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Heatmap: Cluster_173 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
-0.15 0.07 -0.18 -0.05 0.09 0.37 0.19 0.17 -0.55 -0.76 -0.23 -0.2 0.32 -0.22 0.09 -0.09 0.24 0.33 0.12 -0.05 0.08 0.09 -0.54 -0.09 0.09 -0.0 0.05 0.01 -0.12 0.24
-0.12 -0.02 -0.13 -0.13 0.01 -0.2 -0.24 0.07 -0.19 0.06 -0.04 -0.11 0.17 0.22 0.21 0.16 0.2 0.32 -0.15 -0.24 -0.05 -0.18 0.16 -0.12 0.03 -0.02 0.08 -0.24 -0.09 0.29
-0.49 -0.52 -0.17 -0.33 -0.37 0.19 0.24 0.62 -0.01 -0.36 -0.03 0.16 0.22 -0.86 0.35 0.17 0.32 -0.75 -0.03 0.53 -0.04 0.15 -0.53 0.18 0.16 0.21 -0.01 -0.45 -0.24 0.35
-0.24 -0.15 -0.24 -0.24 0.01 0.11 0.3 0.35 -0.02 0.02 0.15 0.08 0.39 -0.12 0.06 0.06 0.19 -0.22 -0.06 -0.08 0.01 -0.04 -0.37 0.09 0.09 -0.05 0.11 -0.2 -0.24 -0.12
0.26 0.14 -0.07 0.33 -0.13 0.19 0.03 0.17 0.0 -0.03 -0.26 -0.21 0.0 0.53 0.08 0.07 -0.1 0.33 -0.4 -0.62 0.08 -0.48 0.03 -0.24 -0.13 -0.16 -0.37 -0.11 0.09 0.32
0.55 0.26 0.14 0.12 -0.35 -0.12 -0.15 0.21 -0.38 -0.16 -0.54 -0.06 -0.17 0.6 -0.06 0.16 -0.3 0.64 -0.34 -0.71 0.0 -0.4 -0.21 -0.06 -0.28 -0.11 -0.14 0.11 0.31 0.34
-0.57 -0.16 -0.63 -1.14 -2.98 -1.11 0.62 -0.77 -0.65 -1.07 0.08 0.01 0.13 -2.94 0.39 0.23 0.91 1.47 0.45 0.54 0.48 0.22 -1.59 -0.08 0.78 0.13 -0.19 -0.64 -0.57 0.49
-4.75 -3.84 -1.68 -1.08 -1.29 1.08 0.83 2.05 0.18 -0.78 0.3 1.08 -0.11 -2.1 0.58 0.13 -1.17 -3.85 0.28 1.11 0.46 0.28 -3.15 -0.64 -0.38 0.08 -0.15 0.04 -0.99 -1.52
-2.92 -2.34 -2.01 -0.95 -1.22 1.07 0.75 2.12 -1.09 -1.5 -0.17 -0.11 -0.2 -2.54 0.9 0.97 1.04 -0.78 -0.11 0.14 0.14 -0.09 -0.95 -0.35 -0.42 0.3 -0.3 -0.67 -1.49 0.05
-0.25 -0.3 -0.3 -0.23 -0.02 0.03 0.29 0.44 -0.05 -0.03 0.1 0.03 0.32 0.07 0.01 0.11 0.19 -0.02 -0.18 -0.04 -0.01 0.1 0.04 -0.04 -0.11 -0.04 -0.06 0.02 -0.32 -0.08
-0.52 -0.2 -0.21 -0.03 -0.03 -0.04 -0.0 0.34 -0.11 -0.03 0.05 0.04 0.22 0.41 0.04 0.2 0.27 0.02 -0.1 0.06 0.11 -0.21 -0.12 -0.01 0.04 -0.11 0.1 -0.12 -0.29 -0.14
- - - 2.59 1.38 1.45 - 2.82 - - - - - 1.58 - - - 2.49 - - - - - - - 1.57 - - - -
-0.55 -0.56 -0.51 -0.27 0.23 0.32 0.15 0.39 -0.57 -0.46 -0.09 -0.16 0.48 0.02 0.4 0.31 0.39 0.27 -0.05 -0.06 -0.01 0.03 -0.22 0.06 0.19 -0.01 0.14 -0.06 -0.83 -0.09
-0.33 0.57 -0.04 1.15 -0.36 0.1 0.47 0.94 -0.77 0.15 0.34 0.04 -0.12 0.97 0.51 -0.58 0.01 -0.24 -0.01 -0.39 -1.11 -3.06 0.29 -0.17 -0.7 -0.8 -2.74 0.8 -1.95 -0.41
-0.31 -0.49 -0.51 -0.44 0.32 0.15 0.2 0.58 -0.39 -0.49 -0.16 -0.17 0.78 0.45 0.28 0.5 0.42 -0.05 -0.17 -0.25 0.12 -0.15 -0.29 -0.17 0.25 0.06 -0.26 -0.66 -0.44 -0.14
-0.06 -0.14 -0.61 0.51 0.19 1.4 0.45 0.94 -1.03 -0.46 0.35 0.48 0.7 0.09 0.46 -0.32 -0.79 0.52 0.84 -0.25 -0.43 -1.3 -0.73 -0.0 -2.24 -1.29 -0.52 -0.83 -0.93 -1.19
-2.45 -2.2 -1.36 -1.0 0.28 0.36 0.54 1.19 0.13 0.06 0.66 0.48 1.25 -0.08 0.08 0.3 0.23 0.36 0.02 0.31 0.04 -0.01 -1.52 -0.61 -0.61 -0.38 -0.24 -0.62 -0.81 -0.96
-0.12 -0.04 -0.15 -0.15 0.06 -0.01 -0.08 0.11 -0.09 -0.12 -0.06 -0.04 0.05 -0.02 0.21 0.07 0.17 0.25 -0.05 -0.11 0.16 0.09 -0.04 -0.12 0.07 0.11 0.16 -0.15 -0.13 -0.23
-0.5 -0.94 -0.3 0.18 -0.34 -0.16 0.29 0.4 -0.2 -0.51 0.07 -0.16 0.92 -0.76 0.47 0.26 0.52 0.12 -0.08 0.04 -0.28 -0.06 0.27 -0.25 0.2 0.02 0.09 -0.36 -0.57 -0.0
-0.08 -0.39 0.34 0.21 -0.62 -0.4 -0.26 0.52 0.13 -0.04 0.08 -0.3 0.81 -1.89 -0.24 -0.22 0.21 -0.88 -0.04 -0.02 -0.26 0.1 0.02 0.17 0.76 -0.27 0.25 -0.06 -0.01 0.19
-1.31 -0.46 -0.57 -0.44 -0.05 -0.28 -0.71 1.13 -0.18 -0.01 -0.29 -0.21 1.26 0.79 -0.28 0.29 0.41 0.72 -0.3 0.09 0.14 0.14 -0.7 -0.53 -0.24 -0.36 -0.28 -0.67 -0.65 0.08
-0.26 -0.2 -0.16 -0.1 -0.33 -0.16 -0.05 0.35 -0.08 -0.15 0.06 0.07 0.15 0.17 0.28 0.17 0.29 -0.07 0.08 0.01 0.01 0.02 -0.04 -0.07 -0.01 -0.02 0.02 -0.22 -0.19 0.14
-0.22 -0.11 -0.15 -0.19 -0.38 -0.2 0.29 0.18 -0.14 -0.13 -0.14 0.01 0.22 -0.02 0.19 0.19 0.06 0.57 -0.08 -0.01 0.09 -0.02 -0.02 -0.02 -0.23 -0.02 0.04 -0.39 -0.12 0.32
-0.3 -0.44 0.07 -0.04 -0.28 -0.14 -0.03 0.29 -0.06 -0.18 0.03 0.19 0.39 0.04 0.24 0.05 0.27 0.01 0.11 -0.13 -0.0 0.08 0.31 -0.36 -0.01 -0.14 -0.03 -0.1 -0.43 0.14
-0.21 0.02 -0.28 0.03 0.21 -0.12 -0.22 0.18 -0.27 -0.17 -0.18 -0.29 0.3 0.21 -0.13 0.2 0.08 0.51 -0.03 -0.36 -0.08 -0.29 0.3 -0.07 -0.01 0.06 0.19 -0.1 -0.36 0.36
-0.62 -0.74 -0.57 -0.46 0.1 0.13 0.3 0.62 -0.39 -0.53 0.16 0.09 0.83 -0.65 0.52 0.34 0.46 -0.23 0.11 0.23 -0.07 -0.11 -0.54 -0.08 0.14 0.1 0.12 -0.59 -0.58 0.11
-0.11 -0.2 -0.1 -0.13 0.04 0.2 0.19 0.25 0.12 0.03 0.08 0.1 0.27 0.18 0.21 0.01 0.05 -0.12 0.06 0.07 -0.08 0.06 -0.57 -0.01 -0.16 -0.08 -0.06 -0.03 -0.18 -0.4
-0.33 -0.32 -0.04 0.16 -0.11 -0.23 0.09 0.44 0.04 -0.05 0.08 -0.05 0.24 -0.02 0.15 0.09 0.14 -0.07 -0.05 -0.04 -0.06 -0.04 -0.03 -0.13 0.03 -0.05 0.08 -0.08 -0.03 -0.05
-1.19 0.34 -0.59 0.71 0.45 0.75 0.21 0.74 -0.31 -0.81 0.22 -0.16 -0.29 0.84 -0.39 0.18 -0.46 0.88 -0.57 -0.51 -0.42 -0.68 -0.02 0.07 -0.29 -0.06 -1.54 0.65 -0.86 -0.8
-2.4 -1.56 -0.99 -0.35 -2.84 -1.08 0.26 1.28 -1.09 0.49 0.12 -0.43 1.09 -3.16 -0.85 -0.48 0.03 0.57 -0.48 0.46 0.83 0.83 0.29 0.41 0.16 0.37 0.29 -0.56 -0.65 0.12
-0.21 -0.04 -0.05 0.1 0.1 0.09 -0.26 0.25 -0.01 -0.18 -0.04 0.01 -0.05 0.27 -0.09 -0.19 -0.09 0.22 0.17 0.04 0.08 -0.11 -0.08 -0.09 0.05 -0.01 -0.15 -0.02 -0.0 0.11
0.14 0.09 0.05 -0.09 -0.11 -0.32 -0.2 0.63 -0.23 -0.16 -0.09 -0.36 -0.26 0.54 -0.09 -0.04 -0.06 0.74 -0.28 -0.27 -0.17 -0.14 0.15 -0.33 -0.32 -0.08 0.08 -0.03 -0.12 0.41
-0.6 0.45 -0.44 0.32 -0.09 0.03 0.28 0.36 0.04 -0.63 -0.09 -0.01 0.2 0.57 -0.21 0.27 0.26 0.71 -0.28 0.11 -0.76 -1.2 -0.15 0.1 0.28 -0.08 -0.54 0.41 -0.52 -0.69
-0.23 -0.28 -0.33 -0.12 -0.17 0.05 0.1 0.14 -0.14 -0.17 0.07 0.04 0.2 0.29 0.1 0.33 0.27 0.09 -0.11 0.02 -0.07 -0.12 -0.03 -0.12 0.14 -0.0 0.12 -0.23 -0.29 0.13
-1.33 -1.26 -0.96 -0.33 -0.81 0.17 0.11 1.12 -0.86 -0.7 -0.08 -0.4 0.8 -0.39 -0.08 0.3 0.21 0.98 0.36 0.41 0.31 0.11 -0.2 0.04 0.02 -0.01 -0.01 -0.52 -0.73 0.17
-0.65 -0.85 -0.69 -0.78 -0.5 0.26 0.75 0.85 -0.02 -0.35 0.23 0.22 1.22 -0.91 -0.03 0.25 0.32 -0.63 -0.05 -0.19 0.36 -0.55 -0.22 0.04 0.02 0.12 0.1 -0.5 -0.37 -0.23
-0.07 -0.12 -0.1 -0.1 0.15 -0.09 -0.06 0.13 -0.01 -0.11 0.07 -0.04 0.16 -0.03 0.05 0.06 0.06 0.25 0.08 -0.02 0.02 0.09 0.09 -0.07 0.03 0.01 0.04 -0.02 -0.26 -0.32
Spov3_chr3.04558 (PP2C.D2)
 -0.06 -0.27 -0.28 -0.28 0.21 0.15 0.23 0.31 -0.18 -0.11 0.1 -0.02 0.41 0.14 0.16 0.1 0.21 -0.12 -0.16 0.03 -0.08 -0.07 -0.14 -0.04 -0.08 -0.06 -0.0 0.01 -0.36 -0.1
Spov3_chr3.04691 (CYP715A1)
 -0.01 0.19 -0.55 -1.02 -0.41 -0.47 0.41 0.46 -0.83 -0.63 -0.09 -0.24 0.42 -1.16 0.44 0.46 0.53 0.73 -0.05 0.1 0.12 0.19 -0.64 -0.14 -0.03 0.21 0.13 -0.26 -0.32 0.28
-1.6 -0.99 -0.74 -0.14 -0.4 0.04 -0.0 1.0 -0.32 -0.12 0.07 -0.0 0.52 0.59 -0.09 0.13 0.14 -0.29 0.2 0.25 0.19 0.06 -0.48 -0.24 -0.16 0.03 0.21 -0.34 0.12 0.21
- - - - - - - 3.36 - - - 3.41 - - - - - 3.19 - - - - - - - - - - - -
-0.2 -0.17 -0.12 0.07 -0.18 -0.13 0.16 0.16 -0.31 -0.34 -0.09 0.07 0.48 -0.64 0.08 0.02 0.46 0.61 0.12 0.07 -0.16 -0.06 -0.42 -0.13 0.22 0.18 0.07 0.01 -0.57 -0.05
-0.03 0.12 -0.05 -0.07 0.08 0.06 0.13 -0.2 -0.13 -0.25 0.09 -0.03 0.21 -0.89 -0.07 0.03 0.12 0.46 -0.38 -0.31 -0.2 -0.01 -0.31 0.06 0.12 0.12 0.21 -0.01 0.04 0.46
-0.15 -0.14 -0.17 0.16 -0.05 -0.36 -0.17 0.06 -0.09 -0.07 0.08 -0.09 0.07 -0.0 0.1 0.09 0.05 0.31 0.02 0.05 -0.04 -0.06 -0.08 0.11 0.29 0.2 0.34 -0.21 -0.32 -0.23
-0.51 -0.19 -0.79 -1.66 -0.06 0.35 0.22 0.48 -0.58 -0.34 0.02 0.03 0.74 -0.13 0.39 0.28 0.27 0.46 -0.13 0.05 -0.05 0.13 -0.13 0.12 -0.14 0.18 -0.14 -0.27 -0.35 -0.04
-0.48 -0.43 -0.5 -0.41 0.11 0.18 0.09 0.38 -0.25 -0.2 -0.01 -0.04 0.4 0.14 0.26 0.12 0.13 -0.1 -0.05 -0.13 0.03 0.09 0.11 0.03 -0.12 0.09 0.18 -0.13 -0.22 0.18
-0.01 -0.02 -0.03 0.09 -0.02 -0.11 -0.04 0.06 -0.13 -0.15 -0.01 -0.12 0.11 -0.18 0.19 0.11 0.14 0.38 -0.07 0.04 0.06 0.06 -0.16 -0.1 0.07 0.13 0.11 -0.01 -0.32 -0.27
Spov3_chr5.02073 (emb2735)
 -0.43 -0.25 -0.33 -0.1 0.05 0.07 0.13 0.45 -0.11 -0.11 -0.13 0.01 0.32 0.28 0.32 0.12 0.21 0.1 0.01 -0.02 -0.07 -0.01 0.01 0.04 0.12 -0.11 -0.02 -0.24 -0.32 -0.46
-1.33 0.13 -0.75 0.86 -0.63 0.42 -0.03 0.53 -0.33 -1.52 0.05 0.44 0.38 1.0 -0.4 0.37 0.03 1.0 -0.21 -0.17 -0.8 -0.96 0.24 0.27 -0.14 -0.33 -0.9 0.6 -1.2 -1.47
-0.62 0.16 -0.36 0.93 -0.32 0.47 -0.21 0.11 -0.09 -0.7 0.48 0.3 0.35 0.87 -0.17 0.15 0.0 1.03 -0.37 -0.68 -1.06 -1.16 0.57 0.05 -1.03 -0.33 -2.0 0.24 -0.41 -0.35
-0.63 -0.68 -0.72 -0.51 -0.12 -0.57 0.05 0.8 -0.38 -0.2 0.08 -0.15 0.66 -1.28 -0.36 -0.3 -0.23 0.6 0.13 0.17 -0.01 0.07 -0.45 0.16 0.46 0.03 0.22 0.03 0.45 0.52
-1.13 -1.17 -1.1 -0.47 0.29 0.35 0.42 0.95 -0.2 -0.39 0.03 -0.14 0.69 -0.03 0.27 0.66 0.39 0.38 -0.03 0.26 0.0 -0.13 -0.73 -0.5 -0.29 -0.3 -0.27 -0.4 -0.01 -0.02
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Spov3_chr5.04524 (NF-YB10)
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Spov3_chr6.01617 (EMB1401)
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.