Heatmap: Cluster_180 (Marchantia polymorpha (Mpo) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Control
Cold (3°C)
Dark (3 days)
Heat (33°C)
Light (435 uEm-2s-1)
Osmotic (100 mM mannitol)
Nitrogen deficiency (0 mM KNO3)
Salt (40 mM NaCl)
Cold-Dark
Cold-Light
Cold-Mannitol
Cold-Nitrogen deficiency
Cold-Salt
Heat-Dark
Heat-Mannitol
Heat-Nitrogen deficiency
Heat-Salt
Light-Salt
Mannitol-Dark
Mannitol-Light
Mannitol-Nitrogen deficiency
Nitrogen deficiency-Dark
Nitrogen deficiency-Light
Salt-Dark
Salt-Mannitol
Salt-Nitrogen deficiency
ZT2 (2 hours after light)
ZT6 (6 hours after light)
ZT10 (10 hours after light)
ZT14 (2 hours after dark)
ZT18 (6 hours after dark)
ZT22 (10 hours after dark)
0.0 0.0 0.16 0.09 0.0 0.21 0.12 0.11 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.0 0.0 0.09 0.38 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.27 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.11 0.0
Mp1g10360.1 (AMR1)
0.25 0.74 0.14 0.59 0.09 0.56 0.13 0.56 0.37 0.08 2.2 0.55 0.34 0.27 0.44 0.32 0.15 0.08 0.4 0.15 0.14 0.08 0.73 0.16 0.46 0.64 0.44 0.25 0.0 0.31 0.22 0.12
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp1g20300.1 (HSF3)
0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.37 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp1g26650.1 (PAB5)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.06 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp2g08270.1 (DUF179)
0.12 0.1 0.38 0.42 0.26 0.17 0.54 0.0 0.17 0.08 0.0 0.0 0.08 0.62 0.21 0.07 0.0 0.16 0.08 0.36 0.0 0.0 0.31 0.08 0.14 0.22 0.0 0.15 0.0 0.23 0.0 0.0
0.13 0.06 0.01 0.67 0.04 0.13 0.08 0.12 0.03 0.08 0.09 0.06 0.08 0.0 0.3 0.19 0.29 0.17 0.03 0.08 0.11 0.01 0.17 0.0 0.15 0.13 0.03 0.06 0.15 0.17 0.05 0.04
0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.03 0.0 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01
0.02 0.05 0.0 0.12 0.0 0.0 0.05 0.04 0.04 0.03 0.0 0.07 0.1 0.0 0.12 0.06 0.03 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.05 0.0 0.0
Mp2g17920.1 (FIB2)
0.0 0.01 0.02 0.02 0.02 0.02 0.05 0.01 0.01 0.0 0.0 0.02 0.04 0.02 0.04 0.03 0.01 0.02 0.02 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.01 0.01 0.01 0.05 0.01 0.02 0.05 0.02
0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0
0.25 0.42 0.0 0.0 0.35 0.07 0.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.41 0.48 0.04 0.0 0.01 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.61 0.04 0.21 0.01 0.22 0.05 0.06
0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp3g05690.1 (NLP8)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.06 0.0 0.04 0.02 0.02 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp3g06740.1 (ORC1B)
0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.23 0.34 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.12 0.11 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.41 0.0 0.0 0.05 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp3g08500.1 (ZRK7)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp3g14240.1 (CTL1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.08 0.16 0.28 0.51 0.0 0.61 0.0 0.06 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.06 0.07 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp3g15220.1 (CHX24)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.11 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.03 0.05 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp4g16810.1 (FDM3)
2.23 1.17 0.7 9.54 1.07 0.94 0.38 1.1 0.48 0.57 0.57 0.47 1.88 1.43 4.31 3.3 6.51 1.51 0.91 0.82 1.41 0.78 1.93 0.0 0.55 1.52 0.5 0.25 1.0 1.84 1.7 0.94
Mp4g21040.1 (PFK2)
0.07 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp4g23800.1 (MBR1)
0.0 0.6 0.0 0.52 0.24 0.27 0.0 0.0 0.2 0.2 0.19 0.44 0.2 0.0 0.18 0.41 0.18 0.0 0.0 0.0 0.59 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp5g13740.1 (MYR2)
0.0 0.0 0.0 2.32 0.0 0.11 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.47 1.1 0.76 0.11 0.0 0.4 0.47 0.0 0.0 0.0 0.21 0.21 0.0 0.0 0.0 0.52 0.13 0.0
Mp5g13880.1 (ENODL2)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp5g17780.1 (PSY1R)
0.01 0.0 0.0 0.14 0.03 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.03 0.0 0.03 0.1 0.03 0.0 0.03 0.02 0.02 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.02 0.03 0.01 0.02
Mp5g17810.1 (FBX5)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.03 0.0 0.07 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.66 0.43 0.0 0.92 0.21 0.79 0.73 0.0 0.26 0.48 1.8 0.97 1.91 0.0 0.88 0.74 0.69 0.8 0.72 0.0 0.0 0.0 2.01 0.0 1.25 0.22 1.42 0.0 0.3 0.0 0.54 0.0
Mp6g00520.1 (B5 #1)
0.05 0.1 0.0 0.29 0.0 0.0 0.06 0.0 0.17 0.23 0.37 0.13 0.0 0.17 0.18 0.18 0.11 0.0 0.23 0.0 0.0 0.12 0.04 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0
Mp6g07420.1 (PDP3)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.01 0.02 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0
0.0 0.0 0.64 0.12 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.13 0.12 0.0 0.0 0.15 0.47 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.11 0.27 0.13 0.0 0.13 0.14 0.13 0.12 0.26 0.0 0.17 0.32
Mp6g10140.1 (RNH1C)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 1.04 0.0 0.15 0.0 0.36 0.17 0.0 0.18 0.46 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp6g10190.1 (BAM9)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.15 0.12 0.0 0.05 0.15 0.18 0.0 0.1 0.06 0.05 0.0 0.06 0.11 0.09 0.1 0.03 0.13 0.42 0.03 0.13 0.09 0.0 0.03 0.15 0.13 0.11 0.12 0.44 0.09 0.21 0.03 0.14
Mp6g19950.1 (EMB2794)
0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.08 0.03 0.11 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp7g02510.1 (emb1441)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.01 0.0 0.04 0.0 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.04 0.0 0.0 0.03 0.0
0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.03 0.0 0.0 0.06 0.04 0.02 0.0 0.0 0.05 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.87 1.75 0.0 1.77 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.0 0.01 0.05 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.01 0.01 0.04 0.0 0.05 0.02 0.02 0.02 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.07 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.06 0.0 0.07 0.19 0.19 0.05 0.02 0.02 0.12 0.02 0.07 0.04 0.02 0.07 0.06 0.15 0.08 0.28 0.31 0.21 0.0 0.1 0.04 0.11 0.25 0.15 0.2 0.03 0.03 0.0 0.08
0.33 0.27 0.0 0.4 0.0 0.18 0.07 0.06 0.17 0.53 0.28 0.0 0.11 0.3 0.3 0.5 0.14 0.0 0.0 0.05 0.05 0.06 0.37 0.0 0.0 0.06 0.0 0.11 0.24 0.08 0.0 0.0
Mp8g10250.1 (GOX1)
0.84 1.53 3.43 3.0 0.58 2.83 1.91 1.7 1.3 1.08 1.35 2.13 1.58 4.05 2.35 3.26 1.87 1.97 2.25 1.83 1.3 2.31 3.01 1.53 2.9 2.46 1.06 0.89 0.58 1.17 2.13 1.21
0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.16 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.2 0.2 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.08 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp8g10810.1 (PYL7)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp8g16010.1 (OSM1)
0.24 0.45 0.16 0.4 0.08 0.2 0.22 0.17 0.06 0.21 0.46 0.23 0.34 0.26 0.22 0.27 0.17 0.17 0.1 0.11 0.08 0.15 0.13 0.07 0.07 0.13 0.03 0.06 0.15 0.22 0.21 0.16
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mpzg00300.1 (AAP8)
0.02 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.03 0.0 0.0 0.01 0.01 0.04 0.01 0.0 0.0 0.0
Mpzg00540.1 (BAGP1)
1.44 1.91 0.99 0.59 0.17 0.82 1.52 0.68 3.27 2.88 1.49 1.98 2.74 1.8 0.27 1.59 0.74 0.54 1.01 1.36 1.29 0.69 1.81 1.37 1.2 1.23 0.18 0.46 1.02 0.77 0.55 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)