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Heatmap: Cluster_21 (Marchantia polymorpha (Mpo) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Control
Cold (3°C)
Dark (3 days)
Heat (33°C)
Light (435 uEm-2s-1)
Osmotic (100 mM mannitol)
Nitrogen deficiency (0 mM KNO3)
Salt (40 mM NaCl)
Cold-Dark
Cold-Light
Cold-Mannitol
Cold-Nitrogen deficiency
Cold-Salt
Heat-Dark
Heat-Mannitol
Heat-Nitrogen deficiency
Heat-Salt
Light-Salt
Mannitol-Dark
Mannitol-Light
Mannitol-Nitrogen deficiency
Nitrogen deficiency-Dark
Nitrogen deficiency-Light
Salt-Dark
Salt-Mannitol
Salt-Nitrogen deficiency
ZT2 (2 hours after light)
ZT6 (6 hours after light)
ZT10 (10 hours after light)
ZT14 (2 hours after dark)
ZT18 (6 hours after dark)
ZT22 (10 hours after dark)
-0.29 0.03 -0.28 -0.14 0.19 -0.23 -0.27 -0.28 0.08 -0.13 0.53 0.29 0.49 0.01 -0.21 -0.2 -0.11 0.35 0.43 0.33 -0.22 0.09 0.34 0.21 -0.13 -0.12 0.03 -0.19 -0.16 -0.52 -0.34 -0.44
-0.32 -0.07 -0.64 0.2 -0.31 0.14 0.09 0.07 -0.39 -0.23 0.55 0.09 0.34 -0.39 0.3 0.23 0.3 0.29 0.09 0.38 0.19 -0.21 0.21 -0.19 0.36 0.18 -0.27 -0.33 -0.23 -0.34 -0.6 -0.64
Mp1g03080.1 (GPAT9)
 -0.09 0.28 -0.65 0.05 -0.09 0.24 0.15 0.08 -0.48 -0.71 0.71 0.33 0.86 -0.85 0.21 0.14 0.03 0.09 0.09 0.27 0.13 -0.34 0.07 -0.25 0.29 0.1 -0.35 -0.25 -0.12 -0.11 -0.63 -1.03
-0.72 -0.27 -1.03 -0.04 -0.77 -0.11 0.15 -0.25 -0.24 -0.2 0.52 0.33 0.5 -0.31 0.32 0.49 0.18 0.33 -0.03 0.42 0.58 -0.2 0.55 -0.14 0.71 0.54 -0.56 -0.62 -0.52 -0.7 -0.7 -0.82
-0.25 -0.29 -0.7 0.11 -0.05 0.07 0.32 0.05 -0.45 -0.58 0.25 0.04 0.23 0.12 0.42 0.52 0.23 0.17 -0.21 0.19 0.35 -0.5 0.32 -0.25 0.51 0.23 -0.34 -0.32 -0.31 -0.37 -0.34 -0.39
Mp1g09970.1 (IAR1)
 -0.07 -0.05 -0.19 -0.05 -0.17 0.17 0.11 0.13 -0.23 -0.34 0.33 0.18 0.27 -0.73 0.1 0.12 0.13 0.18 0.08 0.13 0.16 -0.06 0.22 -0.12 0.28 0.17 -0.3 -0.14 -0.03 -0.12 -0.23 -0.52
Mp1g09980.1 (IAR1)
 -0.07 -0.05 -0.19 -0.05 -0.17 0.17 0.11 0.13 -0.23 -0.34 0.33 0.18 0.27 -0.73 0.1 0.12 0.13 0.18 0.08 0.13 0.16 -0.06 0.22 -0.12 0.28 0.17 -0.3 -0.14 -0.03 -0.12 -0.23 -0.52
Mp1g10190.1 (RDM16)
 -0.16 -0.12 -0.42 0.11 0.02 -0.03 0.09 -0.09 -0.04 -0.25 0.27 0.03 0.11 -0.09 0.22 0.21 0.11 0.1 0.14 0.22 -0.02 -0.09 0.18 -0.13 0.02 0.0 -0.25 -0.16 0.06 -0.05 -0.02 -0.23
-0.53 0.25 -0.6 -0.02 0.02 0.06 -0.1 -0.33 -0.07 -1.02 0.67 0.4 0.66 -0.96 0.53 0.41 0.27 0.14 -0.1 0.6 0.16 -0.08 0.03 -0.3 0.42 0.02 -0.43 -0.56 -0.31 -0.38 -0.31 -0.6
-0.15 0.04 -0.43 0.08 0.01 0.02 -0.08 -0.07 0.16 -0.58 0.47 0.12 0.24 -0.77 0.27 0.11 0.16 0.23 0.26 0.41 -0.15 -0.06 0.24 -0.05 0.03 -0.08 -0.21 -0.27 -0.11 -0.21 -0.13 -0.22
-0.44 -0.1 -1.07 0.24 -0.72 0.15 0.17 0.06 -0.02 -0.14 0.61 0.51 0.55 -1.01 0.55 0.48 0.38 0.22 -0.1 0.24 0.25 -0.31 0.04 -0.56 0.51 0.21 -0.6 -0.66 -0.47 -0.22 -0.43 -0.67
-0.24 0.28 -0.13 -0.15 0.29 -0.05 -0.26 -0.22 -0.01 0.11 0.74 0.19 0.59 -0.62 -0.22 -0.26 -0.16 0.34 0.29 0.21 -0.29 0.12 0.36 0.13 -0.15 0.02 -0.32 0.15 0.23 -0.71 -0.81 -0.98
Mp1g13770.1 (AHL14)
 -0.38 -0.37 -0.3 -0.24 -0.45 -0.03 0.08 -0.29 0.67 -0.13 0.42 0.29 0.27 -0.27 0.01 0.0 -0.16 0.05 0.16 0.29 0.27 0.17 0.19 -0.03 0.41 0.27 -0.32 -0.21 -0.17 -0.2 -0.4 -0.59
-1.17 0.3 0.03 -1.09 -0.25 -0.67 -0.4 -0.4 -0.18 -0.04 0.99 0.41 1.49 -0.76 -0.67 -1.16 -0.47 0.27 0.83 0.65 -0.42 -0.05 0.24 1.02 -0.13 -0.17 0.23 0.55 -0.07 -2.22 -2.48 -2.29
Mp1g16390.1 (MATE45)
 0.1 0.34 0.27 -1.87 0.16 -0.02 -0.27 -0.23 -0.81 -0.1 1.08 0.13 1.53 -0.35 -1.9 -2.47 -1.8 0.69 1.28 0.39 -0.45 0.36 -0.07 1.07 -0.01 -0.47 -1.02 -1.34 -0.78 -0.89 -0.98 -0.74
Mp1g21500.1 (LecRK-VII.2)
 -0.39 -0.49 -0.84 0.27 -1.08 -0.22 0.41 -0.26 -0.63 -0.3 0.26 0.33 0.08 0.43 0.41 0.69 0.39 -0.07 -0.22 -0.02 0.41 -0.02 0.5 -0.33 0.77 0.55 -0.33 -0.52 -0.65 -0.84 -0.47 -0.33
-0.47 0.05 -0.58 0.18 -0.33 0.11 0.05 -0.27 -0.18 -0.22 0.64 0.3 0.5 -0.61 0.3 0.6 0.17 0.03 0.11 0.35 0.15 -0.27 0.18 -0.13 0.3 0.17 -0.51 -0.49 -0.2 -0.31 -0.39 -0.64
Mp1g25620.1 (KINbeta1)
 -0.78 0.51 -0.34 0.1 -0.67 -0.35 0.0 -0.67 -0.02 -1.8 1.02 0.7 1.28 -0.61 0.23 0.46 0.26 0.07 0.38 0.23 -0.07 0.04 0.56 0.29 -0.02 0.18 -0.55 -0.94 -0.95 -1.87 -1.06 -0.82
Mp1g26840.1 (APC1)
 -0.06 -0.01 -0.28 0.01 -0.71 0.14 0.39 0.06 0.09 -0.07 0.4 0.29 0.44 -0.44 -0.09 0.23 -0.14 -0.21 0.1 -0.39 0.33 -0.04 -0.03 -0.19 0.38 0.35 -0.35 -0.18 -0.0 0.09 -0.31 -0.76
-0.48 0.67 -0.1 0.02 -0.45 0.08 0.06 -0.08 -0.28 -1.73 0.98 0.34 1.07 -0.56 0.06 0.03 0.12 0.19 0.06 0.48 0.07 0.06 0.31 -0.15 0.12 0.28 -0.5 -0.26 0.0 -1.38 -1.5 -1.8
Mp2g01170.1 (ARP9)
 -0.52 -0.22 -0.1 0.02 -0.21 0.04 -0.11 -0.35 0.22 -0.89 0.31 -0.11 0.04 -0.67 0.24 0.49 0.17 0.22 0.31 0.38 0.07 0.05 0.36 0.29 -0.09 0.0 -0.2 -0.39 -0.06 -0.25 0.01 -0.06
Mp2g10810.1 (SFPS)
 -0.16 -0.43 -0.5 0.4 -0.18 -0.06 -0.05 -0.14 0.08 -0.77 0.37 -0.33 0.17 -0.67 0.41 0.24 0.31 0.27 0.02 0.28 0.2 -0.06 0.34 -0.33 0.2 0.18 -0.1 0.17 0.2 -0.41 -0.21 -0.56
Mp2g13150.1 (TRM8a)
 -0.16 -0.32 -0.31 -0.01 -0.03 -0.02 0.09 -0.05 -0.22 -0.55 0.26 0.02 0.14 0.02 0.34 0.3 0.29 0.17 -0.12 0.21 0.13 -0.17 0.25 -0.11 0.21 0.09 -0.35 -0.12 0.1 -0.04 -0.19 -0.38
Mp2g15140.1 (COG5)
 -0.12 -0.08 -0.2 0.04 -0.08 0.17 0.06 -0.04 -0.76 -0.33 0.37 -0.05 0.33 -1.15 0.12 0.18 0.12 0.25 0.13 0.46 0.14 -0.06 0.13 -0.09 0.33 0.11 -0.29 -0.1 0.11 -0.01 -0.21 -0.48
Mp2g19130.1 (emb1129)
 -0.47 -0.13 -0.38 -0.27 -0.23 -0.19 -0.14 -0.48 -0.07 0.08 0.75 0.57 0.6 -0.22 0.21 -0.11 -0.11 0.32 -0.14 0.4 0.41 0.03 0.25 -0.05 0.56 0.33 -0.66 -0.78 -0.14 -0.53 -0.52 -0.71
-0.36 -0.37 -0.94 0.24 -0.66 -0.13 0.19 -0.11 -0.49 -0.54 0.06 0.34 -0.01 0.35 0.45 0.75 0.31 0.41 0.11 0.18 0.04 -0.21 0.28 -0.24 0.27 0.15 -0.44 -0.58 -0.37 -0.13 -0.03 -0.03
Mp3g05640.1 (SFAR4)
 -0.34 -0.28 -0.68 0.08 -0.26 -0.04 0.12 -0.18 0.01 -0.49 0.43 0.1 0.33 -0.69 0.38 0.2 0.22 0.08 0.16 0.21 0.24 -0.04 0.3 0.02 0.21 0.14 -0.31 -0.14 0.04 -0.12 -0.13 -0.47
Mp3g09600.1 (TIE4)
 -0.26 -0.36 -0.07 -0.27 -0.3 0.02 0.38 -0.06 0.09 -0.13 0.1 0.29 0.08 -0.48 -0.19 0.16 -0.23 0.25 -0.11 0.34 0.5 -0.08 0.43 0.02 0.47 0.53 -0.3 -0.38 -0.24 -0.31 -0.4 -0.5
-0.46 0.04 -0.5 0.23 -0.13 0.03 0.03 -0.09 -0.08 -0.32 0.44 0.11 0.38 -0.8 0.43 0.67 0.37 0.27 0.08 0.28 0.07 -0.18 0.22 -0.1 0.19 0.08 -0.15 -0.39 -0.43 -0.57 -0.54 -0.53
-0.27 0.42 -0.24 -0.0 -0.05 -0.16 0.11 -0.19 -0.18 -0.38 0.49 0.44 0.56 -0.52 0.06 0.22 -0.02 0.06 0.1 0.24 -0.09 0.11 0.24 -0.05 -0.07 -0.05 -0.42 -0.11 -0.07 -0.16 -0.3 -0.55
-0.15 0.28 -0.41 -0.14 -0.22 0.29 0.17 0.07 -0.1 -0.28 0.52 0.37 0.4 -1.16 0.18 0.2 -0.05 0.2 0.03 0.37 0.28 -0.28 -0.02 -0.31 0.43 0.22 -0.4 -0.38 -0.04 -0.22 -0.51 -0.74
-0.4 0.05 -0.03 -0.02 -0.06 -0.17 0.22 -0.25 0.45 -0.12 0.52 0.32 0.51 -0.39 -0.01 0.14 -0.08 0.07 0.08 0.23 0.05 0.02 0.28 0.08 0.17 0.05 -0.75 -0.53 -0.26 -0.17 -0.34 -0.66
-0.36 -0.21 -0.76 0.08 -0.23 -0.11 0.11 -0.19 -0.13 0.11 0.48 0.05 0.17 0.35 0.3 0.42 0.1 0.09 0.26 0.23 0.07 -0.09 0.2 -0.04 0.07 -0.01 -0.12 -0.19 -0.17 -0.33 -0.41 -0.56
Mp4g03120.1 (NUP54)
 -0.08 -0.07 0.25 -0.03 -1.23 0.03 0.25 -0.4 0.47 -0.15 0.69 0.17 0.16 -0.8 0.21 0.05 -0.39 -0.66 0.49 -0.2 0.21 0.64 -0.38 -0.25 0.5 0.52 -0.77 -0.54 -0.42 -0.21 -0.02 -0.14
-0.29 0.46 0.05 -0.21 -1.4 0.02 0.28 -0.38 0.35 -0.37 0.86 0.32 0.43 -1.06 -0.04 -0.15 -0.79 -1.57 0.58 -0.31 0.59 0.44 0.23 0.2 0.62 0.53 -0.49 -0.61 -0.82 -0.34 -0.27 -0.35
Mp4g03140.1 (ALB3)
 0.16 0.18 0.58 -0.45 -0.99 0.17 0.52 -0.46 0.55 -0.31 0.59 0.14 -0.02 -0.56 -0.17 -0.33 -0.69 -1.13 0.42 -0.68 -0.04 0.79 -0.48 0.19 0.2 -0.04 -0.43 -0.34 -0.05 0.13 0.38 -0.17
Mp4g04710.1 (CRLK1)
 -0.17 0.46 0.49 -0.34 0.05 -0.03 -0.25 -0.18 0.04 -0.15 0.41 -0.16 0.48 -0.3 -0.47 -0.54 -0.51 0.03 0.44 0.21 -0.1 0.7 0.17 0.34 -0.0 0.03 -0.42 -0.52 -0.22 -0.18 -0.2 -0.41
Mp4g04720.1 (AtNPC1-2)
 0.01 1.16 0.7 -0.08 0.16 0.21 0.17 -0.16 0.08 -0.33 0.02 -0.09 0.43 -0.32 -0.47 -0.9 -0.63 -0.27 0.4 -0.09 -0.5 0.52 -0.17 0.52 -0.37 -0.7 -0.74 -0.49 -0.16 -0.09 -0.07 -0.02
Mp4g05700.1 (NSRb)
 -0.05 0.6 0.18 -0.82 -0.21 0.18 0.21 0.03 -0.43 -0.1 0.94 -0.11 0.74 -0.31 -0.69 -1.16 -0.49 -0.45 0.37 -0.09 0.14 0.23 -0.18 0.29 0.47 0.15 -0.36 -0.2 -0.08 -0.21 -0.25 -0.43
Mp4g05780.1 (KIN17)
 -0.34 -0.1 -0.37 0.11 0.04 -0.28 -0.14 -0.22 -0.02 -0.23 0.35 0.14 0.3 0.08 0.08 0.43 0.2 0.17 0.24 0.22 0.07 0.0 0.29 -0.0 -0.01 0.01 -0.1 -0.02 -0.07 -0.46 -0.45 -0.59
-0.2 -0.14 -0.27 0.05 -0.22 0.05 0.13 -0.14 -0.29 -0.27 0.43 0.06 0.33 -1.2 0.16 0.17 0.23 0.1 0.2 0.3 0.13 -0.08 0.2 -0.2 0.32 0.28 -0.3 -0.07 -0.04 -0.16 -0.15 -0.32
-0.16 0.28 0.4 -0.5 -1.09 0.11 -0.31 -0.23 -1.16 -1.45 0.09 -0.37 -0.05 1.64 -0.44 -0.53 -0.56 -0.78 0.77 -0.78 -0.39 0.75 -0.93 1.0 -0.13 -0.23 -0.13 0.0 0.15 -0.19 0.27 0.11
-0.46 -0.23 -0.16 -0.18 -1.23 0.24 0.48 -0.57 0.73 -0.5 0.89 0.63 0.52 -0.73 -0.01 0.09 0.04 -0.66 0.32 0.12 0.49 0.05 0.04 -0.32 0.77 0.38 -0.53 -0.4 -0.7 -0.86 -0.63 -0.79
Mp5g14740.1 (PRMT3)
 -0.37 0.16 -0.31 -0.03 0.03 0.01 -0.01 -0.14 -0.08 -0.36 0.44 0.33 0.39 -0.37 0.05 0.07 -0.06 0.3 0.26 0.3 0.04 -0.01 0.37 0.03 0.22 0.09 -0.27 -0.23 -0.01 -0.48 -0.46 -0.74
-0.42 0.09 -0.68 0.04 0.0 -0.21 0.01 -0.23 -0.08 -0.32 0.62 0.3 0.56 -0.18 0.24 0.37 0.13 0.44 0.01 0.33 0.19 -0.18 0.39 -0.12 0.21 0.17 -0.07 -0.43 -0.3 -0.78 -0.84 -0.84
-0.28 0.07 -0.4 0.19 -0.3 -0.06 -0.17 -0.24 -0.05 -0.1 0.65 0.2 0.52 -0.38 0.19 0.37 0.08 -0.06 0.17 0.17 -0.04 0.04 -0.01 0.12 0.1 -0.0 -0.16 -0.11 -0.14 -0.21 -0.29 -0.67
-0.32 0.6 -0.34 -0.11 -0.25 -0.0 0.12 -0.19 -0.07 -1.14 0.58 0.07 0.72 -0.34 0.28 0.28 0.26 0.38 -0.02 0.37 -0.17 -0.11 0.35 -0.03 0.23 0.16 -0.65 -0.25 -0.01 -0.87 -0.54 -1.03
0.02 -0.12 0.83 -1.18 -0.93 0.14 -0.42 -0.29 -0.03 -0.91 0.2 -0.2 0.23 1.53 -1.2 -1.12 -1.26 -0.19 0.93 -0.65 -0.19 0.89 -0.36 1.03 -0.35 -0.07 -0.68 -0.07 0.29 -0.05 -0.56 -0.69
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Mp6g04730.1 (EID1)
 -0.1 0.51 -0.97 -0.01 -0.35 -0.04 -0.33 -0.06 -1.5 -0.27 0.73 0.35 0.99 -0.79 -0.02 -0.26 0.09 0.34 -0.08 0.41 -0.01 -0.78 0.4 -0.23 0.13 0.21 -0.42 -0.43 -0.63 -0.58 0.07 0.75
-0.25 0.38 -0.52 0.1 -0.84 0.18 0.65 -0.56 0.03 -0.2 0.31 0.58 -0.18 -1.69 -0.06 0.51 -0.58 -0.91 0.61 0.25 0.23 1.21 0.02 -0.19 0.07 0.11 -0.15 -0.63 -0.7 -0.58 -0.27 -0.23
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-0.48 0.1 -0.22 0.15 -0.41 -0.06 0.1 -0.42 0.03 -0.09 0.6 0.41 0.47 -0.56 0.41 0.3 0.17 -0.21 0.01 0.26 0.19 -0.19 -0.07 0.0 0.3 0.12 -0.65 -0.56 -0.29 0.01 -0.09 -0.44
Mp6g17010.1 (EIF3G1)
 -0.26 0.39 -0.39 0.15 0.26 -0.1 0.15 -0.14 -0.14 -0.2 0.48 0.44 0.37 -0.07 0.08 0.27 -0.01 0.22 -0.05 0.19 -0.01 -0.21 0.34 -0.12 -0.01 -0.01 -0.27 -0.18 -0.08 -0.64 -0.62 -0.85
-0.38 -0.13 -0.33 -0.03 -0.02 -0.02 0.02 -0.19 0.19 -0.12 0.4 0.23 0.29 -0.76 0.24 0.38 0.16 0.29 0.07 0.27 0.15 -0.07 0.34 -0.0 0.25 0.18 -0.33 -0.33 -0.31 -0.35 -0.39 -0.68
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Mp7g03900.1 (TAF15b)
 -0.29 -0.06 -0.95 -0.06 -0.09 -0.05 -0.29 -0.14 0.34 -0.08 0.65 0.41 0.41 0.14 0.02 0.09 -0.15 0.35 -0.2 0.4 0.23 -0.22 0.36 -0.27 0.2 0.26 0.1 -0.14 -0.08 -0.68 -0.82 -0.93
Mp7g04570.1 (PAP16)
 -0.34 0.05 -0.53 -0.15 -0.2 0.24 0.17 -0.09 -0.4 -0.03 0.65 0.22 0.55 -0.9 0.14 0.16 -0.11 0.07 0.26 0.37 0.17 -0.25 0.02 -0.03 0.42 0.09 -0.36 -0.33 -0.08 -0.17 -0.22 -0.58
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Mp8g03870.1 (PUX4)
 -0.23 -0.15 -0.64 0.03 -0.57 0.12 0.42 0.12 -1.2 -0.1 0.31 0.25 0.4 0.24 0.28 0.38 0.19 -0.08 -0.12 -0.08 0.29 -0.11 0.16 -0.53 0.69 0.34 -0.07 -0.2 -0.4 -0.56 -0.4 -0.34
Mp8g04210.1 (CSU2)
 -0.23 -0.26 -0.76 0.05 -0.25 -0.07 -0.06 -0.2 0.21 -0.14 0.53 0.23 0.42 -0.32 0.2 0.17 0.08 0.26 0.04 0.36 0.24 -0.05 0.26 -0.14 0.3 0.19 -0.28 -0.17 0.05 -0.39 -0.5 -0.84
Mp8g07060.1 (ACO3)
 -0.5 0.08 1.03 -1.34 -0.53 -0.18 0.01 -0.35 -0.4 -0.3 0.56 0.37 0.68 -0.23 -1.34 -0.79 -1.24 -0.32 0.97 -0.03 -0.1 1.1 -0.17 1.03 -0.04 0.05 -0.89 -0.28 -0.1 0.01 -0.65 -0.86
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-0.16 -0.24 -0.4 0.09 -0.09 0.09 0.08 0.11 -0.2 -0.53 0.35 0.01 0.24 -0.41 0.18 0.27 0.12 0.19 -0.09 0.26 0.16 -0.14 0.25 -0.16 0.23 0.17 -0.22 -0.1 0.05 -0.15 -0.12 -0.42
MpVg01160.1 (CDPK1)
 -0.16 0.2 -0.58 0.01 0.02 -0.05 0.23 -0.09 0.14 -0.09 0.48 0.32 0.41 -0.11 -0.08 0.3 -0.0 0.15 -0.22 0.11 0.14 -0.2 0.45 -0.2 0.04 0.22 -0.08 -0.06 0.02 -0.61 -0.81 -1.07

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.