Heatmap: Cluster_151 (Marchantia polymorpha (Mpo) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Control
Cold (3°C)
Dark (3 days)
Heat (33°C)
Light (435 uEm-2s-1)
Osmotic (100 mM mannitol)
Nitrogen deficiency (0 mM KNO3)
Salt (40 mM NaCl)
Cold-Dark
Cold-Light
Cold-Mannitol
Cold-Nitrogen deficiency
Cold-Salt
Heat-Dark
Heat-Mannitol
Heat-Nitrogen deficiency
Heat-Salt
Light-Salt
Mannitol-Dark
Mannitol-Light
Mannitol-Nitrogen deficiency
Nitrogen deficiency-Dark
Nitrogen deficiency-Light
Salt-Dark
Salt-Mannitol
Salt-Nitrogen deficiency
ZT2 (2 hours after light)
ZT6 (6 hours after light)
ZT10 (10 hours after light)
ZT14 (2 hours after dark)
ZT18 (6 hours after dark)
ZT22 (10 hours after dark)
0.77 0.7 0.8 0.61 0.65 0.71 0.85 0.71 0.94 0.62 0.86 0.75 0.78 0.54 0.55 0.64 0.58 0.65 1.0 0.68 0.68 0.89 0.74 0.81 0.68 0.76 0.67 0.76 0.82 0.77 0.71 0.59
0.62 0.5 0.79 0.51 0.55 0.65 0.57 0.56 0.72 0.41 0.63 0.58 0.54 0.49 0.53 0.5 0.48 0.62 0.85 0.64 0.55 1.0 0.64 0.78 0.65 0.63 0.44 0.62 0.71 0.71 0.72 0.61
Mp1g11070.1 (OTS2)
0.45 0.67 0.74 0.37 0.37 0.42 0.41 0.35 0.85 0.39 0.61 0.59 0.54 0.47 0.37 0.35 0.35 0.35 1.0 0.39 0.37 0.78 0.38 0.92 0.39 0.35 0.39 0.38 0.44 0.66 0.85 0.76
Mp1g12750.1 (ARF6)
0.7 0.56 1.0 0.28 0.23 0.52 0.38 0.42 0.94 0.32 0.6 0.47 0.46 0.46 0.27 0.18 0.25 0.29 0.96 0.32 0.44 0.89 0.33 0.75 0.43 0.55 0.53 0.66 0.75 0.56 0.62 0.56
Mp1g15660.1 (IDD16)
0.61 0.36 0.91 0.2 0.12 0.34 0.31 0.2 0.8 0.1 0.44 0.16 0.12 0.33 0.12 0.18 0.1 0.1 0.59 0.22 0.41 1.0 0.2 0.41 0.34 0.54 0.39 0.69 0.63 0.54 0.51 0.38
Mp1g16890.1 (PYR4)
0.87 0.7 0.84 0.78 0.64 0.79 0.85 0.82 1.0 0.62 0.83 0.78 0.73 0.78 0.71 0.87 0.72 0.72 1.0 0.69 0.73 0.91 0.77 0.89 0.73 0.81 0.74 0.81 0.88 0.88 0.75 0.61
0.26 0.32 0.73 0.21 0.42 0.29 0.16 0.31 0.51 0.22 0.47 0.24 0.48 0.53 0.23 0.16 0.22 0.4 1.0 0.46 0.28 0.76 0.34 0.92 0.32 0.24 0.37 0.26 0.19 0.28 0.59 0.76
Mp2g01950.1 (PQT3)
0.41 0.3 0.53 0.27 0.2 0.46 0.32 0.33 0.28 0.14 0.39 0.29 0.2 0.5 0.31 0.23 0.25 0.22 1.0 0.25 0.31 0.65 0.21 0.68 0.34 0.37 0.35 0.46 0.47 0.44 0.5 0.53
Mp2g02860.1 (UREF)
0.52 0.6 1.0 0.29 0.41 0.45 0.37 0.42 0.93 0.35 0.6 0.44 0.49 0.42 0.26 0.21 0.26 0.3 0.68 0.3 0.37 0.72 0.3 0.74 0.36 0.4 0.36 0.47 0.53 0.55 0.54 0.45
0.74 0.63 0.9 0.52 0.61 0.59 0.59 0.61 0.77 0.46 0.76 0.51 0.73 0.57 0.49 0.49 0.48 0.54 1.0 0.58 0.56 0.96 0.66 0.83 0.56 0.66 0.64 0.73 0.81 0.72 0.81 0.7
0.7 0.36 0.84 0.24 0.1 0.47 0.51 0.36 0.74 0.22 0.26 0.28 0.27 0.38 0.14 0.16 0.13 0.12 0.78 0.19 0.39 0.79 0.15 0.95 0.36 0.41 0.46 0.83 0.81 1.0 0.64 0.45
0.64 0.59 1.0 0.45 0.39 0.64 0.57 0.56 0.86 0.48 0.66 0.64 0.53 0.41 0.45 0.42 0.46 0.45 0.72 0.51 0.6 0.74 0.44 0.73 0.59 0.62 0.62 0.65 0.67 0.65 0.73 0.7
0.46 0.36 1.0 0.18 0.33 0.47 0.36 0.41 0.78 0.3 0.35 0.26 0.29 0.42 0.22 0.17 0.19 0.26 0.9 0.35 0.37 0.72 0.23 0.94 0.42 0.33 0.37 0.42 0.46 0.46 0.44 0.36
Mp2g16580.1 (RCE1)
0.81 0.78 0.82 0.43 0.58 0.7 0.71 0.7 0.91 0.73 0.76 0.77 0.72 0.6 0.4 0.45 0.42 0.61 0.91 0.47 0.62 0.85 0.61 1.0 0.59 0.67 0.76 0.79 0.76 0.62 0.62 0.56
Mp2g18350.1 (XTH8)
0.67 0.81 0.96 0.5 0.39 0.59 0.7 0.63 0.97 0.31 0.75 0.94 0.9 0.64 0.57 0.52 0.57 0.78 0.83 0.6 0.53 1.0 0.5 0.8 0.55 0.54 0.61 0.71 0.82 0.93 0.8 0.63
0.6 0.37 0.79 0.34 0.4 0.48 0.38 0.43 0.76 0.32 0.42 0.46 0.33 0.76 0.28 0.35 0.28 0.25 0.97 0.28 0.39 0.9 0.3 1.0 0.37 0.45 0.46 0.68 0.76 0.55 0.7 0.53
0.74 0.37 0.91 0.73 0.54 0.52 0.51 0.53 1.0 0.37 0.45 0.32 0.37 0.85 0.55 0.54 0.58 0.44 0.78 0.38 0.44 0.87 0.5 0.76 0.41 0.51 0.55 0.81 0.78 1.0 0.85 0.79
Mp3g06470.1 (HSBP)
0.48 0.45 0.86 0.3 0.24 0.41 0.4 0.41 0.65 0.16 0.45 0.43 0.61 0.28 0.22 0.31 0.23 0.43 1.0 0.33 0.39 0.77 0.52 0.96 0.41 0.66 0.46 0.51 0.45 0.44 0.6 0.56
0.52 0.54 0.77 0.42 0.44 0.51 0.46 0.48 0.55 0.31 0.58 0.47 0.49 0.32 0.43 0.4 0.42 0.41 1.0 0.48 0.43 0.82 0.48 0.77 0.48 0.47 0.5 0.62 0.58 0.54 0.66 0.64
Mp3g18880.1 (AKR2B)
0.74 0.71 0.85 0.52 0.57 0.72 0.69 0.71 1.0 0.75 0.81 0.77 0.81 0.48 0.53 0.55 0.56 0.66 0.91 0.63 0.69 0.83 0.59 0.94 0.74 0.74 0.83 0.83 0.78 0.76 0.77 0.74
Mp3g20490.1 (TIF3H1)
0.68 0.66 0.93 0.55 0.63 0.74 0.72 0.71 0.88 0.6 0.78 0.71 0.69 0.64 0.55 0.58 0.52 0.62 0.91 0.65 0.66 0.84 0.6 1.0 0.71 0.74 0.68 0.66 0.73 0.71 0.8 0.74
Mp3g21220.1 (SINAT2)
0.58 0.43 0.77 0.32 0.29 0.48 0.4 0.4 1.0 0.19 0.48 0.39 0.43 0.51 0.34 0.3 0.31 0.35 1.0 0.38 0.4 0.92 0.37 0.86 0.41 0.45 0.44 0.54 0.55 0.55 0.62 0.55
Mp3g21660.1 (PIN3)
0.47 0.57 0.94 0.16 0.16 0.26 0.39 0.32 0.75 0.24 0.34 0.49 0.31 0.14 0.1 0.14 0.14 0.14 0.48 0.14 0.22 1.0 0.19 0.49 0.21 0.28 0.43 0.57 0.59 0.43 0.41 0.36
Mp4g04230.1 (ARFA1F)
0.81 0.43 0.73 0.26 0.35 0.61 0.65 0.7 0.87 0.41 0.25 0.45 0.28 0.81 0.4 0.35 0.31 0.57 0.93 0.44 0.52 1.0 0.33 0.76 0.52 0.51 0.45 0.6 0.73 0.82 0.84 0.79
Mp4g05850.1 (BRF2)
0.83 0.75 1.0 0.3 0.21 0.32 0.47 0.29 0.93 0.31 0.41 0.76 0.55 0.81 0.11 0.19 0.18 0.16 0.69 0.13 0.27 0.92 0.31 0.72 0.23 0.4 0.43 0.74 0.82 0.8 0.62 0.66
Mp4g16270.1 (ALA4)
0.44 0.53 0.98 0.05 0.02 0.04 0.16 0.05 0.27 0.07 0.13 0.26 0.11 0.3 0.0 0.0 0.01 0.0 0.44 0.01 0.06 1.0 0.02 0.39 0.03 0.25 0.14 0.47 0.42 0.81 0.55 0.38
Mp4g18110.1 (AVP1)
0.54 0.68 1.0 0.37 0.25 0.5 0.46 0.51 0.88 0.36 0.61 0.78 0.58 0.3 0.5 0.37 0.45 0.38 0.94 0.42 0.44 0.98 0.36 0.87 0.49 0.47 0.43 0.51 0.57 0.81 0.83 0.79
0.87 0.6 0.83 0.87 0.74 0.7 0.69 0.66 0.95 0.64 0.82 0.57 0.71 1.0 0.76 0.88 0.85 0.78 0.82 0.71 0.64 0.86 0.88 0.7 0.62 0.8 0.75 0.91 0.97 0.74 0.69 0.62
Mp5g03810.1 (NPL1)
0.55 0.36 0.92 0.27 0.41 0.36 0.32 0.41 1.0 0.31 0.38 0.28 0.33 0.47 0.23 0.23 0.29 0.38 0.85 0.38 0.32 0.89 0.47 0.82 0.33 0.43 0.71 0.55 0.39 0.34 0.42 0.64
Mp5g18020.1 (EIF2)
0.49 0.57 1.0 0.42 0.44 0.54 0.51 0.49 0.85 0.45 0.64 0.58 0.6 0.37 0.44 0.45 0.41 0.44 0.85 0.52 0.51 0.82 0.46 0.86 0.55 0.51 0.51 0.5 0.57 0.51 0.52 0.48
0.45 0.59 0.7 0.26 0.42 0.46 0.38 0.42 0.73 0.37 0.72 0.53 0.59 0.5 0.27 0.26 0.26 0.4 0.96 0.44 0.42 0.76 0.44 1.0 0.45 0.44 0.5 0.43 0.42 0.46 0.62 0.72
Mp6g03870.1 (PUB34)
0.5 0.11 0.69 0.2 0.16 0.42 0.32 0.49 0.59 0.12 0.16 0.11 0.12 0.39 0.17 0.13 0.17 0.29 1.0 0.23 0.33 0.83 0.17 0.92 0.4 0.4 0.42 0.59 0.64 0.57 0.51 0.43
Mp6g07920.1 (PHB4)
0.61 0.49 1.0 0.42 0.39 0.52 0.54 0.5 0.85 0.64 0.36 0.58 0.4 0.34 0.36 0.34 0.35 0.38 0.71 0.34 0.46 0.83 0.38 0.67 0.47 0.53 0.53 0.51 0.51 0.62 0.65 0.65
Mp6g13010.1 (GH9B10)
0.6 0.4 0.67 0.44 0.24 0.53 0.54 0.46 1.0 0.43 0.65 0.47 0.56 0.76 0.37 0.32 0.4 0.38 0.66 0.36 0.55 0.91 0.36 0.63 0.53 0.66 0.46 0.66 0.66 0.76 0.69 0.7
0.48 0.27 0.98 0.23 0.23 0.35 0.26 0.36 0.8 0.1 0.24 0.2 0.21 0.63 0.24 0.17 0.28 0.22 0.93 0.22 0.3 0.82 0.24 1.0 0.28 0.32 0.35 0.58 0.67 0.55 0.42 0.35
Mp6g16690.1 (SEC8)
0.89 0.62 0.8 0.82 0.67 0.75 0.79 0.69 1.0 0.72 0.82 0.71 0.75 0.91 0.61 0.9 0.65 0.69 0.95 0.69 0.69 0.9 0.76 0.85 0.69 0.82 0.77 0.92 0.98 0.85 0.76 0.66
0.55 0.63 0.87 0.42 0.48 0.5 0.54 0.5 0.88 0.53 0.69 0.59 0.68 0.59 0.43 0.42 0.4 0.52 0.86 0.58 0.62 0.94 0.53 1.0 0.61 0.59 0.54 0.49 0.55 0.56 0.63 0.65
0.47 0.3 1.0 0.26 0.25 0.46 0.47 0.49 0.82 0.22 0.36 0.28 0.31 0.26 0.21 0.24 0.22 0.37 0.99 0.28 0.47 0.86 0.33 0.86 0.43 0.54 0.32 0.47 0.54 0.43 0.4 0.3
0.65 0.65 0.62 0.26 0.37 0.59 0.58 0.52 0.85 0.5 0.77 0.6 0.68 0.33 0.24 0.31 0.23 0.43 1.0 0.46 0.58 0.71 0.47 0.98 0.49 0.62 0.58 0.68 0.76 0.49 0.57 0.49
0.65 0.47 0.81 0.33 0.45 0.56 0.47 0.52 0.95 0.31 0.56 0.4 0.48 0.57 0.31 0.26 0.31 0.42 1.0 0.42 0.45 0.88 0.44 0.92 0.46 0.51 0.64 0.67 0.71 0.67 0.7 0.64
Mp7g15500.1 (TRP2)
0.51 0.57 0.76 0.48 0.29 0.43 0.46 0.42 0.62 0.41 0.63 0.5 0.61 0.57 0.43 0.47 0.42 0.32 1.0 0.38 0.4 0.83 0.4 0.85 0.4 0.44 0.39 0.57 0.52 0.82 0.91 0.83
0.62 0.33 0.85 0.32 0.26 0.37 0.39 0.35 1.0 0.3 0.34 0.24 0.3 0.35 0.25 0.21 0.28 0.31 0.67 0.34 0.45 0.82 0.4 0.88 0.42 0.45 0.47 0.53 0.65 0.46 0.48 0.44
0.5 0.34 0.88 0.28 0.29 0.39 0.34 0.36 1.0 0.27 0.37 0.25 0.33 0.4 0.26 0.21 0.27 0.27 0.84 0.34 0.38 0.74 0.34 0.95 0.4 0.44 0.51 0.61 0.58 0.45 0.46 0.46
Mp7g18190.1 (SH3P2)
0.72 0.79 0.94 0.51 0.42 0.68 0.82 0.63 0.93 0.53 0.84 0.88 0.82 0.73 0.53 0.67 0.54 0.56 1.0 0.5 0.64 0.99 0.62 0.9 0.58 0.7 0.57 0.74 0.81 0.91 0.81 0.73
0.51 0.34 1.0 0.2 0.15 0.42 0.34 0.34 0.91 0.2 0.56 0.41 0.38 0.28 0.24 0.18 0.2 0.23 1.0 0.28 0.41 0.91 0.25 0.67 0.4 0.44 0.35 0.5 0.59 0.74 0.7 0.65
Mp8g03190.1 (THO5)
0.8 0.77 0.95 0.7 0.61 0.71 0.79 0.77 0.89 0.66 0.96 0.79 0.82 0.65 0.69 0.76 0.67 0.69 1.0 0.66 0.7 0.96 0.8 0.79 0.68 0.77 0.72 0.81 0.86 0.89 0.89 0.76
Mp8g03230.1 (MAT2)
0.58 0.72 0.73 0.43 0.26 0.53 0.56 0.47 0.51 0.44 0.55 0.6 0.54 0.68 0.39 0.43 0.41 0.32 0.83 0.37 0.42 1.0 0.35 0.77 0.46 0.51 0.39 0.54 0.69 0.8 0.86 0.8
0.74 0.45 0.91 0.38 0.25 0.59 0.52 0.51 1.0 0.37 0.53 0.4 0.46 0.77 0.32 0.27 0.32 0.27 0.77 0.28 0.46 0.92 0.27 0.68 0.46 0.49 0.55 0.7 0.71 0.92 0.8 0.8
Mp8g12920.1 (ARL8c)
0.35 0.27 0.81 0.1 0.15 0.22 0.21 0.27 1.0 0.16 0.26 0.17 0.24 0.19 0.09 0.09 0.1 0.3 0.73 0.13 0.18 0.84 0.19 0.7 0.2 0.23 0.22 0.41 0.38 0.25 0.34 0.28
Mp8g14580.1 (STE24)
0.46 0.65 0.81 0.29 0.56 0.46 0.6 0.39 0.83 0.47 0.45 0.68 0.53 0.6 0.33 0.33 0.29 0.4 0.91 0.37 0.36 0.74 0.48 1.0 0.36 0.45 0.44 0.47 0.54 0.64 0.67 0.55
Mp8g17960.1 (UBC2)
0.9 0.53 0.96 0.48 0.54 0.72 0.77 0.67 0.98 0.66 0.54 0.73 0.51 0.88 0.47 0.6 0.46 0.57 0.85 0.49 0.64 1.0 0.64 0.93 0.6 0.75 0.6 0.8 0.92 0.93 0.83 0.77
0.65 0.32 0.79 0.35 0.27 0.34 0.53 0.42 1.0 0.46 0.31 0.44 0.27 0.94 0.27 0.41 0.26 0.25 0.67 0.23 0.33 0.96 0.34 0.72 0.3 0.42 0.39 0.52 0.6 0.66 0.66 0.65
Mpzg00030.1 (STE24)
0.33 0.52 0.63 0.21 0.34 0.31 0.29 0.3 0.67 0.34 0.49 0.5 0.49 0.45 0.23 0.23 0.23 0.28 1.0 0.28 0.24 0.67 0.3 1.0 0.27 0.29 0.26 0.3 0.38 0.52 0.52 0.47
0.74 0.62 0.78 0.53 0.51 0.67 0.69 0.62 1.0 0.53 0.81 0.58 0.69 0.58 0.57 0.55 0.54 0.54 0.87 0.54 0.63 0.85 0.6 0.8 0.68 0.71 0.55 0.67 0.75 0.81 0.74 0.68

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)