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Heatmap: Cluster_148 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
-0.53 0.19 -0.67 -0.94 0.62 0.7 -0.36 -0.35 -1.18 -0.67 -0.57 0.19 -0.25 1.98 0.19 -0.19 0.12 0.29 -0.29 0.11 -0.14 -0.62 -2.56 0.09 -0.91 -0.32 -0.26 -0.56 0.28 0.63
-1.23 -1.24 -1.26 -1.95 0.6 1.21 0.36 0.31 -0.35 -0.27 -0.36 -0.13 0.21 1.15 0.71 0.64 0.31 0.24 -0.25 -0.15 -0.09 -0.07 -1.2 -0.33 -0.52 -0.56 -0.53 -0.09 -0.25 0.18
-0.79 -1.09 -1.13 -1.48 0.08 0.9 0.2 0.54 -0.29 -0.54 -0.32 0.02 0.44 0.95 0.77 0.64 0.34 0.26 -0.24 0.02 -0.05 0.18 -1.19 -0.11 -0.56 -0.26 -0.7 -0.36 -0.13 0.22
0.11 -0.08 -0.25 -0.49 0.47 0.72 -0.05 -0.19 -0.32 -0.37 -0.4 -0.26 -0.29 1.57 0.45 0.1 -0.27 -1.28 -0.49 -0.62 -0.27 -0.2 -0.34 0.39 -0.41 -0.18 -0.35 0.29 0.18 -0.04
0.24 0.09 -0.3 -0.82 0.24 0.91 0.47 -0.17 -0.45 0.01 -0.16 -0.81 -0.05 1.23 0.57 0.42 0.04 -0.52 -0.38 -0.6 -0.62 -0.33 -0.09 -0.01 -0.42 -0.14 -0.25 -0.27 -0.23 -0.02
-0.59 -0.42 -0.86 -1.28 -1.41 0.9 0.43 -0.18 -0.76 -0.92 -0.37 -0.08 0.01 1.95 0.95 0.6 0.61 -1.24 0.02 -0.06 0.04 0.08 -1.02 0.07 -0.47 -0.12 -0.36 -0.98 -0.99 0.03
0.15 0.18 -0.29 -0.96 0.26 0.72 0.54 -0.56 -0.15 -0.16 -0.28 -0.1 -0.14 1.12 0.59 0.33 -0.08 -1.01 -0.26 -0.06 -0.12 -0.17 -0.68 0.02 -0.13 -0.08 -0.15 -0.23 0.13 -0.62
0.14 0.06 -0.38 -0.61 0.5 0.31 0.13 -0.37 -0.23 -0.07 -0.23 -0.23 0.04 1.15 0.28 0.24 0.1 -0.29 -0.11 -0.33 -0.03 -0.16 -0.73 0.03 -0.26 -0.06 -0.27 -0.08 0.01 0.11
0.26 0.23 -0.45 -0.85 0.13 0.46 0.14 -0.3 -0.43 -0.1 -0.27 0.07 -0.34 1.13 0.31 0.19 0.09 -1.62 -0.21 -0.19 0.04 0.06 -0.42 0.25 -0.27 0.09 -0.06 0.05 -0.0 0.03
-1.1 -0.97 -2.54 -4.15 -3.68 1.3 0.94 -0.64 -1.23 -1.16 -0.44 0.08 -0.17 2.54 1.15 0.71 0.44 -3.24 -0.28 0.28 -0.15 0.09 -2.57 0.38 -0.66 -0.68 -0.76 -2.17 -1.93 0.26
0.14 0.24 -0.35 -0.7 0.1 -0.03 0.07 -0.02 -0.18 -0.04 -0.21 0.01 -0.51 1.4 0.51 0.18 0.23 -0.79 -0.26 -0.24 -0.06 -0.04 -0.82 -0.11 -0.28 -0.02 -0.04 -0.22 0.21 -0.1
-0.22 -0.16 -0.49 -0.59 0.2 0.71 0.08 -0.24 -0.23 -0.06 -0.27 -0.06 -0.17 0.97 0.64 0.54 0.4 -0.4 -0.36 -0.48 -0.13 -0.17 0.13 -0.0 -0.32 -0.24 -0.3 -0.08 0.07 -0.34
Spov3_chr1.00355 (SEIPIN1)
 0.31 0.27 -0.28 -0.56 0.41 0.22 -0.27 -0.3 -0.11 -0.03 -0.3 -0.08 0.21 1.15 0.45 0.41 0.4 -1.07 -0.14 -0.15 -0.18 -0.19 -0.56 0.08 -0.24 -0.14 -0.22 0.06 -0.58 -0.41
-0.75 -0.87 -0.4 -0.46 -0.21 0.81 0.22 -0.28 -0.2 -0.74 -0.27 -0.01 -1.85 0.59 0.71 0.1 0.69 1.89 -0.49 -0.45 -0.76 0.18 -3.96 0.22 -0.63 -0.76 -0.93 -1.55 -0.34 1.24
-0.09 0.01 -0.53 -1.09 0.5 0.21 0.03 0.36 -0.42 -0.27 -0.22 -0.11 0.11 1.13 0.46 0.28 0.32 -0.66 -0.36 -0.28 -0.22 -0.15 -0.65 -0.01 -0.3 -0.15 -0.25 0.21 0.14 0.14
0.5 0.02 -0.62 -0.85 -0.15 0.97 0.41 -1.12 -0.33 -0.44 -0.42 -0.08 -0.62 1.16 0.98 0.65 0.63 -1.7 -0.18 -0.06 0.06 0.55 -0.88 0.23 -0.32 -0.28 -0.44 -0.99 -0.43 -0.87
0.24 0.31 -0.51 -0.03 0.27 0.36 0.17 0.3 -0.32 -0.12 -0.29 -0.02 -0.17 1.1 0.69 0.25 0.27 0.19 -0.8 -0.58 -0.83 -0.73 -0.24 -0.44 -0.34 -0.57 -0.44 -0.2 0.22 0.14
Spov3_chr1.02478 (CYCLASE2)
 -0.03 0.9 -0.11 -0.26 0.15 -0.07 -0.26 -0.76 -0.28 0.19 0.02 0.35 -0.54 1.81 0.01 0.18 -0.23 0.38 -0.82 -0.99 0.1 -1.08 -0.37 0.16 -1.17 -0.42 -0.2 -0.44 -0.0 -0.21
-0.11 -0.08 -0.3 -0.58 -0.04 0.32 0.18 -0.03 -0.25 -0.2 -0.14 -0.07 0.06 1.08 0.37 0.31 0.3 -0.5 0.0 0.09 0.03 0.01 -0.56 -0.02 -0.2 0.04 -0.01 -0.23 -0.42 -0.21
-0.01 0.07 -0.27 -0.54 -0.17 0.43 0.32 0.04 -0.16 -0.15 -0.14 0.06 -0.16 1.06 0.21 0.13 -0.02 -0.36 -0.09 -0.02 -0.01 0.04 -0.98 0.04 -0.25 -0.04 -0.15 -0.05 -0.08 0.09
0.06 0.1 -0.25 -0.39 0.37 0.2 0.04 -0.46 -0.3 -0.2 -0.32 -0.15 -0.11 0.83 0.23 0.33 0.18 0.08 -0.11 -0.13 0.02 -0.1 -0.06 -0.08 -0.19 -0.07 -0.08 -0.14 -0.29 0.26
0.08 0.0 -0.18 -0.58 0.43 0.49 0.21 -0.28 -0.29 0.18 -0.3 -0.21 -0.47 0.99 0.43 0.29 -0.01 -0.58 -0.06 -0.36 -0.05 -0.1 -0.29 0.09 -0.1 -0.11 -0.44 0.06 0.23 -0.36
-0.03 0.08 -0.65 -1.65 0.62 0.9 -0.07 -0.32 -0.74 -0.5 -0.44 -0.35 -0.21 1.34 0.51 0.22 0.15 -0.97 -0.1 -0.28 -0.14 -0.15 -0.43 0.1 -0.29 -0.15 -0.28 0.12 -0.05 0.51
-0.02 0.08 -0.36 -0.9 -0.44 0.6 0.41 -0.24 -0.15 -0.18 -0.13 0.05 0.12 1.47 0.47 0.42 0.15 -0.29 -0.16 -0.09 -0.25 -0.1 -1.72 -0.08 -0.5 -0.32 -0.48 -0.5 -0.01 0.23
-0.08 -0.21 -0.37 -0.62 0.27 0.26 -0.1 -1.0 0.2 0.3 0.14 0.34 -0.4 1.37 0.38 0.02 -0.35 -0.79 -0.18 -0.01 -0.19 -0.15 -0.12 0.11 -0.49 -0.23 -0.17 -0.09 0.32 -0.24
0.45 0.09 -0.71 -1.55 -0.22 0.72 0.54 -0.65 -0.37 -0.4 -0.31 -0.02 -0.33 1.34 0.34 0.24 0.09 -0.61 -0.23 -0.19 -0.15 -0.01 -0.82 0.57 -0.03 -0.23 -0.46 0.2 0.18 -0.53
0.01 -0.08 -0.46 -0.84 -1.28 0.56 0.38 -0.74 -0.77 -1.07 -0.13 0.17 0.08 1.92 1.03 0.42 0.22 -2.86 0.02 0.14 0.12 0.47 -0.54 0.24 -0.68 -0.52 -0.54 -0.58 -0.7 -0.71
0.13 0.05 -0.22 -0.27 0.23 0.37 0.03 -0.14 -0.13 -0.15 -0.26 -0.14 0.0 0.7 0.37 0.3 0.07 -0.07 -0.24 -0.32 -0.06 -0.17 0.08 -0.08 -0.3 -0.23 -0.28 0.11 0.09 -0.05
-0.12 0.01 -0.46 -1.17 -0.12 0.38 0.22 0.15 -0.01 0.08 -0.19 0.17 -0.28 1.53 0.25 0.13 -0.09 -0.53 -0.23 -0.1 -0.01 0.14 -1.3 0.02 -0.33 -0.05 -0.26 0.07 -0.04 -0.32
-0.55 -0.53 -1.01 -1.32 0.16 1.08 0.15 -0.92 -0.72 -0.51 -0.26 -0.23 -0.36 1.88 0.83 0.69 0.56 -0.5 -0.44 -0.47 0.0 -0.11 -0.15 -0.01 -0.32 0.03 -0.2 -0.74 -0.9 -0.5
Spov3_chr2.00140 (AtNHR2A)
 -0.02 -0.05 -0.54 -0.76 -0.4 0.39 0.36 -0.42 -0.2 -0.18 0.09 0.2 0.41 0.85 0.31 0.09 0.03 -0.25 -0.21 -0.04 -0.29 -0.06 -0.31 0.28 -0.28 -0.12 -0.13 -0.46 -0.24 0.61
0.25 0.25 -0.27 -0.85 -0.24 0.6 0.32 -0.82 0.06 0.05 0.12 0.37 -0.43 0.56 0.48 0.26 0.11 -0.33 -0.03 -0.04 0.04 0.12 -0.88 0.16 -0.24 -0.01 -0.11 -0.22 -0.26 -0.44
-0.57 -0.86 -2.41 -5.04 -0.5 1.63 0.49 -1.38 -1.95 -1.12 -0.26 -0.14 0.86 2.28 1.04 0.27 -0.27 0.7 -0.27 -0.27 -0.28 -0.14 -0.71 -0.55 -1.07 -0.32 -0.51 -0.51 -1.99 -1.04
0.09 0.16 -0.29 -0.58 0.04 0.32 -0.03 -0.46 -0.17 -0.09 -0.19 -0.06 -0.52 1.04 0.29 0.21 0.13 -0.03 -0.0 -0.0 0.1 0.05 -0.51 0.04 -0.17 0.08 0.03 -0.15 -0.16 -0.18
-0.03 0.55 -0.48 -1.01 0.7 0.98 -0.08 -0.91 -0.65 -0.17 -0.64 -0.42 -0.48 1.86 0.15 0.32 0.02 -0.79 -0.41 -0.53 -0.01 -0.15 -1.02 -0.13 -0.69 -0.11 -0.41 -0.34 -0.36 0.51
-0.3 -0.32 -0.8 -1.32 0.03 0.39 0.39 -0.36 -0.44 -0.52 -0.11 0.02 0.1 1.39 0.49 0.34 0.31 -0.66 0.19 0.26 0.13 0.33 -0.82 0.27 -0.12 -0.04 -0.14 -0.43 -0.59 -0.52
0.43 0.23 -0.05 -0.18 0.22 0.56 0.38 -0.51 -0.5 -0.27 -0.14 -0.21 -0.11 0.83 0.37 0.34 0.27 -0.9 -0.05 -0.14 0.06 0.06 -0.46 -0.04 -0.19 -0.03 -0.13 -0.44 -0.41 -0.38
0.27 0.35 -0.21 -0.73 0.4 0.41 -0.14 -1.14 0.01 0.07 0.06 0.45 -0.46 1.46 0.17 0.19 -0.13 0.34 -0.23 -0.12 -0.14 -0.22 -0.34 0.13 -0.64 -0.45 -0.77 -0.3 -0.38 -0.53
0.18 0.11 -0.21 -0.56 -0.12 0.15 0.14 -0.47 -0.06 -0.01 0.04 0.16 0.13 0.23 0.37 0.2 0.09 0.02 -0.01 0.03 0.12 0.23 -0.36 -0.14 -0.1 0.01 0.04 -0.22 -0.24 -0.19
-0.19 -0.22 -0.67 -0.88 0.16 0.58 0.06 -1.16 0.09 0.1 -0.05 0.29 -0.35 0.86 0.43 0.54 0.1 -0.06 0.11 0.06 -0.09 -0.03 -0.87 0.31 -0.04 -0.1 -0.19 -0.72 -0.01 0.07
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0.14 0.22 -0.06 -0.11 0.12 -0.19 -0.06 -0.08 -0.16 -0.07 0.12 0.06 -0.45 1.09 0.0 -0.07 0.19 -0.24 -0.15 -0.1 -0.08 -0.05 -0.87 -0.25 -0.01 0.14 0.07 0.24 -0.06 -0.37
0.07 0.03 -0.08 -0.1 0.13 0.09 0.13 0.06 -0.13 -0.09 -0.1 -0.02 -0.03 0.61 0.21 0.2 0.14 -0.42 -0.05 -0.02 -0.04 -0.01 -0.45 -0.16 -0.08 0.01 -0.01 -0.09 -0.1 -0.08
0.08 0.16 -0.05 -0.14 -0.03 0.01 -0.04 -0.03 -0.03 -0.1 -0.01 0.04 0.03 0.68 0.35 0.27 0.29 -0.45 -0.16 -0.17 -0.09 -0.01 -0.5 -0.05 -0.09 -0.06 -0.06 0.01 -0.15 -0.2
-0.04 0.06 -0.25 -0.07 -0.1 -0.04 0.03 0.14 0.02 0.01 -0.01 0.14 -0.52 1.09 0.21 0.18 0.21 -0.55 -0.14 -0.29 0.01 -0.04 -0.81 -0.02 -0.11 0.01 -0.09 0.23 -0.06 -0.3
0.01 0.2 -0.46 -0.88 0.06 0.31 -0.06 -0.17 0.16 0.17 -0.41 0.01 -0.36 1.09 0.5 0.19 0.16 -0.14 -0.12 -0.31 0.14 -0.23 -0.22 -0.12 -0.35 -0.07 0.07 -0.07 -0.03 -0.33
0.22 0.21 -0.05 -0.36 0.33 0.35 -0.03 -0.4 0.01 0.05 -0.05 0.05 -0.33 0.73 -0.08 -0.06 -0.15 0.5 -0.3 -0.07 -0.09 -0.07 0.18 -0.02 -0.07 -0.19 -0.42 -0.01 -0.21 -0.43
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-0.23 -0.07 -0.46 -0.86 0.31 0.69 0.15 -0.42 -0.33 -0.1 -0.24 -0.17 -0.05 0.56 0.39 0.36 0.27 0.17 -0.22 -0.18 0.04 0.03 0.1 -0.01 -0.23 0.09 -0.12 -0.23 -0.37 0.07

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.