Heatmap: Cluster_165 (Marchantia polymorpha (Mpo) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Control
Cold (3°C)
Dark (3 days)
Heat (33°C)
Light (435 uEm-2s-1)
Osmotic (100 mM mannitol)
Nitrogen deficiency (0 mM KNO3)
Salt (40 mM NaCl)
Cold-Dark
Cold-Light
Cold-Mannitol
Cold-Nitrogen deficiency
Cold-Salt
Heat-Dark
Heat-Mannitol
Heat-Nitrogen deficiency
Heat-Salt
Light-Salt
Mannitol-Dark
Mannitol-Light
Mannitol-Nitrogen deficiency
Nitrogen deficiency-Dark
Nitrogen deficiency-Light
Salt-Dark
Salt-Mannitol
Salt-Nitrogen deficiency
ZT2 (2 hours after light)
ZT6 (6 hours after light)
ZT10 (10 hours after light)
ZT14 (2 hours after dark)
ZT18 (6 hours after dark)
ZT22 (10 hours after dark)
Mp1g00200.1 (SVR8)
0.64 0.1 0.0 0.27 0.0 0.56 0.0 0.17 0.23 0.21 0.07 0.08 0.15 0.0 0.06 0.25 0.13 0.22 0.07 0.13 0.0 0.0 0.29 0.23 0.13 0.28 0.09 0.08 0.0 0.09 1.0 0.09
0.08 0.48 0.42 0.47 0.14 0.29 0.16 0.0 1.0 0.25 0.12 0.15 0.14 0.0 0.11 0.12 0.11 0.26 0.37 0.12 0.33 0.65 0.13 0.56 0.0 0.0 0.39 0.26 0.18 0.16 0.0 0.0
Mp1g08420.1 (HVA22H)
0.38 0.1 0.89 0.26 0.9 0.17 0.33 0.18 0.0 0.52 0.08 0.34 0.24 0.16 0.27 0.14 0.49 0.45 0.45 0.49 0.32 0.77 0.82 0.79 1.0 0.07 0.24 0.16 0.18 0.74 0.18 0.1
0.1 0.0 0.26 0.0 0.0 0.2 0.3 0.0 0.0 0.18 0.37 0.22 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.51 0.0 0.0 0.0 0.2 0.17 0.36 0.0 0.19 0.43 0.0 1.0 0.0
0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.74 0.0 0.32 1.0 0.31 0.0 0.0 0.0 0.92 0.0 0.73 0.0 0.69 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.95 0.0
0.21 0.25 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.19 0.0 0.38 0.0 0.0 0.48 0.16 0.36 0.0 0.17 0.0 0.75 0.0 0.0 0.0 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.69 0.0 0.37 0.71 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.44 0.0 0.0 1.0 0.92
0.24 0.07 0.09 0.05 0.0 0.36 0.0 0.0 0.2 0.18 0.0 0.0 0.6 0.0 0.25 0.29 0.33 0.12 0.06 0.29 0.0 0.13 0.12 0.13 0.11 0.34 0.0 0.05 0.24 0.29 1.0 0.44
Mp2g08560.1 (RBL2)
0.18 1.0 0.0 0.67 0.0 0.53 0.93 0.37 0.53 0.24 0.93 0.55 0.34 0.0 0.59 0.89 0.52 0.74 0.16 0.23 0.5 0.0 0.0 0.0 0.6 0.16 0.08 0.0 0.48 0.67 0.97 0.53
Mp2g09530.1 (SYP112)
0.32 0.0 0.0 0.3 0.0 0.16 0.31 0.23 0.07 0.27 0.07 0.08 0.07 0.0 0.13 0.43 0.55 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.06 0.07 0.83 0.75 0.38 0.38 0.92 1.0
Mp2g14400.1 (PIRL2)
0.03 0.16 0.24 0.6 0.0 0.26 0.22 0.19 0.32 1.0 0.55 0.53 0.06 0.26 0.16 0.58 0.44 0.3 0.0 0.11 0.05 0.75 0.0 0.13 0.22 0.28 0.0 0.07 0.19 0.14 0.22 0.15
0.37 0.0 0.0 0.3 0.0 0.2 0.0 0.38 0.38 0.0 1.0 0.0 0.37 0.0 0.15 0.29 0.16 0.36 0.51 0.0 0.0 0.0 0.34 0.19 0.16 0.51 0.37 0.0 0.24 0.0 0.9 0.42
Mp2g21980.1 (CNGC5)
0.28 1.0 0.0 0.07 0.23 0.93 0.21 0.0 0.0 0.29 0.13 0.31 0.33 0.0 0.5 0.12 0.2 0.4 0.07 0.42 0.31 0.0 0.07 0.0 0.41 0.35 0.0 0.06 0.08 0.0 0.1 0.0
0.3 0.5 0.0 0.47 0.61 0.3 0.41 0.1 0.09 0.0 0.54 0.89 0.0 0.0 0.08 1.0 0.0 0.18 0.0 0.58 0.22 0.0 0.26 0.0 0.16 0.42 0.3 0.0 0.1 0.7 0.22 0.23
Mp3g05710.1 (AEP3)
0.14 0.12 0.13 0.0 0.0 0.09 0.11 0.21 0.1 0.59 0.0 0.09 0.65 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.61 0.0 0.22 1.0 0.09 0.72 0.48 0.08 0.0 0.0 0.0 0.55 0.0 0.0
0.08 0.0 0.15 0.0 0.13 0.0 0.0 0.38 0.23 0.38 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.2 0.32 0.55 0.0 0.18 0.01 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.21 0.16 0.25 1.0 0.07
0.92 0.56 0.0 0.18 0.6 0.83 0.23 0.0 0.21 0.59 0.83 0.42 0.44 0.4 0.71 0.0 0.37 0.0 0.4 0.95 0.0 0.19 0.6 0.4 0.18 0.19 0.0 0.0 0.67 0.0 1.0 0.5
Mp3g15990.1 (NGA2)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.51 0.0 0.0 0.51 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.41 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.15 1.0 0.0 0.13 0.0 0.8 0.39 0.16 0.16 0.4 0.13 0.16 0.27 0.0 0.0 0.26 0.75 0.0 0.0 0.13 0.24 0.0 0.68 0.0 0.14 0.0 0.15 0.14 0.16 0.95 0.0 0.0
0.0 0.33 0.4 0.0 0.0 0.45 0.0 0.16 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.15 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 1.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.48 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0
0.0 0.81 0.54 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.44 0.0
0.34 0.0 0.82 0.44 0.49 0.26 0.68 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.47 0.11 0.22 0.0 1.0 0.12 0.38 0.22 0.11 0.62 0.23 0.0 0.15 0.0 0.0
0.04 0.01 0.0 0.03 0.0 0.04 0.01 0.01 0.0 0.04 0.03 0.01 0.02 0.0 0.07 0.01 0.01 0.05 0.0 0.02 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.15 0.01 0.05 0.21 1.0 0.34
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
Mp5g07960.1 (OTP80)
0.27 0.0 0.31 0.47 0.17 0.06 0.6 0.24 0.0 0.24 0.18 0.25 0.0 0.0 0.36 0.79 0.32 0.0 0.18 0.39 0.1 1.0 0.29 0.12 0.0 0.22 0.06 0.19 0.26 0.14 0.14 0.28
Mp5g11950.1 (AtRbohG)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.0 0.0 0.32 1.0 0.0 0.0 0.54 0.89 0.27 0.31 0.0 0.0 0.52 0.64 0.0 0.0 0.0 0.3 0.65 0.0 0.0 0.74 0.0 0.0
0.62 0.92 0.0 0.0 0.0 0.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.39 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.73 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.64 0.69 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.14 0.11 0.0 0.14 0.0 0.36 0.34 0.0 0.0 0.31 0.16 0.0 0.0 0.0 0.35 0.41 0.38 0.0 0.0 0.23 0.36 0.0 0.08 0.0 0.45 0.08 0.08 0.0 0.09 0.1 1.0 0.41
0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.41 0.0 0.2 0.0 0.39 0.06 0.0 0.35 0.0 0.22 0.0 0.06 0.07 0.0 0.0 0.11 0.0 0.07 0.0 0.18 0.0 0.21 0.05 0.13 0.85 1.0 0.32
Mp6g00240.1 (ELONGATION FACTOR-TU FAMILY)
0.0 0.0 0.65 0.0 0.0 0.0 0.76 0.55 0.0 0.9 0.48 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.44 0.0 0.47 0.44 0.0 0.5 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp6g06610.1 (TADA)
0.31 0.32 0.05 0.54 0.31 0.22 0.12 0.18 0.79 0.48 0.37 0.51 0.26 0.39 0.98 0.49 0.56 0.29 0.72 0.26 0.17 0.16 0.25 0.5 0.15 0.12 0.14 0.32 0.48 0.69 1.0 0.37
0.34 0.25 0.0 0.2 0.05 0.28 0.05 0.5 0.05 0.18 0.32 0.05 0.33 0.0 0.15 0.38 0.21 0.09 0.0 0.25 0.12 0.05 0.0 0.09 0.25 0.08 0.15 0.24 0.47 0.23 1.0 0.51
0.08 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.21 0.18 0.17 0.46 0.16 0.48 0.0 0.0 0.0 0.14 0.14 0.32 0.0 0.0 0.14 1.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.13 0.51 1.0 0.04 0.12 0.05 0.68 0.42 0.34 0.36 0.22 0.35 0.44 0.05 0.08 0.25 0.12 0.13 0.32 0.21 0.08 0.85 0.33 0.28 0.25 0.08 0.0 0.0 0.14 0.1 0.05 0.16
Mp7g02520.1 (FIB2)
0.49 0.8 0.39 0.57 0.59 0.3 0.83 0.36 0.22 0.44 0.56 0.6 0.6 0.79 0.44 0.71 1.0 0.38 0.71 0.14 0.21 0.84 0.39 0.08 0.18 0.27 0.3 0.6 0.44 0.4 0.99 0.4
Mp7g04820.1 (FDM5)
0.44 1.0 0.17 0.52 0.12 0.12 0.0 0.35 0.13 0.66 0.33 0.23 0.12 0.0 0.47 0.0 0.59 0.54 0.11 0.31 0.46 0.0 0.56 0.0 0.62 0.53 0.42 0.0 0.26 0.13 0.0 0.0
Mp7g04920.1 (DRB5)
0.27 0.18 0.25 0.39 0.5 0.32 0.66 0.0 0.32 0.29 0.6 1.0 0.31 0.49 0.27 0.92 0.14 0.0 0.0 0.14 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.5 0.0 0.35 0.0 0.99 0.0
Mp7g07820.1 (RAF11)
0.0 0.0 0.0 0.52 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.61 0.0 0.0 0.75 0.3 0.26 0.52 0.0 0.8 0.5 1.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.35 0.0 0.38
Mp7g08790.1 (PPRD1)
0.34 0.1 0.34 1.0 0.43 0.33 0.53 0.0 0.67 0.18 0.0 0.14 0.19 0.0 0.05 0.3 0.56 0.31 0.25 0.18 0.05 0.38 0.12 0.2 0.29 0.0 0.75 0.37 0.16 0.69 0.2 0.16
Mp7g11450.1 (VPS30)
0.42 0.07 0.44 0.5 0.12 0.25 0.67 0.07 0.13 0.35 0.12 0.13 0.12 0.19 0.42 0.63 0.98 0.43 1.0 0.23 0.26 0.77 0.43 0.0 0.33 0.22 0.14 0.36 0.13 0.43 0.48 0.15
0.11 0.0 0.0 0.36 0.0 0.24 0.0 0.45 0.0 1.0 0.4 0.48 0.0 0.44 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.57 0.61 0.0 0.0 0.0 0.0 0.45 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25
Mp8g06910.1 (SULTR4;1)
0.37 0.0 0.0 0.17 0.0 0.81 0.0 0.0 0.2 0.55 0.0 0.21 0.0 0.41 0.33 0.2 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
Mp8g07510.1 (ALY2)
0.0 0.0 0.0 0.88 0.0 0.53 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.51 0.0 0.88 0.0 0.93 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.25 0.0 0.67 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
Mp8g10720.1 (DUF7)
0.17 0.0 0.0 0.24 0.14 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.12 0.24 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.67 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.58 0.0 0.0 0.34
0.19 0.0 0.17 0.0 0.76 0.82 0.0 0.0 0.14 0.06 0.58 0.34 0.0 0.34 0.17 0.11 0.0 0.0 1.0 0.95 0.21 0.72 0.32 0.2 0.29 0.53 0.0 0.54 0.19 0.08 0.58 0.08
MpVg00480.1 (GRDP2)
0.15 0.63 0.56 0.12 0.36 0.41 1.0 0.16 0.18 0.14 0.29 0.35 0.65 0.32 0.89 0.12 0.83 0.69 0.14 0.34 0.23 0.82 0.18 0.0 0.25 0.35 0.29 0.65 0.3 0.0 0.54 0.23
MpVg00630.1 (FLA21)
0.54 0.36 0.33 0.36 0.44 0.3 0.45 0.49 0.44 0.31 0.14 0.2 0.0 0.05 0.29 0.16 0.42 0.96 0.61 0.21 0.25 0.05 0.14 0.48 0.12 0.09 0.4 0.15 0.68 0.3 1.0 0.25
0.0 0.55 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.8 0.0 1.0 0.0
Mpzg01310.1 (XTR3)
0.21 0.78 0.18 1.0 0.06 0.51 0.74 0.37 0.41 0.13 0.28 0.68 0.13 0.0 0.43 0.42 0.86 0.76 0.31 0.18 0.72 0.0 0.07 0.28 0.23 0.34 0.37 0.39 0.54 0.63 0.52 0.15

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)