1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_130 (Marchantia polymorpha (Mpo) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Control
Cold (3°C)
Dark (3 days)
Heat (33°C)
Light (435 uEm-2s-1)
Osmotic (100 mM mannitol)
Nitrogen deficiency (0 mM KNO3)
Salt (40 mM NaCl)
Cold-Dark
Cold-Light
Cold-Mannitol
Cold-Nitrogen deficiency
Cold-Salt
Heat-Dark
Heat-Mannitol
Heat-Nitrogen deficiency
Heat-Salt
Light-Salt
Mannitol-Dark
Mannitol-Light
Mannitol-Nitrogen deficiency
Nitrogen deficiency-Dark
Nitrogen deficiency-Light
Salt-Dark
Salt-Mannitol
Salt-Nitrogen deficiency
ZT2 (2 hours after light)
ZT6 (6 hours after light)
ZT10 (10 hours after light)
ZT14 (2 hours after dark)
ZT18 (6 hours after dark)
ZT22 (10 hours after dark)
0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.0 0.56 0.27 0.0 0.0 0.0 0.13 0.17 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.48 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.03 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.05 0.12 0.08 0.15 0.02 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.03
Mp1g07010.1 (RPB1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.06 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0
Mp1g07540.1 (VHP2;2)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp1g12410.1 (EDR1)
 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp1g16200.1 (ANN8)
 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.06 0.07 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.03 0.0
Mp1g16620.1 (FIB2)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.06 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.11 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.51 0.0 0.0 0.11 0.13 0.0 0.0 0.0 0.11 0.46 0.13 0.0 0.75 0.0 0.09 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.12 0.0 0.38 0.0 0.0 0.0 0.0 0.5 0.16 0.15 0.16
0.05 0.06 0.07 0.07 0.01 0.03 0.0 0.03 0.01 0.0 0.01 0.03 0.0 0.08 0.02 0.01 0.0 0.08 0.02 0.01 0.0 0.1 0.03 0.06 0.02 0.07 0.0 0.0 0.04 0.06 0.05 0.02
Mp2g01280.1 (PDS5C)
 0.0 0.16 0.0 0.0 0.14 0.0 0.17 0.0 0.15 0.0 0.3 0.0 0.0 0.45 0.12 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.25 0.31 0.0 0.46 0.0 0.0 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp2g05280.1 (ADAL)
 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.2 0.0 0.0 0.44 0.0 0.89 0.0 0.08 0.33 0.16 1.48 0.08 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.76 0.5 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp2g06060.1 (TOPII)
 0.0 0.01 0.0 0.02 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.04 0.05 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.05 0.02 0.05 0.02 0.01 0.04 0.06 0.0 0.04 0.04 0.01 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.05 0.02 0.0 0.0 0.04 0.0 0.06 0.05 0.04 0.0 0.07 0.04 0.03 0.02
Mp2g25380.1 (AGP31)
 0.05 0.0 0.0 0.29 0.0 0.43 0.0 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.57 0.38 0.21 0.0 0.0 0.0 0.35 0.24 0.08 0.0 0.0 0.08 0.0 0.08 0.0 0.0 0.21 0.0
Mp3g04950.1 (TBL19)
 0.18 0.29 0.0 0.24 0.1 0.29 0.12 0.1 0.09 0.34 0.18 0.3 0.0 0.29 0.24 0.0 0.16 0.09 0.08 0.0 0.15 0.09 0.0 0.0 0.0 0.26 0.31 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0
0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.53 0.3 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.08 0.1 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.04 0.12 0.04 0.14 0.0 0.0 0.04 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0
Mp3g11120.1 (CSI3)
 1.74 0.95 0.0 0.04 0.15 0.78 0.19 1.45 0.05 0.41 0.38 0.16 3.81 0.0 0.43 0.2 0.2 1.95 0.0 0.75 0.83 0.0 0.14 0.0 0.35 1.33 0.05 1.11 4.61 0.9 0.0 0.38
Mp3g11580.1 (TOPP7)
 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp3g19480.1 (CYP76C5)
 0.5 0.68 0.0 0.51 0.52 1.25 0.43 0.89 0.13 0.34 0.77 0.0 1.81 0.13 0.61 1.63 0.53 2.93 0.94 1.96 1.49 0.12 1.63 0.0 2.09 1.87 1.43 0.13 0.13 0.29 0.0 0.15
0.03 0.0 0.0 0.0 0.27 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.16 0.13 0.09 0.14 0.35 0.1 0.18 0.0 0.11 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp3g22060.1 (mTERF23)
 0.27 1.06 0.0 1.13 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.18 0.19 0.36 0.18 0.0 0.14 0.61 0.15 0.78 0.0 0.32 0.0 0.0 0.18 0.0 0.48 0.17 0.0 0.0 0.0 0.2 0.2 0.21
0.28 0.0 0.0 0.82 0.0 0.35 0.0 0.0 0.0 1.4 0.0 0.0 0.0 0.0 1.23 0.0 0.63 0.16 0.0 0.17 0.31 0.0 0.18 0.0 0.16 0.17 0.0 0.0 0.18 0.21 0.69 0.23
Mp4g11840.1 (CSY3)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.02 0.0 0.0 0.0 0.04 0.05 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.04 0.0
Mp4g13680.1 (STH2)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.0 0.01 0.01 0.04 0.0 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.02 0.02 0.02 0.02 0.01 0.03 0.02 0.01 0.01 0.02 0.0 0.0 0.05 0.01 0.02 0.02
Mp5g00570.1 (PME39)
 0.35 0.34 0.0 0.79 0.0 1.19 0.0 0.79 0.0 0.0 0.3 0.16 0.32 0.0 0.64 1.32 0.92 0.15 0.0 0.27 0.5 0.0 0.6 0.0 0.14 0.0 0.14 0.66 0.0 0.0 0.16 0.19
Mp5g04310.1 (TCP4)
 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.19 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.08 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp5g06330.1 (FIB2)
 0.03 0.01 0.05 0.04 0.02 0.04 0.01 0.02 0.03 0.03 0.03 0.03 0.01 0.01 0.02 0.03 0.05 0.02 0.01 0.01 0.01 0.02 0.03 0.01 0.01 0.02 0.04 0.03 0.05 0.01 0.03 0.02
0.01 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.01 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.03 0.02 0.0 0.0
0.18 0.11 0.08 0.05 0.0 0.06 0.09 0.66 0.02 0.07 0.07 0.04 0.61 0.0 0.1 0.0 0.15 0.9 0.0 0.23 0.05 0.02 0.11 0.06 0.12 0.26 0.04 0.18 0.94 0.07 0.0 0.0
Mp5g09860.1 (ABCG10)
 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.21 0.0 0.13 0.25 0.0 0.3 0.37 0.0 0.2 0.26 0.0 0.32 0.0 0.3 0.08 0.08 0.17 0.09 0.0 0.08 0.33 0.38 0.0 0.27 0.17 0.09 0.18 0.17 1.34 0.86 0.36 0.5
Mp5g11810.1 (CHX24)
 0.23 0.17 0.15 0.0 0.12 0.11 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.17 0.0 0.7 0.72 0.09 0.36 0.42 0.0 0.11 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0
Mp5g13060.1 (MYB115)
 0.01 0.01 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp6g03250.1 (AST91)
 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.12 0.0 0.01 0.05 0.01 0.03 0.08 0.03 0.1 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp6g07140.1 (PUB35)
 0.06 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.33 0.11 0.0 0.0 0.0 0.23 0.11 0.0 0.27 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.11 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.25 0.14 0.0
0.67 0.7 0.0 0.0 0.13 0.13 0.0 0.0 0.0 0.34 0.33 0.0 0.12 0.0 0.0 0.22 0.0 0.55 0.0 0.44 0.1 0.0 0.0 0.0 0.43 0.12 0.47 0.0 0.0 0.0 0.0 0.47
Mp6g13430.1 (FLA18)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0
0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.12 0.0
0.23 0.49 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.32 0.0 0.0 0.44 0.41 0.54 0.0 0.27 0.36 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp7g10660.1 (NPF4.5)
 0.02 0.0 0.0 0.06 0.0 0.12 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.05 0.0 0.13 0.06 0.08 0.0 0.03 0.15 0.08 0.0 0.0 0.01 0.02 0.03 0.03 0.0 0.01 0.05 0.01 0.0
1.66 0.93 1.99 1.19 0.57 0.89 1.71 0.91 0.64 2.1 1.78 2.92 2.12 0.77 1.61 1.7 0.65 0.28 0.58 1.06 1.99 0.47 1.73 0.0 1.59 1.9 0.69 0.99 1.33 1.21 1.15 0.9
0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.15 0.35 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32
0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp7g18460.1 (HMGB11)
 0.13 0.12 0.0 0.0 0.0 0.33 0.19 0.0 0.0 0.07 0.22 0.08 0.15 0.0 0.0 0.21 0.0 0.38 0.0 0.07 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.0 0.15 0.18 0.0 0.0 0.0
Mp7g19440.1 (BDR3)
 0.0 0.1 0.0 0.02 0.07 0.02 0.03 0.0 0.0 0.14 0.02 0.0 0.07 0.0 0.13 0.26 0.06 0.12 0.0 0.1 0.03 0.02 0.06 0.0 0.11 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0
0.07 0.04 0.0 0.0 0.15 0.0 0.04 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.03 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.0 0.0 0.05 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.09 0.0 0.02 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0
Mp8g11620.1 (OBGL)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp8g11670.1 (TMT1)
 0.08 0.05 0.0 0.0 0.22 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.04 0.03 0.08 0.0 0.03 0.06 0.06 0.03 0.0 0.03 0.05 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.12 0.0 0.0 0.04 0.04 0.08
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)