Heatmap: Cluster_167 (Marchantia polymorpha (Mpo) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Control
Cold (3°C)
Dark (3 days)
Heat (33°C)
Light (435 uEm-2s-1)
Osmotic (100 mM mannitol)
Nitrogen deficiency (0 mM KNO3)
Salt (40 mM NaCl)
Cold-Dark
Cold-Light
Cold-Mannitol
Cold-Nitrogen deficiency
Cold-Salt
Heat-Dark
Heat-Mannitol
Heat-Nitrogen deficiency
Heat-Salt
Light-Salt
Mannitol-Dark
Mannitol-Light
Mannitol-Nitrogen deficiency
Nitrogen deficiency-Dark
Nitrogen deficiency-Light
Salt-Dark
Salt-Mannitol
Salt-Nitrogen deficiency
ZT2 (2 hours after light)
ZT6 (6 hours after light)
ZT10 (10 hours after light)
ZT14 (2 hours after dark)
ZT18 (6 hours after dark)
ZT22 (10 hours after dark)
0.38 0.21 0.5 0.25 0.36 0.3 0.25 0.31 1.0 0.22 0.19 0.16 0.2 0.4 0.2 0.2 0.23 0.3 0.45 0.22 0.25 0.42 0.36 0.4 0.23 0.28 0.42 0.35 0.34 0.3 0.46 0.52
Mp1g07340.1 (CUL4)
0.67 0.54 0.82 0.61 0.67 0.59 0.68 0.59 0.87 0.57 0.59 0.58 0.55 0.76 0.53 0.65 0.55 0.58 1.0 0.57 0.56 0.88 0.7 0.93 0.54 0.62 0.65 0.7 0.71 0.66 0.66 0.66
0.41 0.17 0.65 0.21 0.15 0.29 0.22 0.31 1.0 0.18 0.18 0.13 0.16 0.45 0.24 0.29 0.28 0.17 0.55 0.16 0.21 0.58 0.15 0.63 0.22 0.24 0.23 0.73 0.96 0.51 0.36 0.34
Mp1g11350.1 (RBSK)
0.22 0.07 0.33 0.21 0.24 0.19 0.2 0.17 1.0 0.23 0.1 0.1 0.08 0.4 0.09 0.11 0.11 0.19 0.29 0.14 0.17 0.31 0.25 0.27 0.18 0.22 0.32 0.25 0.19 0.05 0.04 0.05
0.54 0.37 0.71 0.31 0.17 0.35 0.33 0.33 1.0 0.36 0.59 0.52 0.49 0.56 0.29 0.4 0.28 0.29 0.82 0.27 0.4 0.89 0.35 0.63 0.4 0.57 0.42 0.51 0.57 0.39 0.44 0.41
Mp1g13850.1 (RBGA)
0.55 0.46 0.66 0.61 0.58 0.44 0.51 0.48 1.0 0.5 0.53 0.38 0.46 0.8 0.61 0.57 0.62 0.54 0.81 0.58 0.47 0.69 0.63 0.89 0.46 0.49 0.76 0.65 0.53 0.65 0.79 0.86
0.44 0.15 0.66 0.41 0.29 0.38 0.28 0.38 0.71 0.31 0.32 0.18 0.31 0.68 0.46 0.31 0.47 0.36 0.93 0.39 0.42 0.8 0.36 1.0 0.41 0.37 0.42 0.77 0.65 0.76 0.59 0.51
Mp1g16870.1 (MTI1)
0.58 0.47 0.69 0.57 0.52 0.48 0.53 0.52 1.0 0.39 0.55 0.45 0.47 0.68 0.57 0.53 0.59 0.54 0.86 0.54 0.48 0.77 0.69 0.73 0.48 0.58 0.61 0.62 0.65 0.69 0.78 0.79
0.64 0.47 0.85 0.68 0.52 0.56 0.61 0.56 0.8 0.48 0.64 0.49 0.59 0.66 0.75 0.7 0.78 0.56 1.0 0.54 0.56 0.93 0.63 0.87 0.55 0.65 0.55 0.65 0.68 0.82 0.78 0.63
0.13 0.09 0.63 0.01 0.17 0.06 0.38 0.24 1.0 0.19 0.02 0.24 0.09 0.01 0.01 0.06 0.01 0.17 0.21 0.03 0.07 0.55 0.16 0.24 0.04 0.07 0.14 0.05 0.02 0.07 0.12 0.11
Mp1g27940.1 (MadA3)
0.36 0.22 0.44 0.09 0.04 0.11 0.15 0.25 1.0 0.12 0.21 0.32 0.25 0.19 0.21 0.16 0.1 0.12 0.96 0.18 0.11 0.94 0.07 0.91 0.13 0.14 0.14 0.1 0.11 0.25 0.33 0.34
0.5 0.29 0.85 0.39 0.54 0.41 0.42 0.54 0.91 0.46 0.37 0.37 0.36 0.77 0.4 0.37 0.38 0.63 1.0 0.48 0.44 0.99 0.63 0.97 0.42 0.47 0.42 0.79 0.71 0.56 0.59 0.57
0.59 0.39 0.69 0.46 0.4 0.46 0.47 0.44 1.0 0.4 0.49 0.37 0.52 0.77 0.41 0.51 0.46 0.48 0.73 0.43 0.47 0.73 0.5 0.66 0.44 0.63 0.54 0.64 0.71 0.6 0.59 0.5
Mp2g07460.1 (HDH1)
0.57 0.36 0.75 0.42 0.43 0.47 0.51 0.47 0.8 0.52 0.42 0.45 0.4 0.69 0.38 0.47 0.38 0.4 1.0 0.46 0.44 0.9 0.53 0.75 0.42 0.5 0.51 0.6 0.56 0.61 0.7 0.69
0.38 0.23 1.0 0.25 0.12 0.15 0.25 0.12 0.51 0.07 0.05 0.06 0.06 0.63 0.07 0.18 0.08 0.06 0.24 0.03 0.09 0.57 0.13 0.23 0.04 0.2 0.2 0.4 0.6 0.28 0.3 0.34
0.39 0.12 0.3 0.21 0.26 0.32 0.28 0.27 1.0 0.37 0.14 0.24 0.1 0.3 0.2 0.32 0.2 0.22 0.34 0.2 0.26 0.34 0.32 0.35 0.23 0.27 0.3 0.29 0.3 0.34 0.34 0.34
Mp2g20700.1 (PRK1)
0.06 0.03 0.53 0.06 0.18 0.04 0.04 0.07 1.0 0.04 0.06 0.01 0.09 0.04 0.14 0.21 0.09 0.07 0.1 0.23 0.07 0.3 0.15 0.05 0.11 0.08 0.12 0.08 0.01 0.07 0.17 0.25
Mp2g23620.1 (MSL2)
0.52 0.32 0.53 0.29 0.41 0.39 0.45 0.41 1.0 0.58 0.35 0.39 0.33 0.62 0.29 0.34 0.31 0.57 0.7 0.44 0.39 0.62 0.51 0.63 0.39 0.43 0.36 0.37 0.38 0.43 0.57 0.53
0.91 0.72 0.88 0.36 0.44 0.58 0.57 0.61 1.0 0.5 0.69 0.82 0.68 0.45 0.32 0.31 0.32 0.62 0.95 0.55 0.5 0.99 0.58 0.82 0.53 0.65 0.66 0.59 0.52 0.5 0.64 0.81
Mp3g09570.1 (WRKY21)
0.61 0.35 0.83 0.38 0.56 0.56 0.39 0.5 1.0 0.39 0.52 0.35 0.45 0.66 0.35 0.28 0.36 0.58 0.95 0.56 0.49 0.92 0.56 0.96 0.53 0.53 0.43 0.64 0.63 0.58 0.65 0.56
0.61 0.37 1.0 0.35 0.35 0.39 0.49 0.54 0.99 0.34 0.28 0.23 0.2 0.19 0.3 0.37 0.3 0.42 0.83 0.3 0.29 0.84 0.37 0.66 0.27 0.32 0.38 0.45 0.53 0.58 0.62 0.47
Mp3g11900.1 (CIB3)
0.46 0.27 0.69 0.42 0.17 0.3 0.27 0.22 1.0 0.26 0.3 0.1 0.26 0.36 0.19 0.19 0.27 0.13 0.34 0.12 0.21 0.46 0.15 0.33 0.2 0.29 0.27 0.56 0.8 0.28 0.26 0.19
Mp3g17350.1 (PIF1)
0.69 0.51 0.58 0.53 0.46 0.44 0.38 0.43 1.0 0.42 0.55 0.4 0.49 0.72 0.42 0.38 0.55 0.37 0.68 0.33 0.4 0.66 0.51 0.68 0.3 0.48 0.69 0.81 0.69 0.37 0.53 0.57
0.48 0.19 0.58 0.27 0.28 0.43 0.31 0.42 1.0 0.19 0.23 0.15 0.19 0.52 0.35 0.22 0.36 0.36 0.56 0.32 0.38 0.78 0.32 0.69 0.39 0.43 0.53 0.61 0.59 0.53 0.56 0.51
0.36 0.39 0.46 0.19 0.18 0.25 0.33 0.21 1.0 0.26 0.15 0.35 0.13 0.21 0.25 0.23 0.22 0.33 0.99 0.29 0.22 0.63 0.19 0.84 0.2 0.26 0.25 0.42 0.52 0.39 0.53 0.38
Mp4g13360.1 (NF-YB3)
0.51 0.46 0.57 0.35 0.62 0.48 0.49 0.47 1.0 0.58 0.59 0.45 0.57 0.57 0.33 0.31 0.33 0.51 0.69 0.47 0.48 0.61 0.57 0.69 0.44 0.49 0.47 0.61 0.62 0.51 0.44 0.39
Mp4g13840.1 (ASNAP)
0.45 0.16 0.52 0.23 0.18 0.24 0.4 0.25 1.0 0.36 0.12 0.27 0.14 0.55 0.22 0.43 0.23 0.24 0.58 0.21 0.25 0.73 0.44 0.81 0.23 0.3 0.15 0.19 0.25 0.39 0.38 0.35
Mp5g03890.1 (WXR3)
0.67 0.36 0.6 0.67 0.59 0.54 0.56 0.49 0.91 0.4 0.59 0.39 0.45 1.0 0.54 0.74 0.58 0.59 0.9 0.51 0.59 0.78 0.67 0.92 0.54 0.69 0.77 0.75 0.71 0.73 0.87 0.77
Mp5g06180.1 (NOT3)
0.61 0.51 0.69 0.44 0.49 0.55 0.61 0.58 1.0 0.68 0.66 0.53 0.57 0.53 0.47 0.45 0.47 0.57 0.79 0.53 0.55 0.71 0.58 0.68 0.6 0.62 0.59 0.65 0.67 0.59 0.55 0.52
0.26 0.2 0.46 0.38 0.22 0.22 0.25 0.28 1.0 0.26 0.21 0.24 0.22 0.16 0.36 0.3 0.32 0.29 0.44 0.32 0.22 0.47 0.19 0.35 0.25 0.19 0.14 0.18 0.23 0.43 0.29 0.21
0.37 0.15 0.49 0.15 0.15 0.12 0.16 0.22 1.0 0.25 0.11 0.16 0.1 0.26 0.14 0.13 0.14 0.22 0.47 0.14 0.14 0.48 0.13 0.56 0.12 0.17 0.11 0.15 0.17 0.35 0.26 0.25
Mp5g13170.1 (PAM71)
0.29 0.17 0.58 0.32 0.37 0.27 0.24 0.31 0.92 0.39 0.23 0.13 0.18 0.42 0.32 0.28 0.34 0.34 0.95 0.42 0.32 0.57 0.46 1.0 0.33 0.33 0.51 0.37 0.31 0.49 0.69 0.84
0.46 0.21 0.61 0.04 0.19 0.12 0.35 0.26 1.0 0.26 0.1 0.19 0.2 0.03 0.01 0.06 0.02 0.18 0.63 0.13 0.16 0.63 0.21 0.53 0.17 0.19 0.17 0.15 0.28 0.22 0.3 0.26
0.5 0.3 0.81 0.07 0.19 0.17 0.34 0.22 1.0 0.44 0.12 0.21 0.24 0.14 0.03 0.07 0.05 0.25 0.65 0.11 0.19 0.83 0.25 0.72 0.16 0.27 0.26 0.3 0.18 0.21 0.34 0.27
0.53 0.4 0.73 0.35 0.43 0.42 0.41 0.47 1.0 0.53 0.57 0.5 0.56 0.52 0.33 0.39 0.37 0.42 0.69 0.39 0.38 0.76 0.49 0.65 0.4 0.48 0.41 0.55 0.55 0.56 0.53 0.53
Mp5g15080.1 (PBCP)
0.4 0.16 0.68 0.4 0.18 0.3 0.3 0.29 1.0 0.32 0.2 0.19 0.16 0.47 0.38 0.42 0.41 0.22 0.72 0.2 0.28 0.66 0.26 0.7 0.28 0.33 0.3 0.44 0.46 0.51 0.55 0.51
0.37 0.18 0.3 0.15 0.37 0.21 0.27 0.17 1.0 0.35 0.12 0.11 0.09 0.3 0.08 0.11 0.07 0.15 0.24 0.12 0.16 0.27 0.15 0.29 0.15 0.15 0.28 0.38 0.43 0.14 0.13 0.1
0.6 0.39 0.7 0.52 0.41 0.42 0.52 0.42 1.0 0.45 0.37 0.41 0.35 0.69 0.4 0.58 0.47 0.46 0.71 0.35 0.39 0.68 0.53 0.71 0.33 0.48 0.4 0.57 0.63 0.5 0.46 0.43
Mp5g19770.1 (TN21)
0.46 0.31 0.57 0.43 0.09 0.35 0.24 0.26 1.0 0.14 0.42 0.29 0.36 0.28 0.5 0.32 0.43 0.13 0.45 0.21 0.26 0.87 0.14 0.4 0.25 0.24 0.73 0.67 0.4 0.24 0.67 0.46
Mp5g22520.1 (COILIN)
0.48 0.29 0.74 0.57 0.41 0.49 0.5 0.47 0.56 0.34 0.45 0.34 0.43 0.69 0.59 0.58 0.58 0.49 1.0 0.51 0.49 0.91 0.51 0.83 0.51 0.52 0.33 0.43 0.52 0.82 0.71 0.52
Mp5g22750.1 (KAT1)
0.27 0.13 0.35 0.14 0.22 0.26 0.4 0.27 1.0 0.31 0.16 0.4 0.17 0.2 0.13 0.14 0.13 0.22 0.38 0.23 0.3 0.4 0.39 0.35 0.34 0.34 0.25 0.3 0.27 0.21 0.2 0.2
Mp5g23890.1 (HESP)
0.62 0.34 0.7 0.62 0.49 0.46 0.32 0.43 1.0 0.33 0.43 0.28 0.38 0.49 0.53 0.44 0.6 0.48 0.77 0.39 0.46 0.75 0.48 0.84 0.44 0.46 0.49 0.53 0.63 0.65 0.88 0.9
0.29 0.15 0.29 0.2 0.25 0.23 0.17 0.23 1.0 0.3 0.22 0.11 0.16 0.3 0.13 0.15 0.17 0.18 0.24 0.2 0.23 0.3 0.2 0.26 0.22 0.22 0.26 0.4 0.36 0.32 0.23 0.26
Mp6g02590.1 (CUC2)
0.21 0.13 0.49 0.08 0.28 0.17 0.18 0.13 1.0 0.36 0.22 0.17 0.22 0.38 0.06 0.06 0.06 0.15 0.37 0.16 0.15 0.45 0.21 0.38 0.11 0.17 0.14 0.18 0.23 0.19 0.17 0.15
Mp6g08170.1 (KMD3)
0.46 0.29 0.59 0.43 0.33 0.43 0.42 0.35 0.89 0.26 0.38 0.26 0.28 0.44 0.46 0.53 0.46 0.37 1.0 0.47 0.42 0.79 0.48 0.8 0.4 0.48 0.27 0.48 0.69 0.67 0.66 0.45
Mp6g10570.1 (bZIP62)
0.48 0.31 0.55 0.27 0.36 0.37 0.36 0.4 1.0 0.26 0.31 0.28 0.25 0.48 0.31 0.27 0.29 0.35 0.65 0.38 0.37 0.59 0.46 0.61 0.34 0.42 0.32 0.31 0.35 0.57 0.83 0.71
0.74 0.59 0.88 0.63 0.62 0.7 0.7 0.65 0.96 0.57 0.71 0.65 0.62 0.76 0.56 0.65 0.6 0.58 1.0 0.66 0.65 0.95 0.74 0.94 0.64 0.75 0.7 0.76 0.76 0.76 0.81 0.78
0.75 0.45 0.8 0.77 0.52 0.55 0.45 0.53 0.95 0.58 0.63 0.26 0.53 0.9 0.73 0.6 0.66 0.48 0.82 0.55 0.45 0.85 0.6 0.73 0.56 0.54 0.93 1.0 0.84 0.62 0.78 0.73
Mp7g06170.1 (DRM1)
0.26 0.01 0.62 0.1 0.11 0.19 0.07 0.12 1.0 0.1 0.02 0.01 0.0 0.21 0.09 0.05 0.07 0.06 0.6 0.13 0.16 0.53 0.06 0.59 0.12 0.11 0.06 0.21 0.53 0.41 0.44 0.29
0.59 0.34 0.62 0.44 0.44 0.46 0.35 0.49 1.0 0.55 0.36 0.3 0.3 0.8 0.29 0.32 0.35 0.48 0.64 0.41 0.42 0.64 0.47 0.72 0.43 0.54 0.72 0.74 0.64 0.55 0.55 0.57
Mp7g10370.1 (TPS6)
0.67 0.46 0.67 0.54 0.64 0.5 0.57 0.52 1.0 0.69 0.53 0.61 0.48 0.68 0.38 0.51 0.43 0.52 0.6 0.46 0.45 0.69 0.64 0.56 0.43 0.58 0.52 0.66 0.65 0.55 0.52 0.52
0.52 0.21 0.52 0.23 0.16 0.43 0.44 0.35 1.0 0.12 0.27 0.19 0.23 0.74 0.21 0.2 0.25 0.23 0.59 0.17 0.37 0.73 0.28 0.53 0.32 0.46 0.39 0.59 0.72 0.48 0.43 0.39
Mp7g19740.1 (DJ1B)
0.5 0.26 0.68 0.49 0.39 0.44 0.43 0.48 1.0 0.38 0.37 0.3 0.33 0.59 0.51 0.54 0.53 0.5 0.9 0.47 0.42 0.74 0.51 0.84 0.45 0.45 0.45 0.53 0.49 0.63 0.63 0.66
0.44 0.27 0.78 0.31 0.5 0.32 0.37 0.36 1.0 0.67 0.31 0.15 0.22 0.28 0.35 0.31 0.34 0.55 0.42 0.47 0.3 0.73 0.41 0.38 0.33 0.33 0.31 0.29 0.36 0.31 0.31 0.27
0.73 0.18 0.44 0.5 0.44 0.3 0.3 0.17 0.56 0.25 0.13 0.1 0.16 0.82 0.63 0.53 0.45 0.23 0.5 0.19 0.27 0.47 0.12 0.24 0.25 0.39 1.0 0.65 0.58 0.33 0.5 0.6
0.64 0.69 0.84 0.42 0.53 0.57 0.68 0.57 1.0 0.81 0.75 0.66 0.76 0.58 0.3 0.41 0.34 0.61 0.79 0.64 0.6 0.81 0.75 0.87 0.6 0.75 0.63 0.62 0.6 0.54 0.54 0.47
Mp8g13820.1 (RABG3c)
0.74 0.77 0.98 0.41 0.67 0.7 0.77 0.66 1.0 0.8 0.82 0.81 0.85 0.56 0.34 0.39 0.36 0.66 0.83 0.7 0.65 0.83 0.72 0.91 0.67 0.73 0.69 0.69 0.7 0.69 0.64 0.61
Mp8g17110.1 (CREF7)
0.34 0.22 0.57 0.16 0.2 0.28 0.34 0.31 1.0 0.22 0.2 0.21 0.2 0.17 0.13 0.15 0.15 0.34 0.52 0.19 0.26 0.64 0.3 0.57 0.24 0.31 0.3 0.48 0.4 0.3 0.36 0.32

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)