27.73 24.76 25.6 16.74 21.29 22.87 20.79 23.63 28.62 23.87 21.91 24.62 25.83 24.72 23.12 23.62 18.48 18.91 20.2 17.18 15.92 14.27
7.46 8.05 8.97 10.05 10.91 7.87 8.86 7.56 10.9 7.76 11.44 10.08 11.52 10.08 9.65 12.7 10.68 9.99 9.86 10.83 7.82 9.62 12.09 10.01 8.33 9.18 6.43 7.27 8.09 6.11 5.99 5.43
15.31 19.58 20.56 15.33 19.0 16.1 19.82 15.16 22.1 16.21 22.01 23.26 19.19 23.16 15.76 18.06 15.77 16.77 28.03 19.99 16.74 24.73 20.64 25.96 15.82 17.41 16.43 15.74 14.87 13.43 15.48 14.37
Mp8g06380.1 (SAC3A)
9.48 11.48 10.85 9.56 11.02 9.12 11.26 8.4 14.06 10.68 15.29 14.34 14.41 12.71 9.39 11.47 9.9 10.56 16.78 11.25 9.97 14.64 13.56 15.46 9.7 10.8 9.61 9.28 10.28 8.38 9.08 8.93
Mp8g11350.1 (SAR1)
6.36 7.72 7.89 7.28 6.27 6.29 6.27 5.78 6.81 3.9 9.73 6.24 7.98 7.86 5.77 6.57 6.15 5.97 11.33 6.61 5.71 9.89 7.53 8.7 5.99 6.57 5.67 7.44 8.1 6.25 7.37 6.54
19.58 20.33 16.73 16.35 13.17 16.13 16.51 13.99 35.16 19.8 28.28 30.51 25.68 22.97 13.85 16.7 16.5 20.45 23.01 15.48 18.61 27.63 23.5 22.64 17.03 24.89 17.11 18.36 18.93 14.14 17.74 17.47
Mp8g15320.1 (ART1)
9.01 9.18 9.84 8.53 8.88 7.55 8.49 7.43 13.34 8.39 11.53 9.64 10.09 8.7 8.06 9.31 8.58 9.23 12.02 8.49 7.49 10.8 10.96 10.23 7.51 9.2 8.03 9.24 9.64 7.99 8.47 7.81
9.73 9.55 8.26 11.09 8.78 7.83 10.28 8.13 21.5 9.2 15.28 15.36 12.14 10.46 8.33 11.16 10.01 10.42 10.68 9.03 9.08 13.61 13.93 10.21 7.94 12.14 9.38 9.64 8.64 7.92 9.28 9.11
Mp8g15550.1 (URT1)
16.59 20.75 18.02 16.29 16.37 14.92 17.51 14.33 32.0 16.37 23.55 25.2 22.58 14.32 15.27 19.35 16.52 18.29 22.83 17.21 15.48 22.2 22.27 21.68 15.2 18.7 16.76 16.42 15.28 13.92 16.57 16.45
Mp8g16600.1 (TAF15)
16.6 15.8 14.82 19.09 13.65 17.9 19.43 18.1 25.65 11.87 26.3 24.19 21.62 18.1 20.18 21.44 19.8 21.92 23.85 20.6 21.08 22.99 24.16 20.54 20.98 22.3 17.8 18.17 19.88 16.29 17.97 16.64
7.92 7.08 8.78 8.74 7.54 6.66 7.29 6.41 9.0 5.86 9.1 7.28 7.79 8.65 8.05 8.99 8.56 7.37 11.0 7.56 7.19 10.93 9.28 9.24 6.98 8.45 7.99 8.9 8.66 7.51 8.0 7.22
MpVg00440.1 (BSL3)
22.04 21.04 24.29 20.91 20.64 22.86 22.36 22.69 35.87 20.96 29.27 24.18 25.4 21.01 18.74 20.77 20.01 25.67 28.61 23.07 21.85 28.15 25.87 24.89 22.25 24.81 21.2 23.44 23.32 17.67 18.08 17.32

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)