Heatmap: Cluster_29 (Marchantia polymorpha (Mpo) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Control
Cold (3°C)
Dark (3 days)
Heat (33°C)
Light (435 uEm-2s-1)
Osmotic (100 mM mannitol)
Nitrogen deficiency (0 mM KNO3)
Salt (40 mM NaCl)
Cold-Dark
Cold-Light
Cold-Mannitol
Cold-Nitrogen deficiency
Cold-Salt
Heat-Dark
Heat-Mannitol
Heat-Nitrogen deficiency
Heat-Salt
Light-Salt
Mannitol-Dark
Mannitol-Light
Mannitol-Nitrogen deficiency
Nitrogen deficiency-Dark
Nitrogen deficiency-Light
Salt-Dark
Salt-Mannitol
Salt-Nitrogen deficiency
ZT2 (2 hours after light)
ZT6 (6 hours after light)
ZT10 (10 hours after light)
ZT14 (2 hours after dark)
ZT18 (6 hours after dark)
ZT22 (10 hours after dark)
0.23 0.13 0.09 0.25 0.67 0.2 0.18 0.32 0.1 0.22 0.14 0.25 0.18 0.07 0.25 0.29 0.45 1.0 0.15 0.53 0.16 0.14 0.66 0.12 0.19 0.2 0.17 0.09 0.07 0.07 0.18 0.36
0.3 0.04 0.09 0.34 0.46 0.32 0.16 0.29 0.04 0.06 0.06 0.1 0.07 0.29 0.33 0.18 0.49 1.0 0.33 0.53 0.17 0.17 0.22 0.32 0.29 0.21 0.32 0.22 0.22 0.09 0.1 0.06
Mp1g16250.1 (CYCB2;2)
0.36 0.17 0.24 0.8 0.5 0.53 0.36 0.67 0.12 0.13 0.42 0.22 0.51 0.63 0.9 0.76 1.0 0.88 0.27 0.66 0.53 0.26 0.66 0.38 0.66 0.62 0.4 0.25 0.41 0.32 0.24 0.39
0.06 0.02 0.06 0.37 0.22 0.1 0.35 0.19 0.02 0.14 0.08 0.17 0.19 0.01 0.5 0.51 0.67 1.0 0.12 0.62 0.14 0.12 0.53 0.1 0.28 0.07 0.36 0.08 0.05 0.14 0.11 0.06
Mp1g26770.1 (DAP1)
0.77 0.73 0.62 0.94 0.63 0.76 0.73 0.78 0.81 0.54 0.77 0.67 0.79 0.59 0.81 0.79 0.84 1.0 0.7 0.71 0.67 0.66 0.81 0.67 0.71 0.74 0.7 0.78 0.84 0.81 0.78 0.72
0.23 0.17 0.09 0.47 0.19 0.33 0.22 0.25 0.17 0.08 0.29 0.13 0.52 0.22 0.59 0.31 0.71 1.0 0.11 0.73 0.28 0.09 0.43 0.03 0.42 0.29 0.31 0.14 0.26 0.18 0.26 0.11
0.68 0.58 0.5 0.92 0.76 0.57 0.72 0.64 0.62 0.48 0.54 0.65 0.5 0.82 0.82 0.94 0.91 1.0 0.55 0.6 0.56 0.56 0.93 0.48 0.53 0.65 0.54 0.69 0.72 0.52 0.57 0.5
0.6 0.58 0.46 0.93 0.41 0.59 0.71 0.62 0.49 0.4 0.63 0.66 0.6 0.53 0.81 0.96 0.87 1.0 0.62 0.62 0.66 0.63 0.77 0.56 0.64 0.74 0.53 0.62 0.64 0.65 0.66 0.59
Mp2g08570.1 (RNS3)
0.35 0.26 0.15 0.48 0.18 0.33 0.3 0.37 0.18 0.28 0.18 0.25 0.19 0.23 0.31 0.5 0.31 1.0 0.12 0.31 0.2 0.15 0.3 0.12 0.29 0.23 0.32 0.22 0.16 0.11 0.14 0.23
Mp2g17260.1 (RBL4)
0.43 0.44 0.38 0.54 0.36 0.44 1.0 0.72 0.96 0.25 0.3 0.55 0.38 0.51 0.53 0.83 0.66 0.9 0.1 0.32 0.42 0.3 0.62 0.17 0.58 0.73 0.51 0.43 0.38 0.54 0.51 0.41
0.38 0.35 0.3 0.44 0.3 0.35 0.85 0.56 1.0 0.22 0.25 0.5 0.37 0.44 0.45 0.7 0.58 0.79 0.19 0.26 0.43 0.37 0.61 0.22 0.52 0.61 0.37 0.43 0.37 0.44 0.42 0.33
Mp2g17280.1 (CARK6)
0.56 0.33 0.31 0.57 0.39 0.49 0.8 0.7 0.74 0.21 0.31 0.41 0.36 0.45 0.54 0.77 0.72 1.0 0.23 0.31 0.49 0.4 0.74 0.26 0.52 0.71 0.67 0.73 0.63 0.54 0.57 0.48
0.81 0.66 0.7 0.72 0.35 0.73 0.81 0.8 0.61 0.35 0.7 0.66 0.62 0.24 0.83 0.83 0.84 1.0 0.58 0.61 0.61 0.68 0.67 0.4 0.7 0.81 0.71 0.71 0.71 0.67 0.6 0.54
Mp2g23460.1 (JOX4)
0.3 0.06 0.12 0.49 0.67 0.25 0.2 0.19 0.13 0.12 0.05 0.05 0.07 0.13 0.4 0.3 0.65 1.0 0.2 0.78 0.18 0.17 0.41 0.17 0.19 0.17 0.18 0.3 0.28 0.09 0.1 0.07
Mp2g23560.1 (PA200)
0.48 0.32 0.5 0.54 0.47 0.45 0.61 0.51 0.47 0.37 0.4 0.54 0.37 0.39 0.53 0.6 0.54 1.0 0.73 0.57 0.45 0.65 0.7 0.6 0.48 0.57 0.42 0.49 0.5 0.42 0.47 0.45
Mp2g26160.1 (SIMP1)
0.32 0.06 0.51 0.4 0.38 0.35 0.43 0.54 0.19 0.19 0.07 0.21 0.06 0.34 0.35 0.45 0.39 1.0 0.5 0.37 0.29 0.5 0.52 0.46 0.33 0.36 0.2 0.32 0.27 0.22 0.23 0.18
Mp3g01900.1 (CHIL)
0.02 0.0 0.0 0.04 0.19 0.0 0.04 0.18 0.0 0.0 0.06 0.04 0.05 0.0 0.11 0.11 0.5 1.0 0.0 0.24 0.1 0.0 0.3 0.0 0.09 0.09 0.17 0.03 0.0 0.06 0.0 0.02
Mp3g01910.1 (CHIL)
0.02 0.0 0.0 0.04 0.19 0.0 0.04 0.18 0.0 0.0 0.06 0.04 0.05 0.0 0.11 0.11 0.5 1.0 0.0 0.24 0.1 0.0 0.3 0.0 0.09 0.09 0.17 0.03 0.0 0.06 0.0 0.02
0.18 0.05 0.21 0.56 0.06 0.2 0.37 0.41 0.05 0.06 0.06 0.12 0.07 0.04 0.39 0.46 0.62 1.0 0.09 0.07 0.17 0.14 0.38 0.09 0.16 0.32 0.27 0.3 0.26 0.27 0.15 0.12
0.08 0.09 0.07 0.34 0.1 0.15 0.08 0.31 0.12 0.03 0.05 0.05 0.1 0.05 0.16 0.34 0.34 1.0 0.12 0.1 0.23 0.08 0.2 0.21 0.12 0.09 0.13 0.12 0.02 0.05 0.06 0.05
0.22 0.11 0.12 0.53 0.37 0.39 0.14 0.53 0.05 0.11 0.11 0.12 0.14 0.21 1.0 0.5 0.91 0.99 0.33 0.65 0.3 0.18 0.58 0.47 0.49 0.29 0.36 0.13 0.13 0.2 0.24 0.31
0.63 0.45 0.41 0.9 0.45 0.66 0.77 0.65 0.35 0.34 0.75 0.7 0.55 0.57 0.81 1.0 0.88 0.71 0.61 0.67 0.74 0.59 0.77 0.5 0.77 0.8 0.55 0.6 0.74 0.76 0.72 0.6
Mp3g13630.1 (MEE47)
0.48 0.36 0.37 0.64 0.4 0.53 0.7 0.69 0.25 0.49 0.54 0.46 0.51 0.56 0.81 1.0 0.91 0.82 0.83 0.55 0.64 0.65 0.72 0.65 0.88 0.64 0.61 0.58 0.53 0.61 0.68 0.53
0.43 0.17 0.52 0.5 0.48 0.3 0.48 0.49 0.33 0.24 0.17 0.22 0.2 0.48 0.36 0.56 0.46 1.0 0.48 0.38 0.3 0.61 0.67 0.45 0.3 0.41 0.27 0.39 0.41 0.4 0.39 0.34
Mp3g20190.1 (BRD13)
0.37 0.3 0.16 0.74 0.49 0.54 0.59 0.53 0.16 0.32 0.64 0.29 0.46 0.11 0.88 1.0 0.92 0.58 0.28 0.75 0.5 0.25 0.67 0.12 0.75 0.65 0.37 0.41 0.23 0.27 0.5 0.5
0.45 0.11 0.14 0.86 0.46 0.44 0.28 0.33 0.06 0.2 0.21 0.23 0.15 0.31 1.0 0.44 0.81 0.75 0.58 0.6 0.5 0.31 0.52 0.23 0.46 0.42 0.33 0.39 0.32 0.47 0.34 0.25
Mp4g01420.1 (IWS2)
0.54 0.29 0.42 0.65 0.5 0.48 0.65 0.69 0.46 0.37 0.35 0.26 0.32 0.22 0.55 0.65 0.72 0.85 0.4 0.47 0.48 0.56 1.0 0.29 0.5 0.77 0.58 0.7 0.68 0.65 0.6 0.54
Mp4g08800.1 (AFB2)
0.27 0.12 0.23 0.34 0.62 0.26 0.34 0.38 0.21 0.42 0.16 0.29 0.24 0.29 0.32 0.53 0.33 1.0 0.34 0.51 0.22 0.37 0.54 0.41 0.23 0.25 0.18 0.2 0.22 0.26 0.3 0.29
0.68 0.47 0.52 0.82 0.72 0.61 0.78 0.66 0.62 0.56 0.49 0.66 0.63 0.76 0.89 1.0 0.87 0.97 0.51 0.67 0.63 0.53 0.74 0.53 0.6 0.67 0.48 0.72 0.69 0.69 0.55 0.47
0.06 0.12 0.0 0.48 0.63 0.17 0.07 0.3 0.0 0.06 0.08 0.02 0.04 0.0 0.23 0.28 0.69 1.0 0.0 0.38 0.07 0.0 0.24 0.0 0.04 0.08 0.08 0.07 0.05 0.02 0.07 0.05
Mp4g10530.1 (RLP23)
0.31 0.36 0.12 0.29 0.3 0.46 0.76 0.93 1.0 0.49 0.31 0.61 0.33 0.06 0.37 0.8 0.51 0.89 0.09 0.15 0.24 0.11 0.57 0.11 0.19 0.27 0.26 0.13 0.15 0.21 0.26 0.19
Mp4g10830.1 (RBCS3B)
0.21 0.02 0.01 0.43 0.51 0.21 0.11 0.22 0.03 0.01 0.02 0.02 0.02 0.0 0.87 0.22 1.0 0.93 0.02 0.69 0.25 0.02 0.62 0.04 0.3 0.21 0.26 0.09 0.04 0.09 0.27 0.47
0.74 0.27 0.35 0.69 0.75 0.48 0.63 0.62 0.55 0.38 0.43 0.32 0.33 0.19 0.78 0.77 1.0 0.9 0.45 0.58 0.45 0.72 0.89 0.35 0.5 0.85 0.51 0.69 0.79 0.7 0.61 0.56
Mp4g23180.1 (FUT6)
0.41 0.32 0.34 0.59 0.32 0.67 0.78 0.69 0.25 0.32 0.49 0.52 0.52 0.25 0.92 0.82 1.0 0.81 0.65 0.43 0.54 0.5 0.73 0.6 0.74 0.71 0.34 0.48 0.47 0.49 0.46 0.45
0.5 0.3 0.4 0.61 0.29 0.51 0.64 0.69 0.11 0.25 0.38 0.42 0.35 0.4 0.77 1.0 0.73 0.97 0.51 0.48 0.51 0.41 0.7 0.36 0.56 0.56 0.34 0.32 0.39 0.46 0.59 0.47
Mp5g10810.1 (PPR4)
0.28 0.15 0.11 0.9 0.28 0.16 0.19 0.26 0.23 0.06 0.18 0.07 0.31 0.24 0.99 0.58 1.0 0.93 0.31 0.53 0.31 0.37 0.35 0.26 0.46 0.26 0.19 0.08 0.12 0.1 0.05 0.11
Mp5g13630.1 (TPD1)
0.24 0.37 0.04 0.53 0.67 0.21 0.23 0.46 0.07 0.14 0.36 0.2 0.43 0.01 0.71 0.32 1.0 0.99 0.12 0.59 0.27 0.03 0.47 0.08 0.2 0.25 0.33 0.38 0.15 0.18 0.37 0.36
Mp6g02180.1 (EMB2423)
0.2 0.16 0.31 0.35 0.45 0.19 0.38 0.33 0.37 0.3 0.14 0.58 0.15 0.38 0.28 0.61 0.33 1.0 0.54 0.36 0.25 0.59 0.73 0.37 0.22 0.4 0.14 0.22 0.19 0.14 0.27 0.22
Mp6g02270.1 (EMB3120)
0.33 0.12 0.56 0.48 0.52 0.3 0.45 0.48 0.34 0.24 0.12 0.4 0.12 0.58 0.41 0.58 0.41 1.0 0.87 0.44 0.29 0.8 0.76 0.49 0.3 0.44 0.21 0.28 0.29 0.27 0.46 0.39
Mp6g02280.1 (AtBBE24)
0.24 0.16 0.44 0.38 0.42 0.18 0.35 0.3 0.3 0.28 0.12 0.49 0.11 0.56 0.36 0.46 0.31 1.0 0.62 0.35 0.2 0.59 0.64 0.31 0.23 0.4 0.11 0.21 0.25 0.19 0.28 0.31
0.22 0.2 0.17 0.46 0.68 0.28 0.26 0.32 0.24 0.37 0.27 0.24 0.3 0.35 0.42 0.62 0.43 1.0 0.34 0.49 0.28 0.27 0.67 0.21 0.32 0.3 0.24 0.16 0.15 0.13 0.14 0.19
0.4 0.39 0.19 0.37 0.26 0.51 1.0 0.66 0.85 0.37 0.39 0.9 0.5 0.05 0.44 0.88 0.47 0.79 0.19 0.48 0.48 0.22 0.74 0.15 0.61 0.58 0.53 0.27 0.16 0.27 0.56 0.52
Mp6g17540.1 (PERK6)
0.21 0.04 0.1 0.29 0.23 0.3 0.22 0.54 0.02 0.14 0.1 0.13 0.09 0.17 0.43 0.41 0.45 1.0 0.12 0.27 0.33 0.19 0.46 0.14 0.33 0.39 0.2 0.26 0.28 0.24 0.19 0.16
Mp6g17550.1 (ZED1)
0.09 0.03 0.01 0.29 0.22 0.17 0.1 0.25 0.01 0.07 0.06 0.06 0.06 0.06 0.41 0.48 0.45 1.0 0.03 0.25 0.15 0.05 0.27 0.03 0.2 0.14 0.08 0.1 0.12 0.09 0.13 0.09
Mp6g19370.1 (HscB)
0.05 0.02 0.23 0.68 0.23 0.04 0.0 0.12 0.04 0.0 0.0 0.02 0.04 0.02 1.0 0.47 0.53 0.43 0.34 0.51 0.2 0.08 0.48 0.22 0.11 0.09 0.04 0.02 0.02 0.03 0.14 0.1
Mp7g10420.1 (BRG1)
0.39 0.19 0.28 0.88 0.52 0.49 0.31 0.5 0.06 0.09 0.16 0.12 0.33 0.33 1.0 0.69 0.74 0.75 0.58 0.81 0.51 0.28 0.54 0.42 0.5 0.4 0.21 0.24 0.17 0.29 0.34 0.3
Mp7g16580.1 (PUB56)
0.55 0.38 0.37 0.99 0.76 0.46 0.54 0.49 0.36 0.48 0.34 0.44 0.48 0.54 0.59 0.95 0.74 1.0 0.48 0.71 0.38 0.35 0.71 0.42 0.34 0.48 0.56 0.66 0.41 0.32 0.22 0.35
0.43 0.46 0.17 0.86 0.28 0.5 0.56 0.5 0.17 0.5 0.62 0.56 0.46 0.05 0.91 0.97 0.87 1.0 0.28 0.67 0.59 0.43 0.67 0.15 0.61 0.72 0.25 0.34 0.36 0.37 0.45 0.46
Mp8g14180.1 (ATBCAT-5)
0.37 0.13 0.24 0.59 0.37 0.23 0.34 0.44 0.16 0.1 0.08 0.1 0.11 0.28 0.34 0.65 0.56 1.0 0.17 0.2 0.21 0.4 0.48 0.26 0.17 0.3 0.29 0.41 0.41 0.27 0.22 0.21
Mp8g15680.1 (NRT1.5)
0.53 0.32 0.49 0.84 0.34 0.7 0.84 0.77 0.27 0.31 0.42 0.54 0.41 0.68 0.99 0.99 0.98 1.0 0.54 0.55 0.8 0.55 0.86 0.47 0.76 0.76 0.55 0.52 0.48 0.51 0.65 0.67
0.52 0.27 0.37 1.0 0.36 0.39 0.47 0.66 0.62 0.2 0.17 0.18 0.21 0.38 0.58 0.68 0.92 0.98 0.28 0.22 0.34 0.52 0.52 0.34 0.34 0.56 0.27 0.44 0.57 0.37 0.37 0.22
0.25 0.17 0.1 0.65 0.46 0.05 0.05 0.18 0.21 0.12 0.2 0.06 0.14 0.14 0.4 0.45 1.0 0.73 0.04 0.5 0.21 0.14 0.43 0.1 0.37 0.3 0.25 0.26 0.34 0.2 0.23 0.2

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)