1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_33 (Marchantia polymorpha (Mpo) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
Control
Cold (3°C)
Dark (3 days)
Heat (33°C)
Light (435 uEm-2s-1)
Osmotic (100 mM mannitol)
Nitrogen deficiency (0 mM KNO3)
Salt (40 mM NaCl)
Cold-Dark
Cold-Light
Cold-Mannitol
Cold-Nitrogen deficiency
Cold-Salt
Heat-Dark
Heat-Mannitol
Heat-Nitrogen deficiency
Heat-Salt
Light-Salt
Mannitol-Dark
Mannitol-Light
Mannitol-Nitrogen deficiency
Nitrogen deficiency-Dark
Nitrogen deficiency-Light
Salt-Dark
Salt-Mannitol
Salt-Nitrogen deficiency
ZT2 (2 hours after light)
ZT6 (6 hours after light)
ZT10 (10 hours after light)
ZT14 (2 hours after dark)
ZT18 (6 hours after dark)
ZT22 (10 hours after dark)
5.0 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Mp1g03360.1 (MES14)
 - - - - - - 2.7 2.05 - - - - 2.11 - 1.79 1.67 - - - - 3.38 - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - 3.46 3.39 - - - - 3.39 - - - - - - - - - - -
1.22 1.19 -0.55 0.92 -1.93 -0.88 1.11 -1.96 -0.38 -0.13 -1.08 0.07 -1.08 0.84 -0.23 1.81 0.09 -2.05 - - 0.26 0.23 -1.07 -0.41 -2.16 1.6 -1.86 0.04 -1.01 -1.77 -1.92 0.31
Mp1g11440.1 (ELMOD_A)
 - - - 1.27 - - - - 2.54 - - 1.67 1.45 - 2.32 2.93 - - - 2.39 - - - - - - - - - - - -
Mp1g15380.1 (RING1B)
 - -0.47 - 0.85 -1.87 - -0.4 - 0.26 1.58 -1.73 -0.72 -1.73 1.37 2.75 2.27 2.11 -1.83 - -1.92 -2.15 -0.91 0.75 -1.76 - - - -0.62 - -0.59 - -
Mp1g22320.1 (LOS2)
 1.96 - - - - - 2.09 - - - - - - - 1.63 4.37 - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 3.49 - - - - - - - - - - - - - 4.38 - - - - - - - - - - -
5.0 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - 2.07 - - 2.12 - - 2.2 - - - 4.24 - - - - - - - - - - - - - - - -
Mp1g26430.1 (PLT2)
 0.84 2.05 - - - 0.77 - - 2.32 2.18 - 0.74 - - - 2.14 1.52 - - - 2.11 - - - - - - - 0.61 - - -
Mp1g28630.1 (CP29)
 - - - - - - - - - - - - - - 4.33 3.57 - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.16 - - - - - 2.08 1.84 - - 2.74 - - - 0.5 3.01 0.51 - - 2.14 0.4 - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - 4.39 - 3.46 - - - - - - - - - - - - - - -
Mp2g06450.1 (MEE57)
 - 0.65 - - - 0.27 0.38 2.33 - - - 2.27 1.87 - - - - - 1.78 - 1.97 - 1.83 1.28 0.1 - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 5.0 - - - - - - - - - - - - - - - -
Mp2g06600.1 (LUP2)
 - - - - - - - - - - - - - - 1.9 4.49 - 2.52 - - - - - - - - - - - - - -
-1.89 - - 0.58 - -0.15 -0.93 - - 1.56 -1.26 - - -0.12 2.61 3.03 0.93 0.37 - -0.33 -1.37 - -1.25 -0.14 - -1.28 0.63 - - 0.12 -1.04 0.06
Mp2g09810.1 (APT1)
 0.83 - - - - - 3.29 2.92 - - - - - - - - - 1.71 1.65 - - - 1.69 1.69 - - - - - - - -
- - - - 2.38 - - - - - - - - - - 4.74 - - - - - - - - - - - - - - - -
2.2 - - 1.04 - - - - - 2.1 - - - - - - 1.04 - - 0.98 2.45 - - - 3.25 - - 1.01 - - - -
Mp2g10630.1 (NET1C)
 - - - - - - - - - - - - - - - 5.0 - - - - - - - - - - - - - - - -
Mp2g11450.1 (IRP6)
 - - - - - - - - - - - - - - 5.0 - - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.33 - -1.72 0.82 - 0.59 - -0.02 - - 0.15 -0.5 -0.54 -0.47 2.67 2.05 1.15 - 0.09 1.04 0.38 -1.23 0.1 -2.2 0.72 0.98 - -2.15 - - -1.91 -0.24
Mp2g12270.1 (CYP72A15)
 2.29 - - - - - - - - - - 1.3 1.29 - - 1.95 2.03 1.22 - 1.1 - - 2.17 - - 1.23 - - - - - 1.56
- - - - - - 1.16 - - - - - - - 0.7 4.62 - - 0.85 - - - 0.8 - - - - - - - - -
Mp2g14610.1 (mTERF34)
 - - - - - - - - - - - - - - - 5.0 - - - - - - - - - - - - - - - -
1.13 1.55 - -0.05 - 0.16 1.29 1.23 - 0.09 1.11 1.12 - - 3.02 0.14 - - 1.16 0.02 -0.14 - 0.25 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 3.77 - - - 2.58 2.61 - 2.65 - - - - - - - - -
Mp2g17790.1 (LEN1)
 - - - - - - - - - 2.59 - - - - - 4.53 - - - 1.5 - - - - - - - - - - - -
Mp2g18630.1 (PUB42)
 - - - - - - 1.77 1.61 - 1.3 0.3 1.57 - - 2.53 2.73 - 2.36 - - - - - - - 0.37 - - - - - -
Mp2g19620.1 (OMT1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.0 - - - - - - - - - - -
Mp2g20520.1 (CYP78A7)
 - - - - - - 1.92 1.69 3.13 - 1.54 2.55 - - - - 1.41 - - - 2.26 - - - - - - - - - - -
- 0.11 0.45 1.03 -0.02 - -0.9 - -0.1 1.79 -0.16 - -0.13 -1.08 0.68 2.48 1.09 0.85 - 2.43 - - - - - - - - - -0.9 - 1.19
Mp2g21350.1 (ftsh7)
 -0.47 -0.44 - 0.46 -0.23 -1.89 - -1.76 -1.93 - 0.35 0.98 -0.37 - 2.27 -2.23 0.39 0.58 - 1.59 0.76 -0.97 1.14 - 1.07 1.26 -1.96 0.94 -1.58 -0.7 -0.8 -
Mp2g24570.1 (emb1974)
 - - - - - - - 1.94 - - - - - - - 4.4 - - - - - - 2.82 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - 3.91 4.09 - - - - - - - - - - - - - - - -
0.85 2.18 - - - - - - - - - - - - 1.54 2.77 - - - - 2.56 - - - - 1.59 - - 2.81 - - -
- - - -0.39 - -0.03 -0.02 -1.76 - - 1.1 -1.36 - - -0.43 3.86 0.06 0.39 - 0.04 0.9 - 0.75 - 1.19 -0.69 -0.87 - -1.3 -1.36 - -
Mp3g13520.1 (PCK2)
 2.07 - - - - - 3.24 1.28 1.2 - 0.9 - - - - - - - - - 1.81 1.28 1.09 - - 0.98 - 0.81 - - - -
Mp3g15490.1 (STT3A)
 - - -0.27 0.83 0.14 0.63 0.66 -0.63 - -0.76 - 0.86 0.37 -0.84 1.01 2.67 2.26 - - 0.79 -0.04 -0.61 0.33 0.29 - -0.89 - - - - - -0.48
- 0.37 0.31 0.58 -0.24 - - - - -0.39 - 2.06 - - -0.54 4.26 -0.55 - - - - - -0.39 - - - - - - - - -0.12
Mp3g17040.1 (FUR1)
 - - - - - - - - - 3.4 - - - - - 3.51 - - - 3.34 - - - - - - - - - - - -
Mp3g18810.1 (E2-OGDH2)
 -1.93 0.61 - 2.09 -0.87 0.08 -0.36 0.17 -0.64 - 0.34 -0.76 - 0.9 2.63 1.66 -1.0 0.84 - -0.85 -0.06 1.29 0.21 -0.74 - - - - - - -0.44 -
Mp3g21590.1 (KUP7)
 - 0.87 - - - -0.44 - - - - 0.42 -0.52 1.08 - 3.75 0.91 1.86 0.43 - 1.64 0.23 - - - -0.66 - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.0 - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.0 - - - - - - - - - - -
- - - 3.4 - - - - - - - - - - 3.38 2.38 - 1.61 - - - - - - - 1.48 - - - - - -
- - - 1.94 - - - - - - 2.21 3.15 - - 3.41 - - - - - - - - - 2.01 - - - - - - -
Mp4g02100.1 (PROT1)
 1.83 - - 1.56 1.53 - 1.03 - - - - 1.65 1.7 - - - 0.42 0.6 - - - - - - 2.05 0.58 - - - 1.91 0.94 -
Mp4g03010.1 (ZIK4)
 - - - - - - - - - - - - - - - 5.0 - - - - - - - - - - - - - - - -
Mp4g03050.1 (EDM2)
 - - - - - - - - - - - - - - - 5.0 - - - - - - - - - - - - - - - -
Mp4g03390.1 (ROS3)
 - - - - - - - - - - - - - - - 4.02 - - - - - 2.47 2.35 - - 2.35 - - - - - -
- - - 2.31 - - 2.92 - - - - - - - 3.23 2.26 2.41 - - - - - - - - - - - - - - -
Mp4g10340.1 (MTM2)
 1.86 - - 1.69 - - 2.11 - - - - - - - - 4.38 - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 1.36 - 0.62 1.01 - - - - 0.7 - - 3.35 2.73 0.35 0.55 - 0.46 - - 0.51 - - - - - 0.93 - - -
Mp4g17140.1 (CYP705A32)
 - - - - - - - - - - - - - 2.3 - 4.76 - - - - - - - - - - - - - - - -
Mp4g18770.1 (PUM21)
 - - - 1.69 1.33 - 0.78 - - - - 2.45 - - 2.1 - 0.26 - 0.3 - 1.03 - 0.3 - - 2.24 - - - - 1.44 0.7
Mp4g22530.1 (LIG4)
 - - - 0.89 -1.07 - 0.23 - - -1.24 0.39 1.87 -0.24 0.45 0.15 3.74 -1.38 - - -1.36 - - 0.73 - - 0.7 - -1.02 -1.21 -0.98 -0.1 -
Mp5g01740.1 (CYP707A1)
 - - - - - - - - - - - - 2.75 - 2.54 4.28 - - - - - - - - - - - - - - - -
Mp5g02680.1 (ORP2B)
 - - - - - - - - - - - - - - 4.53 3.15 - - - - - - - - - - - - - - - -
Mp5g03250.1 (UVH6)
 2.95 - - 1.11 0.13 - 1.35 1.1 - 1.7 0.23 - - - 0.92 0.08 - 0.12 - 1.09 -0.07 - 0.2 - - - - 0.19 - - 1.3 -
Mp5g05670.1 (LecRK-V.9)
 0.61 - - - -0.48 - 0.23 - - 0.51 - -0.33 1.12 0.55 0.88 0.37 0.96 -0.43 0.5 - -0.78 - - -0.38 2.24 0.99 0.58 0.42 1.55 -0.16 -0.36 -
Mp5g09240.1 (CYP78A7)
 2.21 - - - - - - - - 3.12 - - 3.26 - - - - - 3.19 - - - - - - - - - - - - -
Mp5g12420.1 (NEK5)
 -0.31 1.94 - - - - 1.21 - - - - - - - 1.41 3.56 - - - - - - 1.5 - 0.47 - - - 2.15 - 0.97 -
2.42 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.06 - - - 3.12 3.26 - - - - - -
Mp5g16760.1 (TTR1)
 - - - - - - - - - 2.95 - - - - - 4.6 - - - - - - - - - - - - - - - -
Mp5g19210.1 (PRAF1)
 -1.03 0.34 - 0.62 - - 1.75 - -0.09 - - -0.05 0.82 - 2.94 2.12 0.7 -0.17 - 0.7 - - - - 1.33 -0.32 - - - - - 1.15
Mp5g20190.1 (MAN1)
 -1.2 1.83 - -0.39 - - 0.3 - 1.48 -0.24 -0.27 1.6 1.38 - - 2.25 - - - 2.04 - 1.8 1.44 - -0.24 - - - - - - -
Mp5g22370.1 (YUC9)
 - - - - - - - - - - - - - - 3.85 4.14 - - - - - - - - - - - - - - - -
Mp5g22860.1 (CNGC19)
 -1.26 - - 1.71 - - - 2.02 - - -0.53 -0.27 0.62 - 2.69 2.35 1.03 -0.5 - -0.53 -0.64 - - - -0.49 1.18 -0.23 - -0.29 -0.1 - -
- - - 0.11 -1.1 - -0.74 - -0.85 0.68 -0.63 - 2.19 - -1.1 3.79 -0.99 - 0.76 1.24 - - - - 0.15 - - 0.35 -0.75 - - -0.54
Mp5g24190.1 (beta1-COP)
 - - - - - - - - - - - - - - - 5.0 - - - - - - - - - - - - - - - -
Mp5g24270.1 (CHUP1)
 -0.65 1.62 - - - - 0.03 -0.3 1.67 1.1 -0.48 1.99 - -1.34 -0.63 - 0.41 1.16 - 0.03 -0.65 2.06 0.59 -1.44 -1.51 -0.5 - - -1.31 -1.12 - 1.15
- 2.3 - - - - - - - - - - - - 2.82 - - - - - 4.32 - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 5.0 - - - - - - - - - - - - - - - -
- 0.56 - -0.36 - 0.93 1.19 - 1.53 -0.18 -0.08 2.23 1.93 1.51 -0.41 -0.13 - - - -0.29 -0.36 - 1.39 - 0.72 - - 0.94 - - - -
0.01 - 2.18 0.49 - 1.89 - - - - 1.63 - - 1.79 2.07 - 1.6 0.67 - - 2.16 - - - 0.6 - - - - - - -
Mp6g05180.1 (MAN2)
 3.55 - - - - - - - - 4.34 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 1.66 0.93 - 2.34 - - 2.37 - 0.93 - - 1.7 1.74 - 0.86 - - 2.67 - - - - - - - - - - -
Mp6g07780.1 (PKT3)
 -2.2 - - 0.55 -1.28 -1.26 -0.15 - - 0.0 -1.21 -2.22 - - 2.59 2.53 1.64 -1.3 0.85 -0.82 -0.22 0.96 -0.27 -0.69 0.17 -0.84 -0.66 -1.27 - -0.46 -0.9 -0.02
1.12 - -1.13 0.44 - -0.71 0.78 -0.54 -0.65 -0.23 0.3 -1.68 - - 1.05 1.07 1.56 -1.75 -0.77 0.74 0.3 -1.82 1.04 0.28 -0.89 0.47 -0.71 -0.14 -1.73 0.94 -1.59 0.58
Mp6g10170.1 (SGS3)
 - 0.47 - 0.8 - 0.22 1.32 - - 2.27 1.05 1.09 - 1.12 - 3.09 -0.2 - - 2.21 - - - - - - - - - - - -
- - - 2.85 - - - - 1.52 - 1.5 1.66 1.44 1.53 - - - - - 1.31 - - 2.4 - 1.38 - - - - - - -
Mp6g11900.1 (CAP-D3)
 3.24 - - 2.34 - - - - - - - - 1.58 - - - 1.33 1.54 - - - - - - - - 2.44 - - - - 1.88
Mp6g12410.1 (BRCC36A)
 -1.92 0.76 -1.59 -0.64 -1.98 0.41 0.79 1.14 - 0.2 0.22 0.43 -2.09 -1.92 -0.67 2.0 0.6 - 0.18 -0.58 - -0.06 1.25 - 0.41 -0.15 -0.35 - -0.1 0.59 0.79 -0.12
Mp6g17460.1 (ZRK7)
 - - - - - - 3.14 - - - - - - - - 3.78 1.56 - - 2.69 - - - - - - - - - - - -
Mp6g18080.1 (RKFL3)
 - 1.89 - - - - - - - - - - 0.44 0.53 1.81 3.41 - - - - - - 0.47 - - - - - 0.49 1.66 2.43 -
- -0.68 - -1.37 -1.11 1.44 - -1.21 - 0.82 0.94 -1.07 -1.02 0.95 0.31 -1.09 0.78 -0.16 -1.16 1.36 2.2 -0.03 -0.09 -0.16 0.32 0.3 0.5 - - - -0.01 0.19
Mp7g05360.1 (SBT3.13)
 3.06 - - - - - - - - 3.79 - - - - - 2.39 2.21 - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 0.38 - - - - - - - - - 2.63 3.14 1.89 2.53 - - 0.44 0.35 - 1.16 - - 0.42 - - - - - -
Mp7g08010.1 (GPS1)
 0.77 -0.19 -1.78 -2.5 -2.26 0.4 1.42 -1.19 - -1.37 0.71 -0.19 -2.23 -2.23 -2.54 -1.48 - 1.01 -0.76 -0.43 2.58 -1.38 0.26 - 1.07 0.62 -1.25 -0.32 -2.19 1.9 -1.09 -1.89
Mp7g09370.1 (ZYP1)
 - - - - - - - - - - - - - - - 4.22 - - - - - - - - 2.11 - - - 3.19 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 5.0 - - - - - - - - - - - - - - - -
Mp7g17270.1 (BPM5)
 0.23 - - 0.02 1.16 - - - - - 0.29 0.28 0.2 0.27 2.3 3.62 1.7 - - - - - 1.22 - - - - - - - - -
Mp7g18650.1 (MTV9)
 - - - - - - - - - - - - - - - 5.0 - - - - - - - - - - - - - - - -
Mp7g18740.1 (TBL36)
 0.47 -0.33 - 1.21 - - -0.4 0.6 1.09 0.94 1.06 -0.54 2.27 - 0.17 1.68 0.87 - - 0.32 - - - -0.52 - 0.9 0.68 0.42 -0.59 - - -
- - - - - - - - - - - - - - 5.0 - - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.55 -0.04 -1.02 1.24 -0.32 - -0.93 0.18 -0.53 -1.63 -1.64 - -1.54 1.66 -1.74 3.23 1.42 -1.6 0.69 - -1.84 0.8 -0.06 0.48 -1.69 - - -1.57 -1.44 - -1.42 -1.13
Mp8g02060.1 (NdhM)
 - - - - - - - - - - - - - - - 5.0 - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - 2.91 3.11 3.56 - - - - - - - - 2.01 - - - - - -
Mp8g04820.1 (LPR2)
 1.25 0.47 -3.21 0.35 0.03 0.79 0.43 0.45 -6.06 -1.61 0.76 -2.75 0.61 -4.44 0.43 -0.32 0.09 -0.24 -4.55 0.67 1.34 -4.24 -0.62 -5.98 0.58 -0.42 1.18 0.19 -0.25 -0.61 -0.29 -0.48
1.76 -3.1 - 1.95 0.36 0.6 1.53 0.54 -1.62 -2.26 1.28 -2.59 0.33 - 0.9 -0.78 -0.46 -0.99 - -0.31 0.76 - -1.51 - -1.05 0.59 0.52 -3.79 -1.81 -0.7 0.37 -0.11
Mp8g06700.1 (GPX5)
 - - - - - - - - - 3.11 - - - - - - - - - - 4.55 - - - - - - - - - - -
0.22 0.34 -0.82 -0.05 -0.14 0.37 1.23 0.08 0.5 0.24 0.16 0.36 0.69 -1.08 -0.48 -0.41 0.01 -0.37 -1.27 -0.97 0.14 -0.26 0.36 -0.7 -0.31 -0.19 -1.33 0.16 0.16 0.03 0.22 -0.24
Mp8g09580.1 (ASE3)
 - - - - - - - - - - - - - - - 5.0 - - - - - - - - - - - - - - - -
3.56 - - - - - - - - - - - - - - - 4.34 - - - - - - - - - - - - - - -
Mp8g18800.1 (SIG3)
 - - - - - - - - - - - - - - 3.62 4.3 - - - - - - - - - - - - - - - -
Mp8g18850.1 (GHR1)
 - - - 0.31 -0.1 - - - - - 0.43 0.52 - - 3.17 3.34 2.74 0.24 - - - - - - - - - - - - - -
-0.09 - - - - - - 0.89 -0.05 -0.27 -0.3 1.45 - - -0.48 3.69 1.19 1.67 - - -0.53 - -0.28 - - -0.3 -0.05 0.58 - - - -
Mpzg01400.1 (MBD13)
 - - - - - - - - - - - - - - 4.16 2.86 1.73 1.85 - - - - - - - - - - - - - -
Mpzg01450.1 (LBD25)
 3.34 - - - - - - - - - - 2.07 - - 3.29 2.98 - - - - - - - - - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.