Heatmap: Cluster_13 (Marchantia polymorpha (Mpo) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Control
Cold (3°C)
Dark (3 days)
Heat (33°C)
Light (435 uEm-2s-1)
Osmotic (100 mM mannitol)
Nitrogen deficiency (0 mM KNO3)
Salt (40 mM NaCl)
Cold-Dark
Cold-Light
Cold-Mannitol
Cold-Nitrogen deficiency
Cold-Salt
Heat-Dark
Heat-Mannitol
Heat-Nitrogen deficiency
Heat-Salt
Light-Salt
Mannitol-Dark
Mannitol-Light
Mannitol-Nitrogen deficiency
Nitrogen deficiency-Dark
Nitrogen deficiency-Light
Salt-Dark
Salt-Mannitol
Salt-Nitrogen deficiency
ZT2 (2 hours after light)
ZT6 (6 hours after light)
ZT10 (10 hours after light)
ZT14 (2 hours after dark)
ZT18 (6 hours after dark)
ZT22 (10 hours after dark)
Mp1g02870.1 (GET4)
0.31 0.6 0.92 0.61 0.33 0.25 0.0 0.23 2.52 0.4 0.34 0.96 0.61 0.84 0.32 0.23 0.37 0.34 0.57 0.25 0.18 1.67 0.67 0.51 0.0 0.03 0.0 0.07 0.1 0.04 0.21 0.21
Mp1g04200.1 (TIP2)
472.75 218.93 1185.5 520.22 535.81 335.01 102.7 386.16 476.31 443.46 211.02 77.53 196.78 758.88 304.51 237.88 398.64 247.38 1016.31 614.83 261.84 1045.16 204.74 1145.63 429.34 221.52 267.12 461.25 533.58 748.88 490.45 395.61
Mp1g10050.1 (SQD2)
0.97 0.37 2.89 1.32 0.4 0.54 0.65 0.37 4.84 0.58 0.89 0.92 0.2 0.91 1.33 2.03 1.54 0.53 1.71 0.77 0.92 2.96 1.03 1.91 0.59 0.6 0.38 0.46 0.55 1.19 0.66 1.02
158.43 95.82 601.83 95.48 188.76 81.44 109.07 96.96 152.08 149.3 67.66 52.38 53.57 228.59 83.2 125.98 113.56 130.05 488.11 78.91 67.6 568.97 128.14 586.65 64.93 84.33 80.09 84.19 162.42 407.69 238.5 130.66
Mp1g17210.1 (PGA37)
0.8 0.77 2.58 0.87 0.67 0.46 0.56 0.48 0.97 0.54 0.59 0.43 0.5 1.02 0.65 0.79 0.79 0.46 2.79 0.6 0.61 3.51 0.84 2.15 0.5 0.64 0.64 0.57 0.73 0.67 0.67 0.79
0.37 0.13 2.92 0.43 1.11 0.33 0.76 0.34 0.89 0.2 0.26 0.16 0.27 1.36 0.52 1.36 0.65 1.19 3.78 1.27 0.37 4.76 1.53 2.93 0.4 0.32 0.42 0.29 0.25 0.16 0.27 0.29
Mp1g25840.1 (PUB23)
2.58 1.02 26.55 1.36 7.58 2.75 8.14 3.51 2.68 3.17 1.65 0.95 1.85 14.65 1.47 1.68 1.21 3.02 16.49 4.16 3.64 26.04 6.9 17.35 3.6 1.97 1.8 1.12 0.9 6.31 8.08 7.92
0.83 0.95 2.17 0.26 0.6 0.55 1.5 0.95 1.59 0.76 0.88 2.56 1.01 0.99 0.5 0.8 0.36 2.14 1.62 1.11 0.68 5.13 1.48 1.54 1.12 1.5 0.71 0.57 0.72 0.98 1.38 1.38
1.87 1.41 4.64 1.02 0.75 0.32 0.38 0.23 2.46 0.52 0.14 0.18 0.1 0.76 0.27 0.54 0.41 0.41 3.58 0.25 0.17 9.27 0.53 2.8 0.1 0.19 1.55 1.21 1.43 1.84 5.17 5.78
Mp1g29680.1 (RHD6)
0.14 0.16 2.43 0.44 0.3 0.24 0.22 0.17 1.57 0.97 0.19 0.25 0.2 0.44 1.12 0.9 0.78 0.26 1.16 0.53 0.43 3.5 0.34 0.64 0.76 0.23 0.3 0.29 0.14 0.18 0.22 0.44
Mp2g00090.1 (GALT1)
21.57 9.57 48.89 19.92 48.25 14.89 28.06 16.91 37.5 13.21 9.27 10.06 7.46 54.36 16.46 25.38 20.63 23.26 49.84 15.5 16.2 94.13 37.46 60.05 11.67 16.78 13.39 14.43 14.11 18.17 18.89 15.27
1.58 3.15 6.65 1.06 0.34 1.2 0.6 1.25 4.27 4.03 2.7 2.59 2.51 2.97 0.77 1.47 1.24 0.35 3.78 0.84 0.88 6.55 0.67 2.54 0.83 0.78 1.35 1.09 1.38 2.16 2.21 1.72
8.08 7.81 16.49 13.53 6.53 8.09 9.52 8.66 9.54 5.65 7.17 7.33 7.75 4.14 7.88 11.58 8.14 13.72 30.09 11.11 8.16 42.18 19.8 29.85 7.96 6.94 7.65 4.86 5.49 7.97 9.94 10.72
0.51 0.17 2.35 0.65 0.07 0.23 0.74 0.17 0.45 0.3 0.27 0.06 0.11 0.22 0.37 0.58 0.2 0.16 1.71 0.29 0.3 3.05 0.15 0.65 0.34 0.15 0.16 0.69 0.91 0.48 0.72 0.81
Mp2g19980.1 (BG_PPAP)
0.31 0.14 1.33 0.27 0.16 0.15 0.12 0.15 0.23 0.21 0.1 0.14 0.02 0.2 0.18 0.22 0.13 0.17 1.1 0.21 0.13 1.14 0.11 0.64 0.25 0.16 0.2 0.36 0.42 0.29 0.61 0.78
0.06 0.03 0.36 0.13 0.01 0.15 0.1 0.15 0.13 0.12 0.13 0.06 0.16 0.27 0.14 0.19 0.05 0.39 0.55 0.14 0.16 0.95 0.01 0.17 0.12 0.07 0.06 0.08 0.1 0.07 0.1 0.17
0.07 0.17 0.37 0.17 0.08 0.1 0.04 0.02 0.36 0.1 0.07 0.15 0.11 0.15 0.05 0.08 0.12 0.07 0.14 0.07 0.06 0.31 0.18 0.16 0.01 0.03 0.04 0.07 0.08 0.04 0.06 0.05
Mp2g26750.1 (GET4)
0.31 0.6 0.92 0.61 0.33 0.25 0.0 0.23 2.52 0.4 0.34 0.96 0.61 0.84 0.32 0.23 0.37 0.34 0.57 0.25 0.18 1.67 0.67 0.51 0.0 0.03 0.0 0.07 0.1 0.04 0.21 0.21
0.4 0.46 0.95 0.54 0.49 0.28 1.19 0.25 0.62 1.75 0.75 0.97 0.73 1.22 0.4 0.83 0.45 0.59 1.21 0.59 0.4 3.7 1.72 1.05 0.65 0.68 0.25 0.35 0.31 0.37 0.49 0.47
Mp3g06560.1 (EXT21)
5.39 3.68 87.41 4.29 3.15 4.07 5.06 8.88 53.51 3.98 1.65 2.19 3.98 6.83 4.72 6.8 6.29 7.66 7.0 2.01 5.24 77.85 3.87 3.66 3.83 5.57 7.5 4.97 3.78 8.44 15.78 8.89
0.46 0.32 1.95 0.6 1.11 0.26 0.78 0.22 0.9 0.27 0.34 1.27 0.35 1.12 0.56 0.72 0.42 0.38 1.86 1.98 0.35 5.29 1.22 1.64 0.25 0.31 0.21 0.14 0.19 0.14 0.3 0.48
Mp3g14610.1 (PERK14)
1.83 0.75 12.42 0.18 0.31 0.77 1.02 1.63 8.38 0.71 0.44 0.34 0.59 3.4 0.49 0.8 0.24 3.31 9.29 0.57 0.6 19.69 1.16 12.05 0.45 0.76 1.04 1.65 1.81 2.16 3.49 3.67
Mp3g15290.1 (SULTR4;1)
1.71 3.06 4.58 0.81 1.86 1.05 1.36 0.76 6.68 1.73 1.84 1.53 1.05 2.32 1.62 0.78 1.18 0.88 5.11 2.93 0.66 9.68 1.38 2.69 1.08 0.93 1.14 1.57 1.28 0.63 1.63 2.09
49.63 0.71 300.4 34.34 91.05 12.56 32.78 15.65 53.16 29.87 0.74 0.87 0.47 164.9 4.46 8.96 11.35 15.73 211.93 34.8 25.99 292.65 42.63 247.44 4.12 25.76 4.23 50.35 49.8 49.42 56.9 41.68
85.8 24.06 634.64 38.39 57.95 58.14 118.27 39.48 119.3 68.04 29.15 43.3 23.41 334.16 26.55 72.17 24.15 23.08 374.12 44.15 72.55 553.46 83.3 481.17 68.15 70.42 29.64 57.55 74.92 172.37 120.79 99.57
Mp3g17140.1 (MES12)
0.02 0.0 0.21 0.0 0.0 0.14 0.05 0.34 0.07 0.0 0.03 0.0 0.0 0.1 0.0 0.14 0.0 0.03 0.53 0.0 0.05 0.56 0.0 0.13 0.0 0.0 0.04 0.0 0.04 0.11 0.0 0.13
Mp3g25410.1 (FIB2)
0.05 0.09 0.25 0.13 0.05 0.05 0.02 0.03 0.27 0.1 0.02 0.1 0.1 0.19 0.09 0.13 0.1 0.1 0.15 0.04 0.04 0.33 0.21 0.11 0.02 0.04 0.02 0.02 0.06 0.02 0.05 0.04
Mp4g00720.1 (SYN2)
0.0 0.38 6.62 0.94 0.29 0.29 0.82 0.14 1.45 0.0 0.52 0.71 0.68 0.43 0.34 1.81 0.12 0.38 3.95 0.49 0.35 15.61 0.78 4.27 1.73 0.13 0.0 0.11 0.13 0.49 0.0 0.0
Mp4g01260.1 (NCED5)
7.96 1.09 30.96 6.99 9.14 5.47 14.02 2.44 29.42 1.47 1.53 3.2 1.06 14.11 2.31 6.37 2.09 3.12 37.15 8.99 7.4 73.35 16.45 34.43 3.03 6.97 1.85 3.31 3.13 2.45 3.22 2.79
Mp4g05040.1 (APT1)
4.07 4.25 18.06 13.61 4.92 1.45 2.26 1.65 9.1 3.27 2.95 4.22 2.46 10.94 6.64 9.1 9.26 2.4 22.92 3.08 1.96 40.47 5.08 19.54 1.69 2.13 3.25 5.08 3.29 4.01 8.51 8.95
Mp4g06290.1 (LON2)
1.7 1.55 3.22 2.6 1.55 2.09 2.52 1.59 1.72 1.47 2.22 2.32 1.82 10.38 2.01 2.18 1.91 1.33 5.87 2.31 2.92 9.18 2.35 6.09 2.54 3.28 1.45 1.5 2.32 1.66 1.92 1.22
Mp4g09380.1 (IPT6)
0.46 0.11 1.48 0.28 0.16 0.28 0.6 0.35 0.39 0.09 0.17 0.14 0.1 0.44 0.56 0.3 0.27 0.37 1.05 0.16 0.29 3.65 0.41 1.65 0.35 0.43 0.3 0.22 0.36 0.5 0.67 0.55
Mp4g09390.1 (CINV2)
8.69 1.68 96.13 0.3 5.62 7.34 12.36 4.6 27.87 26.08 0.95 6.4 0.45 7.8 0.29 2.73 0.7 2.07 69.2 2.75 6.06 220.27 23.83 75.13 6.63 2.49 3.15 2.62 3.3 16.89 29.22 33.08
Mp4g10790.1 (TOC75-IV)
0.41 0.25 3.93 0.61 0.13 0.19 0.14 0.21 4.52 0.4 0.07 0.06 0.06 0.23 0.37 1.34 0.47 0.11 1.67 0.09 0.24 4.33 0.39 2.25 0.16 0.33 0.1 0.16 0.19 0.2 0.03 0.11
Mp4g18720.1 (DGK6)
0.03 0.01 0.29 0.01 0.02 0.0 0.05 0.03 0.15 0.02 0.01 0.0 0.02 0.06 0.02 0.08 0.04 0.01 0.06 0.02 0.01 0.59 0.0 0.35 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.06 0.14 0.26
Mp4g19050.1 (BRXL2)
0.13 0.06 0.39 0.41 0.11 0.07 0.27 0.1 0.19 0.04 0.09 0.09 0.09 0.15 0.31 0.43 0.3 0.12 2.08 0.1 0.09 2.49 0.04 1.21 0.24 0.12 0.11 0.12 0.21 0.26 0.15 0.14
Mp4g19380.1 (ZIP9)
0.84 0.09 10.12 1.41 0.47 0.77 0.39 0.43 3.15 0.74 0.27 0.14 0.23 3.65 0.85 0.68 1.08 0.69 8.67 0.47 0.43 10.63 0.38 6.85 0.48 0.38 0.5 0.45 1.04 0.94 1.14 1.21
11.68 2.45 29.93 7.24 13.64 12.55 14.36 8.21 12.26 4.38 3.37 3.58 2.12 21.73 6.43 8.99 7.26 8.46 27.31 8.68 10.52 39.25 22.65 34.3 8.81 10.25 14.09 13.99 10.83 11.95 21.21 21.39
Mp4g22370.1 (CDC48B)
4.03 0.54 18.48 2.48 4.54 2.84 7.05 1.69 2.91 2.65 0.25 1.9 0.16 14.89 1.36 2.45 2.22 1.78 19.59 2.31 2.3 28.16 4.9 20.78 1.9 2.22 2.7 3.32 5.62 7.37 5.62 5.96
0.03 0.01 0.19 0.02 0.02 0.01 0.04 0.03 0.26 0.01 0.01 0.06 0.02 0.04 0.03 0.03 0.07 0.07 0.07 0.01 0.03 0.16 0.07 0.1 0.02 0.02 0.0 0.01 0.02 0.04 0.01 0.0
0.05 0.05 0.33 0.01 0.04 0.14 0.08 0.22 0.16 0.04 0.1 0.1 0.06 0.12 0.03 0.02 0.0 0.33 0.12 0.14 0.11 0.63 0.06 0.01 0.09 0.05 0.11 0.16 0.14 0.09 0.12 0.18
4.12 2.21 27.92 5.3 7.05 1.9 1.39 3.13 8.31 13.05 1.76 2.5 1.53 9.71 8.26 5.59 6.06 3.82 42.93 6.4 3.03 58.16 5.21 34.84 3.64 3.06 2.21 2.28 3.38 7.92 22.89 22.97
Mp5g09460.1 (SIAR1)
0.22 0.02 0.91 0.11 0.16 0.09 0.2 0.25 0.29 0.1 0.04 0.03 0.08 0.28 0.04 0.14 0.05 0.07 0.27 0.09 0.16 1.97 0.21 0.3 0.14 0.12 0.18 0.17 0.2 0.37 0.29 0.37
0.3 0.63 1.47 0.49 0.49 0.27 0.1 0.07 2.23 0.65 0.4 0.84 0.68 1.24 0.15 0.26 0.21 0.23 0.5 0.15 0.18 1.53 0.92 0.56 0.06 0.23 0.13 0.15 0.13 0.13 0.14 0.25
Mp5g09950.1 (SAR1)
5.84 3.12 8.31 10.75 4.9 7.21 5.5 4.66 7.89 3.58 2.2 4.76 4.26 9.89 15.49 10.94 14.9 9.47 16.06 5.77 5.42 36.33 8.86 16.01 3.79 12.32 7.2 6.57 5.19 3.68 6.88 9.27
Mp5g12230.1 (FAB1B)
0.61 0.3 1.87 0.39 0.24 0.21 0.69 0.25 0.67 1.54 0.17 0.55 0.24 0.51 0.2 0.71 0.29 0.25 1.19 0.14 0.26 2.78 0.43 0.97 0.15 0.2 0.25 0.45 0.5 1.42 1.46 1.4
Mp5g14550.1 (APD1)
0.03 0.03 0.35 0.02 0.03 0.0 0.03 0.0 0.16 0.09 0.0 0.05 0.0 0.28 0.09 0.09 0.02 0.07 0.47 0.0 0.0 0.49 0.07 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03
Mp5g20810.1 (AVA-P3)
606.46 511.54 1067.83 488.54 512.03 656.91 615.34 574.25 621.4 711.8 607.99 527.35 615.69 992.63 427.81 439.52 429.37 548.31 974.9 596.54 600.06 1004.34 516.95 1034.17 666.33 586.17 472.03 511.87 561.11 748.24 719.1 710.65
Mp6g03740.1 (CXIP4)
0.07 0.02 0.51 0.09 0.03 0.03 0.11 0.05 0.03 0.0 0.02 0.01 0.02 0.23 0.03 0.07 0.05 0.06 0.59 0.02 0.02 1.87 0.06 0.7 0.07 0.06 0.15 0.26 0.18 0.22 0.27 0.32
Mp6g05900.1 (ABCG21)
0.84 0.21 5.75 0.32 0.28 0.33 0.29 0.33 1.02 0.46 0.46 0.33 0.24 4.54 0.25 0.15 0.2 0.34 3.67 0.41 0.37 3.87 0.36 5.65 0.46 0.38 0.25 0.39 0.66 1.56 1.28 0.89
0.9 0.29 9.04 1.26 0.29 0.35 0.47 0.5 3.09 1.13 0.26 0.65 0.17 4.37 0.37 0.38 0.94 0.19 4.96 0.36 0.47 8.81 0.35 4.85 0.21 0.5 0.14 0.31 0.69 1.71 1.18 0.94
Mp6g13220.1 (HAC4)
0.5 0.83 13.26 1.37 0.24 0.38 0.3 0.05 6.58 0.33 0.25 0.29 0.13 28.13 0.38 0.87 0.69 0.04 22.5 0.28 0.29 33.18 0.34 14.99 0.08 0.33 1.08 0.46 0.55 0.27 0.74 1.0
0.13 0.17 2.3 0.4 0.87 0.0 0.0 0.27 2.19 0.6 0.18 0.23 0.18 0.88 0.23 0.22 0.14 0.27 0.89 0.06 0.25 2.99 0.27 0.76 0.16 0.11 0.03 0.06 0.2 0.42 0.11 0.08
0.19 0.11 20.84 0.27 0.15 0.89 0.25 0.16 15.84 0.75 0.95 0.03 0.18 1.8 1.73 0.08 0.15 0.32 2.16 2.15 0.79 18.05 0.11 1.09 0.95 0.1 0.1 0.13 0.05 0.03 0.12 0.01
Mp6g20430.1 (AtBBE23)
10.68 1.17 50.74 5.34 18.33 10.83 29.37 13.42 1.21 1.45 0.95 1.5 1.35 12.93 11.67 26.83 10.85 9.47 88.46 8.98 7.82 165.44 41.07 88.85 10.52 6.33 8.95 8.35 6.05 27.69 49.84 47.23
Mp6g21450.1 (NAP8)
17.72 14.01 67.92 12.46 22.94 12.76 13.97 14.59 26.77 11.82 14.27 9.06 14.89 37.56 10.39 10.6 11.39 13.43 66.3 14.2 13.07 72.91 18.67 61.07 11.41 15.21 23.09 22.0 17.55 16.92 18.93 20.0
0.75 0.2 8.87 0.69 0.33 0.73 1.0 0.6 6.81 0.86 0.31 0.21 0.2 2.14 0.64 0.57 0.74 0.57 5.46 0.47 0.94 10.63 0.51 5.46 0.95 1.01 0.44 0.88 0.99 1.12 0.66 0.37
Mp7g00750.1 (HAP5)
1.28 0.0 17.94 2.64 2.91 3.42 1.95 2.9 2.62 0.21 0.0 0.42 0.0 7.99 0.45 1.62 1.54 9.31 9.98 7.43 3.74 37.67 7.98 9.49 7.51 1.78 0.4 0.8 1.23 2.24 3.9 2.08
64.17 34.89 96.56 117.97 47.27 33.68 48.93 47.08 125.63 30.87 20.57 28.48 33.69 82.2 76.93 79.82 106.03 57.97 132.88 47.12 36.25 217.52 82.43 164.87 40.39 46.26 68.45 92.67 83.76 53.93 77.28 74.37
150.6 35.57 227.52 91.44 109.01 102.74 168.33 103.07 131.88 36.56 29.92 55.65 23.6 203.58 97.4 133.16 102.28 119.57 217.14 75.08 117.79 271.14 175.86 273.4 93.45 144.36 91.12 110.29 140.96 164.03 239.24 254.1
Mp7g02870.1 (GUS2)
0.33 0.03 6.91 0.05 0.32 0.12 0.74 0.49 3.18 0.06 0.06 1.03 0.05 13.41 0.07 0.35 0.0 0.41 6.6 0.11 0.12 22.27 1.53 9.63 0.04 0.14 0.04 0.06 0.05 0.1 0.29 0.28
Mp7g02880.1 (GUS2)
0.58 0.13 15.3 0.14 0.9 0.23 1.37 0.72 5.97 0.06 0.09 1.55 0.07 26.13 0.16 0.57 0.04 0.63 13.63 0.34 0.27 45.59 2.74 19.82 0.05 0.28 0.08 0.04 0.1 0.11 0.39 0.71
Mp7g19260.1 (UBC31)
0.1 0.02 0.26 0.18 0.04 0.03 0.04 0.09 0.14 0.03 0.1 0.13 0.07 0.14 0.1 0.02 0.03 0.29 0.25 0.05 0.11 2.0 0.08 0.36 0.08 0.03 0.0 0.03 0.06 0.12 0.04 0.0
Mp8g05440.1 (ATOEP16-2)
6.87 5.48 21.68 10.73 5.33 5.33 8.65 6.8 10.28 4.51 6.47 6.6 8.05 17.3 7.22 11.11 9.98 5.98 18.99 5.23 5.77 30.65 10.23 25.86 5.99 7.17 5.1 5.91 7.3 13.34 12.44 9.61
Mp8g07540.1 (CYCA2;3)
30.83 6.79 475.23 10.56 64.22 20.78 19.15 15.69 127.17 85.73 7.1 3.6 4.58 250.54 2.62 6.37 3.24 3.46 201.38 11.59 17.23 539.46 14.96 142.68 11.18 17.12 8.32 11.68 10.24 16.98 11.13 9.22
0.93 1.05 4.42 2.24 1.7 1.72 1.51 1.1 0.92 0.8 1.59 1.49 1.43 7.1 1.8 1.11 1.69 1.25 4.04 1.68 1.52 4.83 1.63 3.65 1.93 1.51 0.82 0.91 0.8 1.02 0.71 0.57
Mp8g17950.1 (CYP78A7)
0.22 0.13 0.64 0.15 0.04 0.11 0.4 0.23 0.31 0.11 0.04 0.13 0.11 0.17 0.13 0.48 0.1 0.13 1.4 0.05 0.23 2.46 0.13 1.29 0.15 0.17 0.11 0.08 0.12 0.36 0.21 0.3
2.08 0.83 12.53 3.98 0.37 0.47 1.26 0.2 8.91 0.63 0.46 0.49 0.28 4.16 1.08 2.67 0.97 0.2 4.99 0.37 1.12 12.81 0.44 6.93 0.29 0.71 0.44 0.5 1.59 1.34 0.45 0.49
0.04 0.04 0.21 0.04 0.05 0.03 0.02 0.02 0.33 0.08 0.08 0.12 0.13 0.15 0.02 0.02 0.04 0.05 0.06 0.03 0.03 0.23 0.13 0.06 0.04 0.03 0.01 0.03 0.04 0.02 0.02 0.0
Mpzg01260.1 (GET4)
0.31 0.6 0.92 0.61 0.33 0.25 0.0 0.23 2.52 0.4 0.34 0.96 0.61 0.84 0.32 0.23 0.37 0.34 0.57 0.25 0.18 1.67 0.67 0.51 0.0 0.03 0.0 0.07 0.1 0.04 0.21 0.21

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)