Heatmap: Cluster_61 (Marchantia polymorpha (Mpo) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Control
Cold (3°C)
Dark (3 days)
Heat (33°C)
Light (435 uEm-2s-1)
Osmotic (100 mM mannitol)
Nitrogen deficiency (0 mM KNO3)
Salt (40 mM NaCl)
Cold-Dark
Cold-Light
Cold-Mannitol
Cold-Nitrogen deficiency
Cold-Salt
Heat-Dark
Heat-Mannitol
Heat-Nitrogen deficiency
Heat-Salt
Light-Salt
Mannitol-Dark
Mannitol-Light
Mannitol-Nitrogen deficiency
Nitrogen deficiency-Dark
Nitrogen deficiency-Light
Salt-Dark
Salt-Mannitol
Salt-Nitrogen deficiency
ZT2 (2 hours after light)
ZT6 (6 hours after light)
ZT10 (10 hours after light)
ZT14 (2 hours after dark)
ZT18 (6 hours after dark)
ZT22 (10 hours after dark)
Mp1g28620.1 (PIP2)
0.0 0.03 0.0 0.02 0.0 0.04 0.82 0.04 0.0 0.04 0.02 0.29 0.02 0.0 0.02 0.0 0.02 0.1 0.04 0.0 0.06 0.25 0.06 0.14 0.02 0.05 0.02 0.04 0.04 0.07 0.0 0.0
Mp1g28810.1 (NUP82)
0.01 0.05 0.0 0.02 0.01 0.11 2.84 0.04 0.0 0.0 0.01 1.34 0.03 0.0 0.02 0.33 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.94 0.0 0.01 0.25 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp1g28830.1 (NUP82)
0.07 0.02 0.01 0.09 0.01 0.12 7.54 0.09 0.0 0.19 0.03 5.44 0.16 0.02 0.01 1.75 0.03 0.0 0.0 0.02 0.17 0.21 2.0 0.0 0.04 1.36 0.09 0.03 0.03 0.03 0.03 0.0
1.31 2.6 1.17 0.2 23.48 2.15 415.62 6.18 0.53 77.48 0.18 289.07 1.89 0.06 0.69 51.22 0.57 77.92 0.01 7.22 19.1 2.76 190.76 0.95 5.1 27.9 0.22 0.0 0.01 0.11 0.43 0.18
Mp2g03370.1 (PTR5)
0.11 0.14 0.04 0.01 0.0 0.12 10.85 0.0 0.0 0.26 0.06 7.07 0.08 0.0 0.04 0.76 0.0 0.0 0.0 0.01 1.94 0.0 2.06 0.0 0.03 2.15 0.15 0.06 0.01 0.02 0.02 0.0
Mp2g03560.1 (PTR5)
0.47 0.31 0.0 0.12 0.05 0.08 8.82 0.01 0.0 1.01 0.14 6.23 0.31 0.01 0.04 1.43 0.05 0.02 0.0 0.07 2.18 0.04 4.87 0.0 0.18 0.65 0.12 0.1 0.08 0.04 0.17 0.04
Mp2g03610.1 (PTR5)
0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 8.9 0.0 0.0 0.18 0.08 6.74 0.05 0.01 0.1 0.95 0.03 0.01 0.0 0.01 2.3 0.0 3.64 0.02 0.0 0.36 0.07 0.03 0.0 0.0 0.05 0.0
Mp2g03620.1 (NPF5.13)
0.29 0.08 0.0 0.06 0.02 0.06 12.79 0.04 0.0 0.27 0.04 8.74 0.14 0.0 0.21 0.72 0.12 0.04 0.01 0.08 2.57 0.02 2.52 0.01 0.35 2.65 0.21 0.06 0.1 0.25 0.24 0.02
0.54 0.54 0.0 0.11 0.29 0.9 10.08 5.41 0.0 0.46 0.58 5.22 4.15 0.0 0.16 1.26 0.35 1.54 0.0 0.03 0.76 0.08 3.28 0.0 0.54 1.62 0.06 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0
Mp2g18120.1 (CYP76C2)
0.1 0.05 0.01 0.01 0.06 0.09 3.76 0.11 0.0 0.03 0.06 0.93 0.09 0.0 0.02 0.68 0.01 0.25 0.0 0.07 0.19 0.1 1.64 0.0 0.2 0.19 0.01 0.03 0.01 0.0 0.0 0.01
Mp3g04530.1 (ECS1)
0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 7.31 0.02 0.0 0.02 0.0 1.52 0.01 0.0 0.04 0.69 0.04 0.01 0.0 0.05 0.33 0.03 1.44 0.01 0.03 1.52 0.0 0.0 0.03 0.01 0.02 0.01
Mp3g04550.1 (ECS1)
0.04 0.01 0.01 0.0 0.02 0.01 0.89 0.0 0.0 0.01 0.0 0.22 0.0 0.0 0.01 0.04 0.0 0.0 0.0 0.01 0.04 0.0 0.09 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp3g04570.1 (ECS1)
0.03 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.88 0.0 0.0 0.0 0.01 0.35 0.0 0.0 0.02 0.12 0.02 0.0 0.0 0.0 0.11 0.01 0.41 0.0 0.0 0.24 0.01 0.0 0.0 0.0 0.07 0.01
0.01 0.01 0.0 0.04 0.05 0.02 21.75 0.04 0.0 0.06 0.02 4.84 0.05 0.0 0.19 2.77 0.15 0.12 0.02 0.41 1.71 0.1 5.45 0.02 0.04 3.91 0.0 0.01 0.0 0.0 0.03 0.0
0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 2.69 0.0 0.0 0.02 0.0 1.36 0.06 0.0 0.01 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.0 0.04 0.0 0.02 0.0 0.03 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 1.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.47 0.0 0.0 0.04 0.04 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
13.45 7.95 10.41 2.14 5.61 23.7 93.54 24.93 20.47 3.52 13.55 23.48 13.51 1.27 7.65 22.84 6.48 24.32 10.25 11.61 33.6 16.48 29.66 9.8 26.01 38.1 10.23 26.07 22.77 11.43 18.72 10.46
3.4 3.54 0.08 0.09 0.2 0.59 13.41 1.38 0.39 3.57 0.45 3.82 0.84 0.02 0.04 0.26 0.05 0.2 0.01 0.04 0.08 0.05 0.19 0.05 0.32 0.65 1.26 1.66 2.58 2.98 1.29 0.73
Mp3g16310.1 (PTR1)
0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.04 1.09 0.0 0.0 0.01 0.04 0.25 0.01 0.0 0.02 0.36 0.02 0.03 0.0 0.01 0.09 0.02 0.52 0.0 0.01 0.13 0.01 0.0 0.02 0.03 0.03 0.01
Mp3g19720.1 (ARC1)
1.02 1.45 0.38 0.17 1.41 2.03 52.19 1.53 0.6 1.95 1.15 17.48 1.56 0.01 0.11 6.91 0.16 5.7 0.11 0.87 1.43 1.63 14.51 0.02 4.36 1.64 0.47 0.43 0.49 0.54 0.38 0.31
Mp3g22010.1 (CFM4)
0.11 0.15 0.02 0.09 0.03 0.3 2.36 0.32 0.05 0.25 0.2 1.1 0.28 0.09 0.08 0.28 0.03 0.18 0.01 0.11 0.74 0.3 0.7 0.06 0.42 0.54 0.26 0.16 0.17 0.09 0.12 0.03
0.03 0.13 0.02 0.08 0.01 0.15 1.82 0.01 0.01 0.13 0.23 0.85 0.1 0.24 0.09 0.97 0.04 0.15 0.05 0.06 0.39 0.13 0.33 0.01 0.11 0.3 0.02 0.02 0.0 0.0 0.01 0.01
0.33 0.15 0.0 0.02 0.13 0.26 1.38 0.2 0.01 0.18 0.19 0.77 0.23 0.02 0.06 0.1 0.02 0.1 0.03 0.1 0.27 0.0 0.73 0.01 0.01 0.29 0.17 0.18 0.23 0.29 0.09 0.1
1.54 1.51 0.02 0.46 0.29 1.33 226.32 3.87 0.0 1.39 2.47 66.97 6.13 0.08 1.15 21.9 1.38 1.27 0.0 1.78 59.31 0.93 73.65 0.0 6.61 92.62 0.45 3.04 2.06 1.25 0.53 0.23
Mp4g04460.1 (PIP3)
3.66 3.09 0.02 0.18 0.34 1.34 29.6 0.09 0.05 6.59 2.14 22.85 1.07 0.01 0.08 2.24 0.09 0.85 0.0 0.11 5.67 0.26 6.17 0.0 0.05 4.31 0.61 0.47 0.41 0.65 0.22 0.21
Mp4g04470.1 (PIP3)
0.03 0.09 0.0 0.02 0.0 0.01 1.92 0.0 0.0 0.07 0.0 0.65 0.0 0.0 0.0 0.51 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.01 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.06 0.0 0.03 0.0 0.01 0.67 0.31 0.0 0.06 0.02 0.23 0.13 0.0 0.01 0.08 0.0 0.15 0.0 0.02 0.07 0.0 0.08 0.0 0.03 0.15 0.08 0.03 0.01 0.04 0.01 0.0
0.79 1.02 1.02 0.54 0.42 1.33 4.34 1.89 0.85 0.8 0.97 2.55 1.25 0.51 0.96 1.26 0.83 2.17 0.56 0.68 2.04 1.55 2.22 0.48 1.67 2.6 1.29 1.18 1.03 1.23 1.07 0.96
0.37 0.65 0.03 0.1 0.18 0.34 3.17 0.37 0.12 0.99 0.51 2.12 0.49 0.46 0.27 1.19 0.43 0.56 0.25 0.16 0.35 0.31 1.21 0.18 0.73 0.82 0.2 0.43 0.44 0.65 0.05 0.09
Mp4g09940.1 (PIR2)
0.88 0.89 0.17 5.97 3.57 3.05 27.11 3.38 0.04 0.99 1.31 1.93 1.08 0.84 9.52 15.83 7.08 4.0 0.43 5.93 8.43 0.13 8.99 0.39 4.28 6.6 1.42 1.09 0.71 1.42 2.23 1.63
0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.19 0.01 0.0 0.01 0.0 0.1 0.04 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.1 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0
Mp4g22670.1 (ACH2)
0.03 0.01 0.01 0.01 0.01 0.03 0.63 0.08 0.03 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.02 0.0 0.0 0.05 0.04 0.13 0.0 0.04 0.25 0.06 0.09 0.08 0.07 0.06 0.02
Mp5g01640.1 (PRX69)
3.79 3.62 0.13 1.3 0.52 3.93 28.68 1.86 0.3 6.31 2.46 19.69 1.32 0.17 0.74 8.1 0.28 0.66 0.18 0.57 3.76 0.07 10.95 0.0 0.23 5.62 2.66 1.66 1.23 1.86 1.78 1.34
Mp5g01690.1 (PRX69)
0.01 0.18 0.0 0.01 0.0 0.01 6.9 0.0 0.0 0.25 0.03 5.93 0.01 0.0 0.0 0.87 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 1.32 0.0 0.01 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.2 0.64 0.0 0.06 0.04 0.18 20.77 0.07 0.01 0.68 0.13 16.32 0.02 0.01 0.1 1.88 0.01 0.04 0.0 0.04 0.39 0.02 8.51 0.0 0.01 1.38 0.09 0.03 0.04 0.06 0.05 0.02
0.68 1.18 0.0 0.52 0.35 0.88 7.14 0.06 0.16 0.83 0.97 5.31 0.11 0.0 0.27 2.24 0.04 0.0 0.06 0.35 0.68 0.06 2.86 0.02 0.04 0.95 0.34 0.39 0.38 0.68 0.53 0.41
1.05 1.35 0.12 0.92 0.56 1.1 8.37 0.0 0.06 1.54 1.09 4.8 0.11 0.0 0.51 2.78 0.07 0.0 0.04 0.26 0.84 0.07 3.73 0.0 0.03 0.89 0.48 0.54 0.46 0.5 0.38 0.32
Mp5g12330.1 (GSM2)
0.16 0.18 0.0 0.02 0.02 0.07 0.64 0.08 0.0 0.37 0.07 0.21 0.04 0.0 0.0 0.02 0.03 0.02 0.0 0.0 0.06 0.01 0.02 0.01 0.0 0.18 0.03 0.05 0.15 0.41 0.04 0.01
1.35 8.39 11.51 0.54 3.55 0.49 100.14 0.51 13.84 1.46 0.69 45.16 0.89 0.53 0.4 11.09 0.34 5.6 0.76 0.91 2.36 32.17 34.13 2.07 0.89 6.53 0.31 0.3 0.32 0.28 0.28 0.21
12.44 13.99 10.74 5.05 22.03 7.6 221.18 7.95 16.6 15.59 5.2 105.22 6.2 2.91 3.41 24.38 3.86 40.27 9.05 13.26 44.81 16.07 114.59 9.32 12.5 62.73 3.16 3.92 4.62 8.23 8.36 4.47
15.04 17.72 1.36 1.18 16.36 17.94 78.43 10.95 0.54 3.32 3.63 17.5 5.23 0.06 2.32 14.43 2.96 4.77 0.27 6.6 3.07 3.61 43.46 0.0 1.61 3.45 4.01 1.34 1.1 2.11 1.99 2.68
7.57 6.2 0.1 0.29 4.51 5.25 38.19 2.85 0.2 1.83 0.62 6.7 1.62 0.02 0.29 3.32 0.62 0.92 0.22 0.59 0.76 2.25 13.47 0.03 0.18 1.05 0.58 0.13 0.28 0.76 0.59 0.59
7.45 6.56 0.41 0.12 2.26 5.14 22.85 2.76 0.04 2.23 0.38 4.4 0.78 0.2 0.1 2.08 0.18 1.17 0.0 0.18 0.82 0.93 4.16 0.0 0.04 0.41 1.5 0.39 0.57 0.67 0.46 0.54
2.44 0.97 0.0 0.0 2.2 0.18 14.93 0.16 0.0 0.08 0.03 4.03 0.0 0.0 0.0 0.5 0.03 0.06 0.0 0.0 0.0 0.2 6.3 0.0 0.05 0.18 0.0 0.03 0.03 0.04 0.0 0.04
3.87 3.01 0.87 1.04 2.56 7.93 275.78 4.22 1.97 4.35 13.9 153.37 13.0 0.3 5.02 179.58 5.1 4.58 0.56 17.29 26.99 17.81 30.9 0.3 6.73 7.07 1.97 2.19 1.55 1.46 0.59 0.63
0.0 0.0 0.29 0.0 0.01 0.0 9.6 0.06 0.0 0.0 0.0 3.61 0.0 0.0 0.02 0.3 0.06 0.01 0.0 0.0 0.13 0.24 3.03 0.03 0.19 0.64 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05
0.03 0.03 0.0 0.22 0.09 0.0 3.8 0.0 0.22 0.12 0.03 2.8 0.0 0.03 0.36 0.83 0.25 0.14 0.03 0.0 0.09 0.08 1.26 0.03 0.0 0.33 0.0 0.03 0.0 0.04 0.03 0.0
0.06 0.2 0.06 0.0 0.04 0.1 15.34 0.06 0.16 0.31 0.04 11.4 0.14 0.0 0.01 2.42 0.04 0.07 0.0 0.06 0.67 0.08 5.95 0.01 0.09 1.34 0.0 0.01 0.04 0.02 0.0 0.06
0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.04 5.27 0.0 0.0 0.0 0.04 1.69 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.03 1.34 0.0 0.01 0.16 0.0 0.02 0.04 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.0 0.0 0.04 0.0 0.19 0.01 0.0 0.01 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp6g20660.1 (GL22)
0.03 0.28 0.0 0.0 0.0 0.15 5.96 0.03 0.0 0.0 0.0 0.35 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.45 0.0 0.0 0.0 0.0 1.41 0.0 0.68 0.3 0.0 0.07 0.05 0.2 0.0 0.07
Mp7g00710.1 (KT12)
0.2 0.08 0.01 0.25 0.21 0.29 3.08 0.27 0.04 0.17 0.14 0.34 0.09 0.05 0.32 1.49 0.33 0.59 0.1 0.53 0.56 0.05 0.99 0.07 0.35 0.6 0.17 0.23 0.15 0.14 0.11 0.12
Mp7g10790.1 (NADP-ME2)
0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.19 0.01 0.0 0.01 0.02 0.06 0.03 0.01 0.01 0.03 0.02 0.02 0.03 0.02 0.04 0.03 0.03 0.0 0.04 0.02 0.02 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01
0.26 0.13 0.11 1.65 0.48 1.09 39.4 1.18 0.01 0.16 1.08 11.3 1.44 0.26 2.13 7.99 2.13 1.13 0.27 1.56 10.67 0.26 11.86 0.23 4.69 16.42 0.42 0.57 0.15 0.14 0.18 0.1
0.06 0.05 0.17 0.24 0.16 0.05 5.65 0.16 0.28 0.05 0.09 4.31 0.2 0.01 0.32 0.66 0.31 0.13 0.17 0.13 0.16 0.8 2.93 0.04 0.19 0.71 0.09 0.03 0.04 0.08 0.03 0.12
8.48 7.92 1.37 23.67 25.44 7.42 240.52 8.6 0.71 17.8 2.37 37.75 5.65 0.77 5.44 150.58 15.3 16.07 0.38 8.91 35.02 4.25 95.13 0.36 2.42 33.85 2.22 3.87 2.45 9.58 4.14 2.26
Mp8g05000.1 (SAP130b)
0.11 1.13 0.01 0.36 0.57 0.2 10.31 0.5 0.13 2.45 1.38 5.69 3.92 0.0 0.47 2.69 0.87 1.71 0.01 1.49 0.51 0.31 3.28 0.0 0.34 0.48 0.21 0.03 0.11 0.0 0.01 0.02
0.86 1.25 0.42 0.56 0.4 0.79 7.42 1.75 1.7 0.54 0.8 2.01 1.32 1.08 1.23 3.08 1.02 1.96 0.46 1.22 1.52 1.76 3.33 0.5 1.25 2.31 0.55 0.52 0.44 0.52 0.52 0.42
Mp8g16680.1 (ABI8)
0.71 0.35 0.0 0.0 0.7 0.22 13.51 0.0 0.0 0.25 0.02 1.0 0.1 0.04 0.0 2.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.14 3.38 0.0 0.0 0.1 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0
Mp8g16690.1 (CYP705A2)
0.37 0.22 0.0 0.03 0.16 0.07 5.72 0.0 0.0 0.11 0.17 0.35 0.03 0.0 0.01 1.08 0.0 0.01 0.01 0.0 0.06 0.0 1.37 0.0 0.03 0.09 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp8g16710.1 (PMS1)
24.38 37.26 2.76 6.9 7.42 6.53 73.26 40.16 4.63 28.37 6.41 49.84 31.12 0.18 1.69 17.82 5.76 14.93 1.01 0.95 5.48 1.0 32.01 0.33 4.01 10.59 20.96 16.59 17.08 18.15 10.33 9.02
1.46 1.54 0.13 0.08 1.67 0.28 37.22 2.48 0.02 0.42 0.05 6.34 2.04 0.0 0.04 11.91 0.47 3.3 0.0 0.1 0.14 0.04 12.28 0.08 0.45 0.13 0.45 0.27 0.06 0.18 0.06 0.19
0.58 0.63 0.14 1.65 0.51 5.14 11.36 1.56 0.1 1.12 0.91 1.39 0.35 0.31 1.85 2.63 1.04 1.26 0.69 0.49 0.75 0.52 2.17 0.68 0.82 1.34 0.62 1.73 1.55 1.48 1.27 1.12
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.0 0.0 0.04 0.0 0.19 0.01 0.0 0.01 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.0 0.0 0.02 0.01 0.01 5.12 0.28 0.04 0.05 0.01 0.91 0.16 0.0 0.02 1.45 0.08 0.01 0.0 0.0 0.0 0.04 0.62 0.0 0.0 0.04 0.03 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0
0.01 0.0 0.0 0.02 0.01 0.01 5.12 0.28 0.04 0.05 0.01 0.91 0.16 0.0 0.02 1.45 0.08 0.01 0.0 0.0 0.0 0.04 0.62 0.0 0.0 0.04 0.03 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0
0.06 0.33 0.0 0.69 0.14 0.06 9.13 0.12 0.02 0.13 0.12 1.69 0.29 0.02 0.5 5.43 0.83 0.32 0.0 0.3 0.02 0.09 1.05 0.04 0.09 0.02 0.09 0.06 0.0 0.0 0.02 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)