Heatmap: Cluster_68 (Marchantia polymorpha (Mpo) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Control
Cold (3°C)
Dark (3 days)
Heat (33°C)
Light (435 uEm-2s-1)
Osmotic (100 mM mannitol)
Nitrogen deficiency (0 mM KNO3)
Salt (40 mM NaCl)
Cold-Dark
Cold-Light
Cold-Mannitol
Cold-Nitrogen deficiency
Cold-Salt
Heat-Dark
Heat-Mannitol
Heat-Nitrogen deficiency
Heat-Salt
Light-Salt
Mannitol-Dark
Mannitol-Light
Mannitol-Nitrogen deficiency
Nitrogen deficiency-Dark
Nitrogen deficiency-Light
Salt-Dark
Salt-Mannitol
Salt-Nitrogen deficiency
ZT2 (2 hours after light)
ZT6 (6 hours after light)
ZT10 (10 hours after light)
ZT14 (2 hours after dark)
ZT18 (6 hours after dark)
ZT22 (10 hours after dark)
0.2 0.12 0.74 0.09 0.11 0.1 0.05 0.1 0.33 0.07 0.1 0.07 0.08 1.0 0.06 0.09 0.06 0.07 0.57 0.06 0.06 0.62 0.06 0.62 0.06 0.05 0.06 0.12 0.15 0.23 0.19 0.18
0.17 0.09 0.74 0.07 0.09 0.07 0.04 0.07 0.28 0.06 0.07 0.04 0.05 1.0 0.03 0.08 0.04 0.04 0.49 0.04 0.04 0.6 0.04 0.52 0.04 0.03 0.03 0.09 0.12 0.21 0.17 0.16
0.04 0.02 0.62 0.02 0.13 0.02 0.1 0.02 1.0 0.09 0.02 0.11 0.02 0.96 0.01 0.03 0.01 0.02 0.79 0.05 0.03 0.6 0.1 0.89 0.02 0.03 0.01 0.01 0.01 0.04 0.05 0.09
Mp1g17690.1 (PSBR)
0.02 0.0 0.76 0.1 0.01 0.01 0.03 0.02 0.21 0.0 0.0 0.01 0.0 1.0 0.11 0.16 0.14 0.01 0.56 0.01 0.01 0.7 0.02 0.7 0.01 0.01 0.01 0.02 0.04 0.05 0.07 0.04
Mp1g19860.1 (SPX3)
0.37 0.21 0.65 0.4 0.34 0.33 0.25 0.24 0.53 0.25 0.29 0.17 0.29 1.0 0.27 0.3 0.32 0.29 0.73 0.3 0.27 0.72 0.3 0.78 0.25 0.24 0.3 0.38 0.45 0.4 0.46 0.47
Mp1g19880.1 (SPX3)
0.37 0.21 0.65 0.4 0.34 0.33 0.25 0.24 0.53 0.25 0.29 0.17 0.29 1.0 0.27 0.3 0.32 0.29 0.73 0.3 0.27 0.72 0.3 0.78 0.25 0.24 0.3 0.38 0.45 0.4 0.46 0.47
Mp1g19890.1 (YLS9)
0.42 0.19 0.82 0.41 0.43 0.3 0.21 0.23 0.5 0.24 0.18 0.12 0.25 1.0 0.27 0.31 0.32 0.3 0.72 0.27 0.22 0.73 0.29 0.81 0.2 0.21 0.31 0.41 0.48 0.4 0.42 0.45
Mp1g21720.1 (MAT4)
0.34 0.12 0.49 0.21 0.25 0.18 0.24 0.17 0.29 0.15 0.08 0.13 0.09 1.0 0.18 0.22 0.17 0.19 0.52 0.21 0.14 0.47 0.21 0.5 0.15 0.16 0.11 0.17 0.24 0.33 0.3 0.26
0.34 0.3 0.59 0.27 0.25 0.29 0.25 0.25 0.82 0.28 0.34 0.33 0.3 1.0 0.22 0.21 0.21 0.26 0.67 0.25 0.27 0.59 0.27 0.76 0.25 0.29 0.24 0.3 0.34 0.36 0.42 0.42
0.29 0.26 0.66 0.33 0.3 0.32 0.32 0.28 0.8 0.35 0.39 0.27 0.34 1.0 0.32 0.41 0.29 0.25 0.97 0.34 0.33 0.76 0.29 0.94 0.34 0.3 0.25 0.29 0.3 0.43 0.44 0.42
Mp1g29050.1 (FUT2)
0.39 0.1 0.51 0.46 0.24 0.19 0.29 0.27 0.2 0.12 0.1 0.13 0.12 1.0 0.26 0.36 0.41 0.38 0.43 0.16 0.19 0.72 0.39 0.45 0.15 0.34 0.21 0.42 0.44 0.41 0.34 0.31
0.43 0.17 0.76 0.38 0.31 0.25 0.39 0.32 0.31 0.18 0.13 0.16 0.14 1.0 0.23 0.31 0.31 0.41 0.46 0.17 0.21 0.72 0.41 0.51 0.17 0.4 0.22 0.43 0.44 0.38 0.33 0.34
Mp1g29070.1 (RDM16)
0.41 0.14 0.72 0.39 0.32 0.27 0.4 0.3 0.38 0.19 0.17 0.21 0.16 1.0 0.25 0.4 0.33 0.41 0.54 0.19 0.26 0.82 0.49 0.64 0.21 0.41 0.25 0.44 0.43 0.41 0.34 0.35
Mp2g05250.1 (ECA4)
0.01 0.0 0.44 0.07 0.03 0.01 0.01 0.01 1.0 0.12 0.0 0.01 0.0 0.84 0.05 0.08 0.04 0.01 0.52 0.02 0.01 0.54 0.02 0.59 0.01 0.01 0.0 0.01 0.02 0.12 0.18 0.15
Mp2g09200.1 (TOC75-I)
0.14 0.03 0.78 0.05 0.05 0.05 0.09 0.05 0.7 0.07 0.03 0.07 0.03 1.0 0.03 0.06 0.04 0.04 0.54 0.04 0.06 0.57 0.07 0.68 0.04 0.08 0.03 0.07 0.14 0.26 0.29 0.2
Mp2g15780.1 (BBD1)
0.18 0.03 0.49 0.22 0.19 0.13 0.13 0.13 1.0 0.11 0.05 0.04 0.04 0.86 0.18 0.19 0.19 0.14 0.64 0.17 0.12 0.6 0.17 0.63 0.12 0.12 0.08 0.16 0.19 0.21 0.15 0.13
0.14 0.16 0.68 0.13 0.13 0.1 0.11 0.09 1.0 0.24 0.15 0.14 0.13 0.82 0.11 0.13 0.11 0.09 0.89 0.11 0.1 0.74 0.15 0.87 0.09 0.11 0.11 0.13 0.13 0.23 0.24 0.25
0.27 0.24 0.58 0.39 0.12 0.24 0.25 0.22 1.0 0.22 0.3 0.27 0.26 0.91 0.34 0.41 0.34 0.15 0.96 0.17 0.25 0.77 0.18 0.73 0.22 0.28 0.22 0.29 0.3 0.46 0.49 0.5
Mp3g00390.1 (ATL3)
0.26 0.21 0.46 0.21 0.17 0.2 0.26 0.2 0.7 0.19 0.22 0.29 0.23 1.0 0.19 0.2 0.2 0.21 0.54 0.19 0.2 0.62 0.25 0.5 0.18 0.22 0.16 0.21 0.23 0.36 0.34 0.32
0.25 0.18 0.48 0.24 0.18 0.19 0.23 0.18 0.84 0.21 0.23 0.28 0.23 1.0 0.23 0.19 0.24 0.21 0.58 0.21 0.21 0.69 0.26 0.52 0.19 0.28 0.14 0.2 0.25 0.35 0.32 0.3
Mp3g01150.1 (NFA3)
0.39 0.18 0.69 0.26 0.32 0.31 0.34 0.33 0.62 0.26 0.17 0.26 0.16 1.0 0.24 0.28 0.27 0.32 0.75 0.27 0.3 0.69 0.35 0.84 0.29 0.33 0.24 0.32 0.35 0.39 0.42 0.44
Mp3g03690.1 (ORG1)
0.25 0.14 0.61 0.19 0.23 0.14 0.23 0.12 0.85 0.25 0.13 0.3 0.21 0.88 0.12 0.21 0.16 0.15 0.83 0.13 0.16 0.61 0.24 1.0 0.1 0.19 0.1 0.19 0.18 0.28 0.32 0.38
Mp3g08950.1 (OTU2)
0.26 0.22 0.8 0.36 0.36 0.26 0.41 0.28 0.7 0.31 0.26 0.34 0.28 1.0 0.33 0.34 0.34 0.27 0.88 0.35 0.31 0.78 0.4 0.94 0.36 0.33 0.27 0.26 0.27 0.38 0.43 0.39
Mp3g11280.1 (PIRL3)
0.03 0.0 0.74 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.45 0.02 0.0 0.0 0.0 1.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.57 0.0 0.0 0.59 0.0 0.66 0.0 0.0 0.01 0.03 0.05 0.11 0.13 0.15
Mp3g15680.1 (PDI6)
0.13 0.05 0.7 0.1 0.16 0.09 0.2 0.14 0.41 0.07 0.03 0.13 0.05 1.0 0.09 0.17 0.12 0.2 0.56 0.09 0.11 0.6 0.24 0.71 0.07 0.13 0.13 0.12 0.12 0.18 0.36 0.28
Mp3g18280.1 (MMSD)
0.17 0.06 0.83 0.09 0.12 0.16 0.14 0.13 0.74 0.13 0.09 0.07 0.07 1.0 0.1 0.09 0.09 0.11 0.82 0.14 0.14 0.89 0.12 0.94 0.15 0.13 0.11 0.16 0.16 0.26 0.21 0.23
0.22 0.02 0.45 0.17 0.44 0.14 0.11 0.09 0.4 0.1 0.04 0.05 0.03 1.0 0.15 0.17 0.12 0.18 0.71 0.25 0.11 0.59 0.15 0.74 0.09 0.08 0.08 0.17 0.19 0.18 0.25 0.27
Mp3g24880.1 (CRK18)
0.13 0.01 0.94 0.13 0.02 0.01 0.01 0.03 0.75 0.06 0.01 0.0 0.01 1.0 0.06 0.06 0.09 0.01 0.59 0.02 0.01 0.65 0.01 0.74 0.02 0.01 0.03 0.22 0.35 0.44 0.21 0.22
Mp4g00710.1 (OCP3)
0.12 0.08 0.79 0.12 0.06 0.09 0.06 0.08 0.64 0.1 0.07 0.11 0.06 1.0 0.06 0.06 0.08 0.06 0.79 0.07 0.08 0.69 0.07 0.81 0.08 0.11 0.07 0.08 0.08 0.08 0.12 0.14
Mp4g03540.1 (XPO7)
0.1 0.01 0.63 0.03 0.14 0.02 0.02 0.03 0.04 0.09 0.01 0.01 0.01 1.0 0.02 0.02 0.02 0.02 0.47 0.03 0.02 0.48 0.04 0.5 0.02 0.02 0.01 0.02 0.02 0.2 0.07 0.11
Mp4g08080.1 (ARP8)
0.09 0.01 0.7 0.04 0.05 0.04 0.04 0.03 0.77 0.07 0.01 0.03 0.01 0.99 0.03 0.04 0.03 0.03 0.96 0.03 0.03 0.75 0.04 1.0 0.03 0.03 0.02 0.04 0.05 0.29 0.28 0.3
0.3 0.05 0.69 0.21 0.26 0.19 0.22 0.18 0.61 0.08 0.05 0.06 0.04 1.0 0.15 0.21 0.2 0.2 0.63 0.16 0.19 0.66 0.28 0.81 0.13 0.23 0.19 0.29 0.27 0.26 0.28 0.34
Mp4g17710.1 (CD2b)
0.32 0.16 0.52 0.26 0.37 0.29 0.34 0.27 0.62 0.19 0.23 0.23 0.2 1.0 0.26 0.3 0.27 0.39 0.9 0.33 0.31 0.79 0.46 0.92 0.29 0.39 0.3 0.32 0.33 0.26 0.37 0.35
0.2 0.19 0.61 0.1 0.13 0.14 0.13 0.1 0.92 0.19 0.15 0.12 0.13 1.0 0.06 0.11 0.08 0.1 0.5 0.09 0.1 0.59 0.12 0.62 0.1 0.12 0.16 0.23 0.25 0.1 0.17 0.12
Mp5g05890.1 (OSCA1.7)
0.27 0.1 0.57 0.28 0.27 0.19 0.1 0.18 0.53 0.38 0.14 0.04 0.12 1.0 0.19 0.16 0.21 0.14 0.73 0.21 0.15 0.54 0.14 0.67 0.17 0.14 0.19 0.26 0.25 0.4 0.34 0.34
0.23 0.17 0.44 0.14 0.07 0.15 0.08 0.1 0.73 0.13 0.15 0.06 0.11 1.0 0.14 0.17 0.13 0.07 0.47 0.09 0.13 0.54 0.1 0.46 0.13 0.13 0.12 0.16 0.17 0.23 0.3 0.31
Mp5g10090.1 (CCT1)
0.07 0.1 0.66 0.14 0.17 0.05 0.07 0.05 0.93 0.17 0.18 0.12 0.17 1.0 0.13 0.16 0.11 0.07 0.9 0.22 0.08 0.76 0.11 0.9 0.06 0.06 0.11 0.13 0.12 0.24 0.19 0.25
0.21 0.13 0.46 0.2 0.37 0.2 0.16 0.29 0.78 0.24 0.2 0.14 0.19 1.0 0.22 0.19 0.23 0.29 0.7 0.27 0.19 0.57 0.26 0.58 0.22 0.19 0.27 0.26 0.19 0.3 0.24 0.39
0.19 0.06 0.6 0.12 0.16 0.08 0.1 0.08 0.56 0.09 0.03 0.07 0.03 1.0 0.06 0.07 0.07 0.08 0.6 0.08 0.07 0.63 0.15 0.64 0.07 0.07 0.07 0.09 0.1 0.18 0.27 0.21
0.26 0.18 0.92 0.29 0.31 0.25 0.32 0.24 0.68 0.28 0.17 0.39 0.17 1.0 0.24 0.36 0.25 0.26 0.76 0.23 0.22 0.82 0.28 0.97 0.22 0.27 0.16 0.2 0.23 0.31 0.35 0.34
0.2 0.04 0.56 0.18 0.33 0.09 0.12 0.1 0.27 0.22 0.04 0.05 0.06 1.0 0.08 0.12 0.11 0.1 0.47 0.14 0.07 0.75 0.15 0.49 0.07 0.06 0.1 0.14 0.13 0.28 0.21 0.18
0.3 0.25 0.72 0.32 0.32 0.31 0.36 0.33 0.82 0.32 0.3 0.34 0.29 0.85 0.32 0.35 0.32 0.36 0.89 0.32 0.3 0.74 0.38 1.0 0.31 0.31 0.29 0.36 0.32 0.41 0.41 0.43
Mp7g10700.1 (H3.3)
0.17 0.08 0.4 0.12 0.01 0.23 0.18 0.17 0.78 0.03 0.1 0.1 0.11 1.0 0.13 0.16 0.11 0.11 0.3 0.11 0.23 0.82 0.09 0.59 0.26 0.23 0.11 0.14 0.23 0.23 0.2 0.15
Mp7g14650.1 (MCCB)
0.07 0.02 0.48 0.08 0.18 0.05 0.06 0.06 0.67 0.1 0.04 0.04 0.03 1.0 0.07 0.09 0.08 0.1 0.67 0.09 0.06 0.66 0.11 0.77 0.06 0.05 0.04 0.04 0.03 0.13 0.21 0.28
0.31 0.16 0.55 0.27 0.28 0.22 0.28 0.22 0.96 0.31 0.24 0.25 0.24 1.0 0.22 0.32 0.25 0.26 0.97 0.25 0.25 0.74 0.33 0.9 0.2 0.27 0.2 0.27 0.31 0.35 0.35 0.36
Mp7g16120.1 (SEND1)
0.4 0.36 0.71 0.4 0.38 0.31 0.38 0.3 1.0 0.44 0.35 0.39 0.35 0.9 0.36 0.44 0.39 0.34 0.98 0.33 0.3 0.78 0.41 0.93 0.28 0.34 0.31 0.38 0.37 0.48 0.49 0.43
Mp7g16130.1 (SC35)
0.43 0.3 0.6 0.5 0.38 0.31 0.41 0.32 1.0 0.49 0.41 0.43 0.35 0.97 0.38 0.51 0.45 0.44 0.95 0.38 0.36 0.9 0.5 0.84 0.36 0.43 0.34 0.38 0.41 0.48 0.48 0.46
Mp7g19240.1 (NAGS2)
0.29 0.03 0.62 0.14 0.03 0.03 0.04 0.09 0.33 0.1 0.02 0.02 0.01 1.0 0.06 0.08 0.11 0.03 0.48 0.02 0.03 0.61 0.01 0.36 0.02 0.03 0.04 0.08 0.11 0.26 0.15 0.2
0.21 0.04 0.77 0.11 0.21 0.04 0.06 0.04 0.14 0.14 0.01 0.04 0.03 1.0 0.01 0.05 0.02 0.02 0.31 0.02 0.02 0.78 0.1 0.46 0.01 0.05 0.08 0.12 0.1 0.1 0.12 0.19
Mp8g15290.1 (MCCA)
0.15 0.04 0.71 0.1 0.13 0.1 0.12 0.1 0.82 0.19 0.08 0.06 0.07 1.0 0.08 0.12 0.09 0.13 0.74 0.09 0.1 0.8 0.12 0.85 0.09 0.1 0.07 0.11 0.12 0.2 0.18 0.21
Mp8g16280.1 (CIP1)
0.15 0.04 0.47 0.12 0.24 0.12 0.15 0.11 0.76 0.08 0.06 0.09 0.05 1.0 0.12 0.17 0.14 0.17 0.69 0.16 0.14 0.54 0.24 0.79 0.12 0.16 0.15 0.07 0.07 0.12 0.19 0.3

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)