Heatmap: Cluster_170 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 260 uE m-2 s-1	Light: 195 uE m-2 s-1	Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 65 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L18D6	Photoperiod: L13D11 (Control)	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C (Control)	Temperature: 25°C	Temperature: 30°C
Spov3_C0004.00008 (MS2)	0.08	0.02	-0.24	-0.24	0.04	-0.14	-0.42	-0.06	-0.16	-0.33	-0.35	-0.26	-0.03	0.87	0.21	-0.26	0.01	0.8	-0.07	-0.13	-0.05	-0.1	0.27	-0.07	-0.3	-0.3	-0.12	-0.32	0.08	0.5
Spov3_C0017.00039 (CAM3)	-0.12	-0.2	-0.14	-0.11	0.29	-0.01	0.03	0.12	-0.3	-0.19	-0.12	-0.21	0.04	0.33	0.07	0.01	-0.01	0.4	0.0	0.05	0.07	0.01	0.28	-0.17	-0.06	0.04	0.11	-0.19	-0.27	-0.06
Spov3_C0019.00053 (EDA26)	-0.64	-0.14	-0.33	0.23	-0.17	-0.69	-0.24	-0.03	-0.22	-0.31	0.01	-0.23	0.29	0.39	0.16	0.24	0.22	0.77	-0.43	-0.06	0.13	-0.04	0.9	-0.34	-0.05	-0.2	-0.2	-0.34	-0.11	0.1
Spov3_C0302.00001 (BIA)	0.23	0.09	-0.07	-0.04	-0.07	0.01	0.06	-0.08	-0.35	-0.39	-0.08	-0.12	0.16	0.27	0.28	0.21	0.26	0.17	-0.01	0.01	0.03	0.14	0.06	-0.02	-0.08	0.04	-0.09	-0.39	-0.34	-0.25
Spov3_chr1.00203	-0.14	-0.11	-0.15	-0.04	0.05	-0.06	-0.01	0.12	-0.24	-0.15	-0.07	-0.21	0.14	0.18	0.34	0.28	0.34	0.19	-0.03	-0.07	0.07	-0.09	0.18	0.07	-0.04	-0.03	-0.01	-0.18	-0.42	-0.21
Spov3_chr1.00268 (AHP1)	0.0	-0.03	-0.42	-0.4	0.03	0.2	-0.1	-0.07	-0.18	-0.13	-0.05	-0.17	0.2	0.71	0.14	0.3	0.14	0.57	-0.02	0.07	0.12	0.06	0.06	0.01	-0.28	-0.05	0.01	-0.56	-0.68	-0.35
Spov3_chr1.00323 (LCAT3)	0.14	0.16	-0.01	-0.35	-0.07	0.14	-0.36	-1.14	-0.49	-0.33	-0.53	-0.66	-0.47	0.57	0.93	0.84	0.73	1.44	-0.26	-0.61	-0.1	-0.31	0.16	-0.29	-0.74	-0.45	-0.57	-0.73	-0.15	-0.09
Spov3_chr1.00454 (NAS3)	-1.06	-1.22	-0.46	-1.2	-0.41	1.15	-0.1	-0.41	-0.4	-0.49	-0.12	0.14	1.34	0.73	0.11	0.4	-0.21	1.67	-0.19	0.13	-0.14	-0.31	0.38	-0.57	-1.32	-0.42	-0.47	-0.8	-1.38	-0.6
Spov3_chr1.00631 (AAPT1)	-0.27	-0.09	-0.18	-0.07	-0.11	0.05	0.05	0.16	-0.13	-0.17	-0.02	-0.19	0.12	0.39	0.39	0.37	0.38	0.64	-0.19	-0.12	-0.06	-0.05	-0.37	-0.19	-0.1	-0.07	-0.02	-0.28	-0.42	-0.09
Spov3_chr1.00745 (AAP2)	-0.65	-0.72	-0.34	0.26	0.08	0.42	0.29	-0.43	-0.27	-0.39	-0.16	-0.22	0.75	0.68	0.47	0.39	0.25	1.09	-0.35	-0.15	-0.21	-0.2	-0.21	-0.02	-0.26	-0.14	-0.31	-1.05	-0.91	-0.07
Spov3_chr1.01007 (AtEH1)	-1.62	-1.67	-1.51	-0.73	0.25	0.72	-0.97	-0.85	-1.48	-0.09	-1.04	-1.29	2.01	1.58	0.28	0.02	-0.5	2.17	-0.83	-0.99	-0.27	-0.91	1.23	-1.83	-1.13	-0.99	-0.72	-0.77	-1.28	-2.07
Spov3_chr1.01046	-0.19	-0.13	-0.02	0.33	0.15	-0.1	-0.29	0.16	-0.18	-0.25	-0.24	-0.31	-0.03	0.39	0.2	0.25	0.29	0.64	-0.21	-0.28	-0.11	-0.15	0.2	-0.1	-0.11	-0.15	-0.06	-0.09	-0.06	-0.12
Spov3_chr1.01163 (TCTP1)	0.02	0.11	-0.12	-0.16	0.27	0.07	-0.29	-0.44	-0.23	-0.19	-0.32	-0.3	-0.39	0.48	0.28	0.41	0.22	1.1	-0.29	-0.32	-0.06	-0.21	-0.32	-0.02	-0.14	-0.05	-0.12	-0.58	-0.2	0.44
Spov3_chr1.01613 (CSD1)	-0.46	-0.38	-0.37	-0.24	-0.21	-0.06	-0.19	-0.12	-0.08	-0.11	-0.03	-0.06	0.12	0.35	0.15	0.07	0.07	0.83	0.21	0.16	0.1	0.13	0.29	0.04	-0.01	0.08	0.17	-0.73	-0.27	-0.31
Spov3_chr1.01616 (TRS33)	-0.14	0.05	-0.23	-0.37	0.35	-0.09	-0.3	-0.2	0.1	0.22	-0.03	-0.1	0.04	0.68	0.24	0.27	0.16	0.54	-0.14	-0.2	-0.02	-0.17	-0.04	-0.1	-0.07	0.12	-0.11	-0.33	-0.56	-0.36
Spov3_chr1.02029	-0.18	0.05	0.05	0.21	0.1	-0.07	-0.26	0.5	-0.11	0.19	-0.16	-0.03	-0.04	0.47	-0.04	-0.16	-0.05	0.65	-0.09	-0.05	-0.19	-0.24	0.05	-0.12	-0.37	-0.11	-0.02	-0.24	-0.32	0.0
Spov3_chr1.02887	-0.4	-0.38	-0.48	-1.04	-0.11	-0.38	-0.14	-0.51	0.09	-0.04	0.1	0.33	-0.13	0.19	0.11	0.01	-0.03	0.96	0.09	0.15	0.26	0.25	0.29	0.09	0.08	0.39	0.4	-0.44	-0.64	-0.69
Spov3_chr1.03053	0.39	0.14	-0.72	-0.49	0.12	-0.15	-0.11	-0.6	-0.88	-0.38	-0.46	-1.19	0.64	0.89	-0.05	0.08	0.15	1.35	-0.48	-0.39	0.16	-0.74	0.89	-0.06	-0.18	-0.55	-0.57	-0.22	-0.23	0.22
Spov3_chr1.03582 (SUM1)	0.0	-0.09	-0.12	-0.08	-0.0	0.04	-0.05	-0.12	-0.17	-0.04	-0.05	-0.11	0.05	0.2	0.16	0.21	0.1	0.23	-0.04	0.01	0.06	0.09	0.21	-0.01	-0.07	-0.01	-0.06	-0.19	-0.26	-0.05
Spov3_chr1.03633	-0.96	-1.63	-1.04	-1.32	0.03	1.48	-0.02	-0.58	-0.39	0.19	-0.41	-0.27	0.95	0.62	0.77	0.46	0.3	1.05	0.26	0.23	0.28	-0.48	-0.47	-0.57	-0.63	-0.51	-0.92	-1.76	0.04	-0.78
Spov3_chr2.00003 (EF1alpha)	-0.26	-0.24	-0.34	-0.18	0.08	-0.26	-0.43	-0.03	-0.06	-0.02	-0.12	0.1	0.2	0.68	0.36	0.21	0.35	0.67	-0.23	-0.08	-0.17	-0.18	0.22	-0.12	-0.15	-0.09	0.01	-0.13	-0.22	-0.38
Spov3_chr2.00189 (DPMS2)	-0.1	-0.21	-0.23	-0.45	0.02	-0.37	-0.47	-0.23	-0.18	-0.15	0.04	-0.09	0.22	0.37	0.37	-0.06	0.25	0.81	0.22	0.2	0.05	-0.07	0.31	-0.2	-0.04	0.12	-0.04	-0.49	-0.42	-0.08
Spov3_chr2.00731 (AHL1)	-0.0	0.34	-0.25	-0.25	0.28	-0.09	-0.25	-0.43	-0.48	-0.16	-0.38	-0.27	0.21	1.0	0.25	0.16	0.32	0.84	-0.37	-0.49	-0.38	-0.26	0.31	-0.07	-0.22	-0.33	-0.24	0.03	-0.12	-0.18
Spov3_chr2.01404	-0.25	-0.02	-0.04	0.21	-0.2	-0.1	-0.3	0.17	-0.16	-0.23	0.03	0.02	-0.23	0.34	0.24	0.01	0.37	0.71	-0.1	-0.12	0.01	-0.08	-0.08	-0.46	-0.06	-0.19	0.13	-0.25	-0.1	0.13
Spov3_chr2.02616 (NTF2)	-0.31	-0.17	-0.1	0.25	-0.41	-0.3	-0.47	-0.05	-0.2	-0.34	-0.07	-0.2	0.2	0.43	0.22	0.27	0.28	0.42	-0.19	-0.22	0.22	0.16	0.5	0.02	-0.17	0.04	-0.03	-0.05	-0.37	-0.07
Spov3_chr2.04111	0.02	0.06	-0.15	-0.08	0.03	0.08	-0.0	-0.06	-0.5	-0.42	-0.27	-0.39	-0.04	0.26	0.18	0.1	0.24	0.35	0.06	0.03	0.02	0.01	0.5	0.07	0.03	-0.05	0.05	-0.24	-0.27	-0.1
Spov3_chr2.04968 (BON)	-0.17	0.03	0.02	0.42	-0.15	-0.19	-0.3	0.24	-0.33	-0.42	-0.37	-0.4	0.06	0.04	0.16	0.34	0.4	0.48	-0.04	-0.12	0.13	0.0	0.44	-0.12	-0.09	-0.01	0.02	-0.48	-0.3	-0.02
Spov3_chr2.05250 (GS2)	-0.29	-0.25	-0.29	-0.44	-0.01	0.03	-0.26	-0.08	-0.15	-0.12	-0.09	-0.13	-0.04	0.74	0.21	0.34	0.41	0.35	0.21	0.15	0.19	0.05	0.11	0.14	-0.02	0.14	-0.27	-0.38	-0.62	-0.53
Spov3_chr2.05345	-0.1	0.08	-0.03	0.15	0.2	-0.15	-0.1	0.45	-0.05	0.03	-0.15	-0.17	-0.06	0.12	-0.01	0.06	0.1	0.7	-0.25	-0.14	-0.06	-0.14	-0.02	-0.28	-0.18	-0.07	-0.11	-0.07	-0.13	-0.06
Spov3_chr2.05496 (FRO6)	-0.53	-0.47	-0.53	-0.33	-0.04	-0.19	-0.29	-0.04	0.02	0.09	-0.01	0.09	0.63	0.53	0.16	0.33	0.17	0.8	-0.21	0.04	0.11	-0.12	0.41	-0.19	-0.22	-0.13	-0.08	-0.68	-0.59	-0.01
Spov3_chr3.00848 (JANUS)	-0.03	0.02	-0.2	0.26	-0.37	-0.36	-0.61	0.02	-0.25	-0.19	0.02	-0.13	0.2	0.09	0.31	0.25	0.47	0.24	-0.14	-0.18	-0.02	0.05	0.58	-0.14	-0.05	-0.05	-0.07	-0.08	-0.28	0.02
Spov3_chr3.01346 (ADCS)	-0.11	-0.03	-0.05	0.51	-0.18	-0.15	-0.26	0.39	-0.31	-0.27	-0.43	-0.33	0.09	0.0	0.02	0.15	0.08	0.78	-0.23	-0.06	-0.1	-0.06	0.28	-0.12	-0.06	-0.07	0.09	-0.37	0.02	0.06
Spov3_chr3.01432 (HOL3)	0.22	0.31	0.18	0.07	0.22	-0.02	-0.18	-0.33	-0.25	-0.14	-0.05	-0.02	-0.32	0.64	0.11	-0.06	-0.14	0.87	-0.33	-0.08	-0.11	0.01	-0.13	-0.44	-0.16	-0.16	-0.2	-0.21	-0.09	-0.07
Spov3_chr3.02230 (TAF13)	-0.25	-0.02	-0.22	0.07	0.23	-0.03	-0.38	0.11	-0.09	-0.19	-0.28	-0.18	-0.08	0.8	0.0	0.09	0.07	0.81	-0.18	-0.06	-0.12	-0.19	0.16	0.05	-0.26	-0.21	-0.22	-0.24	-0.14	0.08
Spov3_chr3.02958	-0.35	-0.32	-0.44	0.03	-0.27	-0.32	-0.21	-0.05	-0.0	-0.25	-0.02	-0.25	0.22	0.28	0.27	0.14	0.28	0.21	0.05	-0.05	0.24	-0.1	0.67	-0.0	0.17	0.12	0.16	-0.32	-0.44	-0.15
Spov3_chr3.03629	-0.56	-0.62	-0.08	-0.69	-1.05	1.37	0.1	0.36	-2.6	-0.73	-0.43	-0.59	0.93	0.44	0.41	-0.21	0.43	1.4	-0.39	-0.31	0.02	-0.29	-1.28	-1.61	-0.44	-1.14	-0.08	-0.21	-0.24	1.06
Spov3_chr3.03912 (HYH)	-0.98	-1.03	-1.33	-2.41	-0.03	0.87	0.72	-0.04	-0.84	-1.45	-0.81	0.04	1.52	0.49	0.96	0.61	0.24	1.41	-0.02	-0.46	-0.03	-0.59	0.77	-0.22	-0.62	-0.47	-0.74	-0.51	-2.06	-4.36
Spov3_chr3.04065 (MS2)	0.08	0.02	-0.24	-0.24	0.04	-0.14	-0.42	-0.06	-0.16	-0.33	-0.35	-0.26	-0.03	0.87	0.21	-0.26	0.01	0.8	-0.07	-0.13	-0.05	-0.1	0.27	-0.07	-0.3	-0.3	-0.12	-0.32	0.08	0.5
Spov3_chr3.04209	-0.46	-0.38	-0.5	-0.13	-0.36	-0.09	-0.34	-0.13	-0.22	-0.19	-0.02	-0.04	0.15	0.45	0.32	0.36	0.5	0.66	-0.19	0.09	0.25	-0.03	0.34	-0.12	-0.15	0.09	0.09	-0.26	-0.49	-0.17
Spov3_chr4.00692 (SDG2)	-0.38	-0.18	-0.35	0.2	-0.3	-0.36	-0.03	-0.0	-0.04	-0.04	0.0	-0.21	0.26	0.17	0.05	0.08	0.08	0.27	0.17	-0.06	-0.05	-0.18	0.68	-0.24	-0.02	0.04	0.19	-0.33	-0.14	0.16
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Spov3_S10.00002 (MS2)	0.02	-0.05	-0.59	-0.31	0.05	-0.14	-0.27	0.05	-0.15	0.08	-0.37	-0.15	0.22	0.93	0.21	-0.1	0.21	0.89	-0.16	-0.38	-0.09	-0.29	0.31	0.06	-0.3	-0.46	-0.24	-0.32	-0.11	0.16

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.