Heatmap: Cluster_47 (Marchantia polymorpha (Mpo) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Control
Cold (3°C)
Dark (3 days)
Heat (33°C)
Light (435 uEm-2s-1)
Osmotic (100 mM mannitol)
Nitrogen deficiency (0 mM KNO3)
Salt (40 mM NaCl)
Cold-Dark
Cold-Light
Cold-Mannitol
Cold-Nitrogen deficiency
Cold-Salt
Heat-Dark
Heat-Mannitol
Heat-Nitrogen deficiency
Heat-Salt
Light-Salt
Mannitol-Dark
Mannitol-Light
Mannitol-Nitrogen deficiency
Nitrogen deficiency-Dark
Nitrogen deficiency-Light
Salt-Dark
Salt-Mannitol
Salt-Nitrogen deficiency
ZT2 (2 hours after light)
ZT6 (6 hours after light)
ZT10 (10 hours after light)
ZT14 (2 hours after dark)
ZT18 (6 hours after dark)
ZT22 (10 hours after dark)
0.38 0.0 1.22 0.0 0.16 0.31 0.25 0.47 0.17 0.3 0.16 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.43 0.31 0.42 0.0 0.49 1.07 0.0 0.56 0.75 0.14 0.71 0.0 0.73 0.0 0.2
Mp1g08240.1 (NF-YC7)
0.04 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.11 0.36 0.0 0.06 0.0 0.11 0.05 0.0 0.06 0.06 0.16 0.06 0.16 0.0 0.0 0.29 0.07 0.24
0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.2 0.0 0.31 0.14 0.0 0.0 0.15 0.77 0.0 0.4 0.26 0.15 0.14 0.0 0.0 0.0 0.15 0.16 0.0 0.14 0.42 0.0 0.0 0.0 0.33 0.0
Mp1g11170.1 (RGI1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.0
0.09 0.0 0.06 0.0 0.0 0.08 0.0 0.05 0.11 0.02 0.12 0.0 0.0 0.06 0.09 0.02 0.05 0.0 0.13 0.06 0.12 0.1 0.02 0.02 0.04 0.02 0.1 0.0 0.06 0.05 0.02 0.07
Mp1g20380.1 (CeQORH)
187.68 98.44 171.37 261.96 126.61 116.19 113.64 153.39 91.53 135.94 99.94 103.79 117.73 125.78 167.76 216.7 198.02 163.7 111.45 135.23 118.98 173.61 142.3 103.82 127.69 144.29 110.2 161.44 197.54 245.93 130.07 111.75
0.15 0.15 0.05 0.02 0.03 0.19 0.07 0.22 0.0 0.26 0.01 0.0 0.04 0.0 0.02 0.06 0.01 0.04 0.07 0.01 0.03 0.02 0.02 0.04 0.14 0.03 0.25 0.47 0.42 0.72 0.26 0.38
Mp2g02480.1 (TLP6)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.09 0.0
Mp2g05040.1 (PRR2)
0.91 0.65 0.71 0.83 0.41 0.45 0.8 0.53 1.82 0.57 0.31 0.77 0.48 0.14 0.49 1.53 0.95 0.86 0.2 0.26 0.51 0.62 0.55 0.22 0.69 0.71 0.14 0.41 0.99 0.58 0.64 0.35
Mp2g06050.1 (SHBY)
0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.03 0.0 0.06 0.02 0.0 0.0 0.04 0.05 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.1 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0
Mp2g14170.1 (HKL1)
0.23 0.0 0.0 0.31 0.06 0.29 0.14 0.0 0.11 0.54 0.15 0.06 0.05 0.17 0.45 0.62 0.27 0.05 0.1 0.05 0.08 0.15 0.3 0.0 0.09 0.24 0.1 0.32 0.47 0.44 0.2 0.48
0.0 0.29 0.0 0.2 0.22 0.48 0.39 0.26 0.24 0.0 0.0 0.7 0.76 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.94 0.43 0.94 0.25 0.46 1.26 0.87 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 1.69 0.0
Mp2g21440.1 (CUC1)
0.02 0.09 0.0 0.0 0.04 0.04 0.0 0.0 0.0 0.04 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0
Mp2g23320.1 (SIR1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.69 0.0 0.0
0.59 0.25 0.09 0.4 0.3 0.44 0.36 0.44 0.1 0.31 0.12 0.42 0.14 0.01 0.55 0.99 0.36 0.4 0.03 0.26 0.15 0.23 0.19 0.1 0.13 0.4 0.46 0.15 0.22 0.42 1.61 1.43
Mp3g02710.1 (PDR6)
3.72 2.63 0.12 3.17 0.24 2.69 2.06 1.18 2.53 1.46 1.34 0.17 0.91 0.24 5.43 2.69 4.91 0.46 0.44 0.7 1.63 0.41 0.3 0.23 0.91 2.26 1.3 1.42 3.8 5.92 2.67 0.62
Mp3g09500.1 (TFS1)
0.05 0.02 0.11 0.0 0.01 0.07 0.04 0.03 0.01 0.12 0.0 0.01 0.07 0.01 0.0 0.03 0.0 0.09 0.03 0.0 0.02 0.16 0.01 0.04 0.05 0.01 0.04 0.07 0.01 0.08 0.21 0.0
Mp3g14500.1 (SNL3)
0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.1 0.0
1.37 0.73 0.19 2.31 0.28 0.86 0.36 0.7 0.52 0.47 0.41 0.22 0.68 0.49 1.01 0.83 2.56 0.46 0.28 0.32 0.61 0.38 0.63 0.09 0.86 0.63 0.42 1.31 1.5 3.9 1.12 1.45
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0
Mp4g08530.1 (RPS19)
0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.35 0.0 0.0 0.26 0.2 0.08 0.0 0.08 0.27 0.08 0.0 0.15 0.09 0.34 0.0 0.0 0.09 0.0 0.48 0.0 0.43 0.23 0.12
0.39 0.29 0.24 0.09 0.31 0.65 0.53 0.26 0.29 0.29 0.28 0.19 0.56 0.0 0.3 0.32 0.39 0.14 0.63 0.32 0.35 0.51 0.17 0.32 0.57 0.16 0.24 0.44 0.59 0.54 0.8 0.27
Mp4g15000.1 (CHX6B)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.05 0.0 0.05 0.0 0.05 0.0 0.12 0.04 0.09 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.0
0.02 0.02 0.03 0.05 0.02 0.01 0.04 0.1 0.0 0.01 0.03 0.05 0.0 0.0 0.05 0.06 0.1 0.12 0.02 0.02 0.02 0.09 0.02 0.08 0.02 0.03 0.03 0.03 0.03 0.02 0.12 0.02
Mp4g17400.1 (CLPP6)
0.01 0.02 0.01 0.0 0.0 0.01 0.06 0.01 0.0 0.0 0.01 0.04 0.03 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.01 0.0 0.01 0.01 0.03 0.0 0.0 0.01 0.0 0.05 0.03 0.01
0.07 0.02 0.05 0.06 0.01 0.0 0.05 0.0 0.07 0.09 0.03 0.01 0.01 0.12 0.1 0.21 0.05 0.03 0.07 0.07 0.09 0.03 0.14 0.03 0.01 0.04 0.0 0.0 0.1 0.36 0.07 0.13
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp4g23850.1 (NFA3)
0.02 0.02 0.05 0.13 0.06 0.02 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.09 0.05 0.0 0.04 0.02 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.04 0.02 0.0 0.0 0.05 0.0 0.05
Mp5g02550.1 (GLP4)
0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.03 0.0 0.0 0.02 0.02 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.04 0.0
Mp5g05350.1 (IBM1)
0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.12 0.14 0.0 0.25 0.0 0.42 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.0 0.49 0.17
Mp5g06220.1 (PRLIP7)
0.28 0.07 0.0 0.29 0.11 0.31 0.09 0.09 0.02 0.24 0.03 0.03 0.03 0.1 0.17 0.4 0.32 0.17 0.11 0.16 0.38 0.0 0.24 0.0 0.16 0.23 0.23 0.27 0.05 0.97 0.35 0.65
Mp5g06670.1 (GMI1)
1.37 0.35 0.59 0.78 0.77 0.76 1.08 0.66 0.39 1.05 0.12 0.27 0.37 0.26 1.46 2.16 1.33 1.33 0.0 0.79 0.0 1.0 0.48 0.0 0.23 0.67 0.35 0.36 0.28 2.4 4.85 4.42
Mp5g07610.1 (TAF4)
0.0 0.36 0.0 0.11 0.0 0.0 0.52 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.53 0.42 0.1 0.22 0.0 0.12 0.35 0.0 0.12 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0
Mp5g10760.1 (NRT2.4)
0.03 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.05 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.2 0.01 0.0
0.04 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.06 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.05 0.08 0.0 0.0
Mp5g14570.1 (BTL08)
0.07 0.16 0.09 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.13 0.06 0.18 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.22 0.21 0.15 0.0 0.0 0.12 0.16 0.11 0.0 0.0 0.0 0.07 0.28 0.29
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.08
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.8 0.22
33.99 23.42 11.13 20.68 15.26 33.38 31.38 32.84 60.27 6.97 19.72 9.3 17.75 5.93 55.67 58.85 77.48 12.81 6.71 6.7 17.23 20.04 21.7 12.38 22.18 20.27 18.81 33.2 79.98 34.16 31.61 14.64
0.15 0.35 0.19 0.35 0.08 0.17 0.19 0.0 0.29 0.27 0.31 0.45 0.32 0.13 0.41 0.45 0.37 0.35 0.23 0.22 0.0 0.16 0.08 0.0 0.22 0.22 0.04 0.0 0.12 0.15 0.68 0.15
Mp6g06550.1 (TLP1)
0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.01 0.04 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0
Mp6g11130.1 (UBP7)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0
Mp6g13070.1 (RPS5)
0.02 0.01 0.06 0.01 0.04 0.06 0.05 0.02 0.03 0.05 0.01 0.0 0.01 0.02 0.02 0.01 0.0 0.03 0.0 0.03 0.02 0.01 0.03 0.01 0.0 0.03 0.02 0.03 0.01 0.14 0.04 0.06
0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0
0.2 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.5 0.63 0.22 1.45 0.61 0.63 1.09 0.0 0.0 0.5 0.35 0.22 0.64 0.19 0.0 0.0 0.81 0.0 0.94 0.0 0.0 0.22 0.21 0.0 1.57 0.0
0.03 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.12 0.13 0.0 0.13 0.14 0.11 0.12 0.17 0.13 0.0 0.12 0.0 0.0 0.18 0.0 0.12 0.06 0.0 0.0 0.07 0.0 0.15 0.17
Mp7g08200.1 (ALA2)
0.16 0.41 0.0 0.15 0.07 0.35 0.18 0.04 0.02 0.24 0.17 0.23 0.18 0.0 0.05 0.11 0.11 0.21 0.06 0.12 0.18 0.07 0.32 0.07 0.02 0.34 0.11 0.13 0.4 0.28 0.0 0.21
0.04 0.0 0.05 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.03 0.03 0.0 0.0 0.1 0.2 0.04 0.04
0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.04 0.0 0.08 0.02 0.02 0.0 0.02 0.04 0.0 0.04 0.04 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0
0.73 0.16 0.22 0.87 0.42 0.99 2.54 1.63 0.0 3.31 0.94 0.15 0.72 0.44 0.94 3.94 1.6 3.71 0.13 1.01 0.69 0.0 0.81 0.0 2.79 0.52 0.27 0.0 0.18 0.0 0.0 0.34
Mp8g05330.1 (AMT1;2)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp8g11480.1 (TBL34)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp8g13990.1 (MED6)
0.03 0.0 0.0 0.0 0.11 0.16 0.21 0.26 0.0 0.39 0.0 0.41 0.28 0.0 0.0 0.16 0.04 0.99 0.0 0.08 0.0 0.04 0.09 0.0 0.61 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.03 0.0 0.06 0.03 0.02 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0
Mp8g16630.1 (MyoB3)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.12 0.26 0.02 0.0
Mp8g17220.1 (SMO1-1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.09 0.0 0.0 0.07 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.34 0.31 0.0 0.27 0.66 0.36 0.47 0.28 0.0 0.36 0.57 0.82 0.69 0.05 0.42 0.25 0.07 0.35 0.0 0.55 0.14 0.0 0.97 0.0 0.35 0.3 0.81 0.44 0.23 0.59 1.14 0.52
Mpzg00700.1 (PSBB)
0.09 0.0 0.02 0.03 0.03 0.04 0.03 0.04 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.04 0.01 0.0 0.0 0.08 0.05 0.15 0.06 0.11 0.12 0.13 0.02 0.07 0.0 0.0 0.15 0.14 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)