Heatmap: Cluster_64 (Marchantia polymorpha (Mpo) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Control
Cold (3°C)
Dark (3 days)
Heat (33°C)
Light (435 uEm-2s-1)
Osmotic (100 mM mannitol)
Nitrogen deficiency (0 mM KNO3)
Salt (40 mM NaCl)
Cold-Dark
Cold-Light
Cold-Mannitol
Cold-Nitrogen deficiency
Cold-Salt
Heat-Dark
Heat-Mannitol
Heat-Nitrogen deficiency
Heat-Salt
Light-Salt
Mannitol-Dark
Mannitol-Light
Mannitol-Nitrogen deficiency
Nitrogen deficiency-Dark
Nitrogen deficiency-Light
Salt-Dark
Salt-Mannitol
Salt-Nitrogen deficiency
ZT2 (2 hours after light)
ZT6 (6 hours after light)
ZT10 (10 hours after light)
ZT14 (2 hours after dark)
ZT18 (6 hours after dark)
ZT22 (10 hours after dark)
Mp1g00270.1 (LOG4)
0.04 0.07 0.14 0.02 0.06 0.05 0.03 0.05 1.0 0.11 0.12 0.03 0.11 0.02 0.01 0.01 0.02 0.04 0.14 0.07 0.05 0.19 0.06 0.19 0.09 0.05 0.09 0.05 0.05 0.02 0.02 0.02
Mp1g00620.1 (STP11)
0.28 0.22 0.23 0.07 0.25 0.24 0.44 0.25 1.0 0.37 0.25 0.24 0.25 0.06 0.09 0.15 0.1 0.2 0.14 0.24 0.24 0.34 0.3 0.14 0.25 0.33 0.14 0.24 0.32 0.34 0.3 0.22
Mp1g02380.1 (BOP2)
0.33 0.26 0.45 0.23 0.23 0.3 0.42 0.28 1.0 0.23 0.3 0.44 0.3 0.21 0.24 0.28 0.23 0.26 0.43 0.31 0.34 0.49 0.38 0.35 0.36 0.4 0.22 0.31 0.41 0.32 0.39 0.23
0.03 0.01 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.02
Mp1g23130.1 (PSAN)
0.17 0.11 0.25 0.06 0.03 0.11 0.2 0.12 1.0 0.12 0.08 0.29 0.09 0.02 0.02 0.05 0.03 0.08 0.13 0.03 0.16 0.23 0.09 0.1 0.09 0.21 0.05 0.14 0.23 0.11 0.12 0.05
Mp1g23140.1 (AGO5)
0.15 0.1 0.33 0.05 0.03 0.1 0.19 0.1 1.0 0.12 0.06 0.26 0.08 0.02 0.02 0.04 0.03 0.07 0.12 0.02 0.13 0.23 0.08 0.1 0.08 0.2 0.05 0.13 0.22 0.12 0.1 0.06
0.35 0.41 0.32 0.35 0.27 0.3 0.35 0.29 1.0 0.32 0.36 0.37 0.3 0.36 0.3 0.34 0.33 0.26 0.4 0.26 0.29 0.37 0.32 0.35 0.29 0.35 0.36 0.41 0.38 0.27 0.28 0.25
0.31 0.34 0.39 0.19 0.22 0.3 0.36 0.27 1.0 0.28 0.36 0.32 0.37 0.27 0.19 0.24 0.2 0.26 0.38 0.23 0.27 0.33 0.31 0.42 0.27 0.31 0.32 0.3 0.31 0.25 0.32 0.37
Mp1g25990.1 (AGF2)
0.02 0.07 0.05 0.02 0.01 0.04 0.01 0.01 1.0 0.14 0.08 0.03 0.06 0.03 0.04 0.02 0.03 0.02 0.1 0.04 0.02 0.06 0.02 0.07 0.01 0.01 0.01 0.02 0.03 0.03 0.03 0.04
Mp1g29330.1 (LAX2)
0.21 0.23 0.32 0.07 0.06 0.14 0.17 0.13 1.0 0.04 0.17 0.12 0.11 0.08 0.07 0.06 0.07 0.09 0.3 0.09 0.13 0.45 0.14 0.25 0.11 0.19 0.16 0.29 0.24 0.19 0.19 0.13
Mp2g02210.1 (AtUSP)
0.04 0.01 0.13 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 1.0 0.12 0.01 0.0 0.01 0.2 0.01 0.0 0.01 0.0 0.13 0.0 0.01 0.12 0.0 0.18 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.03 0.03 0.05
0.2 0.29 0.2 0.25 0.26 0.17 0.31 0.19 1.0 0.39 0.3 0.33 0.24 0.39 0.27 0.37 0.26 0.32 0.27 0.23 0.16 0.18 0.28 0.18 0.18 0.19 0.15 0.17 0.17 0.14 0.15 0.18
0.19 0.2 0.21 0.26 0.2 0.16 0.26 0.18 1.0 0.34 0.26 0.34 0.21 0.44 0.24 0.45 0.26 0.29 0.3 0.23 0.18 0.23 0.29 0.26 0.18 0.19 0.14 0.14 0.15 0.12 0.16 0.18
0.32 0.37 0.42 0.29 0.39 0.3 0.3 0.31 1.0 0.37 0.43 0.38 0.4 0.54 0.25 0.27 0.26 0.34 0.41 0.28 0.29 0.48 0.4 0.43 0.27 0.33 0.29 0.31 0.34 0.26 0.26 0.24
0.01 0.01 0.15 0.02 0.02 0.01 0.01 0.01 1.0 0.07 0.02 0.03 0.01 0.05 0.02 0.01 0.01 0.01 0.23 0.03 0.02 0.16 0.01 0.19 0.02 0.02 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0
Mp2g13330.1 (TGA2)
0.31 0.3 0.39 0.22 0.29 0.21 0.19 0.19 1.0 0.29 0.33 0.25 0.34 0.53 0.14 0.18 0.17 0.21 0.36 0.21 0.21 0.42 0.26 0.34 0.19 0.22 0.23 0.22 0.28 0.14 0.17 0.21
0.2 0.26 0.32 0.16 0.12 0.07 0.09 0.04 1.0 0.28 0.22 0.25 0.2 0.33 0.08 0.1 0.07 0.06 0.22 0.11 0.07 0.26 0.09 0.21 0.04 0.09 0.22 0.24 0.16 0.06 0.07 0.09
Mp2g17190.1 (MLP28)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.18 0.14 0.31 0.15 0.25 0.07 0.1 0.04 0.81 0.13 0.04 0.08 0.12 1.0 0.09 0.16 0.11 0.01 0.3 0.06 0.11 0.16 0.04 0.24 0.04 0.03 0.06 0.09 0.17 0.23 0.23 0.23
Mp2g24330.1 (TOL8)
0.49 0.46 0.44 0.39 0.41 0.44 0.43 0.43 1.0 0.39 0.52 0.47 0.42 0.51 0.34 0.37 0.35 0.38 0.39 0.35 0.39 0.41 0.41 0.37 0.39 0.44 0.44 0.52 0.52 0.35 0.34 0.33
Mp3g12590.1 (ICME-LIKE2)
0.26 0.26 0.17 0.07 0.08 0.1 0.11 0.07 1.0 0.23 0.14 0.18 0.08 0.06 0.05 0.04 0.04 0.07 0.11 0.02 0.05 0.12 0.07 0.05 0.01 0.12 0.12 0.15 0.25 0.23 0.21 0.14
Mp3g12600.1 (ICME-LIKE2)
0.17 0.2 0.24 0.06 0.09 0.18 0.14 0.16 1.0 0.05 0.1 0.24 0.16 0.12 0.04 0.08 0.04 0.14 0.05 0.09 0.15 0.0 0.16 0.14 0.05 0.1 0.12 0.15 0.14 0.18 0.11 0.17
0.09 0.06 0.09 0.18 0.03 0.08 0.08 0.07 1.0 0.06 0.08 0.08 0.07 0.05 0.06 0.06 0.09 0.06 0.06 0.06 0.08 0.05 0.06 0.06 0.1 0.14 0.06 0.12 0.17 0.04 0.04 0.03
0.06 0.11 0.08 0.04 0.04 0.05 0.16 0.05 1.0 0.27 0.07 0.41 0.08 0.07 0.04 0.11 0.03 0.08 0.06 0.08 0.07 0.1 0.12 0.05 0.06 0.08 0.03 0.03 0.03 0.05 0.07 0.08
0.09 0.02 0.19 0.02 0.02 0.06 0.06 0.12 1.0 0.04 0.02 0.03 0.03 0.17 0.02 0.02 0.01 0.27 0.19 0.02 0.05 0.34 0.03 0.19 0.03 0.05 0.03 0.04 0.03 0.08 0.14 0.08
0.01 0.02 0.07 0.08 0.15 0.01 0.02 0.01 1.0 0.42 0.01 0.03 0.01 0.69 0.02 0.08 0.02 0.02 0.06 0.03 0.01 0.07 0.06 0.07 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01
0.35 0.37 0.24 0.23 0.29 0.29 0.34 0.29 1.0 0.42 0.36 0.43 0.32 0.21 0.24 0.24 0.24 0.28 0.21 0.28 0.29 0.27 0.37 0.22 0.26 0.34 0.35 0.35 0.35 0.35 0.45 0.35
Mp4g12420.1 (BIM3)
0.26 0.33 0.34 0.11 0.2 0.22 0.21 0.22 1.0 0.21 0.35 0.41 0.33 0.15 0.11 0.11 0.11 0.18 0.28 0.21 0.2 0.3 0.23 0.26 0.19 0.19 0.28 0.26 0.22 0.12 0.14 0.17
Mp4g14240.1 (PKP1)
0.25 0.28 0.29 0.19 0.21 0.23 0.25 0.22 1.0 0.23 0.37 0.27 0.33 0.24 0.23 0.29 0.21 0.25 0.37 0.32 0.24 0.33 0.23 0.36 0.26 0.25 0.2 0.23 0.29 0.29 0.37 0.36
Mp4g21100.1 (MSL5)
0.09 0.16 0.05 0.16 0.07 0.06 0.04 0.06 1.0 0.09 0.18 0.08 0.12 0.73 0.07 0.17 0.07 0.05 0.03 0.09 0.06 0.03 0.05 0.02 0.07 0.05 0.1 0.07 0.07 0.04 0.04 0.04
Mp4g21750.1 (HTA3)
0.06 0.11 0.14 0.05 0.04 0.08 0.07 0.07 1.0 0.1 0.2 0.14 0.16 0.03 0.07 0.06 0.06 0.06 0.22 0.13 0.09 0.13 0.07 0.12 0.13 0.09 0.05 0.06 0.08 0.07 0.05 0.05
Mp4g21800.1 (AHL19)
0.19 0.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.11 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.05 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.13 0.14
Mp5g02690.1 (mMDH2)
0.04 0.04 0.2 0.03 0.06 0.01 0.09 0.01 1.0 0.03 0.01 0.16 0.02 0.13 0.04 0.03 0.03 0.0 0.03 0.03 0.04 0.1 0.02 0.04 0.0 0.01 0.0 0.02 0.03 0.03 0.04 0.05
Mp5g12460.1 (UGT73C7)
0.06 0.03 0.15 0.03 0.02 0.06 0.03 0.08 1.0 0.09 0.02 0.02 0.03 0.79 0.03 0.04 0.03 0.1 0.09 0.02 0.03 0.15 0.02 0.1 0.04 0.03 0.05 0.04 0.06 0.07 0.1 0.11
Mp5g17270.1 (NPH3)
0.3 0.37 0.31 0.16 0.28 0.22 0.13 0.19 1.0 0.22 0.32 0.19 0.31 0.17 0.13 0.12 0.14 0.19 0.27 0.21 0.18 0.3 0.23 0.36 0.16 0.2 0.25 0.26 0.28 0.31 0.45 0.43
Mp5g17640.1 (IREH1)
0.23 0.3 0.31 0.22 0.26 0.2 0.28 0.2 1.0 0.5 0.35 0.43 0.33 0.52 0.21 0.28 0.21 0.23 0.43 0.22 0.22 0.36 0.29 0.4 0.21 0.27 0.21 0.24 0.23 0.22 0.22 0.21
0.33 0.34 0.25 0.23 0.24 0.31 0.44 0.26 1.0 0.24 0.3 0.35 0.23 0.26 0.28 0.33 0.26 0.23 0.18 0.18 0.28 0.22 0.32 0.17 0.22 0.35 0.27 0.29 0.33 0.2 0.22 0.23
Mp5g19290.1 (WCRKC1)
0.16 0.12 0.12 0.28 0.09 0.09 0.09 0.13 1.0 0.18 0.13 0.06 0.1 0.61 0.21 0.15 0.23 0.12 0.12 0.11 0.11 0.11 0.1 0.12 0.09 0.11 0.2 0.3 0.27 0.22 0.15 0.11
0.03 0.01 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.02
Mp5g21960.1 (DiT1)
0.25 0.33 0.41 0.13 0.08 0.16 0.45 0.24 1.0 0.41 0.35 0.3 0.4 0.19 0.14 0.14 0.16 0.25 0.25 0.13 0.23 0.29 0.13 0.27 0.22 0.31 0.16 0.2 0.18 0.2 0.23 0.26
Mp5g24380.1 (BRF2)
0.16 0.28 0.13 0.09 0.23 0.22 0.21 0.14 1.0 0.35 0.19 0.41 0.17 0.14 0.08 0.19 0.14 0.18 0.08 0.11 0.33 0.15 0.38 0.11 0.16 0.22 0.1 0.15 0.08 0.17 0.2 0.21
Mp6g02920.1 (EXT8)
0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 1.0 0.09 0.02 0.01 0.05 0.0 0.02 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0
0.08 0.14 0.07 0.08 0.05 0.11 0.04 0.1 1.0 0.06 0.23 0.07 0.26 0.07 0.12 0.08 0.11 0.07 0.17 0.1 0.1 0.09 0.06 0.12 0.1 0.07 0.09 0.31 0.2 0.13 0.1 0.12
0.04 0.16 0.02 0.09 0.06 0.05 0.05 0.05 1.0 0.04 0.05 0.02 0.04 0.01 0.09 0.09 0.11 0.1 0.0 0.04 0.07 0.01 0.09 0.01 0.04 0.06 0.11 0.04 0.01 0.01 0.0 0.02
Mp6g20450.1 (CML3)
0.07 0.24 0.19 0.07 0.04 0.03 0.06 0.05 1.0 0.25 0.16 0.19 0.15 0.59 0.07 0.2 0.07 0.05 0.18 0.03 0.02 0.18 0.04 0.24 0.03 0.04 0.03 0.04 0.04 0.06 0.07 0.06
0.08 0.04 0.22 0.11 0.02 0.04 0.21 0.1 1.0 0.04 0.01 0.1 0.02 0.17 0.04 0.15 0.05 0.41 0.1 0.01 0.09 0.24 0.08 0.13 0.03 0.12 0.06 0.12 0.1 0.1 0.11 0.08
0.12 0.15 0.18 0.11 0.06 0.11 0.1 0.08 1.0 0.27 0.23 0.25 0.12 0.39 0.07 0.27 0.09 0.05 0.31 0.08 0.14 0.33 0.09 0.33 0.08 0.15 0.06 0.08 0.12 0.1 0.12 0.13
Mp7g01930.1 (PP2-A15)
0.14 0.1 0.15 0.0 0.05 0.06 0.04 0.11 1.0 0.23 0.04 0.07 0.06 0.04 0.1 0.06 0.06 0.1 0.25 0.04 0.03 0.21 0.01 0.11 0.06 0.08 0.03 0.02 0.05 0.06 0.13 0.19
Mp7g02370.1 (LHL1)
0.31 0.24 0.25 0.34 0.25 0.23 0.31 0.29 1.0 0.28 0.27 0.17 0.26 0.35 0.31 0.41 0.39 0.33 0.29 0.22 0.23 0.27 0.22 0.25 0.21 0.27 0.39 0.58 0.41 0.23 0.25 0.19
Mp7g05260.1 (PGP16)
0.01 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01
Mp7g08130.1 (DEG24)
0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.05 0.06 0.1 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp7g09870.1 (DEG9)
0.09 0.16 0.32 0.1 0.06 0.09 0.07 0.07 1.0 0.07 0.23 0.11 0.15 0.1 0.09 0.11 0.07 0.06 0.28 0.07 0.09 0.3 0.07 0.17 0.1 0.11 0.09 0.1 0.1 0.07 0.06 0.07
Mp7g10100.1 (PP2C.D6)
0.4 0.51 0.37 0.42 0.36 0.37 0.46 0.36 1.0 0.33 0.47 0.44 0.46 0.4 0.37 0.44 0.4 0.32 0.39 0.35 0.37 0.36 0.41 0.36 0.35 0.41 0.38 0.4 0.4 0.43 0.38 0.37
Mp7g12600.1 (NPF5.11)
0.11 0.19 0.4 0.25 0.19 0.09 0.23 0.09 1.0 0.32 0.11 0.28 0.14 0.49 0.17 0.44 0.2 0.15 0.36 0.17 0.09 0.39 0.26 0.39 0.09 0.09 0.13 0.12 0.1 0.12 0.16 0.17
Mp7g17640.1 (LOI1)
0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 1.0 0.3 0.02 0.06 0.01 0.39 0.0 0.01 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.02 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.02 0.02 0.03 0.03 0.01 0.01 0.0 1.0 0.09 0.02 0.08 0.03 0.04 0.03 0.07 0.03 0.02 0.09 0.03 0.01 0.02 0.05 0.05 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
0.04 0.15 0.06 0.11 0.01 0.03 0.04 0.04 1.0 0.14 0.08 0.1 0.1 0.04 0.1 0.21 0.13 0.04 0.02 0.01 0.04 0.04 0.02 0.02 0.03 0.03 0.04 0.04 0.04 0.03 0.03 0.02

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)