Heatmap: Cluster_31 (Marchantia polymorpha (Mpo) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Control
Cold (3°C)
Dark (3 days)
Heat (33°C)
Light (435 uEm-2s-1)
Osmotic (100 mM mannitol)
Nitrogen deficiency (0 mM KNO3)
Salt (40 mM NaCl)
Cold-Dark
Cold-Light
Cold-Mannitol
Cold-Nitrogen deficiency
Cold-Salt
Heat-Dark
Heat-Mannitol
Heat-Nitrogen deficiency
Heat-Salt
Light-Salt
Mannitol-Dark
Mannitol-Light
Mannitol-Nitrogen deficiency
Nitrogen deficiency-Dark
Nitrogen deficiency-Light
Salt-Dark
Salt-Mannitol
Salt-Nitrogen deficiency
ZT2 (2 hours after light)
ZT6 (6 hours after light)
ZT10 (10 hours after light)
ZT14 (2 hours after dark)
ZT18 (6 hours after dark)
ZT22 (10 hours after dark)
0.6 0.52 0.43 0.66 0.67 0.59 0.55 0.65 1.0 0.62 0.71 0.54 0.7 0.45 0.68 0.72 0.64 0.76 0.71 0.72 0.67 0.57 0.81 0.58 0.67 0.66 0.72 0.73 0.64 0.73 0.74 0.68
Mp1g03580.1 (AGP19)
0.46 0.42 0.38 0.39 0.3 0.42 0.42 0.34 1.0 0.34 0.38 0.36 0.26 0.28 0.5 0.42 0.43 0.34 0.42 0.32 0.36 0.45 0.37 0.35 0.33 0.39 0.25 0.49 0.61 0.44 0.67 0.48
Mp1g04600.1 (DJC77)
0.64 0.16 0.36 0.68 0.56 0.47 0.69 0.57 0.78 0.31 0.18 0.41 0.2 0.51 0.51 0.69 0.75 0.71 0.33 0.47 0.56 0.6 0.89 0.33 0.4 0.69 0.51 1.0 0.84 0.25 0.17 0.16
0.71 0.34 0.5 0.55 0.44 0.68 0.56 0.65 0.82 0.41 0.4 0.36 0.39 0.4 0.51 0.51 0.56 0.57 0.49 0.49 0.53 0.51 0.52 0.4 0.55 0.62 0.5 0.71 0.79 1.0 0.73 0.68
0.73 0.46 0.37 0.6 0.73 0.58 0.52 0.5 0.75 0.47 0.39 0.6 0.44 0.58 0.62 0.74 0.72 0.71 0.46 0.67 0.59 0.39 1.0 0.48 0.48 0.68 0.59 0.75 0.73 0.5 0.39 0.47
Mp1g06850.1 (LecRK-VII.2)
0.77 0.45 0.3 0.61 0.66 0.56 0.52 0.52 0.57 0.45 0.38 0.51 0.43 0.4 0.54 0.61 0.7 0.78 0.32 0.67 0.57 0.32 1.0 0.31 0.5 0.69 0.55 0.71 0.73 0.45 0.36 0.46
0.44 0.58 0.25 0.33 0.19 0.3 0.49 0.26 1.0 0.29 0.37 0.47 0.43 0.18 0.25 0.33 0.26 0.3 0.2 0.25 0.29 0.26 0.39 0.15 0.26 0.38 0.42 0.41 0.49 0.52 0.61 0.41
0.7 0.55 0.63 0.59 0.59 0.69 0.9 0.76 1.0 0.59 0.6 0.8 0.63 0.6 0.62 0.69 0.61 0.78 0.59 0.58 0.72 0.67 0.73 0.6 0.7 0.77 0.61 0.65 0.7 0.76 0.92 0.69
0.08 0.02 0.08 0.05 0.05 0.09 0.06 0.1 0.87 0.14 0.07 0.02 0.03 0.01 0.08 0.02 0.06 0.04 0.1 0.08 0.08 0.08 0.02 0.13 0.13 0.06 0.08 0.13 0.15 0.48 1.0 0.21
Mp1g26990.1 (CuAO-zeta)
0.7 0.4 0.38 0.24 0.29 0.41 0.3 0.56 0.62 1.0 0.42 0.4 0.33 0.3 0.14 0.22 0.23 0.7 0.24 0.23 0.21 0.41 0.32 0.41 0.21 0.32 0.37 0.88 0.73 0.19 0.19 0.19
Mp1g29830.1 (RTE1)
0.77 0.52 0.67 0.63 0.66 0.74 0.73 0.73 1.0 0.71 0.65 0.5 0.52 0.5 0.63 0.56 0.64 0.63 0.49 0.59 0.68 0.47 0.69 0.65 0.73 0.74 0.68 0.78 0.81 0.84 0.76 0.68
Mp2g03120.1 (JASSY)
0.51 0.52 0.33 0.32 0.42 0.49 0.46 0.56 1.0 0.41 0.61 0.53 0.56 0.24 0.36 0.33 0.36 0.47 0.43 0.42 0.49 0.36 0.41 0.37 0.5 0.55 0.58 0.6 0.58 0.64 0.69 0.64
0.67 0.81 0.55 0.59 0.61 0.63 0.65 0.57 1.0 0.6 0.8 0.81 0.85 0.57 0.57 0.59 0.55 0.58 0.45 0.59 0.56 0.48 0.79 0.47 0.59 0.71 0.83 0.68 0.67 0.78 0.83 0.84
Mp2g09460.1 (PMR6)
0.56 0.32 0.2 0.57 1.0 0.52 0.93 0.47 0.19 0.68 0.17 0.16 0.25 0.24 0.58 0.73 0.77 0.8 0.33 0.81 0.55 0.31 0.86 0.29 0.49 0.61 0.44 0.45 0.46 0.43 0.31 0.28
Mp2g09510.1 (TRM4f)
0.4 0.37 0.33 0.4 0.48 0.37 0.24 0.37 1.0 0.67 0.47 0.19 0.45 0.16 0.35 0.37 0.44 0.45 0.42 0.52 0.35 0.27 0.51 0.35 0.37 0.32 0.47 0.46 0.38 0.19 0.18 0.2
Mp2g11710.1 (KAI2)
0.52 0.62 0.3 0.35 0.29 0.35 0.51 0.35 1.0 0.29 0.47 0.54 0.44 0.19 0.3 0.38 0.36 0.32 0.22 0.25 0.3 0.28 0.42 0.19 0.28 0.47 0.43 0.5 0.54 0.59 0.65 0.5
0.49 0.63 0.31 0.33 0.26 0.35 0.5 0.36 1.0 0.27 0.4 0.48 0.38 0.18 0.3 0.4 0.34 0.28 0.26 0.25 0.3 0.29 0.39 0.23 0.28 0.4 0.42 0.48 0.54 0.56 0.66 0.49
Mp2g12520.1 (PEI1)
0.79 0.69 0.5 0.7 0.51 0.61 0.63 0.65 1.0 0.78 0.84 0.64 0.79 0.31 0.77 0.78 0.76 0.93 0.71 0.69 0.61 0.51 0.72 0.56 0.67 0.7 0.44 0.6 0.53 0.76 0.74 0.8
0.52 0.24 0.27 0.35 0.56 0.43 0.46 0.48 0.76 0.48 0.33 0.25 0.31 0.24 0.33 0.32 0.43 0.55 0.3 0.62 0.43 0.23 0.68 0.26 0.38 0.52 0.51 0.98 1.0 0.5 0.33 0.19
Mp2g23380.1 (LOX6)
0.46 0.18 0.35 0.25 0.32 0.4 0.6 0.4 0.31 1.0 0.15 0.36 0.13 0.13 0.29 0.33 0.33 0.6 0.34 0.4 0.34 0.42 0.43 0.35 0.39 0.4 0.28 0.52 0.64 0.28 0.23 0.16
0.68 0.53 0.59 0.69 0.65 0.57 0.59 0.63 1.0 0.75 0.66 0.53 0.62 0.63 0.56 0.67 0.69 0.66 0.62 0.65 0.6 0.65 0.8 0.6 0.56 0.7 0.79 0.93 0.82 0.57 0.54 0.54
Mp3g02110.1 (HDA2)
0.71 0.42 0.42 0.51 0.37 0.56 0.93 0.62 1.0 0.39 0.38 0.87 0.37 0.64 0.52 0.73 0.52 0.65 0.54 0.46 0.59 0.61 0.83 0.55 0.5 0.89 0.64 0.64 0.57 0.54 0.81 0.83
Mp3g06280.1 (CFM2)
0.36 0.37 0.31 0.63 0.31 0.35 0.41 0.39 1.0 0.44 0.67 0.46 0.53 0.34 0.61 0.66 0.67 0.38 0.56 0.47 0.43 0.44 0.47 0.42 0.42 0.49 0.44 0.44 0.45 0.55 0.68 0.6
Mp3g09430.1 (JAC1)
0.68 0.67 0.53 0.69 0.7 0.58 0.63 0.64 0.99 0.93 0.73 0.49 0.8 0.35 0.66 0.61 0.66 1.0 0.6 0.72 0.55 0.6 0.66 0.52 0.62 0.62 0.7 0.69 0.6 0.68 0.79 0.82
0.4 0.19 0.46 0.14 0.15 0.25 0.32 0.19 1.0 0.23 0.14 0.32 0.1 0.31 0.13 0.23 0.14 0.19 0.18 0.15 0.28 0.29 0.37 0.15 0.19 0.4 0.14 0.23 0.41 0.45 0.74 0.59
0.38 0.17 0.44 0.34 0.48 0.35 0.31 0.39 0.61 1.0 0.19 0.13 0.18 0.14 0.27 0.18 0.35 0.35 0.26 0.37 0.3 0.32 0.32 0.28 0.3 0.26 0.34 0.8 0.68 0.26 0.18 0.14
0.28 0.11 0.18 0.14 0.1 0.2 1.0 0.18 0.8 0.25 0.18 0.24 0.14 0.17 0.16 0.48 0.18 0.14 0.19 0.12 0.42 0.25 0.31 0.18 0.2 0.47 0.11 0.24 0.28 0.42 0.44 0.33
0.5 0.55 0.51 0.37 0.39 0.5 0.44 0.52 1.0 0.28 0.56 0.72 0.61 0.16 0.5 0.41 0.46 0.63 0.27 0.45 0.41 0.43 0.47 0.24 0.45 0.51 0.4 0.5 0.45 0.37 0.66 0.69
0.26 1.0 0.17 0.14 0.08 0.07 0.4 0.28 0.89 0.3 0.11 0.38 0.3 0.18 0.03 0.17 0.07 0.23 0.05 0.02 0.09 0.12 0.13 0.05 0.06 0.13 0.25 0.25 0.3 0.32 0.33 0.17
Mp4g10990.1 (ATG101)
0.79 0.4 0.58 0.76 0.87 0.65 0.88 0.66 0.83 0.58 0.49 0.57 0.46 0.81 0.76 0.89 0.74 0.78 0.63 0.73 0.73 0.69 1.0 0.62 0.61 0.81 0.65 0.76 0.79 0.67 0.66 0.57
Mp4g12520.1 (DIN6)
0.83 0.49 0.53 0.57 0.46 0.82 0.56 0.86 0.65 0.33 0.7 0.29 0.66 0.2 0.5 0.22 0.55 0.97 0.42 0.46 0.71 0.44 0.33 0.47 0.5 0.72 0.43 0.83 1.0 0.82 0.75 0.56
0.65 0.58 0.12 0.32 0.47 0.57 0.8 0.47 1.0 0.54 0.3 0.53 0.31 0.16 0.3 0.46 0.29 0.49 0.18 0.29 0.5 0.2 0.59 0.11 0.4 0.75 0.35 0.46 0.68 0.5 0.5 0.36
Mp5g03480.1 (MEL2)
0.46 1.0 0.45 0.54 0.22 0.32 0.45 0.33 0.87 0.29 0.57 0.71 0.64 0.28 0.36 0.69 0.37 0.32 0.52 0.35 0.34 0.45 0.46 0.34 0.31 0.45 0.37 0.34 0.29 0.31 0.57 0.62
0.39 0.34 0.18 0.19 0.22 0.41 0.44 0.42 1.0 0.47 0.43 0.4 0.41 0.08 0.21 0.18 0.21 0.33 0.2 0.28 0.44 0.2 0.31 0.16 0.51 0.52 0.5 0.42 0.37 0.31 0.29 0.29
Mp5g07680.1 (iqd2)
0.96 0.67 0.7 0.68 0.83 0.87 0.78 0.87 0.93 0.75 0.7 0.6 0.63 0.53 0.82 0.76 0.72 0.78 0.65 0.78 0.86 0.64 0.7 0.7 0.81 0.86 0.76 0.89 0.93 1.0 0.91 0.78
0.89 0.82 0.62 0.58 0.75 0.77 0.71 0.64 1.0 0.83 0.66 0.69 0.67 0.68 0.53 0.67 0.58 0.79 0.59 0.66 0.64 0.62 0.87 0.57 0.48 0.74 0.69 0.79 0.86 0.78 0.71 0.68
Mp5g12650.1 (PILS2)
0.73 0.63 0.42 0.65 0.51 0.85 0.39 0.94 0.45 0.79 0.61 0.4 0.61 0.2 0.41 0.42 0.53 0.65 0.51 0.54 0.6 0.43 0.46 0.49 0.58 0.86 0.45 0.84 1.0 1.0 0.8 0.52
Mp5g12700.1 (TCH4)
0.39 0.4 0.58 0.01 0.08 0.37 0.59 0.63 1.0 0.34 0.4 0.65 0.75 0.01 0.03 0.07 0.05 0.4 0.2 0.09 0.35 0.42 0.2 0.25 0.45 0.47 0.5 0.51 0.64 0.61 0.48 0.56
0.54 0.4 0.48 0.55 0.53 0.52 0.69 0.55 1.0 0.36 0.41 0.68 0.41 0.41 0.44 0.62 0.53 0.59 0.58 0.53 0.52 0.51 0.73 0.51 0.49 0.57 0.61 0.51 0.53 0.53 0.63 0.59
0.59 0.19 0.6 0.67 0.51 0.54 0.52 0.54 0.42 1.0 0.18 0.36 0.16 0.51 0.42 0.45 0.56 0.6 0.54 0.48 0.4 0.57 0.48 0.59 0.51 0.43 0.57 0.65 0.63 0.49 0.46 0.5
Mp5g19690.1 (ATH4)
0.74 0.55 0.27 0.11 0.56 0.52 0.23 0.46 0.8 1.0 0.35 0.48 0.37 0.22 0.14 0.11 0.14 0.48 0.37 0.28 0.35 0.32 0.26 0.46 0.33 0.43 0.54 0.68 0.66 0.35 0.35 0.41
0.52 0.43 0.55 0.29 0.27 0.67 0.7 0.61 1.0 0.13 0.42 0.47 0.4 0.6 0.4 0.44 0.38 0.55 0.3 0.4 0.6 0.37 0.45 0.43 0.67 0.63 0.36 0.5 0.66 0.48 0.42 0.39
0.62 0.67 0.46 0.8 0.64 0.66 0.62 0.67 0.81 0.69 1.0 0.55 0.75 0.83 0.87 0.84 0.89 0.69 0.66 0.72 0.65 0.55 0.72 0.54 0.69 0.74 0.88 0.73 0.7 0.72 0.89 0.87
0.59 0.27 0.64 0.57 0.37 0.63 0.41 0.58 0.79 1.0 0.4 0.3 0.28 0.89 0.51 0.55 0.57 0.52 0.83 0.5 0.49 0.76 0.37 0.76 0.62 0.48 0.49 0.6 0.79 0.59 0.48 0.45
0.69 0.31 0.35 0.59 1.0 0.58 0.66 0.59 0.43 0.91 0.29 0.38 0.33 0.36 0.49 0.58 0.59 0.82 0.46 0.67 0.49 0.39 0.74 0.46 0.49 0.57 0.5 0.79 0.83 0.46 0.33 0.29
Mp6g12300.1 (MIP2)
0.48 0.4 0.31 0.4 0.43 0.36 0.46 0.44 1.0 0.45 0.49 0.38 0.43 0.18 0.26 0.31 0.37 0.43 0.2 0.39 0.42 0.27 0.54 0.18 0.35 0.55 0.72 0.81 0.48 0.25 0.24 0.25
Mp6g12540.1 (RAY1)
0.66 0.81 0.58 0.65 0.52 0.57 0.79 0.65 1.0 0.68 0.91 0.9 0.96 0.54 0.62 0.73 0.66 0.64 0.79 0.52 0.6 0.7 0.75 0.62 0.57 0.67 0.6 0.72 0.64 0.65 0.75 0.8
0.95 0.53 0.58 0.34 0.74 0.84 0.85 0.73 0.59 0.94 0.47 0.78 0.45 0.4 0.35 0.42 0.32 0.56 0.59 0.62 0.86 0.56 0.76 0.5 0.8 1.0 0.5 0.8 0.9 0.68 0.62 0.49
Mp6g14110.1 (BDR1)
0.47 0.33 0.41 0.63 0.51 0.37 0.76 0.5 0.65 0.39 0.28 0.51 0.37 0.36 0.43 0.66 0.51 0.78 0.39 0.29 0.57 0.48 1.0 0.45 0.38 0.59 0.38 0.46 0.45 0.64 0.77 0.81
Mp6g15550.1 (LYK3)
0.58 0.13 0.15 0.25 0.17 0.53 0.39 0.84 0.66 0.46 0.44 0.14 0.2 0.16 0.39 0.21 0.48 0.53 0.46 0.33 0.57 0.15 0.18 0.38 0.66 0.65 0.24 0.97 0.76 1.0 0.43 0.43
Mp6g16350.1 (RKFL3)
0.9 0.46 0.48 0.81 0.84 0.35 0.67 0.64 0.67 0.7 0.38 0.3 0.41 0.22 0.52 0.57 0.56 1.0 0.2 0.6 0.49 0.33 0.95 0.2 0.46 0.83 0.77 0.86 0.81 0.17 0.14 0.12
Mp6g16370.1 (RKFL3)
0.24 0.54 0.18 0.12 0.32 0.06 0.29 0.29 1.0 0.25 0.07 0.35 0.2 0.08 0.17 0.16 0.2 0.45 0.1 0.21 0.16 0.21 0.27 0.05 0.24 0.35 0.71 0.43 0.53 0.27 0.22 0.2
Mp6g16380.1 (PERK6)
0.34 0.26 0.31 0.16 0.09 0.05 0.23 0.11 1.0 0.1 0.04 0.17 0.07 0.18 0.14 0.18 0.18 0.06 0.08 0.13 0.13 0.16 0.14 0.05 0.07 0.21 0.43 0.5 0.53 0.44 0.36 0.23
Mp7g04910.1 (PRPL28)
0.62 0.52 0.55 0.5 0.4 0.54 0.54 0.57 1.0 0.89 0.78 0.75 0.68 0.4 0.41 0.35 0.48 0.63 0.45 0.64 0.56 0.51 0.54 0.37 0.64 0.72 0.61 0.62 0.65 0.68 0.62 0.56
0.69 0.36 0.41 0.66 0.54 0.76 0.47 0.77 0.92 0.35 0.48 0.26 0.39 0.47 0.76 0.56 0.8 0.8 0.56 0.66 0.64 0.56 0.53 0.5 0.77 0.64 0.63 0.88 1.0 0.8 0.77 0.64
0.29 0.9 0.15 0.25 0.07 0.18 0.4 0.19 1.0 0.34 0.41 0.53 0.36 0.27 0.22 0.58 0.28 0.16 0.04 0.09 0.18 0.13 0.21 0.04 0.19 0.38 0.2 0.18 0.29 0.23 0.3 0.16
0.54 0.52 0.31 0.37 0.28 0.59 0.51 0.51 1.0 0.42 0.56 0.77 0.47 0.26 0.36 0.32 0.36 0.35 0.31 0.34 0.51 0.33 0.38 0.33 0.53 0.57 0.38 0.6 0.61 0.67 0.86 0.63
0.51 0.49 0.38 0.63 0.53 0.45 0.47 0.48 1.0 0.6 0.6 0.33 0.49 0.49 0.59 0.7 0.64 0.5 0.57 0.49 0.43 0.43 0.55 0.56 0.41 0.5 0.74 0.71 0.61 0.59 0.71 0.65
Mp8g00450.1 (ARA6)
0.92 0.54 0.67 0.94 0.86 0.92 0.97 0.79 0.77 0.67 0.64 0.73 0.63 0.82 0.87 1.0 0.89 0.85 0.72 0.93 0.84 0.68 0.91 0.7 0.86 0.87 0.61 0.81 0.85 0.78 0.71 0.69
Mp8g02940.1 (SEL1)
0.93 0.33 0.22 0.24 0.76 0.7 0.61 0.41 0.64 0.87 0.2 0.44 0.17 0.05 0.11 0.2 0.17 0.18 0.09 0.31 0.91 0.28 0.76 0.1 0.35 1.0 0.54 0.85 0.66 0.24 0.19 0.18
Mp8g09050.1 (LOX2)
0.54 0.14 0.31 0.23 0.24 0.66 0.09 0.6 1.0 0.37 0.19 0.03 0.15 0.06 0.39 0.07 0.29 0.33 0.25 0.39 0.3 0.18 0.08 0.21 0.55 0.18 0.5 0.62 0.74 0.83 0.62 0.37
0.04 0.1 0.04 0.03 0.03 0.03 1.0 0.12 0.18 0.1 0.01 0.27 0.12 0.0 0.06 0.16 0.05 0.01 0.01 0.08 0.3 0.06 0.19 0.05 0.04 0.61 0.07 0.23 0.34 0.43 0.27 0.16
Mp8g17680.1 (ALDH2)
0.63 0.33 0.35 0.54 0.51 0.57 0.62 0.52 1.0 0.84 0.25 0.39 0.24 0.25 0.52 0.55 0.61 0.54 0.38 0.46 0.55 0.35 0.54 0.37 0.46 0.58 0.46 0.63 0.73 0.53 0.42 0.38
MpVg00600.1 (RPT1)
0.82 0.48 0.67 0.87 0.84 0.82 0.86 0.8 0.88 0.65 0.63 0.64 0.55 0.76 0.78 0.95 0.84 0.9 0.75 0.75 0.79 0.75 1.0 0.66 0.75 0.86 0.74 0.85 0.9 0.64 0.58 0.51

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)