Heatmap: Cluster_179 (Marchantia polymorpha (Mpo) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Control
Cold (3°C)
Dark (3 days)
Heat (33°C)
Light (435 uEm-2s-1)
Osmotic (100 mM mannitol)
Nitrogen deficiency (0 mM KNO3)
Salt (40 mM NaCl)
Cold-Dark
Cold-Light
Cold-Mannitol
Cold-Nitrogen deficiency
Cold-Salt
Heat-Dark
Heat-Mannitol
Heat-Nitrogen deficiency
Heat-Salt
Light-Salt
Mannitol-Dark
Mannitol-Light
Mannitol-Nitrogen deficiency
Nitrogen deficiency-Dark
Nitrogen deficiency-Light
Salt-Dark
Salt-Mannitol
Salt-Nitrogen deficiency
ZT2 (2 hours after light)
ZT6 (6 hours after light)
ZT10 (10 hours after light)
ZT14 (2 hours after dark)
ZT18 (6 hours after dark)
ZT22 (10 hours after dark)
0.6 0.35 0.11 0.57 1.0 0.3 0.33 0.25 0.08 0.26 0.41 0.19 0.22 0.2 0.37 0.32 0.29 0.29 0.25 0.49 0.31 0.28 0.32 0.18 0.18 0.27 0.07 0.11 0.27 0.21 0.21 0.11
0.63 0.28 0.55 0.73 1.0 0.51 0.35 0.52 0.13 0.37 0.45 0.29 0.32 0.42 0.45 0.33 0.43 0.47 0.46 0.67 0.39 0.47 0.5 0.34 0.51 0.43 0.37 0.47 0.49 0.9 0.66 0.73
Mp1g11330.1 (NCH1)
0.92 0.63 0.58 0.82 1.0 0.79 0.42 0.86 0.46 0.5 0.5 0.36 0.58 0.27 0.67 0.41 0.64 0.8 0.52 0.57 0.46 0.49 0.47 0.58 0.6 0.43 0.92 0.64 0.63 0.54 0.58 0.75
1.0 0.1 0.44 0.19 0.52 0.5 0.11 0.43 0.11 0.15 0.07 0.04 0.03 0.18 0.22 0.12 0.11 0.14 0.23 0.2 0.21 0.1 0.17 0.03 0.17 0.19 0.48 0.47 0.35 0.13 0.3 0.52
Mp1g13910.1 (CBC1)
0.63 0.41 0.44 0.48 1.0 0.54 0.62 0.63 0.6 0.38 0.51 0.37 0.58 0.45 0.46 0.4 0.5 0.84 0.79 0.67 0.56 0.71 0.79 0.81 0.54 0.56 0.75 0.51 0.46 0.73 0.79 0.88
0.59 0.3 0.67 0.44 1.0 0.55 0.51 0.58 0.77 0.47 0.36 0.49 0.35 0.37 0.47 0.48 0.51 0.98 0.65 0.87 0.6 0.68 1.0 0.81 0.61 0.59 0.53 0.42 0.43 0.92 0.94 0.93
0.08 0.02 0.39 0.05 1.0 0.01 0.05 0.09 0.29 0.05 0.01 0.05 0.01 0.15 0.01 0.02 0.03 0.42 0.04 0.04 0.02 0.16 0.26 0.07 0.01 0.01 0.02 0.0 0.02 0.01 0.09 0.07
Mp2g05080.1 (GBF1)
0.81 0.26 0.18 0.25 0.64 1.0 0.19 0.23 0.04 0.47 0.38 0.14 0.22 0.08 0.2 0.2 0.24 0.25 0.1 0.49 0.39 0.16 0.37 0.18 0.41 0.25 0.23 0.22 0.7 0.28 0.19 0.24
Mp2g09170.1 (PDE191)
0.51 0.22 0.59 0.56 1.0 0.38 0.41 0.42 0.76 0.26 0.24 0.17 0.22 0.51 0.54 0.51 0.6 0.62 0.63 0.72 0.44 0.51 0.92 0.76 0.39 0.47 0.54 0.43 0.36 0.42 0.71 0.82
0.83 0.1 0.01 0.38 0.48 1.0 0.2 0.13 0.02 0.12 0.13 0.01 0.03 0.0 0.16 0.32 0.13 0.04 0.0 0.12 0.3 0.0 0.06 0.01 0.32 0.34 0.37 0.35 0.66 0.62 0.2 0.26
0.71 0.06 0.52 0.76 0.77 0.99 0.41 0.7 0.09 0.08 0.19 0.05 0.19 0.57 0.82 0.55 0.74 0.78 0.81 0.82 0.65 0.66 0.54 0.73 0.64 0.61 0.66 0.81 1.0 0.43 0.58 0.48
Mp2g18820.1 (OVA4)
0.71 0.38 0.57 0.67 0.64 0.66 0.57 0.72 0.5 0.31 0.57 0.35 0.54 0.58 0.64 0.66 0.7 0.83 0.68 0.71 0.65 0.64 0.71 0.71 0.69 0.74 1.0 0.86 0.73 0.66 0.72 0.74
Mp2g20090.1 (LST8-1)
0.74 0.3 0.6 0.58 0.74 0.83 0.68 0.8 0.52 0.32 0.37 0.33 0.42 0.66 0.76 0.6 0.7 0.74 0.8 0.7 0.77 0.73 0.81 0.8 0.84 0.7 1.0 0.86 0.77 0.75 0.66 0.58
1.0 0.76 0.06 0.15 0.6 0.34 0.18 0.27 0.34 0.91 0.52 0.05 0.62 0.08 0.09 0.09 0.07 0.16 0.04 0.17 0.16 0.01 0.07 0.02 0.12 0.13 0.86 0.37 0.2 0.27 0.3 0.2
0.69 0.64 0.04 0.14 1.0 0.51 0.35 0.45 0.04 0.75 0.08 0.2 0.19 0.01 0.1 0.06 0.16 0.5 0.01 0.07 0.18 0.04 0.31 0.0 0.1 0.22 0.84 0.38 0.53 0.53 0.13 0.23
Mp3g05980.1 (TAF11b)
0.68 0.62 0.56 0.74 0.9 0.69 0.59 0.7 0.75 0.54 0.84 0.68 0.78 0.53 0.78 0.7 0.84 1.0 0.77 0.85 0.72 0.62 0.99 0.8 0.73 0.8 0.65 0.62 0.65 0.74 0.78 0.76
0.5 0.12 0.53 0.29 1.0 0.36 0.23 0.4 0.14 0.4 0.16 0.1 0.13 0.58 0.2 0.19 0.24 0.54 0.63 0.39 0.23 0.47 0.5 0.75 0.23 0.23 0.26 0.39 0.39 0.47 0.46 0.44
Mp3g06890.1 (BOR1)
0.22 0.38 0.02 0.07 1.0 0.12 0.09 0.12 0.0 0.23 0.13 0.16 0.19 0.02 0.12 0.04 0.13 0.41 0.01 0.27 0.16 0.01 0.3 0.01 0.06 0.16 0.1 0.09 0.03 0.08 0.01 0.05
0.0 0.0 0.0 0.11 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.22 0.24 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp3g10950.1 (PFA-DSP1)
0.91 0.38 0.94 0.8 0.84 0.81 0.88 0.71 0.55 0.44 0.35 0.48 0.34 0.74 0.57 0.8 0.61 0.69 0.87 0.68 0.72 0.9 0.77 0.82 0.69 0.81 0.67 0.85 0.94 0.97 1.0 0.78
Mp3g12360.1 (GLP10)
1.0 0.34 0.09 0.1 0.8 0.64 0.19 0.74 0.0 0.18 0.29 0.17 0.12 0.02 0.19 0.0 0.1 0.35 0.1 0.56 0.54 0.15 0.38 0.14 0.4 0.31 0.08 0.17 0.52 0.11 0.09 0.07
Mp3g19340.1 (AtNPC1 - 1)
0.28 0.1 0.0 0.38 1.0 0.14 0.0 0.13 0.0 0.24 0.01 0.0 0.04 0.02 0.21 0.08 0.35 0.45 0.0 0.09 0.05 0.0 0.03 0.0 0.15 0.01 0.11 0.2 0.17 0.09 0.07 0.12
Mp3g20750.1 (CYP704A1)
0.37 0.21 0.45 0.64 1.0 0.36 0.17 0.39 0.26 0.58 0.32 0.07 0.29 0.35 0.55 0.33 0.56 0.54 0.34 0.73 0.24 0.28 0.49 0.31 0.28 0.18 0.18 0.14 0.2 0.45 0.32 0.36
Mp4g01740.1 (SBT1.8)
0.63 0.42 0.23 0.71 0.51 0.41 0.35 0.52 0.12 0.36 0.36 0.33 0.43 0.08 0.27 0.17 0.33 0.46 0.2 1.0 0.33 0.23 0.51 0.13 0.34 0.55 0.37 0.54 0.57 0.63 0.49 0.38
Mp4g02800.1 (PAB5)
0.53 0.46 0.59 0.63 0.85 0.43 0.42 0.45 0.61 0.62 0.49 0.52 0.53 0.53 0.54 0.55 0.61 0.79 0.79 0.69 0.49 0.54 0.9 1.0 0.44 0.54 0.56 0.48 0.44 0.5 0.79 0.94
0.76 0.36 0.89 0.72 0.51 0.52 0.59 0.59 0.43 0.37 0.34 0.36 0.31 0.88 0.51 0.5 0.58 0.51 0.69 0.5 0.59 0.98 0.8 0.62 0.66 0.66 0.59 0.74 0.68 1.0 0.72 0.67
0.53 0.03 0.58 0.35 0.68 0.71 0.38 0.68 0.55 0.07 0.08 0.02 0.03 0.68 0.61 0.24 0.58 0.65 0.83 0.55 0.64 0.69 0.6 1.0 0.63 0.5 0.56 0.9 0.82 0.92 0.85 0.54
Mp4g06630.1 (CDP1)
0.47 0.17 0.41 0.31 1.0 0.31 0.08 0.27 0.21 0.1 0.15 0.02 0.1 0.38 0.3 0.14 0.34 0.56 0.22 0.51 0.18 0.22 0.32 0.16 0.24 0.17 0.32 0.24 0.19 0.26 0.34 0.57
Mp4g07480.1 (NRAMP4)
0.95 0.86 0.4 0.7 1.0 0.99 0.69 0.78 0.99 0.74 0.75 0.35 0.7 0.57 0.48 0.46 0.48 0.71 0.53 0.8 0.7 0.47 0.62 0.43 0.73 0.61 0.92 0.8 0.73 0.62 0.58 0.49
Mp4g08940.1 (GRXS17)
0.93 0.45 0.81 0.37 0.4 1.0 0.64 0.92 0.43 0.24 0.44 0.21 0.39 0.31 0.47 0.29 0.41 0.41 0.91 0.43 0.62 0.47 0.32 0.84 0.82 0.54 0.86 0.95 0.88 0.86 0.83 0.88
Mp4g09780.1 (MOT1)
0.87 0.23 0.59 0.77 0.64 0.67 1.0 0.83 0.26 0.2 0.2 0.23 0.25 0.71 0.44 0.54 0.62 0.78 0.8 0.44 0.62 0.78 0.76 0.79 0.43 0.73 0.89 0.98 0.92 0.79 0.64 0.62
1.0 0.18 0.25 0.67 0.6 0.52 0.29 0.71 0.07 0.1 0.13 0.02 0.27 0.47 0.28 0.27 0.43 0.28 0.19 0.48 0.49 0.12 0.2 0.07 0.3 0.19 0.53 0.85 0.63 0.79 0.63 0.72
0.55 0.46 0.78 0.57 0.66 0.58 0.43 0.7 0.7 0.46 0.58 0.4 0.58 0.34 0.72 0.58 0.75 0.86 0.66 0.76 0.59 0.62 0.64 0.67 0.62 0.58 0.64 0.58 0.6 0.9 1.0 0.96
Mp5g05720.1 (GID1B)
0.83 0.13 0.24 0.28 0.87 0.66 0.54 0.47 0.13 0.12 0.14 0.08 0.1 0.1 0.48 0.19 0.34 0.38 0.63 0.97 0.47 0.35 0.49 0.4 0.55 0.49 0.64 0.6 0.55 0.68 0.84 1.0
0.67 0.16 0.7 0.9 0.67 0.61 0.42 0.67 0.56 0.27 0.28 0.16 0.27 0.52 0.83 0.68 0.93 0.75 0.67 0.7 0.63 0.71 0.66 0.88 0.67 0.61 0.56 0.95 1.0 0.86 0.65 0.57
0.4 0.12 0.0 0.34 1.0 0.22 0.04 0.23 0.01 0.09 0.06 0.04 0.04 0.04 0.29 0.11 0.41 0.36 0.0 0.34 0.19 0.03 0.37 0.0 0.14 0.09 0.05 0.08 0.08 0.09 0.06 0.2
Mp5g17290.1 (GRXC1)
0.54 0.3 0.53 0.41 1.0 0.54 0.32 0.54 0.37 0.25 0.34 0.21 0.32 0.3 0.4 0.35 0.37 0.57 0.44 0.68 0.46 0.39 0.58 0.7 0.5 0.45 0.6 0.48 0.55 0.54 0.72 0.69
Mp5g18380.1 (LecRK-I.2)
0.43 0.14 0.15 0.23 1.0 0.44 0.38 0.43 0.06 0.43 0.16 0.11 0.14 0.1 0.18 0.23 0.25 0.41 0.23 0.26 0.21 0.42 0.21 0.13 0.37 0.22 0.53 0.39 0.28 0.34 0.55 0.57
Mp6g01050.1 (MED7A)
0.75 0.44 0.71 0.76 0.72 0.8 0.63 0.63 0.58 0.36 0.52 0.41 0.49 1.0 0.84 0.76 0.76 0.73 0.96 0.75 0.69 0.8 0.72 0.91 0.64 0.74 0.8 0.83 0.99 0.66 0.67 0.69
0.8 0.06 0.0 0.12 0.89 0.38 0.12 0.32 0.0 0.34 0.04 0.02 0.03 0.0 0.07 0.05 0.05 0.21 0.01 1.0 0.27 0.01 0.25 0.0 0.21 0.16 0.15 0.27 0.38 0.51 0.33 0.29
0.55 0.16 0.17 0.44 1.0 0.44 0.26 0.54 0.25 0.11 0.18 0.14 0.13 0.13 0.46 0.31 0.55 0.87 0.07 0.46 0.21 0.11 0.7 0.09 0.4 0.24 0.37 0.45 0.21 0.11 0.25 0.34
Mp6g03150.1 (H1.1)
0.73 0.25 0.61 0.37 0.58 0.72 0.56 0.67 0.22 0.08 0.37 0.27 0.32 0.23 0.39 0.28 0.39 0.6 0.76 0.63 0.67 0.64 0.61 0.71 0.7 0.69 1.0 0.87 0.94 0.59 0.64 0.56
Mp6g15210.1 (MAP1D)
0.75 0.37 0.65 0.52 0.77 0.65 0.55 0.74 0.55 0.37 0.41 0.32 0.36 0.52 0.48 0.41 0.53 0.7 0.65 0.66 0.61 0.56 0.67 0.76 0.64 0.66 0.95 1.0 0.85 0.8 0.92 0.9
0.63 0.61 0.56 0.55 0.87 0.61 0.47 0.78 0.86 0.72 0.78 0.41 0.74 0.24 0.75 0.51 0.85 1.0 0.77 0.88 0.65 0.63 0.96 0.89 0.69 0.71 0.94 0.72 0.65 0.74 0.96 0.94
Mp7g05780.1 (ATXR2)
0.71 0.22 0.68 0.71 0.61 0.57 0.61 0.67 0.72 0.52 0.29 0.29 0.24 0.59 0.7 0.73 0.72 0.62 0.82 0.57 0.6 0.92 0.51 0.71 0.62 0.67 0.51 0.74 0.84 1.0 0.88 0.63
0.91 0.33 0.69 0.66 0.95 1.0 0.7 0.96 0.56 0.53 0.51 0.38 0.48 0.71 0.72 0.72 0.72 0.89 0.87 0.87 0.8 0.74 0.82 0.85 0.93 0.81 0.71 0.93 0.99 0.89 0.92 0.9
Mp7g08120.1 (AtCCR4a)
0.65 0.26 0.74 0.72 0.79 0.57 0.47 0.64 0.52 0.3 0.33 0.22 0.26 0.36 0.74 0.6 0.75 0.7 0.76 0.78 0.53 0.65 0.62 0.7 0.53 0.52 1.0 1.0 0.76 0.93 0.96 0.97
0.76 0.37 0.05 0.75 0.74 1.0 0.12 0.68 0.1 0.11 0.38 0.09 0.21 0.02 0.52 0.17 0.63 0.81 0.43 0.58 0.51 0.05 0.29 0.08 0.64 0.42 0.38 0.45 0.49 0.4 0.49 0.53
0.65 0.18 0.51 1.0 0.78 0.54 0.39 0.56 0.46 0.32 0.18 0.07 0.15 0.35 0.75 0.81 0.8 0.47 0.44 0.5 0.46 0.44 0.29 0.48 0.42 0.3 0.65 0.99 0.74 0.49 0.4 0.37
Mp8g09670.1 (SGF11)
0.9 0.37 0.74 0.77 0.83 0.7 0.68 0.77 0.62 0.39 0.49 0.36 0.38 0.6 0.8 0.71 0.73 0.69 0.87 0.72 0.66 0.88 0.72 0.77 0.67 0.69 0.85 0.82 0.79 1.0 0.95 0.84
0.96 0.33 0.39 0.46 0.61 0.84 0.38 0.69 0.37 0.2 0.37 0.19 0.46 0.64 0.41 0.22 0.46 0.83 0.69 0.61 0.59 0.37 0.66 0.92 0.56 0.82 0.76 0.95 1.0 0.74 0.91 0.89
Mp8g17780.1 (CAX2)
0.91 0.5 0.54 0.1 1.0 0.5 0.01 0.53 0.13 0.18 0.18 0.01 0.34 0.11 0.02 0.0 0.02 0.26 0.08 0.28 0.01 0.09 0.13 0.07 0.08 0.05 0.43 0.52 0.46 0.2 0.2 0.44
MpVg00220.1 (TAPX)
0.54 0.53 0.44 0.61 0.59 0.52 0.41 0.48 0.58 0.41 0.48 0.48 0.53 0.29 0.66 0.52 0.92 1.0 0.49 0.62 0.49 0.39 0.77 0.64 0.5 0.6 0.33 0.48 0.52 0.47 0.43 0.52

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)