1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_94 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
- 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.17 - 2.57 - - - - - 2.06 - 1.91 - - - - - - - - - - - - - - -16.23 - 3.54 -
- -20.03 - 2.0 - - - - 1.38 - - - 0.7 - - - 2.03 - - - - - 0.77 2.13 -5.81 - - - 2.81 2.2
1.28 1.36 0.61 -0.45 1.97 -1.79 0.0 -1.34 -0.41 -0.79 -1.87 - 0.43 - 0.09 -0.69 1.03 0.36 -1.8 0.97 -0.83 -0.71 -3.05 -1.4 0.13 -4.08 -0.49 0.08 0.06 0.36
2.96 2.14 - - 3.0 - - 0.84 - - 1.05 - 1.97 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.02
- 3.57 - - 1.84 - - - 1.18 - 1.19 - - - - - - - - 1.03 - - - - - - - 2.78 0.15 -
1.17 1.36 -0.17 0.27 0.2 -0.64 0.37 -0.88 -1.02 0.74 0.3 0.78 -0.09 0.92 0.12 -0.08 0.38 -1.1 -1.63 -1.62 -0.58 -3.23 -0.22 -1.1 0.38 -0.08 -0.86 -0.81 -0.91 0.08
- 1.8 0.11 1.38 - - - -0.12 - - 0.15 - - 1.09 - 2.47 - - 1.51 - - - 0.86 - -0.2 1.46 -0.36 0.1 0.22 0.89
1.78 2.81 - 2.26 0.45 - - - - - - - - 2.74 - - 1.65 - - - - - - - - - - - 0.86 0.8
- 3.96 - 2.88 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.82 -
- 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.98 - 3.0 - - - - - - - 2.63 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-23.78 3.88 - - - - - - - - - - - 3.6 1.64 - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.97 - - 3.51 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.05 - - - 2.73 - -
- - - 3.02 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.84 - - - - - 3.88 -
3.08 2.94 - 2.9 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.68 - - - -
- 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.95 - - - - - - - - - - - 3.86 - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.29 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.38 - - - - - - - -
- 3.96 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.85 -
2.92 2.67 - - 2.95 - - - - - - - 1.37 -0.67 -0.21 - - -0.27 - - - - 1.0 - - - - 0.47 - -
3.57 - 1.82 - 2.43 - - - - - - - 1.76 - 1.59 - - 1.5 - - - - - - - - - - - -
- 1.74 1.03 1.04 -0.0 - - -0.83 - 1.36 -0.84 - 0.58 -1.01 -0.13 -0.84 -0.9 -0.19 -1.07 2.02 - -1.09 0.91 - - 0.92 -0.26 - 1.13 0.28
- 4.22 2.94 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.9 - - - - - - - - - -
- 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 1.7 - 1.61 1.27 - - 1.46 - 3.68 - - - - 1.51 - - - 1.51 - - - - - - - - - - -
- 3.92 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.9 - - -
- 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.8 0.9 - - 0.67 1.74 - - - - - - - - 0.98 - 2.0 - - - - - - - - 0.75 1.15 1.0 2.12
0.04 1.07 -0.17 0.42 0.63 -0.63 -1.06 -0.44 -0.34 0.17 -0.39 -0.35 -0.07 0.19 -0.04 -0.05 -0.27 0.17 0.36 -0.14 0.08 -0.68 0.32 -1.16 0.01 -0.12 -0.42 0.62 0.18 -0.21
- 4.48 - 2.48 - - - - - - - 0.54 - - - - - - - - - - - - - -0.45 - - - -
- 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.37 - - - - - - - - 3.22 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.62 - 2.54 1.39 - 1.27 - - - - 1.34 - - 1.31 - - - - - - - - - - 1.35 - 1.55 - 1.33
1.35 2.77 2.14 - - 0.9 - - - - - - 2.03 3.04 - - - - - - - - - - - - - - 1.06 -
- 2.1 1.76 - - 2.31 - - - 2.43 - - - - - 0.86 - 2.24 - - - - - - - 0.6 - 1.96 - -
1.64 1.81 - - 2.54 - - - - - - - 1.62 - - - - - - - - 2.39 - - - - - 2.69 - 1.47
- 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.64 0.21 1.77 - - - 0.31 - - 1.33 - 0.29 - - - - 0.0 - - 1.14 1.55 - 0.01 - - - 2.82 - -
- 4.02 - - - - - - - - - - - - - - - 2.63 - - - - - - - - - 2.92 - -
1.81 1.13 - 1.62 - -1.16 1.81 -0.44 - 0.8 - -0.13 1.87 -1.02 0.09 - 0.09 -1.24 -0.09 - - - - -0.43 0.47 0.6 - 0.04 - 0.63
- 2.7 - - - - - 2.65 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.1 -
3.23 3.26 - - 1.03 1.1 - - - - - - - 1.83 - - - - - 0.92 - - - - - - -0.54 - - -0.49
- 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.01 - - - - - - - - - - - - - - 2.76 - - - - - - - - - - - 3.92 -
-0.55 1.65 0.4 1.64 0.28 - -0.68 - -0.61 0.52 - - 1.56 - 0.59 0.22 - - - - - -0.95 1.12 - 0.27 0.75 -1.02 0.56 1.81 0.21
3.41 4.28 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.82 - 1.74 - - - - - 1.64 - - - 1.45 0.48 - 2.67 1.62 - - - - - - - - - - - 1.53
- 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.6 - - - - - 3.32 - - - - - - - - - - - - - - - - 2.38 - - - - 1.41
Spov3_chr3.02417 (UGT73C6)
 - 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.14 - - -0.12 - - - 1.83 - - - - - - - - - - - - - 3.05 - - - - 3.08 - -
- 3.41 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.27 -
-0.38 0.19 0.42 0.37 -0.84 -1.02 0.12 0.03 - -0.73 -0.06 -0.29 - 0.5 -1.93 -0.71 1.23 -0.84 - 0.97 0.44 -0.33 0.21 1.02 - -0.16 -0.77 -0.51 2.09 -0.04
1.6 - 1.48 1.4 - 0.22 1.26 - - - - 0.42 0.61 - - 2.21 - - 2.39 - 0.43 - 0.28 - - 0.34 0.53 - - -
- 2.62 1.01 - 2.2 - - - - -0.19 - 1.35 -0.05 -0.14 - -0.14 - 2.46 - - - - - - - - -0.31 0.12 0.15 1.32
0.76 0.49 -1.04 -0.39 0.57 0.07 -0.27 -0.62 -0.76 0.13 -0.1 -0.03 0.38 0.88 0.12 -0.61 -0.6 0.38 -1.22 -0.81 -0.09 0.49 -0.42 -0.9 -1.0 0.46 0.14 0.62 -0.01 0.08
2.21 1.05 -3.4 -3.43 -1.5 0.66 -3.52 -0.99 -0.74 0.22 -0.76 -2.0 0.4 1.56 -0.03 -1.15 -1.49 1.2 -2.37 -2.06 -1.21 -1.16 -0.38 -0.17 -1.28 0.97 -0.4 0.66 0.21 -0.37
Spov3_chr4.00088 (LecRK-S.7)
 4.03 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.78 - - - -
- 3.25 1.18 0.08 0.29 0.18 - - - 0.38 - - - 0.39 - 0.27 - 1.1 - - 1.84 - - - - 0.17 1.52 - 0.33 -
2.85 4.01 - - - - - - - - - - - 1.67 - - 1.81 - - - - - - - - - - - - -
- 2.5 - 2.09 - - - - - 3.05 - - - - 1.68 - - - - - - - 2.05 - - - - - - 2.15
- 4.0 - 2.83 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.78 -
0.7 3.75 0.21 -1.87 - 1.62 - 2.97 - - - - - - - - - - - -0.83 - - - 1.04 - - - - - -
0.8 0.63 -1.45 -0.55 0.93 -0.08 -0.93 0.05 -0.48 -0.12 -0.44 -0.41 0.28 -0.55 -0.77 -0.35 0.43 0.22 -0.21 -0.94 -0.06 -0.19 -0.14 -0.82 -0.24 -0.13 0.01 0.73 0.91 0.41
- 4.09 - 3.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
3.71 4.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.42 - - - - - - - 3.33 - - - - - - - - - - 3.21 - - - - - - - - -
-0.03 1.98 - 1.88 0.48 - - - - - -0.13 -0.32 1.46 - - -0.3 - - - - -0.38 -0.3 - - 0.96 0.79 -0.37 -0.07 1.39 2.36
- 4.57 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.64 - - - - - -
- 2.93 - - - - - - - - - 2.18 - 3.45 - - - - - - - 0.71 - - - - 1.77 0.9 - -
2.3 1.66 -2.73 -3.56 2.52 -1.23 -3.53 -5.13 -2.7 -2.02 -4.08 -5.06 -1.66 1.48 -1.31 -0.81 -1.51 1.46 -3.18 -3.65 -2.43 -3.18 0.94 -1.35 -2.74 -1.48 -2.16 -1.2 1.39 0.21
- - - - - - - 2.48 - - - 2.6 - - - 2.85 - - 2.54 - - - - - - - 2.42 - - -
- 3.34 - - - - - - - - - - - - - - 2.62 - - - - - - - - - - - 3.78 -
0.43 0.59 -0.14 -0.92 0.9 -0.01 -0.19 0.05 -0.5 -0.04 -0.12 -0.25 -0.1 -0.58 -0.13 0.25 -0.23 -1.64 -0.31 -0.4 0.01 -0.23 -0.37 0.77 -0.0 0.06 -0.36 1.59 -0.91 -1.44
- 2.26 - - 3.55 - - - - - - - - - - - - - 1.98 - - - - - - - - 2.33 2.19 -
- 3.33 - 1.71 - - - 1.68 - - - 1.45 - 1.45 - - - - - 1.42 1.14 - - - - - 1.65 - - -
- 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
1.65 4.01 - - - - - - - - - - - - - - - 2.32 - - - - - - - - 1.34 - 1.71 -
- 1.84 0.56 - - - - - - - - 0.64 0.65 0.55 - - - 0.49 - - - - 2.54 2.21 - - - 2.82 - 0.56
- - - - - 1.1 - 2.9 - - - - - - - - - - - - - - 2.63 - - - - - 3.83 -
- 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.7 - - - - - - - - - - - - - - 2.03 - - - - - - - - - - - - -
- 4.2 - - - - - - - - 2.63 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.45
- 2.1 - 0.48 - - - 1.99 - - 0.45 - 1.43 1.69 0.3 0.58 - - - - - 0.06 - - - - - 2.97 0.56 -
1.82 1.05 -0.91 0.26 -1.01 - -0.88 -1.38 -1.81 0.25 -0.49 -3.63 0.6 1.69 0.19 -0.07 0.19 0.04 -0.91 -2.17 0.45 -0.05 -0.22 -0.29 -2.1 -1.01 -0.12 -0.9 0.76 0.42
- 4.29 - - - - - 3.38 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Spov3_S07.00083 (UMAMIT9)
 - 2.62 - - 2.79 - - - - - - - - - - 2.59 - - - - - - - - - 1.14 - 2.5 1.62 -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.