Heatmap: Cluster_11 (Marchantia polymorpha (Mpo) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Control
Cold (3°C)
Dark (3 days)
Heat (33°C)
Light (435 uEm-2s-1)
Osmotic (100 mM mannitol)
Nitrogen deficiency (0 mM KNO3)
Salt (40 mM NaCl)
Cold-Dark
Cold-Light
Cold-Mannitol
Cold-Nitrogen deficiency
Cold-Salt
Heat-Dark
Heat-Mannitol
Heat-Nitrogen deficiency
Heat-Salt
Light-Salt
Mannitol-Dark
Mannitol-Light
Mannitol-Nitrogen deficiency
Nitrogen deficiency-Dark
Nitrogen deficiency-Light
Salt-Dark
Salt-Mannitol
Salt-Nitrogen deficiency
ZT2 (2 hours after light)
ZT6 (6 hours after light)
ZT10 (10 hours after light)
ZT14 (2 hours after dark)
ZT18 (6 hours after dark)
ZT22 (10 hours after dark)
Mp1g07620.1 (PTAC2)
14.11 14.48 3.62 3.03 19.56 38.19 7.82 33.95 14.95 15.46 41.39 8.32 31.05 2.09 15.88 1.43 10.33 39.16 28.35 29.77 28.68 1.92 11.88 1.69 65.33 19.56 24.44 19.67 11.66 12.88 16.93 16.56
Mp1g08990.1 (PRB1)
2.02 1.65 0.19 0.15 0.51 4.21 4.56 36.22 0.27 1.07 3.93 3.08 25.74 0.0 0.72 0.55 1.7 27.51 0.3 0.59 1.68 0.02 2.46 0.29 7.94 0.41 1.2 0.17 0.05 0.54 0.4 0.09
Mp1g22330.1 (SPH1)
0.26 0.4 0.45 0.27 1.44 0.47 0.85 2.29 0.84 0.45 0.55 0.81 2.41 0.0 0.13 0.57 0.56 5.5 0.16 0.84 0.51 0.15 3.37 0.0 0.14 0.14 0.17 0.0 0.0 0.18 0.16 0.0
1.84 1.94 1.26 0.0 1.63 2.51 3.48 14.79 0.0 7.34 0.0 10.81 1.05 0.34 0.7 1.28 0.0 13.26 0.0 1.67 0.71 0.0 4.98 0.35 2.11 1.67 0.5 0.0 0.15 0.38 1.15 0.0
0.0 0.05 0.0 0.16 0.22 0.07 0.24 0.75 0.0 0.17 0.12 0.24 0.92 0.0 0.35 0.3 0.4 2.56 0.0 0.11 0.18 0.0 0.09 0.19 0.23 0.17 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0
Mp2g05980.1 (UBC16)
23.03 13.57 8.11 4.29 6.01 19.91 6.36 60.2 7.26 14.84 14.6 4.88 29.34 5.56 4.81 3.21 10.17 39.49 6.24 2.97 7.27 3.73 2.02 8.21 43.07 13.03 23.79 14.62 13.52 12.09 21.33 20.08
Mp2g06540.1 (EXT21)
0.04 0.17 0.0 0.25 1.22 1.28 0.11 3.0 0.07 0.0 0.43 0.0 2.03 0.0 0.63 0.07 0.25 2.13 1.35 4.6 0.85 0.0 0.07 0.22 7.37 0.21 1.22 0.9 0.57 1.05 0.66 1.96
Mp2g08490.1 (LRX10)
0.21 0.37 0.02 0.08 1.4 1.83 0.06 2.65 0.09 0.14 1.29 0.03 2.18 0.0 1.37 0.15 0.65 5.33 1.78 7.03 1.09 0.06 0.15 0.07 10.18 0.29 1.57 1.67 1.23 0.99 1.44 0.76
Mp2g08500.1 (EXT21)
0.92 1.35 0.22 0.2 4.07 6.05 0.32 8.01 0.8 0.7 4.61 0.3 6.49 0.01 1.9 0.13 0.85 12.61 6.91 20.3 4.45 0.19 0.75 0.12 29.6 1.3 4.56 6.18 4.08 3.69 4.68 1.99
Mp2g10420.1 (TPR4)
0.64 0.44 0.21 0.11 0.15 0.91 0.81 0.89 0.08 0.49 0.68 0.55 0.45 0.02 0.17 0.1 0.15 0.66 0.42 0.56 1.26 0.55 0.59 0.4 2.09 1.8 0.46 0.55 0.55 0.55 0.56 0.3
Mp2g14460.1 (EXT21)
1.58 1.76 0.75 0.54 1.37 3.66 2.69 4.39 0.97 2.11 3.28 1.88 3.85 0.12 1.44 0.35 1.12 3.03 1.21 3.7 3.13 1.31 2.13 0.49 7.33 2.61 1.91 2.22 1.51 1.25 1.2 1.21
Mp2g14510.1 (EXT21)
0.74 1.49 0.49 0.11 1.08 1.72 0.4 3.87 1.22 1.13 1.95 0.08 3.55 0.14 0.7 0.08 0.49 4.42 4.61 2.8 1.23 0.15 0.16 0.47 5.81 0.57 2.24 2.09 1.22 1.37 1.45 1.39
0.16 0.2 0.02 0.06 0.05 0.21 0.26 1.08 0.04 0.23 0.47 0.26 0.91 0.0 0.09 0.1 0.11 0.47 0.01 0.15 0.37 0.02 0.18 0.0 0.22 0.28 0.13 0.12 0.1 0.18 0.13 0.09
Mp2g15200.1 (EXT19)
3.35 1.58 6.64 2.62 1.27 4.7 10.09 31.03 5.06 5.14 3.64 3.78 7.19 1.02 3.9 24.14 5.88 21.45 12.47 1.92 6.48 16.89 3.64 10.53 4.24 4.45 3.05 3.46 5.21 3.57 4.15 3.07
Mp2g20620.1 (PHT3)
0.6 0.59 0.34 0.1 0.22 0.91 0.79 0.86 0.04 0.54 0.89 0.59 0.76 0.03 0.64 0.12 0.36 0.67 0.2 0.37 1.3 0.42 0.25 0.21 2.34 1.89 0.39 0.92 0.49 0.46 0.49 0.25
8.05 6.09 2.0 1.85 8.1 11.01 14.06 19.96 4.31 12.6 7.38 9.15 10.22 0.25 3.28 3.43 3.34 13.39 1.51 5.09 10.51 2.95 6.42 2.37 11.5 10.58 5.95 4.61 4.33 7.08 5.12 3.78
8.53 7.58 21.28 1.72 114.62 21.86 19.45 89.76 51.77 59.75 7.19 25.45 27.75 0.5 2.18 6.16 1.91 121.64 21.36 44.16 22.26 61.95 50.55 15.31 33.13 4.21 6.68 1.1 0.55 1.81 9.88 5.53
8.2 6.56 3.6 1.35 20.76 13.17 22.74 34.39 2.06 22.75 3.97 17.24 18.41 0.6 1.94 13.19 2.96 29.43 7.61 5.9 6.25 12.28 23.19 3.84 11.31 5.1 9.56 2.53 1.89 3.76 4.89 5.1
Mp3g03260.1 (SMAP1)
0.06 0.09 0.0 0.0 0.03 0.12 0.1 0.27 0.0 0.05 0.24 0.04 0.27 0.0 0.04 0.0 0.14 0.25 0.0 0.04 0.13 0.0 0.05 0.0 0.23 0.2 0.09 0.11 0.03 0.08 0.03 0.02
Mp3g03460.1 (AtATP23)
0.54 0.52 0.77 0.15 0.85 0.85 0.33 2.14 0.22 0.48 1.49 0.25 2.19 0.0 1.36 0.16 0.95 3.12 0.92 1.31 0.89 0.28 0.74 0.8 3.12 0.54 1.04 0.81 0.6 1.05 0.77 0.48
Mp3g04640.1 (GLP5)
0.04 0.07 0.02 0.03 0.09 0.06 0.26 0.22 0.05 0.05 0.09 0.14 0.04 0.01 0.09 0.12 0.09 0.37 0.02 0.13 0.04 0.03 0.07 0.0 0.08 0.05 0.02 0.05 0.04 0.03 0.04 0.02
Mp3g04650.1 (CHX21)
0.04 0.02 0.0 0.01 0.0 0.15 0.11 0.28 0.0 0.03 0.0 0.11 0.05 0.0 0.06 0.01 0.01 0.26 0.0 0.01 0.18 0.0 0.1 0.0 0.04 0.08 0.01 0.0 0.0 0.06 0.02 0.0
28.12 11.81 28.78 12.93 9.72 48.41 48.29 51.88 45.85 9.09 19.21 21.51 16.44 10.04 20.2 10.23 13.97 92.34 14.85 15.43 47.51 22.29 25.48 13.94 61.03 35.4 15.32 22.53 17.08 22.93 20.84 15.25
Mp3g08020.1 (CPNB3)
0.01 0.02 0.02 0.01 0.0 0.03 0.03 0.11 0.02 0.05 0.0 0.04 0.01 0.01 0.04 0.01 0.03 0.13 0.02 0.03 0.0 0.01 0.05 0.04 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.02 0.02 0.02
0.0 1.0 0.25 0.0 0.0 0.86 0.2 8.31 0.0 0.49 7.61 1.92 9.52 0.53 2.13 0.27 1.49 5.5 0.0 1.4 2.0 0.0 0.17 0.34 5.98 0.96 1.02 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0
7.82 8.69 3.11 1.58 5.75 11.33 7.1 16.27 6.51 6.43 15.92 4.8 21.82 0.76 4.54 0.73 4.38 8.65 4.03 11.62 11.75 3.15 2.78 1.86 35.88 12.07 9.36 10.04 9.11 9.04 7.98 6.09
Mp3g16810.1 (NPSN11)
0.74 0.58 0.52 0.47 0.89 3.59 0.45 5.83 0.88 1.71 0.97 0.69 1.76 0.04 0.66 1.06 0.43 2.4 0.0 0.89 1.61 0.24 0.52 0.25 2.07 0.81 0.57 0.42 0.64 1.54 0.35 0.09
0.93 1.08 0.31 0.79 0.49 0.89 0.23 1.78 0.0 1.55 1.62 1.0 3.84 0.28 0.74 0.53 1.63 6.13 0.25 2.08 1.09 0.44 0.82 0.26 1.8 0.91 0.98 1.13 0.79 0.72 1.03 0.48
Mp4g10880.1 (CYP81D7)
0.12 0.55 1.34 0.0 0.0 0.44 0.74 6.26 0.21 0.19 0.48 1.92 0.59 0.0 1.02 1.14 0.71 12.57 0.48 1.25 0.65 1.13 2.87 1.57 0.82 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0
13.35 9.07 27.91 17.07 23.21 13.59 11.35 38.66 13.38 48.31 8.56 17.19 16.55 20.56 11.1 18.48 14.97 42.26 12.31 17.86 10.56 29.27 20.88 13.0 13.29 11.23 13.12 9.75 11.54 9.48 7.54 5.93
Mp4g20750.1 (HSFA8)
0.25 0.23 0.2 0.08 0.14 0.29 0.23 0.53 0.11 0.43 0.58 0.18 0.8 0.08 0.22 0.21 0.35 0.8 0.23 0.26 0.17 0.15 0.13 0.19 0.26 0.06 0.42 0.2 0.09 0.11 0.19 0.13
Mp5g00880.1 (MOB1D)
0.5 0.49 0.08 0.05 0.04 0.65 0.13 1.34 0.18 0.4 0.31 0.18 1.06 0.04 0.07 0.09 0.04 0.41 1.55 0.11 0.34 0.0 0.0 0.02 1.01 0.12 1.24 0.44 0.32 0.81 0.73 0.51
Mp5g00890.1 (CCR4f)
6.02 6.27 0.26 0.32 1.13 12.84 4.88 13.94 1.03 4.87 6.79 1.5 11.56 0.19 2.05 1.35 1.08 10.02 4.09 3.93 8.74 0.03 0.86 0.11 21.55 2.01 6.27 4.37 2.61 4.9 5.46 2.83
0.74 2.33 0.06 0.07 0.67 0.85 0.79 3.04 0.75 1.74 2.01 1.66 1.5 0.01 0.39 0.3 0.24 2.03 0.1 1.34 1.21 0.04 1.76 0.03 1.22 1.33 1.06 0.25 0.19 0.03 0.14 0.13
1.83 1.16 2.82 1.11 0.71 0.83 6.21 17.54 1.68 0.6 0.36 6.74 2.7 1.14 1.32 5.8 2.73 25.16 1.31 0.52 0.62 3.34 3.68 1.81 1.42 1.01 1.81 1.54 1.18 2.13 1.99 1.69
Mp5g04000.1 (Prx66)
3.51 2.34 0.28 0.37 2.18 4.78 1.67 5.4 0.82 0.77 3.82 0.4 3.79 0.01 0.55 0.08 0.38 5.03 1.64 4.44 6.29 0.42 1.11 0.03 12.1 2.56 3.48 2.89 2.09 3.15 3.44 2.08
Mp5g04010.1 (Prx66)
0.44 1.15 0.0 0.05 0.72 2.03 0.18 3.39 0.06 0.31 4.36 0.19 5.17 0.0 1.16 0.05 0.6 4.5 0.85 7.21 2.25 0.0 0.21 0.01 9.79 0.59 1.23 1.46 0.7 0.75 0.54 0.41
Mp5g05780.1 (APL3)
1.3 2.8 0.39 0.77 0.39 2.48 4.0 3.91 2.04 1.36 1.87 3.36 2.36 0.09 0.72 1.05 0.8 4.71 0.25 0.74 1.9 0.35 0.89 0.23 1.27 1.61 0.72 0.97 1.31 1.0 0.58 0.34
Mp5g12510.1 (PRB1)
15.56 20.84 7.09 4.94 15.96 13.5 45.52 118.73 7.51 17.22 14.32 17.91 83.07 0.59 5.89 14.12 8.44 97.95 9.19 8.93 7.57 3.52 31.5 3.67 25.55 7.21 14.32 7.67 7.24 7.41 7.51 7.47
5.24 4.98 2.49 1.69 18.51 3.74 3.37 13.43 3.88 11.2 3.14 2.38 8.3 2.12 1.87 4.52 2.56 14.12 3.18 4.3 1.7 4.92 9.52 2.22 3.48 1.36 5.64 2.69 2.16 2.63 3.83 5.4
Mp5g16630.1 (OEP37)
0.1 0.41 0.0 0.38 0.17 0.18 0.12 0.88 0.03 0.14 0.38 0.32 1.37 0.0 0.23 0.23 0.15 1.67 0.0 0.16 0.22 0.03 0.25 0.0 0.45 0.24 0.03 0.03 0.03 0.22 0.03 0.08
0.67 0.55 0.16 0.03 0.27 0.95 0.48 1.37 0.12 0.3 0.93 0.58 1.43 0.0 0.05 0.07 0.03 1.57 0.27 0.49 0.89 0.49 0.4 0.08 0.9 0.89 0.62 0.59 0.38 0.71 0.47 0.63
0.02 0.01 0.0 0.08 0.04 0.11 0.05 0.24 0.02 0.02 0.04 0.03 0.05 0.04 0.18 0.27 0.16 0.17 0.06 0.1 0.08 0.06 0.05 0.08 0.03 0.06 0.02 0.02 0.03 0.03 0.01 0.02
Mp6g00230.1 (SMD2)
0.06 0.04 0.0 0.04 0.0 0.05 0.04 0.13 0.01 0.03 0.15 0.07 0.13 0.01 0.07 0.03 0.05 0.1 0.02 0.04 0.08 0.01 0.06 0.03 0.12 0.08 0.05 0.04 0.04 0.07 0.03 0.03
210.65 129.31 113.02 52.16 99.77 220.8 159.05 325.54 292.94 196.13 116.54 110.15 133.1 38.1 54.92 50.74 49.44 396.5 75.81 99.44 144.1 117.91 109.82 64.12 257.33 150.0 189.52 144.24 138.74 128.54 130.26 101.13
Mp6g03990.1 (TREPH1)
99.27 194.99 129.39 101.19 269.96 181.14 147.82 255.97 139.9 136.43 160.16 279.97 222.95 102.28 107.39 140.52 106.68 444.53 231.99 245.03 132.88 232.71 254.95 166.68 150.49 150.98 222.26 125.33 156.82 90.31 138.38 107.0
Mp6g14120.1 (TERT)
37.16 19.94 10.32 6.78 13.39 21.96 26.75 55.34 35.37 57.96 11.0 20.08 23.43 6.68 3.44 5.67 3.78 42.48 2.99 7.91 22.97 8.81 18.04 3.75 26.41 35.79 26.84 19.54 15.93 22.67 18.31 16.03
Mp7g02900.1 (LPPepsilon2)
1234.69 1785.52 719.99 1515.1 9519.05 4183.73 7315.15 12847.07 1021.45 1623.56 3879.47 3316.25 9544.5 30.37 4019.66 8771.66 4661.86 18114.8 1257.48 6673.32 4347.17 1826.12 9418.61 956.93 6457.42 2121.42 1907.6 460.22 244.11 205.6 498.6 436.33
Mp7g02910.1 (LPPepsilon2)
7.7 11.14 1.83 2.43 36.53 13.57 65.2 461.24 4.1 7.77 11.34 24.03 230.04 0.26 10.07 55.79 48.53 308.68 2.98 47.75 13.72 6.42 39.39 10.76 59.81 12.49 10.33 7.01 6.18 4.79 2.99 2.71
Mp7g05420.1 (CYP71A15)
13.0 14.06 1.37 1.75 13.66 6.67 80.19 83.2 1.69 6.9 2.89 32.86 67.03 0.08 1.15 18.85 12.56 76.93 0.92 7.32 5.56 0.75 63.14 0.51 17.02 3.09 12.16 2.75 1.75 2.3 2.69 3.81
0.21 0.24 0.02 0.38 0.09 0.54 0.32 12.54 0.1 0.19 0.31 0.21 4.87 0.03 0.31 0.16 0.8 6.3 0.09 0.24 0.5 0.06 0.49 0.07 0.87 0.36 0.05 0.15 0.18 0.06 0.2 0.05
Mp7g06330.1 (MT2B)
255.5 409.94 254.95 135.72 161.28 632.04 850.35 864.26 241.03 298.03 683.31 527.61 781.39 108.34 628.15 533.4 430.14 342.56 195.79 550.05 866.16 214.83 383.53 92.35 1600.23 734.81 641.82 543.06 631.61 493.39 580.49 535.13
Mp8g00840.1 (RLP38)
2.41 1.57 0.08 1.16 0.86 8.3 2.72 8.28 0.32 1.43 4.63 1.54 5.29 0.26 3.78 1.11 3.67 3.34 0.84 2.02 8.33 0.09 1.28 0.15 20.09 8.56 3.95 4.34 3.97 3.59 3.42 2.19
Mp8g00860.1 (GATL7)
10.76 11.3 4.42 4.6 8.73 35.48 8.17 59.11 3.99 2.83 20.39 3.18 17.33 2.46 7.96 4.05 7.02 23.31 1.98 29.19 34.27 3.71 7.03 1.45 69.72 20.44 20.53 9.36 8.29 5.52 2.46 2.09
Mp8g01270.1 (TBL32)
2.66 1.0 0.24 1.27 0.86 2.25 1.41 2.52 0.56 0.57 1.59 1.08 0.85 0.37 1.89 1.11 1.53 3.52 3.24 1.36 1.42 0.32 0.83 1.7 1.3 1.26 1.86 1.58 1.93 1.87 1.77 1.34
Mp8g10470.1 (GLP10)
1.63 2.24 0.52 0.81 0.31 0.7 2.0 2.52 1.94 1.86 1.41 3.01 2.97 0.04 0.33 0.82 0.83 3.71 0.26 0.19 1.02 0.74 1.0 0.29 1.04 1.62 1.75 1.29 1.52 1.2 1.53 1.39
Mp8g15470.1 (OPL1)
0.03 0.05 0.09 0.0 0.01 0.04 1.43 2.26 0.21 0.0 0.08 0.34 1.07 0.0 0.01 0.39 0.18 2.2 0.02 0.01 0.05 0.3 0.25 0.09 0.11 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)