1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_96 (Marchantia polymorpha (Mpo) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
Control
Cold (3°C)
Dark (3 days)
Heat (33°C)
Light (435 uEm-2s-1)
Osmotic (100 mM mannitol)
Nitrogen deficiency (0 mM KNO3)
Salt (40 mM NaCl)
Cold-Dark
Cold-Light
Cold-Mannitol
Cold-Nitrogen deficiency
Cold-Salt
Heat-Dark
Heat-Mannitol
Heat-Nitrogen deficiency
Heat-Salt
Light-Salt
Mannitol-Dark
Mannitol-Light
Mannitol-Nitrogen deficiency
Nitrogen deficiency-Dark
Nitrogen deficiency-Light
Salt-Dark
Salt-Mannitol
Salt-Nitrogen deficiency
ZT2 (2 hours after light)
ZT6 (6 hours after light)
ZT10 (10 hours after light)
ZT14 (2 hours after dark)
ZT18 (6 hours after dark)
ZT22 (10 hours after dark)
Mp1g03280.1 (HCF243)
 0.05 -1.02 0.06 0.32 -0.33 -0.37 -0.07 -0.01 0.13 -1.08 -1.01 -1.19 -1.25 0.2 0.24 0.39 0.36 -0.28 0.17 -0.53 -0.31 -0.08 -0.15 0.28 -0.33 -0.05 0.69 0.65 0.25 0.36 0.53 0.54
-0.09 -0.46 -0.03 0.22 -0.13 -0.17 -0.15 -0.13 0.41 -0.56 0.04 -0.23 -0.21 -0.03 0.25 0.21 0.38 0.05 0.3 -0.06 -0.15 0.29 0.14 0.15 -0.17 0.05 -0.03 0.09 0.1 -0.28 -0.11 -0.29
Mp1g05570.1 (FTRA2)
 -0.01 -0.7 -0.56 0.26 -0.1 -0.25 -0.67 -0.21 0.14 -0.61 -0.14 -0.73 -0.21 0.38 0.15 -0.15 0.32 0.03 -0.0 0.01 -0.07 -0.15 0.03 0.32 -0.09 0.03 0.45 0.3 -0.09 -0.07 0.4 0.7
-0.02 -0.79 -0.37 0.54 0.01 0.09 -0.89 -0.03 -0.72 -0.24 -0.26 -0.96 -0.11 0.64 0.35 0.07 0.52 0.32 0.58 0.32 -0.2 0.13 -0.7 0.51 -0.14 -0.28 -1.23 0.01 0.42 0.41 -0.12 -0.31
0.37 -4.61 -0.12 -1.36 -2.79 -0.39 0.75 -0.54 0.85 -3.8 -4.07 -3.84 -4.41 0.15 0.25 1.26 0.24 -2.22 0.7 -2.67 -0.95 0.59 -0.83 0.77 -1.07 -0.14 -1.57 -1.15 -0.37 1.93 1.36 1.35
-0.27 -1.55 -0.4 0.24 0.4 0.31 -1.19 -0.58 -0.43 -0.62 -0.71 -2.13 -1.04 0.02 0.38 0.13 0.24 0.12 1.12 0.6 0.16 0.06 -0.22 0.73 0.08 -0.38 -1.34 -0.37 0.85 0.33 0.41 0.13
-0.27 -2.8 -0.02 0.89 0.14 -0.46 -0.15 -0.3 0.77 0.14 -1.03 -1.86 -1.19 0.93 0.43 0.55 0.63 -0.15 0.52 0.06 -0.27 0.28 0.17 0.43 -0.52 -0.04 -0.81 -0.3 -0.25 0.01 -0.27 -0.4
-0.22 -0.18 -0.04 0.22 -0.21 -0.36 0.13 -0.32 0.63 -1.05 -0.11 -0.37 -0.12 -0.06 0.37 0.44 0.51 0.08 0.34 -0.06 -0.2 0.24 0.39 0.14 -0.34 0.0 -0.27 -0.34 -0.33 -0.23 0.0 0.11
-0.15 -0.88 -0.2 0.6 -0.02 -0.06 -0.1 -0.11 0.33 -0.34 -0.06 -0.29 -0.21 0.11 0.34 0.59 0.39 0.08 0.16 -0.01 -0.05 0.09 0.1 0.08 0.09 0.04 -0.34 -0.21 -0.06 -0.22 -0.33 -0.25
Mp1g17330.1 (GLUS)
 -0.13 -0.49 0.42 0.48 0.0 -0.12 0.03 -0.18 0.45 -0.85 -0.4 -0.62 -0.49 -0.16 0.36 0.49 0.51 0.14 0.44 -0.33 -0.1 0.47 0.41 0.28 -0.39 -0.07 -0.16 -0.06 -0.15 -0.63 -0.5 -0.29
-0.72 -1.23 0.48 0.26 0.18 -0.41 -0.48 -0.77 -0.02 -0.47 -1.3 -1.72 -1.25 -0.29 0.57 0.33 0.59 -1.79 1.11 0.28 -1.1 -0.07 -0.94 1.14 -0.77 -0.66 -0.94 -0.69 -0.77 1.68 0.95 0.48
Mp1g23800.1 (GUX2)
 -0.1 -0.49 -0.36 0.14 0.08 -0.12 -0.28 -0.07 0.05 -0.59 -0.32 -0.68 -0.38 0.5 0.13 -0.15 0.24 0.28 0.21 0.12 -0.19 -0.37 0.15 0.27 -0.09 -0.11 0.09 0.2 0.06 0.16 0.41 0.34
Mp1g26000.1 (AtHMP46)
 -1.92 -1.42 -1.71 1.23 0.21 -1.72 -1.92 -0.99 1.67 -0.66 -1.28 -1.72 -1.26 -0.86 2.32 1.13 2.01 1.07 -0.65 0.4 -1.63 -1.22 0.91 -1.01 -1.2 -1.46 -0.96 -1.73 -2.8 -2.11 -1.87 -1.57
Mp1g26710.1 (PEX11B)
 0.24 -1.17 -0.65 0.76 0.39 0.02 -1.15 -0.34 -0.54 -1.37 -1.22 -2.47 -1.38 0.95 0.6 -0.02 0.6 0.08 0.52 0.03 -0.47 -0.54 -0.29 0.67 -0.48 -0.45 0.29 0.17 0.21 -0.12 0.54 0.84
0.11 -0.81 -0.01 0.48 -0.2 -0.21 0.06 -0.06 -0.07 -0.81 -0.75 -0.76 -0.87 0.53 0.26 0.48 0.51 -0.11 -0.05 -0.36 -0.31 0.06 0.1 -0.0 -0.38 -0.0 0.27 0.53 0.35 0.32 0.06 -0.08
Mp1g27360.1 (TIC110)
 -0.17 -0.32 -0.13 0.37 -0.13 -0.17 -0.04 -0.23 -0.05 -0.49 0.01 -0.35 -0.26 0.21 0.28 0.59 0.36 -0.26 0.27 -0.08 -0.29 -0.13 0.02 0.2 -0.3 -0.19 0.22 0.01 0.06 0.06 0.23 0.02
Mp1g29020.1 (PRORP1)
 0.26 -0.65 0.18 0.55 -0.09 -0.08 -0.04 -0.08 -0.28 -0.77 -0.4 -0.66 -0.5 0.23 0.43 0.67 0.43 -0.03 -0.44 -0.11 -0.22 -0.02 0.05 -0.5 -0.4 -0.15 -0.11 0.42 0.33 0.22 0.23 0.05
0.0 -1.7 0.34 0.32 -0.34 -0.27 -0.65 -0.12 0.68 -1.16 -1.19 -2.44 -1.76 0.4 0.29 0.41 0.39 -0.31 0.72 -0.32 -0.32 0.2 -0.49 0.47 -0.27 -0.29 -0.52 0.07 0.24 1.23 0.64 0.1
Mp2g08990.1 (emb1427)
 0.23 -0.86 0.03 0.47 -0.32 -0.04 0.06 0.03 -0.02 -0.78 -0.31 -0.78 -0.6 0.24 0.28 0.38 0.35 -0.1 0.0 -0.06 -0.05 0.11 0.08 -0.38 0.01 0.26 -0.02 0.27 0.3 0.18 0.03 -0.16
-2.88 0.19 - 2.2 -1.9 - - - 0.22 1.5 0.38 - 0.73 - 2.84 1.06 2.52 -0.34 - 0.3 - -1.83 -0.31 - - -2.04 -1.96 -1.78 - - - -
-0.18 -0.53 -0.37 0.14 0.17 -0.37 0.01 -0.27 0.6 -0.36 -0.05 -0.12 -0.17 0.22 0.06 0.27 0.15 0.04 0.31 0.06 -0.05 0.26 0.33 0.34 -0.2 -0.02 0.07 0.07 0.0 -0.41 -0.35 -0.43
Mp2g14680.1 (PER1)
 0.13 -1.25 -0.5 -0.08 -0.28 0.36 -0.46 -0.25 0.36 -0.8 -0.56 -0.95 -0.87 0.64 0.48 0.23 0.24 0.12 0.38 0.34 -0.04 0.17 -0.7 0.41 -0.05 -0.45 -1.06 -0.05 0.56 0.7 0.28 0.13
-0.12 -0.28 -0.25 0.27 0.09 -0.19 -0.07 -0.16 0.32 -0.18 0.01 -0.09 -0.03 -0.23 0.13 0.37 0.25 0.16 0.17 0.03 -0.12 0.07 0.24 0.11 -0.13 0.04 -0.07 -0.09 -0.14 -0.19 -0.09 -0.15
Mp2g20310.1 (ERA1)
 0.08 -0.9 -0.12 0.41 -0.17 -0.24 -0.35 -0.04 0.6 -0.58 -0.27 -1.19 -0.75 -0.59 0.34 0.16 0.46 -0.23 -0.02 -0.22 -0.25 -0.16 -0.16 0.07 -0.23 -0.07 0.54 0.39 0.11 0.44 0.49 0.48
-0.53 -0.88 -0.36 1.85 -0.42 -1.46 -1.23 -0.99 1.61 -0.46 -0.79 -0.94 -1.44 -2.14 1.71 1.33 2.14 -0.09 -1.87 -1.26 -0.99 -0.62 -0.31 -1.43 -0.74 -0.87 -0.0 -1.49 -0.97 -1.19 -0.73 -0.63
-0.02 -0.89 -0.28 0.37 -0.65 -0.38 -0.2 -0.06 -0.04 -0.93 -0.57 -0.96 -0.81 0.2 0.35 0.42 0.51 -0.18 0.02 -0.38 -0.2 -0.17 -0.15 0.12 -0.17 0.01 0.44 0.57 0.31 0.56 0.52 0.46
Mp4g02350.1 (VIR3)
 -0.14 -0.99 0.03 0.49 -0.25 -0.39 -0.25 -0.39 0.55 0.04 -0.62 -1.11 -0.75 0.42 0.39 0.69 0.62 -0.22 0.34 -0.41 -0.48 -0.04 -0.19 0.35 -0.55 -0.36 -0.25 0.08 0.11 0.42 0.36 0.22
Mp4g09450.1 (ABC4)
 0.21 -2.25 -0.07 0.38 -1.6 -0.17 0.25 0.18 -2.7 -2.1 -2.06 -2.42 -2.25 0.88 0.44 0.4 0.63 -0.65 0.31 -1.3 -0.22 0.19 -0.77 0.47 -0.02 0.21 0.85 0.73 0.13 0.72 0.67 0.66
Mp4g16800.1 (ROL5)
 -0.26 -0.68 -0.14 0.58 0.1 -0.22 -0.08 -0.45 0.77 -0.69 -0.33 -0.71 -0.56 0.09 0.53 0.57 0.63 0.03 0.24 0.17 -0.22 0.05 0.34 0.29 -0.33 -0.17 -0.21 -0.17 -0.11 -0.27 -0.19 -0.3
0.13 -0.82 0.12 -0.0 -0.31 0.16 -0.93 -0.12 0.16 -0.75 -0.59 -1.52 -0.67 -0.1 0.51 -0.35 0.42 -0.11 0.45 -0.04 -0.05 -0.28 -0.43 0.53 -0.08 -0.27 -0.17 0.34 0.35 1.06 0.45 0.22
Mp4g21830.1 (emb2004)
 -0.33 -1.09 -0.37 0.47 0.09 -0.41 -0.12 -0.28 0.73 -0.39 -0.45 -1.22 -0.61 0.58 0.51 0.67 0.59 0.11 0.26 0.07 -0.31 -0.18 0.28 0.18 -0.32 -0.23 0.02 -0.09 -0.12 0.01 -0.09 -0.1
Mp5g00050.1 (POK2)
 0.11 -0.86 0.15 0.59 0.04 -0.1 -0.09 -0.07 0.1 -0.83 -0.46 -1.02 -0.51 0.65 0.33 0.34 0.57 -0.15 0.6 -0.52 -0.49 0.14 -0.15 0.25 -0.03 -0.38 0.11 -0.21 -0.14 -0.17 0.19 0.17
Mp5g03050.1 (AGL77)
 -0.09 -0.22 -0.21 0.5 -0.05 -0.36 -0.14 -0.34 0.22 -0.38 -0.07 -0.19 -0.05 0.37 0.25 0.53 0.47 0.03 0.02 -0.26 -0.39 -0.15 0.11 0.01 -0.49 -0.24 -0.12 0.05 -0.0 0.12 0.22 0.07
0.11 -0.45 -0.54 0.86 0.07 -0.05 -0.4 -0.14 0.24 -0.96 -0.41 -0.75 -0.39 -0.06 0.55 0.57 0.83 -0.14 -0.25 -0.24 -0.19 -0.1 0.19 -0.06 -0.22 0.01 0.15 -0.12 -0.11 -0.04 0.08 0.2
0.12 -0.58 -0.07 0.73 -0.47 -0.35 -0.06 -0.36 0.61 -0.72 -0.44 -0.35 -0.56 0.31 0.38 0.47 0.36 -0.38 0.4 -0.42 -0.33 0.1 -0.06 -0.03 -0.3 -0.18 -0.02 0.14 0.29 0.14 0.08 0.01
Mp5g13760.1 (AtcathB2)
 0.02 -0.61 -0.1 0.24 -0.11 0.09 -0.29 -0.29 -0.31 -0.47 -0.09 -0.53 -0.19 0.42 0.16 0.23 0.31 0.26 0.1 0.29 0.14 0.21 0.31 0.29 0.01 0.14 -0.69 0.09 0.37 -0.05 -0.32 -0.7
Mp5g24430.1 (CCR2)
 0.17 -0.92 0.1 0.48 0.02 -0.18 -0.52 -0.07 0.31 -0.71 -0.66 -1.24 -0.94 0.58 0.32 0.31 0.4 -0.16 0.24 -0.25 -0.28 0.12 -0.04 0.1 -0.26 -0.12 0.24 0.33 0.21 0.09 0.23 0.19
Mp6g20090.1 (TIP5;1)
 0.1 -0.95 -0.25 0.44 -0.58 -0.17 -0.35 0.04 0.42 -1.13 -0.49 -1.25 -0.79 -0.11 0.48 0.12 0.55 -0.22 -0.06 -0.27 -0.18 0.22 -0.21 -0.19 -0.18 0.06 0.42 0.69 0.49 0.52 0.32 0.12
Mp6g20350.1 (PPR19)
 -0.32 -0.47 -0.36 0.44 -0.16 -0.2 -0.18 -0.33 0.46 -0.5 0.01 -0.33 -0.14 0.25 0.4 0.53 0.5 -0.04 0.13 0.14 -0.15 -0.15 0.17 -0.06 -0.24 -0.06 -0.17 -0.08 0.0 0.02 0.14 -0.08
-0.32 -0.57 -0.36 0.39 0.13 -0.31 -0.1 -0.33 0.68 -0.43 -0.06 -0.46 -0.33 -0.35 0.49 0.65 0.59 0.13 0.1 0.18 -0.17 -0.19 0.45 0.11 -0.26 -0.18 -0.16 -0.1 -0.27 -0.15 0.03 -0.12
-0.07 -0.17 0.05 0.25 -0.29 -0.13 -0.07 -0.2 0.08 -0.26 -0.06 -0.11 -0.23 0.34 0.25 0.42 0.24 -0.32 0.36 -0.21 -0.28 0.13 0.02 -0.07 -0.31 -0.04 -0.08 0.05 0.01 -0.01 0.12 0.13
Mp7g15950.1 (SCS9)
 0.08 -1.49 -0.39 0.61 -0.6 -0.41 -0.11 0.06 -0.12 -1.25 -0.93 -1.85 -1.31 0.02 0.59 0.32 0.69 -0.58 0.33 -0.8 -0.33 -0.1 -0.64 0.29 -0.34 -0.22 0.47 0.74 0.37 0.73 0.73 0.65
Mp7g16780.1 (ATX2)
 -0.08 -0.27 -0.11 0.39 -0.52 -0.33 -0.09 -0.28 0.31 -0.64 0.09 -0.12 -0.1 0.17 0.29 0.58 0.34 -0.26 0.31 -0.29 -0.27 0.22 0.07 -0.06 -0.34 0.05 -0.08 0.13 0.02 0.04 0.03 -0.04
Mp7g16940.1 (CtpC)
 -0.23 -0.58 0.05 0.59 -0.19 -0.27 -0.4 -0.51 -0.66 -0.94 -0.17 -0.75 -0.34 0.41 0.47 0.67 0.66 -0.17 0.35 -0.11 -0.31 -0.1 0.21 0.47 -0.51 -0.21 0.46 0.4 -0.09 -0.45 -0.03 0.22
Mp7g18810.1 (cpLEPA)
 0.03 -1.17 -0.22 0.44 0.13 -0.39 -0.53 -0.2 0.54 -0.55 -0.71 -1.49 -1.0 0.47 0.27 0.2 0.53 0.21 0.04 -0.05 -0.37 -0.13 0.23 0.09 -0.44 -0.1 0.38 0.27 -0.0 0.23 0.44 0.42
-0.33 -0.69 -0.39 0.04 -0.12 -0.15 -0.33 -0.05 -0.32 -1.13 -0.17 -1.33 -0.15 0.32 0.39 -0.04 0.49 0.28 0.0 0.45 -0.21 -0.36 0.15 0.36 0.03 -0.25 0.73 -0.19 -0.25 -0.08 0.62 0.57
Mp8g06200.1 (VPS60.2)
 0.11 -1.02 0.04 0.3 -0.09 -0.3 -0.17 -0.19 0.24 -0.67 -0.63 -1.0 -0.96 0.3 0.38 0.35 0.4 -0.24 0.22 -0.31 -0.24 0.27 -0.15 0.36 -0.26 -0.14 0.04 0.19 0.24 0.56 0.27 0.3
Mp8g10780.1 (PAP12)
 -0.23 -0.54 0.32 0.29 -0.62 -0.2 -0.16 -0.29 0.35 -0.41 -0.39 -0.57 -0.26 -0.15 0.3 0.25 0.34 -0.38 0.47 -0.21 -0.27 0.33 -0.34 0.35 -0.19 -0.13 -0.29 -0.27 -0.0 0.74 0.52 0.2
-0.47 -0.66 -0.18 0.29 0.07 -0.35 -0.02 -0.44 0.39 -0.45 0.09 -0.36 -0.25 -0.2 0.24 0.66 0.33 0.12 0.48 0.19 -0.2 0.2 0.42 0.36 -0.25 -0.1 -0.27 -0.27 -0.15 -0.29 0.04 -0.12
Mp8g13720.1 (CRD1)
 0.01 -0.82 0.21 0.36 -1.17 -0.83 0.12 -0.19 0.8 -1.5 -0.99 -1.3 -1.22 0.04 0.35 1.27 0.58 -1.1 0.19 -1.2 -0.73 0.24 -0.66 0.1 -0.86 -0.28 0.67 0.75 0.32 0.45 0.44 0.3
Mp8g13730.1 (CRD1)
 0.01 -0.82 0.21 0.36 -1.17 -0.83 0.12 -0.19 0.8 -1.5 -0.99 -1.3 -1.22 0.04 0.35 1.27 0.58 -1.1 0.19 -1.2 -0.73 0.24 -0.66 0.1 -0.86 -0.28 0.67 0.75 0.32 0.45 0.44 0.3
-0.15 -0.77 -0.08 0.23 0.06 -0.34 -0.58 -0.12 0.43 -0.58 -0.21 -1.07 -0.64 -0.61 0.29 0.1 0.35 0.03 0.23 0.11 -0.37 -0.06 0.04 0.26 -0.26 -0.32 0.32 0.21 0.16 0.41 0.64 0.55
-0.86 -0.34 -0.2 1.07 -0.8 -0.79 -1.07 -0.43 0.57 -0.49 -0.05 -0.78 -0.17 -1.34 1.29 0.92 1.43 0.6 -0.34 -0.22 -0.15 0.19 0.47 -0.7 -0.21 -0.06 -0.95 -0.85 -0.63 0.29 -0.42 -0.9

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.