Heatmap: Cluster_77 (Marchantia polymorpha (Mpo) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Control
Cold (3°C)
Dark (3 days)
Heat (33°C)
Light (435 uEm-2s-1)
Osmotic (100 mM mannitol)
Nitrogen deficiency (0 mM KNO3)
Salt (40 mM NaCl)
Cold-Dark
Cold-Light
Cold-Mannitol
Cold-Nitrogen deficiency
Cold-Salt
Heat-Dark
Heat-Mannitol
Heat-Nitrogen deficiency
Heat-Salt
Light-Salt
Mannitol-Dark
Mannitol-Light
Mannitol-Nitrogen deficiency
Nitrogen deficiency-Dark
Nitrogen deficiency-Light
Salt-Dark
Salt-Mannitol
Salt-Nitrogen deficiency
ZT2 (2 hours after light)
ZT6 (6 hours after light)
ZT10 (10 hours after light)
ZT14 (2 hours after dark)
ZT18 (6 hours after dark)
ZT22 (10 hours after dark)
0.43 0.3 0.39 0.71 0.54 0.53 0.54 0.52 0.34 0.31 0.38 0.35 0.37 0.31 0.8 1.0 0.77 0.67 0.44 0.66 0.51 0.41 0.68 0.42 0.55 0.53 0.38 0.39 0.39 0.44 0.5 0.48
Mp1g00190.1 (PME31)
0.63 0.34 0.58 0.97 0.75 0.63 0.55 0.63 0.37 0.37 0.39 0.24 0.38 0.78 0.95 1.0 0.91 0.87 0.67 0.87 0.59 0.67 0.72 0.62 0.59 0.59 0.55 0.63 0.68 0.55 0.52 0.47
0.34 0.22 0.2 0.89 0.6 0.38 0.34 0.43 0.2 0.28 0.28 0.22 0.26 0.38 0.84 1.0 0.83 0.87 0.25 0.46 0.35 0.25 0.68 0.27 0.31 0.34 0.25 0.27 0.28 0.21 0.16 0.18
0.1 0.09 0.03 0.73 0.28 0.09 0.36 0.14 0.11 0.26 0.16 0.28 0.2 0.13 0.71 1.0 0.9 0.34 0.17 0.24 0.25 0.08 0.36 0.05 0.21 0.16 0.16 0.11 0.11 0.08 0.09 0.07
Mp1g06470.1 (BRP1)
0.51 0.26 0.5 0.9 0.52 0.44 0.56 0.46 0.58 0.32 0.46 0.37 0.41 0.64 0.87 1.0 0.99 0.65 0.67 0.56 0.47 0.69 0.72 0.54 0.46 0.58 0.5 0.56 0.55 0.43 0.48 0.46
Mp1g11490.1 (EXPRS)
0.41 0.31 0.53 0.85 0.38 0.42 0.61 0.44 0.43 0.3 0.43 0.36 0.39 0.56 0.75 1.0 0.78 0.45 0.63 0.43 0.44 0.69 0.56 0.52 0.42 0.5 0.42 0.46 0.45 0.41 0.43 0.39
0.28 0.13 0.13 0.65 0.4 0.35 0.36 0.37 0.08 0.15 0.29 0.15 0.21 0.18 1.0 0.99 0.94 0.47 0.26 0.61 0.42 0.23 0.6 0.21 0.5 0.36 0.37 0.41 0.37 0.39 0.47 0.39
Mp1g25110.1 (NIT1)
0.63 0.45 0.56 0.96 0.75 0.68 0.64 0.67 0.49 0.36 0.53 0.41 0.5 0.64 0.99 1.0 0.99 0.74 0.67 0.75 0.67 0.64 0.85 0.59 0.66 0.68 0.57 0.64 0.67 0.62 0.7 0.59
0.53 0.29 0.46 0.88 0.64 0.59 0.6 0.52 0.31 0.33 0.39 0.3 0.39 0.6 1.0 0.96 0.86 0.76 0.55 0.66 0.59 0.61 0.89 0.49 0.59 0.57 0.45 0.48 0.56 0.51 0.57 0.41
Mp1g26930.1 (ACD11)
0.48 0.28 0.47 0.89 0.62 0.53 0.53 0.52 0.39 0.29 0.36 0.33 0.33 0.45 0.74 1.0 0.81 0.63 0.51 0.61 0.51 0.49 0.68 0.52 0.54 0.53 0.44 0.46 0.49 0.46 0.48 0.39
Mp1g28640.1 (PSK5)
0.57 0.19 0.28 0.94 0.68 0.43 0.62 0.39 0.14 0.2 0.18 0.19 0.17 0.47 0.96 0.68 1.0 0.56 0.32 0.49 0.49 0.34 0.77 0.35 0.39 0.46 0.43 0.46 0.4 0.39 0.37 0.37
0.26 0.22 0.51 0.92 0.38 0.35 0.44 0.22 0.18 0.19 0.2 0.37 0.19 0.6 0.86 1.0 0.86 0.43 0.61 0.43 0.35 0.73 0.68 0.41 0.24 0.39 0.14 0.26 0.29 0.32 0.41 0.27
0.37 0.15 0.14 0.89 0.33 0.31 0.52 0.47 0.14 0.21 0.2 0.29 0.24 0.6 0.82 0.87 1.0 0.53 0.25 0.34 0.33 0.25 0.52 0.22 0.36 0.51 0.26 0.27 0.33 0.44 0.28 0.22
Mp2g13310.1 (BUB3.2)
0.41 0.18 0.18 0.94 0.37 0.38 0.55 0.56 0.19 0.23 0.23 0.32 0.27 0.71 0.88 0.93 1.0 0.59 0.32 0.4 0.39 0.31 0.5 0.31 0.42 0.54 0.29 0.3 0.37 0.5 0.32 0.25
Mp2g20080.1 (SMC2)
0.09 0.03 0.25 0.58 0.22 0.06 0.36 0.1 0.03 0.05 0.06 0.1 0.02 0.25 0.68 1.0 0.79 0.28 0.18 0.23 0.22 0.27 0.37 0.17 0.13 0.12 0.16 0.15 0.06 0.18 0.11 0.12
0.41 0.09 0.38 0.99 0.63 0.48 0.4 0.47 0.27 0.12 0.16 0.14 0.15 0.48 0.81 0.86 1.0 0.82 0.46 0.8 0.42 0.51 0.7 0.69 0.5 0.36 0.53 0.47 0.44 0.37 0.43 0.49
Mp3g04210.1 (B5 #6)
0.45 0.33 0.45 0.81 0.5 0.47 0.57 0.49 0.5 0.27 0.34 0.34 0.3 0.42 0.76 1.0 0.91 0.61 0.57 0.6 0.48 0.56 0.63 0.54 0.51 0.56 0.45 0.42 0.52 0.56 0.59 0.45
Mp3g04780.1 (SPMS)
0.35 0.22 0.17 0.76 0.54 0.31 0.39 0.36 0.07 0.14 0.13 0.21 0.16 0.18 0.8 1.0 0.58 0.58 0.18 0.29 0.23 0.23 0.58 0.1 0.34 0.31 0.13 0.19 0.26 0.31 0.19 0.22
Mp3g10540.1 (CRM3)
0.34 0.13 0.3 0.71 0.48 0.39 0.42 0.38 0.1 0.16 0.18 0.23 0.13 0.2 0.83 1.0 0.94 0.47 0.37 0.43 0.37 0.29 0.52 0.38 0.36 0.39 0.28 0.29 0.33 0.35 0.33 0.29
0.7 0.41 0.65 1.0 0.86 0.68 0.63 0.65 0.59 0.46 0.56 0.42 0.5 0.76 0.94 0.97 0.99 0.99 0.8 0.83 0.64 0.74 0.95 0.61 0.67 0.7 0.67 0.73 0.69 0.54 0.62 0.62
0.38 0.3 0.31 1.0 0.79 0.46 0.44 0.47 0.33 0.53 0.52 0.32 0.45 0.4 0.94 0.93 0.96 0.74 0.48 0.78 0.52 0.42 0.82 0.4 0.59 0.48 0.49 0.48 0.44 0.42 0.42 0.37
Mp3g19430.1 (ASG3)
0.38 0.2 0.34 0.97 0.69 0.46 0.38 0.5 0.27 0.25 0.4 0.19 0.4 0.53 0.99 0.86 1.0 0.73 0.5 0.73 0.47 0.38 0.69 0.49 0.51 0.5 0.44 0.53 0.46 0.34 0.33 0.35
0.19 0.14 0.23 1.0 0.45 0.23 0.22 0.17 0.13 0.06 0.12 0.12 0.18 0.42 0.83 0.84 0.91 0.48 0.21 0.4 0.24 0.36 0.56 0.14 0.2 0.25 0.29 0.21 0.26 0.17 0.14 0.16
Mp4g00080.1 (SAUR37)
0.49 0.32 0.48 0.83 0.57 0.47 0.52 0.49 0.49 0.32 0.49 0.33 0.42 0.52 0.84 1.0 0.87 0.66 0.62 0.64 0.54 0.56 0.81 0.5 0.52 0.61 0.44 0.51 0.53 0.46 0.5 0.46
0.7 0.26 0.66 1.0 0.9 0.61 0.5 0.63 0.33 0.66 0.3 0.19 0.27 0.84 0.84 0.92 0.99 0.71 0.77 0.77 0.58 0.65 0.67 0.67 0.56 0.57 0.51 0.77 0.73 0.58 0.53 0.55
0.29 0.18 0.2 0.7 0.24 0.39 0.49 0.43 0.22 0.17 0.24 0.28 0.24 0.1 0.96 1.0 1.0 0.53 0.21 0.42 0.44 0.22 0.51 0.19 0.43 0.41 0.26 0.25 0.3 0.41 0.66 0.49
Mp4g03370.1 (ARS1)
0.63 0.35 0.45 0.95 0.55 0.59 0.66 0.58 0.55 0.3 0.55 0.44 0.45 0.61 0.95 1.0 0.95 0.64 0.64 0.63 0.64 0.66 0.79 0.61 0.63 0.66 0.59 0.59 0.68 0.57 0.56 0.49
Mp4g03630.1 (PGP1)
0.4 0.21 0.18 0.86 0.39 0.33 0.47 0.39 0.12 0.14 0.12 0.18 0.18 0.27 0.81 1.0 0.96 0.43 0.12 0.44 0.35 0.23 0.59 0.11 0.3 0.31 0.31 0.39 0.37 0.34 0.46 0.37
0.45 0.28 0.26 0.94 0.42 0.49 0.56 0.49 0.22 0.24 0.39 0.42 0.38 0.42 0.87 1.0 0.87 0.62 0.41 0.57 0.54 0.46 0.69 0.31 0.52 0.63 0.47 0.52 0.53 0.56 0.58 0.5
0.37 0.06 0.27 0.86 0.66 0.37 0.44 0.44 0.16 0.16 0.08 0.1 0.07 0.34 0.91 1.0 0.98 0.59 0.31 0.62 0.42 0.34 0.8 0.31 0.41 0.43 0.34 0.39 0.39 0.44 0.47 0.41
0.25 0.1 0.41 0.8 0.19 0.17 0.29 0.16 0.2 0.07 0.07 0.13 0.11 0.3 0.73 1.0 0.85 0.38 0.45 0.31 0.17 0.72 0.4 0.55 0.17 0.25 0.06 0.12 0.15 0.19 0.14 0.08
Mp4g13160.1 (FRS10)
0.16 0.08 0.2 0.61 0.14 0.16 0.5 0.23 0.13 0.13 0.11 0.18 0.1 0.23 0.71 1.0 0.73 0.3 0.37 0.3 0.24 0.23 0.48 0.23 0.16 0.28 0.11 0.15 0.17 0.14 0.16 0.15
Mp4g19970.1 (PPa1)
0.13 0.06 0.19 0.74 0.22 0.18 0.27 0.15 0.06 0.06 0.08 0.11 0.04 0.15 0.75 1.0 0.77 0.23 0.25 0.35 0.18 0.09 0.38 0.16 0.27 0.13 0.11 0.1 0.15 0.15 0.19 0.23
0.28 0.16 0.23 0.57 0.37 0.28 0.33 0.34 0.1 0.15 0.1 0.17 0.1 0.26 0.58 1.0 0.76 0.51 0.27 0.28 0.24 0.29 0.58 0.27 0.28 0.33 0.25 0.24 0.21 0.31 0.33 0.32
Mp4g22240.1 (NACA5)
0.32 0.11 0.25 0.89 0.44 0.19 0.38 0.3 0.22 0.19 0.19 0.16 0.2 0.5 0.72 0.92 1.0 0.53 0.35 0.37 0.24 0.46 0.72 0.28 0.25 0.36 0.46 0.33 0.26 0.22 0.3 0.29
0.58 0.46 0.44 0.85 0.76 0.56 0.55 0.58 0.38 0.46 0.51 0.53 0.52 0.51 0.91 1.0 0.97 0.73 0.56 0.7 0.58 0.49 0.75 0.56 0.61 0.6 0.58 0.53 0.52 0.53 0.56 0.54
Mp5g08110.1 (CARB)
0.36 0.13 0.2 1.0 0.88 0.3 0.22 0.28 0.06 0.11 0.06 0.05 0.1 0.3 0.76 0.58 0.96 0.54 0.22 0.44 0.19 0.21 0.68 0.27 0.2 0.22 0.28 0.22 0.24 0.15 0.26 0.3
Mp5g12430.1 (TBL3)
0.52 0.38 0.3 0.93 0.56 0.52 0.51 0.54 0.37 0.43 0.54 0.43 0.53 0.42 0.98 1.0 0.95 0.69 0.54 0.69 0.59 0.5 0.64 0.4 0.62 0.61 0.53 0.59 0.51 0.66 0.63 0.6
Mp5g13570.1 (ATH12)
0.24 0.23 0.28 0.85 0.3 0.26 0.63 0.26 0.26 0.23 0.27 0.32 0.27 0.34 0.84 1.0 0.85 0.44 0.49 0.32 0.29 0.44 0.51 0.4 0.25 0.33 0.21 0.17 0.2 0.25 0.25 0.23
Mp6g00670.1 (ABCG9)
0.09 0.02 0.02 0.95 0.36 0.1 0.07 0.14 0.03 0.0 0.01 0.01 0.03 0.13 0.83 0.83 1.0 0.71 0.1 0.71 0.13 0.06 0.61 0.02 0.28 0.15 0.26 0.09 0.09 0.03 0.1 0.13
Mp6g01220.1 (IMPA1)
0.3 0.18 0.36 1.0 0.4 0.2 0.31 0.22 0.45 0.19 0.22 0.25 0.18 0.42 0.7 0.79 0.86 0.43 0.43 0.31 0.24 0.59 0.63 0.34 0.18 0.3 0.33 0.32 0.23 0.16 0.25 0.26
0.23 0.2 0.02 0.79 0.47 0.15 0.3 0.23 0.02 0.21 0.24 0.13 0.22 0.08 0.8 1.0 0.74 0.51 0.11 0.49 0.26 0.12 0.68 0.01 0.14 0.32 0.23 0.24 0.14 0.1 0.14 0.29
Mp6g17560.1 (CRPK1)
0.25 0.04 0.14 0.88 0.36 0.21 0.22 0.38 0.02 0.23 0.06 0.15 0.07 0.26 0.8 0.94 1.0 0.96 0.09 0.35 0.25 0.22 0.63 0.09 0.24 0.33 0.17 0.42 0.38 0.28 0.19 0.17
0.46 0.33 0.38 0.75 0.45 0.43 0.57 0.39 0.43 0.37 0.42 0.5 0.46 0.47 0.74 1.0 0.78 0.58 0.57 0.52 0.48 0.52 0.7 0.48 0.45 0.53 0.35 0.44 0.42 0.5 0.48 0.49
Mp7g09240.1 (NRT2.4)
0.38 0.18 0.24 0.92 0.33 0.32 0.62 0.34 0.1 0.07 0.15 0.36 0.2 0.34 0.81 1.0 0.97 0.46 0.21 0.53 0.46 0.52 0.74 0.25 0.31 0.38 0.15 0.33 0.26 0.24 0.19 0.2
Mp7g16300.1 (URP10)
0.31 0.11 0.21 0.88 0.57 0.29 0.4 0.38 0.2 0.14 0.15 0.19 0.12 0.44 0.67 1.0 0.81 0.44 0.31 0.4 0.32 0.31 0.65 0.33 0.25 0.29 0.26 0.36 0.38 0.27 0.32 0.21
Mp7g16800.1 (RecQl3)
0.32 0.22 0.24 0.72 0.31 0.33 0.55 0.28 0.24 0.16 0.29 0.31 0.27 0.35 0.7 1.0 0.72 0.46 0.39 0.48 0.39 0.31 0.59 0.3 0.36 0.41 0.25 0.32 0.35 0.29 0.35 0.32
0.41 0.29 0.32 0.79 0.55 0.43 0.49 0.41 0.32 0.31 0.34 0.27 0.32 0.34 0.86 1.0 0.84 0.58 0.38 0.61 0.47 0.33 0.78 0.34 0.48 0.49 0.41 0.42 0.42 0.46 0.38 0.46
Mp7g19140.1 (BBX8)
0.44 0.23 0.33 0.96 0.83 0.49 0.44 0.5 0.31 0.27 0.35 0.21 0.37 0.41 1.0 0.87 1.0 0.82 0.54 0.95 0.49 0.38 0.77 0.5 0.53 0.46 0.46 0.49 0.49 0.44 0.43 0.44
0.13 0.1 0.22 0.53 0.26 0.14 0.59 0.15 0.19 0.29 0.13 0.31 0.09 0.2 0.77 1.0 0.76 0.34 0.2 0.29 0.2 0.15 0.56 0.19 0.2 0.25 0.06 0.12 0.15 0.18 0.13 0.17
Mp8g05610.1 (HIL1)
0.36 0.15 0.28 1.0 0.53 0.33 0.36 0.35 0.13 0.17 0.15 0.16 0.18 0.3 0.7 0.79 0.87 0.6 0.25 0.52 0.35 0.29 0.69 0.23 0.34 0.43 0.49 0.44 0.34 0.27 0.34 0.37
Mp8g06620.1 (MED21)
0.55 0.36 0.37 0.88 0.65 0.54 0.56 0.48 0.37 0.41 0.42 0.53 0.44 0.45 0.87 1.0 0.86 0.68 0.46 0.58 0.55 0.46 0.74 0.47 0.48 0.59 0.42 0.47 0.48 0.5 0.46 0.39
Mp8g10030.1 (PAP8)
0.38 0.31 0.28 0.82 0.59 0.48 0.45 0.47 0.36 0.37 0.48 0.26 0.34 0.19 1.0 0.99 0.99 0.65 0.46 0.73 0.52 0.38 0.62 0.41 0.51 0.48 0.47 0.41 0.5 0.65 0.66 0.49
Mp8g14360.1 (APA1)
0.28 0.13 0.35 0.71 0.33 0.32 0.59 0.3 0.26 0.19 0.17 0.22 0.16 0.46 0.71 1.0 0.74 0.43 0.37 0.44 0.34 0.44 0.55 0.32 0.36 0.36 0.23 0.31 0.31 0.3 0.29 0.25

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)