Heatmap: Cluster_75 (Marchantia polymorpha (Mpo) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Control
Cold (3°C)
Dark (3 days)
Heat (33°C)
Light (435 uEm-2s-1)
Osmotic (100 mM mannitol)
Nitrogen deficiency (0 mM KNO3)
Salt (40 mM NaCl)
Cold-Dark
Cold-Light
Cold-Mannitol
Cold-Nitrogen deficiency
Cold-Salt
Heat-Dark
Heat-Mannitol
Heat-Nitrogen deficiency
Heat-Salt
Light-Salt
Mannitol-Dark
Mannitol-Light
Mannitol-Nitrogen deficiency
Nitrogen deficiency-Dark
Nitrogen deficiency-Light
Salt-Dark
Salt-Mannitol
Salt-Nitrogen deficiency
ZT2 (2 hours after light)
ZT6 (6 hours after light)
ZT10 (10 hours after light)
ZT14 (2 hours after dark)
ZT18 (6 hours after dark)
ZT22 (10 hours after dark)
Mp1g02630.1 (TOP3A)
0.28 0.45 0.31 0.55 0.29 0.24 0.32 0.26 0.48 0.46 0.38 0.51 0.43 1.0 0.47 0.8 0.51 0.29 0.41 0.3 0.25 0.41 0.43 0.36 0.25 0.3 0.33 0.31 0.26 0.21 0.23 0.23
0.25 0.21 0.19 0.55 0.28 0.31 0.42 0.25 0.13 0.7 0.25 0.28 0.24 1.0 0.55 0.71 0.61 0.28 0.29 0.38 0.32 0.2 0.51 0.28 0.3 0.37 0.26 0.19 0.14 0.15 0.18 0.19
0.45 0.14 0.33 0.64 0.55 0.34 0.83 0.37 0.77 0.76 0.15 0.47 0.16 0.88 0.5 1.0 0.61 0.58 0.42 0.44 0.41 0.41 0.89 0.39 0.31 0.52 0.37 0.44 0.37 0.38 0.43 0.43
Mp1g08740.1 (PPOX)
0.58 0.41 0.52 0.8 0.55 0.48 0.7 0.48 0.58 0.79 0.4 0.73 0.43 1.0 0.63 0.96 0.74 0.7 0.59 0.64 0.55 0.65 0.78 0.62 0.5 0.61 0.37 0.51 0.55 0.66 0.55 0.47
0.1 0.23 0.02 0.21 0.15 0.05 0.12 0.06 0.07 0.43 0.17 0.27 0.18 1.0 0.06 0.18 0.06 0.22 0.03 0.09 0.07 0.05 0.09 0.01 0.05 0.07 0.05 0.03 0.03 0.05 0.07 0.09
0.1 0.23 0.02 0.21 0.15 0.05 0.12 0.06 0.07 0.43 0.17 0.27 0.18 1.0 0.06 0.18 0.06 0.22 0.03 0.09 0.07 0.05 0.09 0.01 0.05 0.07 0.05 0.03 0.03 0.05 0.07 0.09
0.32 0.22 0.37 0.59 0.59 0.32 0.54 0.3 0.24 0.55 0.25 0.45 0.25 1.0 0.45 0.72 0.52 0.47 0.58 0.47 0.35 0.51 0.73 0.57 0.32 0.4 0.27 0.28 0.27 0.31 0.35 0.39
0.11 0.17 0.15 0.61 0.07 0.03 0.15 0.04 0.07 0.83 0.03 0.14 0.1 1.0 0.22 0.64 0.46 0.04 0.05 0.05 0.03 0.07 0.13 0.03 0.02 0.04 0.04 0.06 0.09 0.32 0.17 0.15
Mp1g18650.1 (LOH3)
0.13 0.07 0.12 0.3 0.33 0.07 0.56 0.08 0.08 0.46 0.02 0.35 0.04 1.0 0.17 0.67 0.21 0.16 0.21 0.13 0.16 0.22 0.47 0.26 0.08 0.24 0.02 0.03 0.05 0.2 0.27 0.23
0.06 0.11 0.03 0.5 0.04 0.03 0.11 0.03 0.36 0.27 0.14 0.14 0.11 0.91 0.46 1.0 0.69 0.03 0.08 0.09 0.07 0.09 0.16 0.06 0.04 0.03 0.03 0.01 0.0 0.01 0.02 0.0
Mp1g28670.1 (ARPC3)
0.46 0.46 0.35 0.7 0.44 0.47 0.61 0.44 0.5 0.5 0.54 0.57 0.52 1.0 0.65 0.95 0.63 0.52 0.36 0.49 0.48 0.39 0.6 0.39 0.51 0.55 0.45 0.38 0.42 0.4 0.27 0.22
Mp1g29560.1 (XBAT35)
0.39 0.54 0.4 0.56 0.4 0.29 0.63 0.34 0.36 0.63 0.5 0.59 0.59 0.99 0.5 1.0 0.54 0.43 0.47 0.39 0.31 0.42 0.59 0.45 0.29 0.42 0.33 0.35 0.3 0.29 0.29 0.34
0.02 0.0 0.0 0.01 0.03 0.04 0.17 0.04 0.03 0.17 0.03 0.68 0.0 1.0 0.02 0.13 0.01 0.21 0.02 0.02 0.02 0.06 0.05 0.01 0.02 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
0.03 0.01 0.02 0.01 0.03 0.01 0.37 0.0 0.02 0.18 0.04 0.37 0.02 1.0 0.01 0.08 0.01 0.0 0.03 0.03 0.09 0.09 0.04 0.01 0.01 0.1 0.01 0.04 0.01 0.01 0.02 0.04
0.03 0.01 0.02 0.01 0.03 0.01 0.37 0.0 0.02 0.18 0.04 0.37 0.02 1.0 0.01 0.08 0.01 0.0 0.03 0.03 0.09 0.09 0.04 0.01 0.01 0.1 0.01 0.04 0.01 0.01 0.02 0.04
Mp2g01780.1 (SWEETIE)
0.03 0.0 0.0 0.05 0.06 0.0 0.65 0.0 0.05 0.38 0.04 0.28 0.02 1.0 0.01 0.1 0.0 0.02 0.06 0.03 0.06 0.12 0.02 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04
0.03 0.01 0.02 0.01 0.03 0.01 0.37 0.0 0.02 0.18 0.04 0.37 0.02 1.0 0.01 0.08 0.01 0.0 0.03 0.03 0.09 0.09 0.04 0.01 0.01 0.1 0.01 0.04 0.01 0.01 0.02 0.04
0.03 0.02 0.03 0.04 0.07 0.06 0.3 0.07 0.04 0.15 0.06 0.83 0.02 1.0 0.05 0.21 0.03 0.31 0.02 0.05 0.07 0.15 0.08 0.02 0.03 0.08 0.02 0.01 0.01 0.01 0.02 0.04
0.01 0.07 0.0 0.33 0.04 0.01 0.05 0.0 0.07 0.81 0.04 0.18 0.03 1.0 0.29 0.95 0.38 0.11 0.01 0.06 0.04 0.0 0.14 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.01 0.01 0.0 0.05
Mp2g14380.1 (NACA3)
0.36 0.32 0.36 0.45 0.54 0.31 0.51 0.27 0.34 0.6 0.32 0.53 0.41 1.0 0.32 0.57 0.4 0.48 0.4 0.44 0.35 0.44 0.71 0.43 0.27 0.44 0.3 0.37 0.38 0.22 0.24 0.27
Mp2g17410.1 (MAPKKK15)
0.03 0.07 0.03 0.22 0.18 0.05 0.08 0.06 0.02 0.74 0.09 0.04 0.17 1.0 0.25 0.45 0.27 0.11 0.18 0.17 0.05 0.07 0.16 0.1 0.07 0.03 0.05 0.02 0.03 0.05 0.05 0.11
Mp2g18490.1 (SOS6)
0.58 0.38 0.42 0.69 0.57 0.45 0.77 0.44 0.86 0.81 0.46 0.5 0.41 1.0 0.61 1.0 0.71 0.63 0.6 0.45 0.55 0.57 0.81 0.55 0.43 0.66 0.49 0.52 0.54 0.53 0.45 0.41
Mp2g21050.1 (CBF5)
0.17 0.05 0.07 0.14 0.07 0.03 0.1 0.06 0.22 0.53 0.04 0.18 0.05 1.0 0.08 0.43 0.06 0.07 0.04 0.05 0.04 0.11 0.16 0.05 0.04 0.07 0.05 0.02 0.03 0.08 0.07 0.03
Mp3g00960.1 (UVH1)
0.31 0.29 0.23 0.69 0.32 0.25 0.36 0.25 0.43 0.54 0.25 0.43 0.25 0.96 0.51 1.0 0.58 0.39 0.3 0.32 0.3 0.36 0.51 0.25 0.23 0.38 0.3 0.3 0.31 0.24 0.28 0.25
0.65 0.46 0.48 0.82 0.72 0.5 0.71 0.54 0.5 0.91 0.55 0.58 0.54 1.0 0.63 0.91 0.73 0.67 0.64 0.52 0.53 0.56 0.77 0.58 0.49 0.65 0.55 0.62 0.59 0.56 0.51 0.51
Mp3g15410.1 (URM11)
0.56 0.43 0.4 0.77 0.63 0.41 0.74 0.37 0.67 0.77 0.36 0.6 0.45 1.0 0.7 0.97 0.75 0.52 0.5 0.52 0.54 0.52 0.84 0.59 0.44 0.6 0.31 0.34 0.42 0.44 0.39 0.37
Mp3g15570.1 (ATL30)
0.18 0.35 0.12 0.32 0.23 0.17 0.57 0.17 0.12 0.52 0.19 0.81 0.28 1.0 0.38 0.72 0.39 0.23 0.11 0.23 0.29 0.27 0.36 0.2 0.25 0.29 0.13 0.13 0.24 0.15 0.12 0.06
0.07 0.12 0.12 0.35 0.08 0.05 0.07 0.05 0.35 0.15 0.19 0.21 0.15 1.0 0.28 0.6 0.29 0.08 0.42 0.09 0.05 0.15 0.11 0.21 0.09 0.06 0.03 0.03 0.05 0.08 0.04 0.05
Mp3g17450.1 (CLCF)
0.02 0.16 0.01 0.48 0.08 0.02 0.21 0.03 0.03 0.65 0.05 0.28 0.08 0.68 0.15 1.0 0.21 0.11 0.01 0.06 0.03 0.02 0.11 0.01 0.01 0.03 0.01 0.03 0.01 0.01 0.0 0.0
0.33 0.27 0.25 0.5 0.41 0.2 0.28 0.22 0.28 0.85 0.23 0.52 0.23 1.0 0.37 0.72 0.41 0.37 0.35 0.32 0.23 0.32 0.52 0.34 0.19 0.26 0.25 0.19 0.17 0.12 0.19 0.24
Mp4g14500.1 (FBN1b)
0.27 0.49 0.43 0.43 0.58 0.26 0.51 0.27 0.52 0.53 0.44 0.79 0.55 1.0 0.29 0.54 0.38 0.54 0.39 0.36 0.3 0.64 0.66 0.48 0.26 0.39 0.55 0.41 0.22 0.07 0.08 0.15
Mp4g16280.1 (EHD1)
0.45 0.47 0.4 0.68 0.64 0.55 0.57 0.54 0.37 0.75 0.53 0.52 0.57 1.0 0.68 0.92 0.68 0.66 0.5 0.68 0.52 0.45 0.73 0.48 0.63 0.56 0.38 0.4 0.44 0.43 0.36 0.31
0.07 0.05 0.03 0.16 0.12 0.02 0.35 0.1 0.06 0.15 0.06 0.4 0.04 1.0 0.19 0.75 0.14 0.13 0.13 0.07 0.12 0.04 0.31 0.15 0.04 0.19 0.05 0.03 0.02 0.02 0.04 0.05
0.33 0.28 0.4 0.57 0.7 0.36 0.66 0.32 0.34 0.77 0.39 0.59 0.42 1.0 0.47 0.74 0.54 0.52 0.52 0.61 0.42 0.51 0.82 0.49 0.36 0.47 0.34 0.24 0.22 0.23 0.28 0.31
Mp4g24010.1 (OZS3)
0.47 0.46 0.37 0.67 0.61 0.45 0.47 0.41 0.52 0.71 0.53 0.51 0.52 1.0 0.62 0.73 0.68 0.58 0.52 0.55 0.43 0.45 0.7 0.42 0.44 0.5 0.47 0.36 0.32 0.31 0.44 0.52
Mp5g07380.1 (AHL4)
0.34 0.5 0.35 0.71 0.56 0.37 0.62 0.36 0.26 0.84 0.25 0.56 0.41 1.0 0.55 0.86 0.56 0.55 0.41 0.52 0.34 0.4 0.68 0.33 0.32 0.42 0.26 0.3 0.24 0.2 0.25 0.26
Mp5g07390.1 (GAMMA CA3)
0.22 0.4 0.22 0.6 0.54 0.19 0.47 0.21 0.23 0.99 0.3 0.89 0.49 1.0 0.43 0.95 0.5 0.44 0.39 0.56 0.26 0.41 0.67 0.32 0.27 0.33 0.15 0.16 0.12 0.12 0.13 0.13
Mp5g11150.1 (ATRBP45C)
0.03 0.07 0.03 0.29 0.03 0.07 0.16 0.06 0.02 0.24 0.13 0.06 0.13 0.73 0.23 1.0 0.31 0.1 0.02 0.07 0.03 0.01 0.12 0.02 0.07 0.04 0.03 0.03 0.03 0.01 0.03 0.03
0.25 0.11 0.25 0.64 0.39 0.21 0.52 0.2 0.17 0.54 0.15 0.33 0.15 0.75 0.35 1.0 0.47 0.33 0.27 0.37 0.28 0.37 0.61 0.28 0.24 0.39 0.11 0.18 0.22 0.2 0.17 0.17
Mp5g15230.1 (WSS1B)
0.3 0.45 0.25 0.75 0.32 0.27 0.52 0.24 0.33 0.61 0.27 0.6 0.34 1.0 0.52 1.0 0.62 0.34 0.35 0.3 0.3 0.3 0.47 0.29 0.24 0.34 0.27 0.31 0.27 0.22 0.18 0.19
Mp5g16010.1 (GAUT3)
0.14 0.18 0.04 0.28 0.07 0.1 0.21 0.07 0.15 0.33 0.1 1.0 0.09 0.6 0.24 0.59 0.29 0.16 0.09 0.08 0.15 0.08 0.21 0.04 0.1 0.23 0.12 0.16 0.15 0.08 0.07 0.11
0.18 0.56 0.03 0.16 0.08 0.15 0.11 0.23 0.04 0.37 0.21 0.44 0.2 1.0 0.07 0.2 0.09 0.31 0.11 0.08 0.07 0.05 0.1 0.07 0.1 0.11 0.19 0.15 0.12 0.08 0.14 0.18
Mp5g19030.1 (PRMA)
0.31 0.35 0.27 0.48 0.47 0.26 0.56 0.27 0.33 0.65 0.23 0.68 0.27 1.0 0.39 0.73 0.43 0.44 0.38 0.4 0.27 0.31 0.45 0.3 0.23 0.31 0.13 0.18 0.23 0.27 0.25 0.22
0.43 0.4 0.34 0.6 0.46 0.45 0.76 0.43 0.46 0.57 0.57 0.72 0.55 0.98 0.51 1.0 0.55 0.61 0.42 0.49 0.47 0.46 0.66 0.39 0.49 0.57 0.34 0.4 0.4 0.34 0.25 0.22
0.08 0.12 0.08 0.63 0.22 0.07 0.14 0.07 0.02 1.0 0.1 0.24 0.12 0.9 0.29 0.83 0.38 0.17 0.17 0.18 0.08 0.13 0.27 0.15 0.08 0.1 0.1 0.08 0.06 0.04 0.05 0.07
0.23 0.35 0.15 0.48 0.22 0.25 0.3 0.2 0.18 0.44 0.33 0.52 0.43 1.0 0.52 0.7 0.51 0.31 0.32 0.27 0.25 0.25 0.42 0.23 0.27 0.34 0.18 0.18 0.2 0.25 0.25 0.2
Mp6g07170.1 (PAT2)
0.55 0.44 0.44 0.73 0.58 0.49 0.77 0.49 0.56 0.65 0.47 0.51 0.48 0.79 0.66 1.0 0.71 0.58 0.62 0.56 0.52 0.54 0.74 0.46 0.47 0.63 0.46 0.51 0.57 0.53 0.46 0.41
0.51 0.39 0.38 0.61 0.53 0.46 0.69 0.51 0.62 0.58 0.5 0.87 0.44 1.0 0.7 0.81 0.7 0.61 0.51 0.55 0.49 0.59 0.71 0.47 0.5 0.53 0.44 0.42 0.42 0.53 0.54 0.56
0.72 0.5 0.67 0.81 0.71 0.66 0.89 0.61 0.84 0.84 0.65 0.68 0.6 0.9 0.65 1.0 0.74 0.71 0.84 0.67 0.7 0.75 0.85 0.77 0.59 0.78 0.68 0.65 0.68 0.62 0.63 0.64
Mp6g18010.1 (CORD3)
0.34 0.13 0.26 1.0 0.71 0.32 0.55 0.27 0.24 0.91 0.2 0.44 0.24 0.95 0.48 0.82 0.59 0.52 0.24 0.57 0.41 0.29 0.76 0.25 0.33 0.45 0.16 0.3 0.3 0.27 0.17 0.17
Mp7g02280.1 (RAF11)
0.22 0.14 0.2 0.49 0.52 0.19 0.34 0.18 0.12 0.8 0.19 0.31 0.3 1.0 0.36 0.79 0.37 0.32 0.37 0.45 0.22 0.28 0.52 0.35 0.2 0.23 0.15 0.2 0.22 0.25 0.21 0.18
0.06 0.08 0.03 0.03 0.03 0.02 0.13 0.03 0.16 0.2 0.04 0.3 0.03 1.0 0.02 0.1 0.01 0.22 0.08 0.03 0.04 0.05 0.04 0.04 0.02 0.06 0.06 0.03 0.01 0.01 0.05 0.08
0.05 0.06 0.1 0.43 0.01 0.03 0.1 0.18 0.05 0.09 0.03 0.05 0.09 0.89 0.34 1.0 0.34 0.13 0.17 0.07 0.02 0.09 0.05 0.14 0.0 0.08 0.03 0.0 0.03 0.07 0.09 0.0
Mp8g06470.1 (APO1)
0.27 0.36 0.17 0.65 0.37 0.26 0.24 0.25 0.31 0.7 0.41 0.37 0.43 1.0 0.66 0.9 0.68 0.38 0.35 0.38 0.28 0.21 0.46 0.29 0.27 0.29 0.28 0.3 0.29 0.43 0.47 0.5
Mp8g08450.1 (ETL1)
0.55 0.61 0.53 0.57 0.67 0.56 0.63 0.62 0.62 0.64 0.74 0.77 0.73 1.0 0.5 0.63 0.5 0.76 0.64 0.76 0.51 0.54 0.8 0.54 0.59 0.6 0.61 0.66 0.57 0.36 0.38 0.39
0.1 0.16 0.02 0.31 0.04 0.08 0.25 0.02 0.23 0.22 0.18 0.34 0.12 1.0 0.45 0.55 0.4 0.06 0.1 0.12 0.14 0.08 0.21 0.12 0.14 0.1 0.06 0.04 0.06 0.07 0.19 0.09
Mp8g12140.1 (PDCD5)
0.27 0.15 0.27 0.38 0.29 0.23 0.52 0.22 0.35 0.59 0.25 0.58 0.27 1.0 0.29 0.62 0.32 0.32 0.28 0.3 0.3 0.38 0.49 0.32 0.24 0.34 0.18 0.19 0.16 0.15 0.14 0.2
0.23 0.35 0.21 0.68 0.29 0.27 0.43 0.27 0.31 0.56 0.33 0.45 0.4 1.0 0.61 0.97 0.65 0.35 0.32 0.36 0.29 0.27 0.38 0.24 0.29 0.29 0.21 0.24 0.24 0.22 0.21 0.17
Mp8g15590.1 (HIT1)
0.05 0.03 0.06 0.47 0.08 0.05 0.29 0.07 0.04 0.16 0.04 0.16 0.03 1.0 0.55 0.97 0.61 0.15 0.05 0.08 0.1 0.05 0.23 0.08 0.01 0.2 0.03 0.06 0.0 0.0 0.06 0.12

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)