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Heatmap: Cluster_44 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
0.02 0.1 0.41 0.98 0.36 -0.41 -1.42 -0.05 0.11 -0.19 -0.28 0.03 -1.52 -0.34 -0.44 -0.49 -0.2 0.4 -0.73 -0.83 -0.05 -0.59 -1.04 -0.53 -0.17 0.05 -0.16 0.41 0.92 1.41
0.13 0.31 0.11 0.23 0.1 -0.13 -0.3 0.22 -0.13 -0.12 -0.01 0.04 0.06 -0.04 -0.24 -0.0 -0.26 0.24 -0.4 -0.32 -0.14 -0.17 -0.15 -0.15 -0.32 -0.09 -0.27 0.17 0.39 0.62
0.23 0.27 0.2 0.01 -0.29 -0.2 -0.25 0.15 -0.15 0.12 -0.19 -0.09 -0.5 0.5 0.01 -0.19 -0.33 0.15 -0.35 -0.45 -0.17 -0.06 0.43 0.05 -0.32 -0.17 -0.23 0.41 0.45 0.17
0.3 0.2 0.12 0.47 0.02 0.01 -0.35 0.57 0.01 -0.1 -0.33 -0.39 -0.28 0.18 -0.22 -0.18 -0.12 -0.17 -0.33 -0.42 -0.24 -0.43 0.11 -0.36 -0.24 -0.09 -0.1 -0.01 0.63 0.67
0.33 0.25 -0.13 0.03 0.18 -0.09 -0.15 0.13 -0.39 -0.02 -0.27 -0.16 -0.28 0.46 -0.21 -0.19 0.02 0.43 -0.42 -0.41 -0.14 -0.19 -0.13 -0.04 -0.03 -0.09 -0.04 0.06 0.38 0.45
0.09 0.18 0.32 0.57 0.27 -0.31 -0.42 0.4 0.05 -0.33 -0.08 -0.14 -0.04 -0.3 -0.47 -0.19 -0.07 0.08 -0.33 -0.5 -0.13 -0.06 0.02 -0.4 -0.08 -0.15 -0.15 0.35 0.44 0.46
0.24 0.34 0.02 0.03 0.09 -0.07 0.04 0.27 0.04 0.08 -0.08 -0.02 -0.01 0.07 -0.19 -0.0 0.02 -0.1 -0.33 -0.33 -0.18 -0.0 -0.43 -0.12 -0.08 -0.07 -0.24 0.24 0.16 0.26
0.1 0.54 0.74 0.88 -0.17 -0.38 -0.66 0.27 -0.0 -0.06 -0.16 -0.46 -0.41 -0.29 -0.53 -0.28 -0.11 -0.05 -0.24 -0.35 -0.07 -0.33 -0.15 -0.49 -1.12 -0.08 -0.04 0.75 0.49 0.55
0.51 -0.11 0.05 0.67 -0.58 -0.25 -0.56 0.36 -0.03 -0.29 -0.14 -0.33 -0.45 0.98 -0.49 -0.34 -0.23 0.2 -0.59 -0.59 -0.4 -0.52 0.05 -0.29 -0.44 -0.53 -0.67 0.51 1.19 0.52
0.17 0.46 -0.05 -0.19 0.04 0.14 0.2 0.4 -0.16 -0.34 -0.16 -0.02 -0.2 0.69 0.11 0.05 -0.14 -0.17 -0.22 -0.46 -0.27 -0.31 -0.3 -0.08 -0.22 -0.15 -0.02 0.03 0.18 0.28
0.08 0.38 0.42 0.62 0.19 -0.39 -1.09 -0.07 -0.11 0.3 -0.39 -0.14 -0.65 0.23 -0.4 -0.32 -0.12 0.52 -0.53 -1.02 -0.07 -0.5 -0.89 -0.48 -0.43 -0.26 0.03 0.49 0.73 1.08
-0.46 0.0 0.32 0.81 0.11 -0.15 -1.11 -0.26 0.16 0.32 0.1 -0.09 -0.46 -0.02 -0.79 -0.69 0.08 -0.85 -0.92 -0.26 0.48 -1.03 -1.61 -0.34 -0.37 0.1 -0.22 0.4 0.78 1.57
0.28 0.37 0.27 0.14 0.28 0.1 -0.34 -0.14 -0.59 -0.41 -0.3 -0.23 -0.31 0.82 0.46 -0.02 0.2 -0.16 -0.86 -0.67 0.06 0.15 -0.42 -0.43 -0.01 -0.4 -0.2 -0.12 0.16 0.73
0.25 0.29 0.1 -0.03 0.26 0.12 0.1 0.28 -0.16 -0.13 -0.11 -0.09 -0.18 -0.02 -0.05 -0.03 0.02 -0.17 -0.1 -0.29 -0.09 -0.05 -0.2 -0.03 -0.1 -0.17 -0.28 0.34 0.2 0.03
-0.16 -0.01 0.54 0.86 0.09 -0.07 -0.78 0.5 -0.17 -0.02 -0.13 -0.29 -0.65 -0.95 -0.54 -0.98 0.25 0.03 -0.65 -0.92 0.03 -0.23 -0.74 -0.52 -0.52 0.01 0.03 0.56 0.95 1.14
-0.24 -0.09 0.24 0.76 -0.1 -0.46 -1.26 0.31 -0.03 0.26 -0.12 0.1 -0.34 0.1 -0.29 -0.18 -0.0 0.37 -0.49 -0.33 -0.07 -0.37 -0.67 -0.28 -0.33 0.12 0.26 0.41 0.36 0.71
0.15 0.19 0.16 0.34 0.02 0.04 -0.13 0.15 0.06 0.06 -0.12 0.04 -0.09 0.04 0.03 -0.05 -0.0 -0.05 -0.27 -0.29 -0.05 -0.19 -0.33 -0.12 -0.14 -0.02 0.1 -0.01 0.13 0.15
0.26 0.38 0.4 0.86 0.59 -0.57 -1.3 -0.18 -0.24 0.16 -0.17 -0.57 -0.41 0.37 -0.91 -0.26 0.16 0.38 -0.72 -0.74 -0.71 -0.49 -0.63 -0.93 -0.27 0.01 0.52 0.53 0.34 0.89
0.02 0.09 -0.02 0.7 -0.12 -0.25 -0.92 0.16 -0.28 0.03 -0.04 -0.08 -0.05 0.08 -0.34 -0.01 0.1 0.13 -0.52 -0.84 -0.08 -0.35 0.09 -0.64 -0.25 -0.02 0.19 0.08 0.34 1.13
0.09 0.19 0.17 0.46 0.07 0.02 -0.66 -0.02 -0.21 -0.05 -0.24 -0.13 -0.28 -0.03 -0.13 -0.03 0.19 0.43 -0.17 -0.54 -0.26 -0.46 0.11 -0.42 -0.13 0.15 0.06 -0.0 0.19 0.75
-0.02 0.25 -0.18 0.48 -0.1 -0.15 -0.59 0.53 -0.05 0.34 -0.09 0.02 -0.05 0.06 0.09 0.07 0.18 -0.14 -0.94 -0.53 -0.12 -0.47 -0.0 -0.51 -0.43 0.08 0.1 0.07 0.39 0.54
0.39 0.01 0.39 0.82 0.1 -0.28 -1.25 -0.27 -0.2 0.07 -0.09 -0.42 -0.39 -0.8 -0.86 -0.19 0.16 -0.25 -0.33 -0.99 0.15 -0.83 -1.04 -0.17 -0.01 0.21 0.39 0.21 0.79 1.28
0.1 0.29 0.08 0.18 -0.01 0.02 -0.14 0.13 -0.23 -0.33 -0.19 -0.26 -0.06 0.5 0.35 0.23 0.18 0.21 -0.35 -0.51 -0.16 -0.16 -0.11 -0.2 -0.24 -0.24 -0.18 0.08 0.14 0.29
0.4 0.34 -0.04 0.49 -0.03 -0.46 -0.53 -0.39 -0.2 0.0 -0.25 -0.2 -0.07 0.43 -0.07 -0.19 -0.25 0.53 -0.44 -0.49 -0.13 -0.13 0.3 -0.21 -0.08 -0.08 0.07 0.19 0.21 0.34
-0.06 -0.07 0.2 0.27 0.09 -0.03 -0.58 0.1 -0.15 -0.1 -0.08 -0.15 -0.34 0.24 -0.04 -0.02 0.18 0.16 -0.28 -0.37 0.21 -0.19 -0.77 -0.35 -0.19 0.14 0.19 0.16 0.26 0.73
0.12 0.23 0.16 0.22 0.07 -0.12 -0.34 0.06 -0.03 0.18 -0.04 -0.04 0.04 -0.1 -0.0 0.02 0.12 0.11 -0.19 -0.25 -0.14 -0.29 -0.06 -0.25 -0.16 -0.04 0.05 0.07 0.18 0.18
0.03 0.34 0.11 0.67 -0.32 -0.39 -0.43 -0.01 -0.07 -0.14 -0.24 -0.11 0.01 -0.23 -0.07 0.11 0.21 -0.24 -0.47 -0.4 0.04 -0.06 -0.33 -0.34 0.16 0.04 0.29 0.15 0.25 0.58
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0.14 -0.13 0.29 0.42 -0.06 0.06 -0.63 0.43 0.36 -0.01 0.02 -0.09 -0.39 0.93 -0.1 0.06 -0.08 -0.4 -0.6 -0.61 -0.32 -0.3 -0.54 -0.79 -0.65 0.0 -0.09 -0.11 0.37 0.89
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0.43 0.42 0.27 0.37 -0.08 -0.25 -0.14 0.2 0.08 0.06 -0.08 -0.07 -0.15 -0.06 -0.17 -0.09 -0.1 -0.51 -0.7 -0.65 -0.15 -0.12 -0.22 -0.12 0.04 -0.08 0.15 0.26 0.35 0.33
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0.66 0.56 0.35 0.19 0.06 0.32 -0.17 -0.19 -0.57 -0.93 -0.7 -0.37 0.06 1.12 -0.23 -0.82 -0.2 0.32 -0.41 -1.08 -0.34 -0.45 -0.39 -0.2 -0.67 -0.36 -0.55 0.36 0.54 0.95
Spov3_chr3.00249 (NADP-ME3)
 0.35 0.29 0.06 -0.13 0.3 -0.02 -0.15 0.28 -0.07 0.16 -0.23 -0.19 0.1 0.31 -0.12 0.08 -0.08 0.2 -0.42 -0.55 -0.25 -0.01 -0.41 -0.32 -0.34 -0.09 -0.12 0.2 0.21 0.33
0.21 0.18 -0.05 0.08 -0.04 0.08 -0.06 0.09 -0.11 -0.06 0.1 -0.16 0.03 0.46 0.12 0.07 0.04 -0.03 -0.3 -0.29 -0.23 -0.03 -0.28 -0.04 -0.18 -0.21 -0.23 0.08 0.24 0.22
-0.03 -0.03 0.34 0.46 0.02 -0.32 -0.88 0.23 -0.05 -0.06 -0.32 -0.32 -0.5 0.37 0.1 -0.66 -0.2 0.09 0.08 -0.54 0.16 0.12 -0.38 -0.52 -0.42 0.11 0.41 -0.08 0.5 0.83
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0.3 0.42 0.13 0.6 -0.23 -0.01 -0.68 0.29 -0.24 -0.24 -0.21 -0.01 -0.22 0.4 0.05 0.45 0.1 -0.31 -0.61 -0.59 -0.15 -0.25 0.09 -0.53 -0.31 -0.18 -0.2 0.03 0.21 0.64
0.16 0.32 0.43 0.66 0.11 -0.37 -0.65 0.26 -0.05 -0.14 -0.24 -0.43 -0.09 -0.4 -0.37 0.03 -0.2 0.07 -0.62 -0.64 -0.03 -0.33 0.11 0.03 -0.53 0.08 0.08 0.34 0.58 0.5
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0.21 0.18 -0.18 0.37 0.07 -0.08 -0.44 -0.44 -0.3 0.03 -0.32 -0.24 -0.22 0.22 -0.12 0.07 0.06 0.53 -0.56 -0.45 0.02 0.02 -0.14 -0.26 -0.19 0.27 0.19 0.16 0.06 0.62
0.01 -0.1 -0.06 0.34 -0.3 -0.27 -0.34 0.15 -0.02 -0.16 0.03 0.08 0.2 -0.16 0.15 0.14 0.24 0.55 -0.12 -0.16 -0.08 -0.27 0.25 -0.23 -0.12 -0.01 0.1 0.04 -0.26 -0.07
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-0.01 0.17 0.01 0.46 -1.01 -0.53 -0.57 -0.34 -0.02 -0.28 -0.07 -0.34 0.35 -0.09 0.3 0.3 0.38 0.61 -0.2 -0.2 -0.05 0.02 0.54 -0.22 -0.18 -0.05 0.01 -0.37 -0.42 0.48
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Spov3_chr6.02940 (AtNPC1 - 1)
 -0.01 -0.02 0.02 0.49 0.22 -0.3 -0.27 0.03 0.16 -0.0 0.04 0.09 -0.04 0.12 -0.01 -0.15 0.08 -0.04 -0.26 -0.31 -0.33 -0.27 -0.34 -0.43 0.01 0.12 0.16 0.14 0.15 0.44
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Spov3_S08.00054 (ALADIN)
 0.02 0.1 0.3 0.62 -0.03 -0.19 -0.37 -0.3 -0.0 0.05 -0.04 -0.09 0.02 -0.12 0.03 -0.05 0.03 -0.17 -0.18 -0.22 0.01 -0.12 -0.46 -0.26 -0.07 0.17 0.21 0.13 0.19 0.33

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.