Heatmap: Cluster_51 (Marchantia polymorpha (Mpo) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Control
Cold (3°C)
Dark (3 days)
Heat (33°C)
Light (435 uEm-2s-1)
Osmotic (100 mM mannitol)
Nitrogen deficiency (0 mM KNO3)
Salt (40 mM NaCl)
Cold-Dark
Cold-Light
Cold-Mannitol
Cold-Nitrogen deficiency
Cold-Salt
Heat-Dark
Heat-Mannitol
Heat-Nitrogen deficiency
Heat-Salt
Light-Salt
Mannitol-Dark
Mannitol-Light
Mannitol-Nitrogen deficiency
Nitrogen deficiency-Dark
Nitrogen deficiency-Light
Salt-Dark
Salt-Mannitol
Salt-Nitrogen deficiency
ZT2 (2 hours after light)
ZT6 (6 hours after light)
ZT10 (10 hours after light)
ZT14 (2 hours after dark)
ZT18 (6 hours after dark)
ZT22 (10 hours after dark)
4.96 5.08 6.29 8.72 6.74 5.26 6.84 4.78 5.78 5.37 7.06 8.03 7.09 9.56 8.29 10.19 8.21 7.13 9.08 6.33 5.73 8.41 8.31 8.52 5.72 6.52 2.88 5.01 5.65 5.01 5.17 5.14
Mp1g01090.1 (NEF1)
8.41 9.22 9.53 10.96 8.28 8.22 11.52 8.26 11.03 8.15 10.94 11.2 10.52 10.06 10.32 14.77 10.62 9.79 13.95 8.52 8.68 11.61 11.31 11.87 8.4 9.71 7.67 8.12 8.64 9.4 9.6 8.51
20.25 11.91 18.25 25.42 21.37 21.49 20.84 20.54 18.1 10.3 18.99 16.41 18.48 16.21 27.7 25.52 26.15 25.89 24.97 25.86 23.09 24.62 25.68 21.32 24.3 20.0 21.16 18.84 21.11 14.51 15.42 14.22
39.76 40.67 40.92 43.39 40.49 43.59 50.65 43.19 44.6 39.47 48.5 46.34 48.51 27.03 43.4 53.77 43.28 50.12 55.13 47.31 46.15 46.01 51.51 44.6 46.85 45.56 36.95 38.59 43.3 42.04 37.84 32.98
Mp1g05980.1 (MNS1)
13.02 12.99 13.85 18.3 15.94 14.85 22.65 14.93 15.43 13.25 15.61 20.83 17.53 14.69 17.21 23.31 16.96 19.18 21.39 16.69 14.21 17.57 19.8 18.06 14.41 15.81 11.64 13.08 13.98 13.98 12.19 10.37
Mp1g06110.1 (GPS1)
4.89 6.33 6.52 7.84 6.96 6.21 9.08 6.28 6.47 8.18 8.02 11.29 8.9 8.91 7.68 10.28 7.55 8.29 10.74 8.62 6.7 7.68 10.2 9.31 6.57 6.9 4.96 5.09 4.92 4.39 4.69 4.84
Mp1g10550.1 (LARP6a)
12.32 14.42 13.23 14.43 12.62 12.8 16.46 12.47 13.72 11.64 17.03 16.46 18.19 10.17 13.39 16.84 14.48 13.53 16.26 14.86 13.02 14.52 15.34 15.64 12.87 14.08 11.82 12.23 14.0 13.05 11.4 9.72
Mp1g13560.1 (XEG113)
4.79 4.85 6.8 9.18 4.6 5.78 7.58 5.78 5.5 4.63 6.17 5.88 6.37 6.51 9.08 13.48 9.29 8.1 9.12 7.01 6.15 8.86 7.77 7.16 7.37 7.12 4.92 5.56 6.36 5.74 5.39 3.56
Mp1g15870.1 (PDI7)
12.62 14.27 12.69 15.07 11.99 15.29 18.08 14.39 15.92 11.38 17.88 16.2 16.84 11.36 15.18 18.97 15.97 16.93 16.85 15.61 15.47 15.28 16.99 13.58 15.79 16.85 12.68 12.53 14.16 14.26 12.66 11.08
Mp1g17050.1 (PNET5)
16.21 15.61 18.33 20.06 16.75 17.62 22.31 16.03 18.77 13.43 18.98 18.08 17.99 13.97 19.87 28.42 20.63 18.44 25.06 18.68 18.03 20.19 20.75 21.47 17.38 18.87 15.46 16.06 16.17 16.42 15.52 13.67
15.73 15.05 16.45 21.16 17.31 16.18 20.32 15.26 15.51 13.77 15.49 17.65 16.8 15.68 20.3 26.36 19.52 18.94 20.19 17.44 17.64 20.32 21.27 18.74 16.42 18.53 12.82 12.67 14.26 16.74 18.85 15.6
Mp1g24280.1 (AQC1)
9.26 5.9 12.16 13.02 9.48 8.96 12.17 8.03 9.64 5.79 7.4 7.53 6.62 8.14 13.42 19.17 13.67 10.24 14.9 10.92 10.25 14.2 14.03 11.95 8.87 11.12 6.54 7.73 8.21 9.48 9.79 8.29
1.65 2.19 2.37 2.59 2.05 2.02 3.16 2.46 2.92 2.58 3.19 3.59 3.14 2.11 2.63 4.18 2.49 2.63 2.86 2.43 2.25 2.54 3.01 2.55 2.26 2.27 2.02 1.74 2.06 2.15 2.44 1.94
Mp1g28420.1 (TMN11)
8.18 9.65 11.95 15.95 10.8 10.49 14.9 12.57 12.11 4.87 7.32 20.35 8.29 12.34 13.83 21.04 15.6 25.83 18.14 14.36 9.86 15.17 15.5 15.64 10.45 10.37 7.72 6.77 8.28 7.74 9.68 7.16
Mp2g01200.1 (Cyclophilin)
49.18 43.35 42.76 61.98 60.63 53.12 62.06 51.67 54.83 42.89 58.38 51.15 57.09 51.08 60.93 66.34 63.03 64.73 57.16 67.05 60.46 53.95 72.11 59.88 59.83 61.85 45.73 47.15 50.4 49.94 48.07 42.38
9.15 10.55 10.22 14.22 9.77 9.72 12.02 9.32 9.22 9.64 9.64 13.19 9.52 10.03 13.2 14.93 13.13 10.5 14.06 9.34 9.3 13.34 12.67 10.0 9.24 10.68 8.92 9.67 10.55 8.64 8.98 7.87
4.61 3.93 4.89 7.71 4.27 4.94 5.74 4.49 2.76 3.36 6.18 7.02 5.67 5.6 7.16 7.25 7.8 6.24 8.27 5.49 4.49 7.57 7.21 5.15 4.48 5.26 4.06 5.28 5.44 3.63 3.98 3.45
Mp2g05870.1 (PIF5)
10.89 8.77 13.04 16.04 9.1 11.03 11.63 10.39 11.28 8.41 12.75 10.84 10.79 12.82 14.4 18.35 15.73 12.13 17.74 11.57 11.04 15.94 13.63 14.06 10.94 12.43 11.05 11.46 10.51 11.04 12.65 11.73
Mp2g07250.1 (HAP15)
11.95 13.5 9.97 12.76 13.07 12.82 16.85 12.33 10.07 11.5 14.5 15.72 13.63 14.78 12.27 16.38 12.18 14.37 13.17 14.21 12.55 11.56 14.74 12.6 12.88 13.59 11.39 10.89 11.96 11.18 10.05 8.5
16.41 20.13 20.97 17.98 20.96 17.09 21.89 16.46 20.99 19.82 23.16 32.35 22.08 31.61 19.4 22.83 17.97 30.15 32.54 22.65 17.58 26.7 25.04 31.23 18.12 18.19 15.88 16.9 17.36 15.74 16.37 14.15
Mp2g23810.1 (BLOS1)
50.78 42.46 66.67 67.04 47.75 57.29 79.51 57.76 63.94 44.17 55.93 64.88 55.55 58.05 89.68 111.39 84.45 80.42 74.48 69.61 60.29 71.98 75.4 74.97 66.72 65.33 40.55 42.7 48.65 71.74 73.54 64.48
11.83 10.16 11.67 13.27 12.05 12.39 14.64 12.61 12.48 10.47 11.66 12.83 11.48 13.97 13.53 17.01 13.44 13.68 15.92 12.88 13.12 13.1 15.57 14.69 12.17 13.75 10.95 10.46 12.06 11.88 10.55 8.82
Mp2g25780.1 (DECOY)
15.67 18.85 19.34 26.64 20.93 16.25 23.55 15.37 18.35 17.3 22.57 24.73 22.39 20.09 24.54 37.44 23.69 19.62 28.8 21.76 17.9 24.62 24.39 24.2 17.42 18.74 11.31 13.55 16.31 17.67 17.25 15.07
Mp2g26810.1 (LCB1)
9.29 7.33 9.98 11.03 9.98 9.67 11.56 9.16 8.94 7.18 8.88 9.03 8.46 11.32 9.07 12.78 10.43 10.09 9.83 9.56 9.01 10.19 12.01 10.44 9.69 9.94 7.93 9.07 9.5 9.88 8.28 6.82
11.4 11.8 11.54 16.2 12.61 13.17 16.12 12.95 13.72 14.35 15.51 16.97 17.24 12.92 14.4 18.2 15.44 16.71 16.61 14.82 13.69 15.33 17.61 14.99 15.03 15.26 9.11 10.95 12.56 11.35 10.61 8.54
Mp3g07630.1 (OHP2)
7.04 8.48 9.13 14.3 5.03 8.04 11.47 6.99 8.55 4.27 9.77 8.64 9.86 9.87 12.49 19.03 13.14 7.15 16.94 9.13 9.2 13.28 8.74 11.14 9.05 10.71 6.59 7.12 7.17 7.09 8.58 7.42
11.18 11.09 12.94 18.21 9.25 12.66 17.93 9.25 11.93 14.0 15.04 16.39 12.63 13.16 17.51 22.29 17.55 9.3 18.83 12.1 14.34 14.48 14.02 16.88 11.39 14.3 10.85 10.05 11.15 12.7 12.01 10.26
Mp3g16620.1 (Drg1-1)
19.11 18.91 18.56 22.59 21.0 20.5 23.44 20.15 23.44 16.43 21.94 22.59 22.77 18.08 22.32 29.02 23.58 24.52 21.45 23.45 21.87 21.03 25.43 20.32 21.42 22.97 19.9 21.24 22.25 19.02 18.67 15.38
Mp3g20860.1 (NERD1)
22.0 23.95 27.14 36.53 25.1 23.14 35.81 23.38 24.74 20.8 27.09 29.74 27.51 30.83 34.34 57.16 35.97 29.47 35.09 27.28 25.27 32.11 35.39 30.27 24.51 26.09 20.93 21.57 23.1 21.59 21.13 17.82
18.17 13.9 22.29 21.66 28.83 17.16 28.57 17.42 19.15 20.38 17.62 31.97 17.85 22.64 17.77 28.78 18.63 27.85 30.27 29.78 20.69 25.95 33.72 28.23 19.45 20.48 23.0 16.22 15.01 13.37 17.39 17.89
9.9 7.54 13.09 14.47 11.58 10.09 17.24 10.58 10.74 8.76 9.31 10.91 9.19 8.05 14.13 19.29 15.78 14.47 16.17 12.09 11.84 15.01 17.51 14.59 11.24 12.43 8.45 9.78 10.7 11.48 12.31 9.26
6.06 5.39 5.73 7.8 6.63 6.92 7.55 6.89 6.59 4.59 7.96 7.36 7.11 5.78 7.63 9.68 7.42 7.96 8.09 8.17 7.22 6.93 8.38 7.61 7.95 7.1 5.97 5.89 6.0 5.57 5.41 4.48
1.59 2.72 1.09 2.22 1.62 1.98 4.29 1.52 1.13 1.5 3.43 2.61 4.14 0.81 3.31 4.03 2.83 2.47 1.87 3.0 1.68 2.34 5.16 0.9 2.18 2.26 1.1 1.03 1.0 1.12 1.09 0.98
5.84 3.04 7.99 9.82 4.14 4.74 7.72 5.29 4.68 3.5 3.97 5.21 3.41 5.23 9.99 12.43 8.15 7.33 10.14 5.72 6.9 9.24 7.19 7.58 5.07 7.2 4.47 3.74 4.7 5.5 8.55 6.36
Mp4g21000.1 (PAT14)
24.23 25.52 31.06 41.46 24.68 26.49 38.11 26.25 35.22 30.16 30.14 35.64 30.32 27.09 41.19 61.44 42.06 31.89 44.31 32.05 28.98 36.46 35.03 35.58 30.46 31.43 18.74 22.34 23.33 22.86 21.61 19.86
Mp5g03740.1 (CMU2)
13.64 8.89 11.61 14.72 13.78 13.35 16.73 13.69 14.8 11.7 12.19 12.16 12.23 13.58 15.38 18.21 15.31 16.51 17.65 14.3 13.97 14.8 17.74 15.58 14.88 16.06 11.39 13.15 14.65 13.71 12.07 10.17
Mp5g04370.1 (IPK1)
2.29 2.33 3.56 4.51 2.84 2.74 4.9 2.9 3.14 2.37 2.98 3.49 3.01 3.69 4.2 5.48 4.55 4.25 4.16 4.1 3.21 3.78 5.35 4.15 3.2 3.92 2.06 2.01 2.45 2.81 3.26 2.8
57.44 48.69 69.65 76.97 47.38 54.36 65.86 47.11 63.47 39.88 58.94 82.08 57.01 52.39 81.7 100.42 74.0 49.01 84.79 52.65 50.76 79.99 53.51 70.97 52.05 55.75 34.87 43.32 52.19 61.0 67.38 61.7
Mp5g06050.1 (SUVR2)
1.1 1.67 1.85 2.82 0.93 1.32 2.35 1.23 1.23 0.63 1.99 2.79 1.54 2.36 3.04 4.84 3.1 1.24 4.2 1.29 1.4 2.52 1.85 2.73 1.28 1.2 1.25 1.24 1.25 1.14 1.17 1.19
35.92 37.52 41.59 49.27 33.42 41.51 51.28 38.8 39.98 38.56 47.89 45.35 46.8 41.06 47.49 66.96 47.05 43.79 54.89 41.88 39.27 44.75 44.05 51.39 40.42 39.7 30.09 31.89 35.77 43.95 45.36 40.68
15.0 16.79 11.43 21.36 17.55 17.77 19.92 14.21 17.65 20.93 20.54 21.43 19.94 17.05 23.9 27.64 23.99 22.36 17.02 18.17 17.95 17.46 25.26 18.44 18.76 21.36 10.57 12.66 15.43 15.49 15.04 11.59
Mp6g10180.1 (TIM50)
12.78 15.63 13.79 15.3 17.64 14.54 20.0 12.81 13.73 12.76 17.63 16.65 18.67 11.55 16.12 23.92 16.67 16.48 16.05 16.81 15.46 16.26 19.02 13.02 15.55 15.56 12.21 12.1 13.62 11.26 9.66 8.29
Mp6g11050.1 (UNE5)
44.05 58.78 43.79 55.86 53.65 51.57 68.11 49.95 38.46 44.93 62.86 66.97 65.14 52.78 55.49 69.03 54.36 62.79 59.42 62.72 53.26 50.97 70.07 55.72 57.6 54.9 39.8 43.71 49.84 47.18 37.86 30.45
16.68 13.65 17.81 26.21 17.33 14.41 19.97 14.13 17.02 13.45 18.88 18.97 17.09 13.03 31.72 35.76 27.95 23.12 23.3 19.8 17.09 24.89 19.56 27.23 18.2 19.33 10.84 11.36 14.92 18.28 20.38 15.18
Mp6g12560.1 (EBS3)
5.27 4.18 5.83 6.77 4.81 5.89 7.04 5.73 3.83 3.03 5.12 6.37 4.8 4.33 6.29 7.73 6.35 7.24 7.3 6.62 6.11 6.71 6.89 6.06 5.83 6.99 4.58 5.09 5.13 4.66 4.8 3.86
5.9 7.22 6.27 8.76 3.22 6.7 10.23 6.08 7.07 3.47 9.32 11.58 8.92 4.31 9.79 14.12 8.24 5.62 12.64 6.48 8.32 10.31 8.61 9.84 7.36 7.57 4.65 4.9 6.2 7.12 8.67 7.09
Mp6g14230.1 (FOU2)
3.94 4.03 2.95 5.13 5.12 4.51 5.35 4.6 4.39 3.34 5.4 4.22 5.78 4.91 5.49 5.92 5.48 5.98 4.16 5.89 4.88 4.04 6.15 3.71 5.09 5.17 3.98 3.89 3.93 3.78 3.93 3.65
Mp7g00850.1 (PSE1)
12.4 9.69 13.89 14.87 11.34 12.11 17.99 10.33 7.85 10.09 12.28 13.82 13.67 12.49 16.86 30.05 15.29 16.65 18.57 14.33 12.94 17.53 21.32 19.67 14.08 15.51 8.72 9.57 10.73 10.1 11.25 10.91
Mp7g03520.1 (AVA-P2)
7.97 12.79 9.43 9.33 12.44 9.19 14.13 9.36 11.3 10.56 14.48 14.91 15.35 5.37 9.81 11.79 9.43 10.78 11.53 10.6 9.28 10.05 11.5 11.09 9.3 9.41 8.19 8.22 8.34 9.14 9.25 7.73
Mp7g05650.1 (PSL4)
15.56 12.48 15.83 21.14 15.24 18.21 19.61 17.12 14.87 12.0 18.93 17.33 18.83 12.58 20.45 25.91 21.07 21.22 22.26 19.2 19.84 20.34 21.36 19.61 19.48 21.27 13.53 15.18 16.81 14.45 13.91 10.79
35.48 35.18 33.3 36.01 43.59 34.4 41.58 31.52 44.44 36.25 39.86 48.26 43.48 42.3 35.0 42.74 35.47 47.43 51.3 45.51 35.63 40.63 52.53 52.47 31.09 35.96 38.02 34.72 32.31 33.43 35.65 37.27
14.56 13.39 14.48 16.57 15.79 16.46 19.24 15.5 17.22 15.41 16.86 16.44 15.62 10.24 15.79 21.05 16.8 17.27 16.27 17.0 15.33 15.24 20.04 13.74 16.39 17.14 13.29 13.23 14.52 13.02 11.64 9.74
1.22 0.3 3.69 4.74 2.99 1.53 4.54 1.71 5.08 1.24 0.53 2.55 1.05 2.91 5.96 8.88 5.23 7.15 5.98 3.36 1.54 3.94 6.13 2.97 2.15 2.17 1.06 1.3 1.07 0.8 1.37 1.39
14.1 13.47 15.75 16.38 17.87 14.11 17.88 14.47 16.81 16.65 16.42 21.32 15.7 15.01 16.49 23.87 17.42 19.43 21.69 18.15 13.81 19.43 21.56 21.13 15.09 15.86 14.0 14.8 14.67 13.74 14.29 13.02
Mp8g00830.1 (PIN6)
3.91 6.02 3.8 5.89 7.85 5.46 11.92 4.89 4.22 6.29 8.02 17.05 6.43 11.3 7.07 8.28 5.63 8.46 12.87 11.73 6.36 10.8 10.94 9.63 5.71 7.27 2.65 2.58 3.48 3.35 3.39 2.92
0.26 0.04 0.98 3.38 0.64 0.0 0.74 0.13 0.06 0.18 0.12 0.46 0.09 1.7 1.94 4.21 2.33 0.15 1.83 0.14 0.5 2.11 1.72 2.99 0.11 0.68 0.1 0.19 0.3 0.19 0.43 0.07
30.9 26.99 40.25 46.84 31.58 32.54 39.64 31.39 34.65 28.25 34.03 36.52 33.24 38.14 45.82 61.26 47.78 36.62 44.46 34.64 33.6 45.68 42.21 45.78 33.79 34.88 24.69 26.42 30.28 32.51 31.82 27.11
Mp8g08570.1 (EFOP2)
4.49 3.65 3.41 5.02 3.38 4.7 7.66 4.24 3.45 3.02 6.28 5.36 5.62 4.85 4.04 6.33 4.08 4.54 4.62 4.13 4.82 5.1 5.72 3.72 4.69 5.38 3.85 4.37 4.7 4.29 2.75 2.23
Mp8g10130.1 (ISTL8)
25.34 19.07 19.93 30.0 30.59 25.09 27.38 23.77 27.22 23.0 25.69 26.79 25.02 23.12 30.67 33.25 33.06 31.09 25.63 29.06 26.07 27.27 36.63 27.42 25.86 31.65 16.82 24.01 24.48 25.49 23.44 23.07
3.24 8.52 2.75 5.58 15.23 6.15 21.68 9.03 0.93 4.94 17.52 10.91 35.74 0.81 19.62 17.38 18.33 20.1 1.71 35.9 9.18 4.76 39.18 1.39 9.58 13.96 4.98 3.74 3.32 3.47 3.54 2.16
1.56 1.36 3.66 2.11 2.41 1.83 4.23 5.72 1.48 4.24 1.56 10.73 2.32 2.11 3.0 13.62 3.3 12.59 8.46 5.28 1.87 8.72 8.93 4.6 3.21 3.89 0.7 0.43 0.56 0.49 1.18 1.73
Mp8g14410.1 (KEA5)
15.31 16.38 18.17 21.7 15.31 15.05 19.88 14.37 15.57 14.46 21.04 24.71 20.01 13.32 18.36 26.26 19.34 18.1 20.88 16.81 16.47 17.59 22.18 18.24 15.09 18.91 12.11 12.93 13.43 16.25 17.63 17.43
7.84 8.57 8.58 9.47 5.83 8.04 11.48 7.21 6.47 7.2 9.92 14.94 9.46 6.82 9.34 11.15 9.8 7.84 12.4 8.06 8.4 10.72 9.92 9.92 8.22 9.99 6.51 6.63 6.89 7.48 8.77 7.34
MpVg00250.1 (ATSRL1)
13.91 9.77 11.49 16.89 13.57 14.33 13.03 13.19 15.91 9.38 14.27 11.2 11.73 9.63 17.39 17.13 17.51 16.78 17.27 16.0 14.3 14.61 17.26 17.33 15.58 15.42 13.76 13.92 14.03 11.34 11.82 9.97

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)