Heatmap: Cluster_79 (Marchantia polymorpha (Mpo) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Control
Cold (3°C)
Dark (3 days)
Heat (33°C)
Light (435 uEm-2s-1)
Osmotic (100 mM mannitol)
Nitrogen deficiency (0 mM KNO3)
Salt (40 mM NaCl)
Cold-Dark
Cold-Light
Cold-Mannitol
Cold-Nitrogen deficiency
Cold-Salt
Heat-Dark
Heat-Mannitol
Heat-Nitrogen deficiency
Heat-Salt
Light-Salt
Mannitol-Dark
Mannitol-Light
Mannitol-Nitrogen deficiency
Nitrogen deficiency-Dark
Nitrogen deficiency-Light
Salt-Dark
Salt-Mannitol
Salt-Nitrogen deficiency
ZT2 (2 hours after light)
ZT6 (6 hours after light)
ZT10 (10 hours after light)
ZT14 (2 hours after dark)
ZT18 (6 hours after dark)
ZT22 (10 hours after dark)
0.02 0.04 0.17 0.1 0.09 0.02 0.03 0.03 0.12 0.41 0.13 0.12 0.11 1.0 0.13 0.16 0.12 0.11 0.69 0.13 0.03 0.37 0.08 0.64 0.04 0.04 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01
0.23 0.2 0.24 0.19 0.28 0.16 0.26 0.19 0.18 0.4 0.15 0.39 0.18 1.0 0.17 0.28 0.19 0.26 0.39 0.2 0.17 0.3 0.34 0.42 0.15 0.19 0.14 0.14 0.15 0.28 0.35 0.4
0.74 0.53 0.71 0.75 0.66 0.7 0.77 0.66 0.85 0.82 0.66 0.6 0.68 1.0 0.77 0.84 0.82 0.89 0.8 0.62 0.64 0.82 0.85 0.71 0.63 0.82 0.66 0.76 0.73 0.69 0.75 0.67
Mp1g07380.1 (PIE1)
0.17 0.2 0.18 0.23 0.23 0.15 0.21 0.16 0.38 0.33 0.3 0.21 0.24 1.0 0.19 0.25 0.21 0.21 0.23 0.19 0.17 0.27 0.31 0.2 0.16 0.23 0.15 0.25 0.19 0.07 0.08 0.09
Mp1g07450.1 (KAM2)
0.74 0.46 0.66 0.73 0.68 0.59 0.73 0.55 0.65 0.69 0.63 0.63 0.57 1.0 0.54 0.77 0.68 0.72 0.74 0.6 0.6 0.75 0.83 0.66 0.56 0.78 0.57 0.72 0.76 0.63 0.56 0.49
Mp1g07920.1 (AtFDB27)
0.02 0.03 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.18 0.02 1.0 0.04 0.08 0.02 0.0 0.08 0.0 0.0 0.12 0.02 0.26 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0
0.12 0.43 0.04 0.08 0.05 0.15 0.05 0.09 0.3 0.31 0.42 0.19 0.34 1.0 0.11 0.24 0.09 0.07 0.05 0.09 0.09 0.04 0.09 0.06 0.07 0.15 0.15 0.04 0.06 0.03 0.06 0.13
0.28 0.26 0.3 0.33 0.18 0.18 0.26 0.17 0.43 0.37 0.33 0.38 0.32 1.0 0.36 0.39 0.36 0.29 0.38 0.3 0.21 0.32 0.41 0.34 0.26 0.32 0.22 0.19 0.19 0.2 0.21 0.26
Mp1g17110.1 (CCT2)
0.05 0.08 0.28 0.23 0.21 0.04 0.09 0.02 0.37 0.19 0.16 0.2 0.12 1.0 0.25 0.31 0.27 0.11 0.68 0.23 0.05 0.37 0.2 0.82 0.08 0.01 0.01 0.01 0.01 0.04 0.02 0.07
Mp1g24070.1 (TBP2)
0.41 0.51 0.28 0.7 0.38 0.37 0.38 0.33 0.56 0.42 0.57 0.66 0.56 1.0 0.51 0.63 0.56 0.46 0.37 0.37 0.35 0.31 0.51 0.3 0.34 0.43 0.4 0.41 0.37 0.32 0.37 0.44
Mp1g24190.1 (KCO6)
0.37 0.31 0.26 0.29 0.34 0.24 0.31 0.22 0.33 0.33 0.35 0.39 0.29 1.0 0.32 0.36 0.3 0.33 0.32 0.31 0.28 0.43 0.37 0.41 0.29 0.33 0.26 0.28 0.24 0.24 0.36 0.39
0.38 0.34 0.32 0.43 0.25 0.33 0.31 0.36 0.58 0.37 0.45 0.38 0.43 1.0 0.36 0.47 0.34 0.3 0.42 0.33 0.34 0.34 0.34 0.41 0.38 0.39 0.24 0.28 0.39 0.34 0.37 0.29
Mp1g25280.1 (LSM2)
0.44 0.53 0.33 0.5 0.53 0.48 0.51 0.42 0.39 0.47 0.54 0.6 0.5 1.0 0.47 0.58 0.42 0.46 0.37 0.48 0.48 0.42 0.55 0.36 0.5 0.49 0.34 0.42 0.43 0.3 0.26 0.27
0.05 0.06 0.18 0.18 0.19 0.07 0.07 0.06 0.26 0.43 0.09 0.08 0.11 1.0 0.12 0.19 0.13 0.13 0.25 0.15 0.08 0.14 0.15 0.39 0.09 0.08 0.07 0.03 0.03 0.04 0.05 0.05
Mp2g03240.1 (IMB3)
0.31 0.09 0.28 0.44 0.37 0.25 0.27 0.28 0.15 0.39 0.09 0.11 0.09 1.0 0.3 0.43 0.25 0.33 0.46 0.26 0.25 0.46 0.33 0.35 0.23 0.24 0.19 0.26 0.25 0.22 0.19 0.22
0.28 0.44 0.25 0.42 0.31 0.28 0.24 0.25 0.37 0.33 0.56 0.45 0.55 1.0 0.35 0.48 0.37 0.26 0.33 0.3 0.28 0.3 0.33 0.33 0.3 0.32 0.26 0.29 0.33 0.26 0.21 0.21
0.5 0.4 0.48 0.58 0.51 0.38 0.58 0.38 0.57 0.45 0.47 0.46 0.42 1.0 0.39 0.63 0.53 0.44 0.64 0.36 0.4 0.6 0.66 0.57 0.32 0.57 0.45 0.53 0.52 0.33 0.33 0.31
Mp2g17360.1 (ARID5)
0.58 0.54 0.72 0.62 0.58 0.54 0.63 0.51 0.63 0.47 0.56 0.72 0.52 1.0 0.56 0.77 0.56 0.55 0.78 0.57 0.51 0.73 0.73 0.72 0.51 0.62 0.55 0.63 0.64 0.51 0.5 0.46
Mp3g02830.1 (SRM1)
0.31 0.4 0.3 0.4 0.31 0.32 0.23 0.22 0.35 0.29 0.52 0.32 0.42 1.0 0.35 0.43 0.37 0.3 0.47 0.32 0.24 0.46 0.33 0.44 0.27 0.26 0.26 0.32 0.36 0.22 0.28 0.29
0.15 0.09 0.29 0.36 0.39 0.12 0.17 0.13 0.17 0.49 0.22 0.14 0.21 1.0 0.2 0.32 0.29 0.24 0.47 0.24 0.14 0.42 0.34 0.47 0.13 0.2 0.12 0.16 0.15 0.18 0.15 0.16
Mp3g10870.1 (SUC3)
0.6 0.51 0.58 0.62 0.45 0.46 0.58 0.48 0.74 0.63 0.68 0.6 0.73 1.0 0.52 0.66 0.55 0.5 0.7 0.49 0.48 0.63 0.58 0.65 0.47 0.53 0.54 0.58 0.58 0.56 0.54 0.55
Mp3g18300.1 (PRP18a)
0.32 0.35 0.33 0.41 0.33 0.29 0.32 0.27 0.58 0.27 0.44 0.39 0.4 1.0 0.37 0.42 0.38 0.34 0.44 0.38 0.34 0.39 0.38 0.48 0.32 0.37 0.36 0.37 0.38 0.25 0.27 0.25
Mp3g19570.1 (MKK4)
0.32 0.14 0.35 0.32 0.45 0.34 0.42 0.36 0.23 0.56 0.17 0.31 0.15 1.0 0.35 0.68 0.33 0.45 0.52 0.37 0.34 0.48 0.5 0.46 0.36 0.37 0.3 0.33 0.34 0.31 0.29 0.29
Mp3g21150.1 (KIN10)
0.5 0.64 0.48 0.51 0.43 0.45 0.51 0.43 0.67 0.41 0.72 0.65 0.72 1.0 0.45 0.56 0.48 0.44 0.55 0.41 0.43 0.52 0.53 0.57 0.41 0.48 0.52 0.53 0.54 0.39 0.39 0.36
Mp3g22050.1 (HTR14)
0.23 0.46 0.31 0.44 0.18 0.29 0.27 0.21 0.46 0.22 0.49 0.42 0.47 1.0 0.43 0.51 0.35 0.24 0.33 0.41 0.31 0.27 0.27 0.34 0.32 0.31 0.17 0.27 0.28 0.32 0.21 0.15
Mp3g22400.1 (SC35)
0.37 0.45 0.44 0.42 0.47 0.38 0.38 0.36 0.47 0.39 0.55 0.49 0.51 1.0 0.48 0.55 0.45 0.44 0.7 0.51 0.38 0.6 0.52 0.64 0.38 0.41 0.35 0.39 0.39 0.37 0.42 0.37
Mp4g04900.1 (RMR2)
0.33 0.2 0.39 0.4 0.42 0.27 0.41 0.26 0.43 0.68 0.17 0.25 0.17 1.0 0.31 0.65 0.38 0.29 0.56 0.26 0.24 0.45 0.4 0.54 0.21 0.31 0.22 0.38 0.39 0.27 0.24 0.2
Mp4g06190.1 (DDR3)
0.39 0.42 0.42 0.49 0.39 0.37 0.46 0.35 0.57 0.44 0.59 0.53 0.56 1.0 0.44 0.53 0.45 0.45 0.5 0.45 0.4 0.48 0.54 0.49 0.4 0.47 0.37 0.4 0.4 0.33 0.37 0.32
Mp4g06760.1 (RPA1A)
0.27 0.32 0.26 0.4 0.34 0.3 0.31 0.27 0.4 0.33 0.42 0.38 0.36 1.0 0.36 0.44 0.37 0.37 0.47 0.42 0.35 0.37 0.41 0.39 0.36 0.36 0.31 0.26 0.28 0.25 0.31 0.29
0.35 0.3 0.56 0.47 0.31 0.32 0.44 0.28 0.46 0.35 0.43 0.58 0.36 1.0 0.4 0.66 0.44 0.43 0.53 0.39 0.42 0.59 0.55 0.55 0.3 0.48 0.26 0.26 0.31 0.34 0.31 0.32
Mp4g15940.1 (SRP3)
0.13 0.18 0.38 0.3 0.26 0.17 0.18 0.14 0.42 0.3 0.38 0.2 0.4 1.0 0.25 0.36 0.27 0.24 0.49 0.29 0.17 0.35 0.24 0.59 0.21 0.17 0.13 0.12 0.14 0.09 0.06 0.06
Mp4g21020.1 (MSI1)
0.37 0.51 0.39 0.39 0.28 0.42 0.44 0.39 0.59 0.28 0.64 0.62 0.55 1.0 0.41 0.57 0.38 0.39 0.49 0.37 0.44 0.44 0.41 0.45 0.45 0.45 0.39 0.42 0.41 0.34 0.35 0.31
0.51 0.41 0.55 0.54 0.58 0.5 0.54 0.43 0.56 0.61 0.59 0.49 0.55 1.0 0.5 0.6 0.49 0.58 0.66 0.58 0.48 0.63 0.64 0.55 0.5 0.54 0.48 0.52 0.52 0.44 0.46 0.42
Mp6g04860.1 (CNGC14)
0.3 0.44 0.28 0.33 0.28 0.32 0.35 0.31 0.6 0.49 0.62 0.52 0.58 1.0 0.35 0.4 0.32 0.28 0.43 0.34 0.33 0.37 0.32 0.37 0.35 0.37 0.3 0.29 0.33 0.34 0.33 0.29
Mp6g09650.1 (PUB11)
0.11 0.05 0.13 0.14 0.08 0.06 0.09 0.05 0.21 0.32 0.05 0.12 0.05 1.0 0.11 0.13 0.08 0.09 0.17 0.04 0.04 0.24 0.09 0.21 0.06 0.07 0.03 0.03 0.07 0.06 0.05 0.06
0.54 0.5 0.52 0.52 0.42 0.46 0.51 0.4 0.58 0.46 0.78 0.57 0.8 1.0 0.5 0.64 0.55 0.51 0.65 0.46 0.43 0.57 0.65 0.61 0.42 0.52 0.47 0.47 0.49 0.44 0.52 0.56
Mp6g15610.1 (LTI45)
0.01 0.01 0.07 0.02 0.03 0.01 0.01 0.01 0.08 0.38 0.02 0.01 0.02 1.0 0.01 0.02 0.01 0.01 0.28 0.02 0.01 0.13 0.01 0.27 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.02 0.02 0.03
Mp6g15990.1 (SNS1)
0.47 0.51 0.47 0.6 0.48 0.45 0.4 0.42 0.59 0.49 0.64 0.53 0.53 1.0 0.61 0.59 0.55 0.49 0.65 0.54 0.47 0.66 0.55 0.68 0.48 0.5 0.46 0.46 0.5 0.5 0.6 0.57
Mp6g16510.1 (DAZ2)
0.06 0.58 0.17 0.11 0.12 0.13 0.15 0.14 0.84 0.1 0.45 0.35 0.45 1.0 0.17 0.2 0.13 0.1 0.21 0.08 0.12 0.16 0.09 0.09 0.08 0.11 0.09 0.1 0.08 0.06 0.1 0.06
Mp7g06110.1 (MSRB1)
0.18 0.19 0.17 0.25 0.29 0.16 0.26 0.17 0.22 0.5 0.16 0.27 0.19 1.0 0.23 0.42 0.27 0.3 0.29 0.28 0.19 0.2 0.36 0.34 0.17 0.22 0.29 0.24 0.17 0.18 0.23 0.29
Mp7g07410.1 (VAMP727)
0.5 0.39 0.55 0.43 0.53 0.48 0.58 0.5 0.43 0.51 0.4 0.56 0.41 1.0 0.44 0.59 0.41 0.57 0.55 0.51 0.47 0.58 0.55 0.53 0.48 0.52 0.34 0.43 0.51 0.47 0.37 0.31
Mp7g11630.1 (RDO2)
0.43 0.68 0.39 0.4 0.47 0.4 0.45 0.39 0.74 0.49 0.73 0.71 0.7 1.0 0.39 0.49 0.37 0.42 0.47 0.48 0.43 0.46 0.57 0.49 0.39 0.46 0.44 0.43 0.45 0.31 0.37 0.36
Mp7g19080.1 (PHO1)
0.16 0.14 0.24 0.33 0.38 0.14 0.24 0.16 0.37 0.59 0.21 0.23 0.2 1.0 0.28 0.39 0.31 0.3 0.42 0.23 0.2 0.27 0.39 0.48 0.18 0.25 0.15 0.16 0.12 0.17 0.27 0.43
Mp8g02260.1 (BRIP2)
0.04 0.01 0.14 0.11 0.04 0.01 0.03 0.02 0.05 0.13 0.0 0.02 0.01 0.96 0.09 0.19 0.07 0.02 1.0 0.06 0.05 0.29 0.1 0.66 0.0 0.04 0.01 0.02 0.01 0.01 0.09 0.02
Mp8g02500.1 (BGLU31)
0.17 0.14 0.19 0.08 0.13 0.13 0.24 0.12 0.34 0.28 0.18 0.2 0.15 1.0 0.1 0.18 0.09 0.13 0.24 0.14 0.16 0.31 0.27 0.24 0.16 0.18 0.09 0.09 0.11 0.13 0.15 0.16
0.36 0.49 0.28 0.43 0.42 0.39 0.48 0.39 0.55 0.45 0.61 0.54 0.58 1.0 0.43 0.65 0.43 0.45 0.37 0.44 0.42 0.36 0.52 0.4 0.43 0.46 0.45 0.41 0.43 0.27 0.28 0.25
Mp8g16410.1 (PFU2)
0.13 0.18 0.27 0.28 0.25 0.13 0.12 0.12 0.19 0.15 0.23 0.14 0.33 1.0 0.23 0.29 0.24 0.27 0.95 0.33 0.11 0.54 0.21 0.66 0.14 0.12 0.13 0.1 0.09 0.11 0.16 0.21

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)