Heatmap: Cluster_36 (Marchantia polymorpha (Mpo) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Control
Cold (3°C)
Dark (3 days)
Heat (33°C)
Light (435 uEm-2s-1)
Osmotic (100 mM mannitol)
Nitrogen deficiency (0 mM KNO3)
Salt (40 mM NaCl)
Cold-Dark
Cold-Light
Cold-Mannitol
Cold-Nitrogen deficiency
Cold-Salt
Heat-Dark
Heat-Mannitol
Heat-Nitrogen deficiency
Heat-Salt
Light-Salt
Mannitol-Dark
Mannitol-Light
Mannitol-Nitrogen deficiency
Nitrogen deficiency-Dark
Nitrogen deficiency-Light
Salt-Dark
Salt-Mannitol
Salt-Nitrogen deficiency
ZT2 (2 hours after light)
ZT6 (6 hours after light)
ZT10 (10 hours after light)
ZT14 (2 hours after dark)
ZT18 (6 hours after dark)
ZT22 (10 hours after dark)
Mp1g01920.1 (MPK18)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.04 0.01 0.03 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp1g26340.1 (RGLG4)
0.03 0.1 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.05 0.38 0.05 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.04 0.08 0.02 0.07 0.02 0.06 0.11 0.02 0.0 0.03 0.03 0.05 0.03
0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
0.06 0.09 0.18 0.03 0.17 0.04 0.2 0.04 0.2 1.53 0.0 0.79 0.22 0.0 0.05 0.12 0.0 0.06 0.0 0.06 0.08 0.49 0.76 0.0 0.06 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.37
Mp2g12090.1 (PXC2)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp2g18860.1 (APSE)
0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.04 0.01 0.0 0.0 0.03 0.04 0.08 0.01 0.0 0.03 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp2g22960.1 (APC10)
0.14 0.14 0.0 0.06 0.0 0.08 0.24 0.08 0.0 0.58 0.25 0.65 0.1 0.04 0.03 0.13 0.0 0.04 0.07 0.96 0.46 0.0 0.03 0.0 0.1 0.1 0.07 0.0 0.05 0.17 0.45 0.0
0.03 0.04 0.0 0.02 0.0 0.0 0.06 0.0 0.05 0.11 0.05 0.05 0.02 0.0 0.0 0.11 0.0 0.02 0.02 0.0 0.06 0.0 0.05 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp3g05630.1 (EngD-1)
0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.03 0.03 0.02 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp3g11010.1 (mTERF11)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp3g21020.1 (PDE327)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.05 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.49 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp3g23030.1 (At17.1)
0.11 0.0 0.0 0.24 0.0 0.31 0.26 0.0 0.6 2.21 0.18 1.44 0.37 0.29 0.24 1.64 0.25 0.18 0.0 0.16 0.08 0.27 0.72 0.2 0.16 0.33 0.0 0.09 0.0 0.35 0.3 0.38
0.02 0.04 0.04 0.19 0.0 0.03 0.04 0.0 0.06 0.44 0.09 0.34 0.08 0.03 0.12 0.24 0.05 0.0 0.08 0.1 0.05 0.09 0.11 0.06 0.02 0.13 0.0 0.05 0.03 0.07 0.14 0.07
Mp4g09610.1 (PDR2)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp4g10970.1 (DPBF2)
0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.43 0.36 0.6 0.28 0.0 0.0 0.27 0.17 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp4g14520.1 (BEE2)
0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
Mp4g18780.1 (NISP)
0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp4g21630.1 (RPS4)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.0 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp4g22560.1 (AtBBE18)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.32 0.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.09 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0
Mp5g08030.1 (HRQ1)
0.02 0.0 0.0 0.04 0.05 0.0 0.04 0.08 0.0 0.23 0.0 0.24 0.1 0.05 0.02 0.13 0.05 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.09 0.06 0.0 0.03 0.14 0.0 0.0
0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.04 0.04 0.0 0.03 0.11 0.04 0.06 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.02 0.01 0.0 0.01 0.0 0.02 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp5g20510.1 (VAC1)
0.02 0.05 0.03 0.09 0.0 0.0 0.05 0.02 0.02 0.19 0.08 0.04 0.06 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.02 0.02 0.11 0.07 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.02 0.02 0.0 0.07
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp6g08370.1 (XBAT35)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp6g08520.1 (OXI1)
0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.4 0.0 0.2 0.05 0.0 0.01 0.11 0.05 0.01 0.0 0.05 0.01 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp6g17840.1 (WRKY42)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp6g18050.1 (SRF5)
0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.77 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp6g21050.1 (GLP6)
0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.13 0.03 0.0 0.0 0.0 0.83 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.0 0.38 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp7g11610.1 (LARP1a)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp7g18180.1 (VTL5)
0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.0 0.16 0.03 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp8g04350.1 (CuAOgamma2)
0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp8g05100.1 (ZRK7)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp8g09450.1 (GSQ5)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
Mp8g13130.1 (TOE1)
0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp8g14100.1 (NET1B)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp8g14460.1 (UPL1)
0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.43 0.0 0.42 0.0 0.22 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.36 0.0 0.0 0.0 0.75 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.18 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
MpVg00360.1 (UGP2)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)