Heatmap: Cluster_182 (Marchantia polymorpha (Mpo) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Control
Cold (3°C)
Dark (3 days)
Heat (33°C)
Light (435 uEm-2s-1)
Osmotic (100 mM mannitol)
Nitrogen deficiency (0 mM KNO3)
Salt (40 mM NaCl)
Cold-Dark
Cold-Light
Cold-Mannitol
Cold-Nitrogen deficiency
Cold-Salt
Heat-Dark
Heat-Mannitol
Heat-Nitrogen deficiency
Heat-Salt
Light-Salt
Mannitol-Dark
Mannitol-Light
Mannitol-Nitrogen deficiency
Nitrogen deficiency-Dark
Nitrogen deficiency-Light
Salt-Dark
Salt-Mannitol
Salt-Nitrogen deficiency
ZT2 (2 hours after light)
ZT6 (6 hours after light)
ZT10 (10 hours after light)
ZT14 (2 hours after dark)
ZT18 (6 hours after dark)
ZT22 (10 hours after dark)
0.48 0.49 0.05 0.11 0.35 0.86 0.65 0.76 0.12 0.49 0.87 0.73 0.78 0.03 0.35 0.35 0.29 0.65 0.37 0.79 0.78 0.16 0.62 0.06 1.0 0.63 0.45 0.29 0.19 0.57 0.35 0.53
Mp1g09360.1 (NRT1.6)
0.76 0.71 0.46 0.56 0.64 0.85 0.7 0.62 0.44 0.62 0.92 1.0 0.92 0.32 0.9 0.75 0.72 0.66 0.56 0.78 0.78 0.58 0.79 0.42 0.95 0.95 0.49 0.55 0.63 0.65 0.55 0.57
Mp1g11550.1 (LpxA)
0.94 0.81 0.51 0.7 0.83 0.92 0.63 0.97 0.62 0.71 1.0 0.62 0.92 0.28 0.59 0.52 0.58 0.99 0.46 0.81 0.77 0.48 0.75 0.42 0.89 0.82 0.81 0.82 0.93 0.97 0.84 0.76
Mp1g12070.1 (SYP73)
0.79 0.8 0.37 0.5 0.8 0.76 0.81 0.75 0.39 0.6 0.89 0.84 1.0 0.21 0.53 0.4 0.53 0.75 0.38 0.71 0.77 0.42 0.73 0.31 0.77 0.9 0.6 0.8 0.84 0.97 0.71 0.65
0.67 0.66 0.53 0.66 0.75 0.94 0.89 0.79 0.64 0.58 0.91 0.77 0.84 0.29 0.75 0.72 0.71 0.85 0.59 1.0 0.89 0.55 0.9 0.5 0.96 0.89 0.68 0.71 0.77 0.67 0.58 0.47
0.42 0.73 0.03 0.38 0.19 0.56 0.54 0.75 0.01 0.36 0.82 0.39 1.0 0.02 0.29 0.23 0.37 0.7 0.03 0.52 0.61 0.04 0.37 0.02 0.66 0.73 0.3 0.45 0.55 0.46 0.11 0.06
Mp1g27080.1 (AGL92)
0.53 0.71 0.27 0.32 0.28 0.56 0.37 0.55 0.37 0.2 1.0 0.41 0.93 0.13 0.35 0.26 0.39 0.35 0.23 0.36 0.44 0.25 0.31 0.23 0.46 0.48 0.71 0.6 0.51 0.38 0.46 0.54
Mp2g03820.1 (EFOP2)
0.79 0.6 0.52 0.55 0.51 0.76 0.84 0.78 0.36 0.44 0.97 0.86 1.0 0.33 0.65 0.63 0.63 0.81 0.53 0.87 0.76 0.59 0.94 0.38 0.84 0.98 0.72 0.8 0.84 0.71 0.72 0.67
Mp2g04630.1 (PTR5)
0.51 0.56 0.12 0.28 0.15 0.45 0.37 0.41 0.09 0.09 0.89 0.54 1.0 0.06 0.39 0.3 0.3 0.34 0.15 0.35 0.44 0.15 0.36 0.09 0.5 0.48 0.45 0.44 0.38 0.46 0.45 0.43
0.68 0.58 0.09 0.33 0.21 0.88 0.51 0.72 0.07 0.39 0.75 0.47 0.71 0.11 0.34 0.34 0.29 0.5 0.09 0.41 0.57 0.1 0.37 0.05 0.69 0.62 0.44 0.7 1.0 0.62 0.3 0.21
0.75 0.75 0.04 0.25 0.33 0.65 0.45 0.65 0.05 0.75 1.0 0.69 0.97 0.08 0.36 0.16 0.28 0.61 0.08 0.75 0.67 0.03 0.51 0.04 0.62 0.62 0.72 0.83 0.84 0.55 0.49 0.44
0.64 0.73 0.17 0.5 0.42 0.78 0.63 0.67 0.16 0.3 1.0 0.67 0.96 0.15 0.63 0.54 0.55 0.67 0.31 0.76 0.76 0.24 0.69 0.18 0.82 0.8 0.6 0.53 0.51 0.49 0.59 0.64
0.59 0.56 0.01 0.06 0.17 0.89 0.31 1.0 0.01 0.36 0.58 0.24 0.69 0.01 0.07 0.05 0.11 0.5 0.0 0.36 0.49 0.01 0.12 0.01 0.48 0.52 0.4 0.45 0.66 0.59 0.37 0.29
Mp3g00730.1 (RABA5d)
0.56 0.69 0.21 0.5 0.42 0.66 0.64 0.63 0.48 0.43 0.93 0.75 1.0 0.23 0.55 0.49 0.54 0.66 0.29 0.73 0.71 0.26 0.65 0.24 0.8 0.79 0.58 0.59 0.63 0.61 0.4 0.38
Mp3g02320.1 (HAT5)
0.52 0.84 0.2 0.43 0.45 0.58 0.63 0.63 0.33 0.5 1.0 0.77 0.93 0.07 0.46 0.35 0.4 0.57 0.46 0.87 0.6 0.22 0.75 0.21 0.67 0.66 0.52 0.61 0.58 0.54 0.54 0.47
Mp3g03030.1 (RRM1)
0.39 0.27 0.04 0.14 0.17 0.63 0.29 0.29 0.03 0.35 0.88 0.36 1.0 0.09 0.16 0.08 0.1 0.19 0.08 0.33 0.46 0.04 0.19 0.03 0.52 0.48 0.17 0.21 0.35 0.37 0.56 0.42
Mp3g06230.1 (LCB2)
0.75 0.69 0.51 0.8 0.56 0.84 0.89 0.82 0.61 0.72 1.0 0.98 0.86 0.37 0.97 0.9 0.91 0.86 0.76 0.91 0.91 0.57 0.89 0.6 0.99 1.0 0.64 0.76 0.85 0.93 0.79 0.74
0.65 0.82 0.09 0.55 0.15 0.76 0.52 0.42 0.19 0.3 1.0 0.45 0.85 0.04 0.46 0.32 0.33 0.21 0.13 0.4 0.57 0.13 0.16 0.06 0.68 0.58 0.52 0.65 0.85 0.69 0.42 0.34
Mp3g11240.1 (LLR2)
0.56 0.67 0.19 0.54 0.4 0.87 0.77 0.79 0.57 0.34 1.0 0.66 0.91 0.17 0.66 0.6 0.67 0.85 0.35 0.76 0.84 0.28 0.7 0.23 0.97 0.84 0.57 0.59 0.64 0.47 0.44 0.39
0.74 0.83 0.33 0.49 0.37 0.74 0.68 0.8 0.28 0.62 1.0 0.69 0.96 0.12 0.56 0.49 0.55 0.65 0.3 0.62 0.64 0.34 0.54 0.2 0.79 0.76 0.72 0.84 0.97 0.89 0.63 0.53
0.44 0.61 0.08 0.21 0.53 0.62 0.44 0.56 0.18 0.2 0.79 0.54 1.0 0.03 0.38 0.17 0.31 0.76 0.15 0.85 0.65 0.09 0.59 0.1 0.75 0.63 0.51 0.43 0.38 0.32 0.42 0.52
Mp3g20400.1 (PRX71)
0.31 0.62 0.06 0.2 0.04 0.48 0.66 0.6 0.03 0.14 0.68 0.52 1.0 0.01 0.38 0.16 0.39 0.57 0.06 0.14 0.52 0.01 0.35 0.04 0.62 0.52 0.19 0.4 0.63 0.51 0.23 0.19
Mp3g21300.1 (PREP1)
0.73 0.48 0.09 0.16 0.36 0.77 0.33 0.58 0.2 0.39 0.73 0.2 0.65 0.09 0.26 0.11 0.22 0.5 0.1 0.49 0.59 0.08 0.31 0.07 0.61 0.59 0.53 0.95 1.0 0.45 0.28 0.28
Mp3g23380.1 (AAD2)
0.73 0.7 0.11 0.28 0.21 0.72 0.61 0.71 0.16 0.48 1.0 0.45 0.83 0.13 0.41 0.3 0.38 0.51 0.09 0.29 0.6 0.07 0.32 0.08 0.56 0.74 0.44 0.66 0.86 0.32 0.19 0.14
0.58 0.73 0.02 0.15 0.16 0.69 0.78 0.72 0.04 0.5 0.79 0.67 0.97 0.01 0.17 0.19 0.19 0.55 0.03 0.38 0.75 0.03 0.5 0.01 0.67 1.0 0.36 0.37 0.56 0.33 0.17 0.16
Mp4g11020.1 (ALKBH9C)
0.55 0.86 0.12 0.33 0.48 0.46 0.49 0.57 0.1 0.22 0.84 0.46 1.0 0.02 0.37 0.38 0.42 0.54 0.13 0.47 0.43 0.1 0.49 0.12 0.47 0.58 0.62 0.55 0.55 0.56 0.52 0.43
0.79 0.74 0.07 0.33 0.38 0.81 0.5 0.82 0.12 0.32 0.8 0.57 0.93 0.02 0.34 0.18 0.39 0.68 0.08 0.55 0.59 0.06 0.45 0.04 0.7 0.73 0.67 0.78 1.0 0.91 0.56 0.42
0.59 0.6 0.43 0.59 0.53 0.81 0.75 0.74 0.44 0.51 0.91 0.69 0.82 0.25 0.73 0.74 0.63 0.72 0.53 0.9 0.85 0.42 0.65 0.44 1.0 0.81 0.66 0.65 0.7 0.7 0.56 0.42
0.54 0.63 0.06 0.18 0.43 0.71 0.39 0.53 0.31 0.53 0.86 0.49 1.0 0.04 0.3 0.2 0.31 0.54 0.15 0.47 0.59 0.09 0.41 0.09 0.44 0.56 0.49 0.78 0.48 0.35 0.73 0.7
0.77 0.67 0.16 0.45 0.34 0.7 0.68 0.74 0.19 0.35 1.0 0.8 0.97 0.1 0.63 0.49 0.48 0.61 0.25 0.74 0.76 0.19 0.7 0.13 0.86 0.82 0.53 0.58 0.66 0.6 0.63 0.51
Mp6g18230.1 (MAKR3)
0.51 0.74 0.12 0.43 0.34 0.73 0.53 0.63 0.11 0.26 1.0 0.79 0.94 0.11 0.49 0.41 0.46 0.7 0.15 0.61 0.64 0.18 0.55 0.1 0.61 0.68 0.56 0.6 0.61 0.38 0.46 0.35
Mp7g03880.1 (GPAT5)
0.81 0.67 0.01 0.26 0.63 0.86 0.54 0.82 0.02 0.29 0.92 0.65 1.0 0.03 0.4 0.16 0.34 0.86 0.08 0.8 0.68 0.03 0.58 0.04 0.73 0.8 0.85 0.78 0.87 0.57 0.51 0.5
0.64 0.94 0.14 0.38 0.24 0.78 0.51 0.73 0.15 0.42 1.0 0.51 0.97 0.03 0.44 0.35 0.48 0.77 0.13 0.52 0.59 0.18 0.3 0.1 0.65 0.58 0.54 0.63 0.8 0.62 0.45 0.34
0.62 0.93 0.18 0.57 0.4 0.71 0.55 0.59 0.24 0.61 1.0 0.57 0.91 0.13 0.53 0.49 0.53 0.42 0.34 0.53 0.61 0.22 0.45 0.18 0.7 0.64 0.6 0.62 0.71 0.55 0.44 0.39
Mp7g05620.1 (MRPL11)
0.73 0.69 0.56 0.65 0.75 0.91 0.83 0.71 0.6 0.43 0.89 0.81 0.72 0.41 0.75 0.65 0.61 0.88 0.67 1.0 0.89 0.61 0.9 0.6 0.97 0.87 0.57 0.63 0.74 0.65 0.52 0.48
0.59 0.64 0.21 0.31 0.34 0.72 0.59 0.56 0.11 0.23 0.84 0.59 1.0 0.05 0.31 0.34 0.31 0.58 0.16 0.57 0.47 0.21 0.58 0.09 0.61 0.7 0.62 0.69 0.75 0.58 0.47 0.37
Mp7g13010.1 (PAKRP2)
0.68 0.43 0.23 0.43 0.66 0.64 0.47 0.8 0.1 0.57 0.76 0.64 0.65 0.18 0.48 0.31 0.47 0.79 0.16 0.67 0.63 0.23 0.67 0.18 0.63 0.76 0.35 0.85 1.0 0.81 0.68 0.36
0.55 0.76 0.16 0.25 0.28 0.75 0.52 0.73 0.48 0.26 0.97 0.77 1.0 0.08 0.35 0.24 0.32 0.63 0.16 0.63 0.66 0.17 0.48 0.11 0.82 0.69 0.65 0.66 0.76 0.45 0.36 0.29
0.74 0.98 0.16 0.72 0.32 0.68 0.59 0.62 0.27 0.33 0.99 0.78 1.0 0.13 0.71 0.7 0.72 0.59 0.29 0.6 0.62 0.26 0.56 0.17 0.65 0.79 0.75 0.76 0.73 0.7 0.77 0.77
0.44 0.59 0.02 0.27 0.07 0.52 0.4 0.64 0.02 0.16 0.79 0.44 1.0 0.02 0.44 0.22 0.35 0.33 0.13 0.37 0.62 0.05 0.28 0.06 0.63 0.68 0.67 0.36 0.21 0.52 0.52 0.65
0.54 0.72 0.14 0.64 0.32 0.53 0.29 0.39 0.37 0.22 1.0 0.32 0.86 0.09 0.55 0.35 0.56 0.39 0.3 0.46 0.46 0.21 0.37 0.18 0.46 0.47 0.56 0.55 0.56 0.46 0.49 0.48
0.59 0.61 0.18 0.33 0.22 0.59 0.49 0.54 0.31 0.25 1.0 0.73 0.84 0.11 0.41 0.33 0.35 0.46 0.22 0.55 0.61 0.22 0.44 0.14 0.67 0.68 0.52 0.52 0.54 0.53 0.41 0.41
Mp8g08410.1 (ATA27)
0.76 0.8 0.28 0.63 0.62 0.87 0.83 0.72 0.22 0.58 0.97 0.95 1.0 0.08 0.85 0.63 0.78 0.74 0.45 0.94 0.85 0.45 0.89 0.27 0.91 0.88 0.45 0.62 0.75 0.85 0.71 0.61
Mp8g08780.1 (YUC2)
0.35 0.76 0.1 0.18 0.27 0.46 0.49 0.41 0.05 0.2 0.97 0.55 1.0 0.02 0.31 0.23 0.25 0.43 0.14 0.45 0.44 0.09 0.51 0.03 0.49 0.5 0.67 0.45 0.32 0.52 0.69 0.7
Mp8g12790.1 (ACLB-1)
0.38 0.79 0.09 0.19 0.31 0.63 0.51 0.81 0.08 0.43 0.8 0.64 0.83 0.03 0.28 0.26 0.27 0.8 0.3 1.0 0.68 0.17 0.73 0.13 0.78 0.68 0.5 0.37 0.36 0.37 0.38 0.41
Mp8g13800.1 (UGD3)
0.66 0.96 0.27 0.64 0.47 0.74 0.8 0.55 0.25 0.63 0.81 1.0 0.81 0.1 0.66 0.7 0.59 0.44 0.51 0.7 0.63 0.34 0.63 0.23 0.69 0.71 0.54 0.52 0.55 0.56 0.51 0.46
0.54 0.56 0.29 0.6 0.53 0.77 0.8 0.76 0.42 0.44 0.84 0.62 0.8 0.23 0.71 0.68 0.67 0.78 0.37 0.81 0.82 0.33 0.74 0.28 1.0 0.83 0.61 0.56 0.64 0.54 0.46 0.31

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)