Heatmap: Cluster_171 (Marchantia polymorpha (Mpo) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Control
Cold (3°C)
Dark (3 days)
Heat (33°C)
Light (435 uEm-2s-1)
Osmotic (100 mM mannitol)
Nitrogen deficiency (0 mM KNO3)
Salt (40 mM NaCl)
Cold-Dark
Cold-Light
Cold-Mannitol
Cold-Nitrogen deficiency
Cold-Salt
Heat-Dark
Heat-Mannitol
Heat-Nitrogen deficiency
Heat-Salt
Light-Salt
Mannitol-Dark
Mannitol-Light
Mannitol-Nitrogen deficiency
Nitrogen deficiency-Dark
Nitrogen deficiency-Light
Salt-Dark
Salt-Mannitol
Salt-Nitrogen deficiency
ZT2 (2 hours after light)
ZT6 (6 hours after light)
ZT10 (10 hours after light)
ZT14 (2 hours after dark)
ZT18 (6 hours after dark)
ZT22 (10 hours after dark)
0.34 0.43 0.51 0.48 0.33 0.4 0.36 0.31 0.26 0.23 0.48 0.41 0.47 0.16 0.61 0.61 0.55 0.33 1.0 0.44 0.37 0.65 0.41 0.95 0.41 0.35 0.25 0.27 0.32 0.35 0.49 0.47
0.34 0.27 0.29 0.82 0.35 0.54 0.53 0.29 0.21 0.38 0.64 0.44 0.45 0.17 1.0 0.95 0.89 0.38 0.82 0.68 0.43 0.47 0.4 0.44 0.58 0.37 0.38 0.22 0.48 0.59 0.66 0.62
Mp1g21600.1 (CAC3)
0.21 0.13 0.24 0.46 0.2 0.38 0.2 0.27 0.25 0.1 0.3 0.16 0.17 0.27 0.69 0.39 0.44 0.34 1.0 0.39 0.38 0.46 0.28 0.53 0.49 0.3 0.19 0.19 0.17 0.22 0.27 0.28
0.58 0.4 0.73 0.67 0.74 0.6 0.64 0.55 0.47 0.41 0.61 0.43 0.56 0.61 0.66 0.7 0.65 0.58 1.0 0.77 0.58 0.79 0.71 0.89 0.62 0.59 0.43 0.51 0.56 0.71 0.72 0.63
0.44 0.42 0.51 0.61 0.41 0.49 0.53 0.44 0.52 0.4 0.7 0.5 0.68 0.27 0.62 0.74 0.6 0.5 1.0 0.68 0.57 0.77 0.54 0.78 0.63 0.52 0.43 0.43 0.52 0.55 0.58 0.46
Mp1g25570.1 (ATG10)
0.38 0.41 0.3 0.81 0.37 0.51 0.56 0.43 0.31 0.34 0.58 0.44 0.43 0.07 1.0 0.97 0.82 0.49 0.47 0.51 0.53 0.35 0.57 0.33 0.59 0.47 0.35 0.43 0.4 0.52 0.46 0.43
Mp1g29700.1 (CPL3)
0.52 0.56 0.75 0.75 0.46 0.52 0.56 0.49 0.49 0.31 0.7 0.66 0.71 0.25 0.56 0.75 0.63 0.56 1.0 0.49 0.51 0.83 0.66 0.84 0.51 0.61 0.49 0.49 0.58 0.54 0.58 0.48
Mp2g11010.1 (ATL37)
0.62 0.49 0.72 0.79 0.28 0.54 0.55 0.6 0.5 0.46 0.66 0.57 0.65 0.32 0.7 0.57 0.75 0.52 0.98 0.5 0.61 1.0 0.46 0.84 0.68 0.74 0.58 0.64 0.76 0.84 0.68 0.72
Mp2g17110.1 (CIPK5)
0.23 0.29 0.39 0.74 0.16 0.25 0.49 0.33 0.55 0.23 0.47 0.43 0.38 0.29 0.71 1.0 0.78 0.17 0.39 0.24 0.4 0.4 0.3 0.41 0.42 0.5 0.34 0.34 0.61 0.69 0.7 0.58
Mp2g19580.1 (RRP41)
0.39 0.46 0.59 0.62 0.31 0.37 0.4 0.3 0.37 0.27 0.59 0.49 0.55 0.31 0.74 0.72 0.66 0.33 1.0 0.45 0.37 0.71 0.39 0.78 0.41 0.38 0.28 0.3 0.41 0.59 0.72 0.58
0.45 0.57 0.55 0.8 0.42 0.44 0.51 0.3 0.36 0.43 0.65 0.58 0.56 0.34 0.65 1.0 0.6 0.33 0.9 0.49 0.44 0.63 0.43 0.66 0.41 0.41 0.39 0.35 0.48 0.57 0.74 0.72
Mp2g25530.1 (GA2OX4)
0.4 0.25 0.6 0.46 0.51 0.46 0.48 0.45 0.3 0.25 0.32 0.32 0.3 0.42 0.51 0.51 0.5 0.53 0.93 0.55 0.47 0.67 0.6 1.0 0.5 0.45 0.41 0.32 0.32 0.36 0.64 0.74
Mp3g08140.1 (SAGL1)
0.61 0.67 0.59 0.8 0.47 0.55 0.59 0.52 0.42 0.38 0.6 0.61 0.57 0.55 0.72 1.0 0.71 0.52 0.65 0.53 0.47 0.59 0.53 0.55 0.49 0.5 0.43 0.48 0.57 0.71 0.9 0.69
0.48 0.4 0.74 0.47 0.56 0.58 0.57 0.48 0.45 0.41 0.47 0.5 0.42 0.57 0.59 0.65 0.52 0.5 1.0 0.56 0.55 0.75 0.6 0.94 0.63 0.55 0.35 0.41 0.47 0.63 0.83 0.8
Mp3g08300.1 (COG1)
0.64 0.61 0.72 0.69 0.55 0.67 0.71 0.64 0.62 0.56 0.78 0.69 0.7 0.46 0.75 0.79 0.73 0.62 1.0 0.65 0.66 0.82 0.73 0.89 0.71 0.76 0.52 0.64 0.69 0.81 0.84 0.77
0.41 0.26 0.61 0.48 0.36 0.5 0.27 0.42 0.34 0.21 0.35 0.2 0.32 0.19 0.44 0.42 0.45 0.52 1.0 0.79 0.45 0.82 0.44 0.75 0.55 0.4 0.41 0.28 0.33 0.47 0.75 0.82
0.27 0.22 0.24 0.4 0.17 0.34 0.47 0.33 0.2 0.17 0.25 0.29 0.24 0.19 0.58 1.0 0.53 0.19 0.34 0.24 0.4 0.31 0.34 0.28 0.4 0.44 0.33 0.26 0.27 0.37 0.55 0.54
0.52 0.45 0.63 0.58 0.52 0.58 0.52 0.51 0.51 0.49 0.61 0.41 0.54 0.34 0.66 0.64 0.58 0.52 1.0 0.7 0.59 0.67 0.54 0.87 0.67 0.55 0.54 0.56 0.61 0.79 0.86 0.81
Mp4g01790.1 (ZHD9)
0.62 0.53 0.79 0.59 0.69 0.68 0.63 0.56 0.44 0.54 0.61 0.68 0.61 0.83 0.68 0.72 0.54 0.67 1.0 0.6 0.63 0.8 0.71 0.95 0.73 0.66 0.37 0.47 0.5 0.75 0.85 0.84
0.2 0.34 0.49 0.39 0.17 0.27 0.27 0.17 0.39 0.18 0.38 0.35 0.35 0.25 0.45 0.36 0.37 0.18 0.96 0.33 0.2 0.61 0.25 1.0 0.24 0.25 0.22 0.12 0.18 0.26 0.44 0.48
0.17 0.14 0.3 0.27 0.16 0.3 0.22 0.34 0.36 0.13 0.39 0.17 0.38 0.21 0.55 0.38 0.44 0.36 1.0 0.45 0.42 0.55 0.23 0.58 0.43 0.33 0.2 0.18 0.2 0.27 0.36 0.35
0.35 0.11 0.52 0.54 0.4 0.42 0.39 0.39 0.13 0.17 0.19 0.14 0.17 0.28 0.54 0.54 0.58 0.52 1.0 0.68 0.46 0.66 0.52 0.72 0.51 0.47 0.23 0.35 0.4 0.32 0.43 0.37
Mp4g06570.1 (EngB-3)
0.43 0.45 0.53 0.79 0.5 0.63 0.66 0.49 0.64 0.44 0.79 0.49 0.63 0.39 0.92 1.0 0.83 0.48 0.8 0.66 0.6 0.61 0.64 0.64 0.64 0.55 0.38 0.46 0.56 0.63 0.73 0.52
0.07 0.02 0.04 0.27 0.06 0.16 0.1 0.07 0.03 0.03 0.06 0.03 0.01 0.09 0.76 0.26 0.24 0.21 1.0 0.23 0.05 0.25 0.09 0.45 0.12 0.11 0.09 0.06 0.03 0.15 0.02 0.0
0.47 0.17 0.54 0.6 0.51 0.48 0.42 0.48 0.37 0.22 0.23 0.19 0.18 0.53 0.71 0.53 0.65 0.48 1.0 0.54 0.44 0.67 0.58 0.74 0.54 0.55 0.44 0.49 0.5 0.5 0.71 0.68
0.73 0.69 0.78 0.99 0.55 0.83 0.72 0.74 0.82 0.64 0.87 0.82 0.75 0.5 0.94 0.83 0.93 0.71 1.0 0.78 0.79 0.88 0.7 0.98 0.86 0.8 0.7 0.7 0.75 0.75 0.84 0.79
Mp4g19040.1 (BRXL2)
0.14 0.06 0.35 0.52 0.05 0.1 0.19 0.22 0.16 0.02 0.28 0.18 0.13 0.09 0.64 0.55 0.4 0.15 1.0 0.25 0.29 0.66 0.21 0.35 0.4 0.16 0.14 0.14 0.18 0.18 0.34 0.25
0.31 0.16 0.27 0.87 0.25 0.23 0.34 0.19 0.12 0.12 0.21 0.26 0.19 0.07 1.0 0.95 0.81 0.21 0.75 0.36 0.3 0.58 0.42 0.44 0.35 0.5 0.21 0.25 0.24 0.36 0.29 0.27
0.47 0.49 0.68 0.86 0.33 0.57 0.67 0.53 0.66 0.44 0.67 0.61 0.55 0.39 0.88 1.0 0.85 0.48 0.58 0.65 0.61 0.65 0.61 0.47 0.7 0.68 0.49 0.51 0.58 0.63 0.76 0.72
Mp5g02360.1 (PFK6)
0.43 0.19 0.53 0.45 0.55 0.54 0.3 0.45 0.25 0.25 0.29 0.29 0.24 0.22 0.6 0.51 0.63 0.72 0.99 0.62 0.44 0.83 0.45 1.0 0.58 0.43 0.26 0.42 0.54 0.63 0.63 0.52
Mp5g04390.1 (RAD50)
0.48 0.14 0.69 0.73 0.49 0.44 0.5 0.47 0.21 0.23 0.27 0.21 0.21 0.52 0.72 0.78 0.79 0.62 1.0 0.65 0.48 0.86 0.69 0.95 0.53 0.56 0.37 0.49 0.48 0.46 0.63 0.63
Mp5g05500.1 (AtICP55)
0.52 0.47 0.72 0.79 0.52 0.61 0.73 0.6 0.51 0.37 0.73 0.56 0.7 0.48 0.83 0.84 0.77 0.66 1.0 0.66 0.66 0.84 0.76 0.76 0.61 0.61 0.49 0.56 0.59 0.59 0.59 0.55
Mp5g08270.1 (ATL13)
0.46 0.49 0.59 0.61 0.34 0.5 0.39 0.47 0.54 0.19 0.56 0.38 0.48 0.4 0.67 0.59 0.61 0.46 1.0 0.56 0.45 0.71 0.5 0.77 0.49 0.47 0.46 0.46 0.47 0.49 0.64 0.69
Mp5g13460.1 (PBCP)
0.54 0.35 0.62 0.58 0.56 0.65 0.57 0.61 0.34 0.37 0.37 0.55 0.4 0.41 0.62 0.65 0.62 0.89 1.0 0.74 0.63 0.88 0.77 0.86 0.63 0.66 0.33 0.49 0.61 0.57 0.62 0.45
Mp5g15110.1 (XYL4)
0.18 0.13 0.21 0.21 0.03 0.28 0.18 0.14 0.09 0.1 0.16 0.24 0.07 0.19 0.55 0.28 0.3 0.44 1.0 0.29 0.42 0.59 0.33 0.61 0.4 0.34 0.13 0.29 0.19 0.12 0.26 0.28
0.48 0.46 0.46 0.8 0.42 0.55 0.55 0.52 0.47 0.42 0.7 0.56 0.62 0.22 1.0 0.97 0.95 0.44 0.67 0.73 0.54 0.47 0.48 0.41 0.62 0.54 0.42 0.45 0.58 0.61 0.66 0.56
0.28 0.24 0.39 0.66 0.22 0.35 0.49 0.32 0.27 0.23 0.32 0.41 0.32 0.2 0.87 1.0 0.9 0.42 0.48 0.62 0.52 0.47 0.56 0.4 0.61 0.54 0.45 0.39 0.31 0.41 0.49 0.5
0.28 0.25 0.23 0.59 0.17 0.54 0.48 0.55 0.29 0.21 0.56 0.5 0.43 0.42 0.8 0.67 0.56 0.61 1.0 0.48 0.49 0.39 0.35 0.73 0.59 0.46 0.23 0.2 0.3 0.42 0.28 0.26
Mp6g08030.1 (MRPL11)
0.64 0.35 0.94 0.72 0.3 0.9 0.34 0.64 0.3 0.27 0.64 0.28 0.44 0.4 0.79 0.53 0.71 0.59 0.88 0.52 0.66 1.0 0.39 0.63 0.73 0.61 0.41 0.57 0.67 0.65 0.61 0.62
Mp6g14630.1 (EIF3A)
0.56 0.5 0.62 0.76 0.68 0.66 0.61 0.59 0.48 0.46 0.6 0.49 0.54 0.7 0.84 0.81 0.8 0.65 0.99 0.8 0.61 0.71 0.68 1.0 0.68 0.56 0.47 0.54 0.65 0.71 0.78 0.65
0.28 0.48 0.42 0.64 0.29 0.32 0.27 0.23 0.28 0.31 0.75 0.53 0.64 0.26 0.38 0.64 0.34 0.24 1.0 0.59 0.33 0.68 0.41 0.81 0.37 0.35 0.24 0.2 0.26 0.25 0.29 0.29
0.44 0.31 0.56 0.66 0.57 0.55 0.51 0.47 0.35 0.32 0.52 0.3 0.49 0.27 0.8 0.85 0.78 0.65 1.0 0.8 0.61 0.68 0.7 0.93 0.66 0.62 0.46 0.48 0.52 0.62 0.84 0.72
Mp7g05100.1 (EXL4)
0.43 0.25 0.32 0.44 0.11 0.56 0.29 0.51 0.3 0.1 0.48 0.21 0.35 0.28 0.83 0.67 0.58 0.37 1.0 0.41 0.44 0.55 0.19 0.65 0.57 0.35 0.22 0.27 0.3 0.46 0.65 0.65
Mp7g08220.1 (CIK2)
0.35 0.24 0.48 0.31 0.4 0.46 0.34 0.44 0.31 0.28 0.41 0.31 0.4 0.38 0.58 0.33 0.4 0.5 1.0 0.59 0.46 0.62 0.39 0.82 0.57 0.4 0.34 0.36 0.41 0.5 0.68 0.68
0.55 0.43 0.63 0.64 0.56 0.61 0.57 0.62 0.64 0.34 0.58 0.46 0.6 0.58 0.81 0.65 0.73 0.69 1.0 0.7 0.63 0.81 0.67 0.96 0.66 0.67 0.52 0.6 0.62 0.68 0.58 0.56
0.38 0.33 0.49 0.85 0.32 0.41 0.48 0.4 0.43 0.28 0.59 0.47 0.47 0.18 0.93 1.0 0.89 0.36 0.73 0.63 0.52 0.6 0.51 0.6 0.6 0.47 0.36 0.4 0.53 0.66 0.71 0.55
0.05 0.05 0.36 0.31 0.17 0.09 0.18 0.08 0.05 0.02 0.06 0.13 0.07 0.11 0.48 0.31 0.21 0.23 1.0 0.15 0.09 0.28 0.18 0.51 0.05 0.05 0.08 0.06 0.03 0.09 0.06 0.04
Mp8g03860.1 (RBP45A)
0.63 0.39 0.77 0.86 0.7 0.64 0.56 0.59 0.54 0.37 0.57 0.43 0.47 0.78 0.85 0.85 0.79 0.68 1.0 0.79 0.63 0.72 0.71 0.91 0.68 0.69 0.59 0.59 0.61 0.72 0.88 0.89
0.1 0.04 0.38 0.26 0.01 0.2 0.14 0.23 0.05 0.02 0.11 0.05 0.1 0.1 0.45 0.21 0.31 0.37 1.0 0.2 0.2 0.49 0.07 0.38 0.14 0.13 0.1 0.12 0.06 0.06 0.09 0.1
0.41 0.13 0.71 0.47 0.49 0.43 0.29 0.4 0.23 0.11 0.2 0.13 0.16 0.25 0.46 0.36 0.51 0.55 1.0 0.53 0.36 0.73 0.43 0.96 0.4 0.34 0.3 0.25 0.32 0.61 0.76 0.52
Mp8g12660.1 (DES-1-LIKE)
0.45 0.52 0.57 0.71 0.45 0.54 0.49 0.5 0.51 0.36 0.63 0.48 0.62 0.17 1.0 0.82 0.9 0.51 0.97 0.64 0.49 0.63 0.5 0.92 0.61 0.5 0.38 0.42 0.45 0.63 0.73 0.68

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)