1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_109 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
0.3 0.34 -0.1 -0.28 0.4 -0.44 -0.78 -0.5 -0.33 -0.0 -0.37 -0.34 0.11 1.2 -0.34 -0.49 -0.46 0.85 -0.16 -0.32 0.06 -0.07 0.49 -0.11 -0.02 -0.09 0.23 0.0 -0.27 -0.54
-0.33 -0.47 -0.76 -0.72 0.86 -0.4 -0.62 -0.58 -0.19 0.13 -0.51 -0.37 0.33 1.07 -0.39 -0.56 -0.57 1.08 -0.36 -0.31 -0.13 -0.31 1.15 -0.07 -0.08 0.08 0.17 0.33 -0.34 -0.47
0.1 0.03 -0.14 -0.21 0.36 -0.19 -0.34 -0.12 -0.08 0.19 0.17 -0.08 -0.1 0.88 -0.07 -0.0 -0.1 -0.83 -0.23 -0.16 -0.12 -0.11 0.42 -0.02 -0.01 0.14 0.1 0.05 0.01 -0.42
0.07 0.28 0.01 0.05 0.27 -0.28 -0.3 -0.11 -0.18 0.06 -0.13 -0.19 -0.07 0.61 -0.09 -0.05 -0.03 0.01 -0.02 -0.08 -0.01 -0.13 0.35 -0.05 -0.14 -0.06 0.03 0.09 -0.07 -0.23
0.24 -0.1 -0.31 0.18 0.52 -0.34 -0.52 -0.51 -0.18 0.12 -0.11 -0.37 0.44 0.68 -0.19 -0.14 -0.24 0.67 -0.27 -0.31 -0.08 -0.23 0.28 -0.0 -0.04 -0.04 0.16 0.15 -0.21 -0.35
0.19 0.24 -0.04 0.07 0.28 -0.28 -0.36 -0.09 -0.28 0.0 -0.18 -0.01 0.22 0.42 -0.04 -0.08 -0.07 0.26 -0.28 -0.26 -0.19 -0.11 0.17 0.02 -0.04 -0.11 0.05 0.15 0.08 -0.14
0.27 0.29 -0.12 -0.17 0.4 -0.21 0.01 -0.31 -0.38 0.03 -0.23 -0.2 -0.06 0.31 -0.05 -0.21 -0.24 0.14 -0.08 -0.37 0.01 0.01 0.36 0.13 0.05 0.05 0.24 0.42 0.02 -0.82
0.07 0.03 -0.09 -0.09 0.34 -0.16 -0.05 0.11 -0.07 0.04 -0.12 -0.23 0.11 0.34 -0.0 -0.12 0.09 0.31 -0.26 -0.17 -0.26 -0.17 0.58 -0.16 -0.12 -0.21 0.03 0.15 0.05 -0.43
-0.34 0.08 -0.24 -0.14 0.67 -0.93 -1.04 -0.36 -0.36 0.36 -0.39 -0.74 0.3 1.19 -0.65 -0.61 -1.1 1.28 -0.33 -0.58 -0.22 -0.25 0.36 -0.07 -0.04 -0.17 0.08 0.7 0.17 -0.27
0.02 -0.11 -0.0 -0.04 0.14 -0.14 0.01 0.0 0.05 -0.03 -0.07 -0.12 -0.03 0.62 0.06 0.0 0.12 -0.5 -0.07 -0.04 0.03 -0.08 0.15 -0.11 -0.25 0.07 0.03 0.1 0.04 -0.17
0.08 0.08 -0.07 0.0 0.05 -0.12 -0.18 -0.09 -0.19 -0.01 -0.11 -0.17 0.03 0.61 0.1 0.04 0.11 -0.21 -0.19 -0.26 -0.0 -0.08 -0.08 0.14 0.03 0.02 0.07 0.12 0.14 -0.13
0.2 0.26 -0.09 -0.04 0.34 -0.2 -0.08 -0.1 -0.23 -0.1 -0.13 -0.12 0.06 0.72 0.08 -0.01 0.09 -0.36 -0.15 -0.17 -0.17 -0.05 -0.04 0.04 0.06 -0.11 0.07 0.37 -0.06 -0.72
Spov3_chr1.04946 (CASPL4A3)
 0.15 0.07 -0.03 0.06 0.55 -0.16 -0.43 -0.4 -0.25 -0.0 -0.18 -0.16 0.06 0.49 0.16 -0.05 0.03 0.28 -0.2 -0.22 -0.21 -0.19 0.16 -0.05 -0.14 -0.17 -0.04 0.22 0.27 -0.19
Spov3_chr1.05162 (EMB2247)
 0.24 0.15 -0.13 0.0 0.03 -0.09 -0.1 0.01 -0.18 -0.03 -0.29 -0.12 0.0 0.59 0.07 0.0 -0.04 -0.15 -0.17 -0.26 -0.01 -0.09 0.27 0.01 0.02 -0.03 0.0 0.22 0.05 -0.31
0.17 0.44 -0.47 -0.12 0.35 -0.49 -0.45 -0.31 -0.62 -0.23 -0.17 -0.34 0.24 0.48 -0.4 -0.2 -0.42 0.4 -0.35 -0.63 0.13 0.13 0.29 0.54 0.32 0.1 0.17 0.44 0.18 -0.57
0.12 0.62 -0.28 -0.55 0.59 -0.47 -0.57 -0.57 -0.92 0.42 -0.38 -0.43 0.16 0.95 -0.77 -0.09 -0.64 1.55 -0.29 -0.79 -0.8 -0.19 -0.51 -0.33 -0.01 0.16 0.13 0.11 -0.33 0.43
-0.02 -0.01 -0.08 -0.1 0.22 -0.13 -0.16 -0.08 -0.2 0.07 -0.1 -0.19 -0.0 0.38 -0.01 -0.06 -0.13 0.38 -0.08 -0.08 0.01 -0.06 0.42 0.01 0.0 0.04 0.04 -0.02 -0.03 -0.33
0.19 0.15 0.05 -0.06 -0.06 -0.29 -0.1 0.09 0.18 0.33 -0.03 -0.08 -0.18 0.43 -0.08 -0.16 -0.15 0.11 -0.07 -0.12 0.01 -0.08 0.07 -0.07 -0.1 0.03 0.09 0.02 -0.05 -0.34
-0.15 0.04 -0.29 -0.47 0.2 -0.66 -0.51 0.01 -0.2 0.34 -0.61 -0.76 0.22 0.79 -0.03 -0.25 -0.36 1.36 -0.61 -0.87 -0.18 -0.28 0.75 -0.03 -0.15 -0.08 0.11 0.22 -0.23 0.11
0.03 0.0 -0.17 0.01 0.2 -0.08 -0.16 -0.13 -0.05 0.02 -0.1 -0.07 0.14 0.56 0.1 0.09 -0.04 0.26 -0.14 -0.28 -0.04 -0.14 0.17 -0.08 -0.14 -0.06 0.01 0.07 -0.02 -0.27
0.34 0.39 -0.12 0.03 0.27 -0.54 -0.43 -0.27 -0.39 0.03 -0.23 -0.32 0.26 0.52 -0.27 -0.11 -0.25 0.46 -0.05 -0.42 -0.06 -0.23 0.47 0.09 0.0 -0.15 0.09 0.18 0.16 -0.36
0.12 0.03 -0.08 -0.05 0.26 -0.1 -0.17 -0.09 -0.08 0.08 -0.18 -0.21 0.08 0.33 -0.03 -0.17 -0.19 0.41 -0.07 -0.06 -0.01 -0.11 0.3 -0.03 -0.1 -0.07 0.1 0.0 0.04 -0.22
-0.04 -0.12 -0.03 0.03 0.16 -0.15 -0.1 0.04 -0.04 -0.01 -0.05 -0.05 0.04 0.58 0.12 -0.07 -0.03 -0.06 -0.18 -0.12 -0.06 -0.08 0.26 -0.14 -0.05 -0.06 0.12 0.07 -0.08 -0.15
0.12 0.12 0.02 0.11 0.31 -0.15 -0.19 -0.11 -0.14 0.04 -0.09 -0.07 0.08 0.35 -0.25 -0.27 -0.24 0.1 -0.01 -0.14 -0.07 -0.06 0.2 -0.06 -0.07 0.01 0.1 0.16 0.13 -0.17
-0.05 -0.1 -0.1 -0.12 0.24 -0.31 -0.23 0.11 -0.3 -0.1 -0.07 -0.35 -0.0 0.34 0.02 -0.13 -0.1 0.72 -0.15 -0.21 -0.03 -0.13 0.77 -0.17 -0.02 -0.02 0.14 -0.01 -0.1 -0.28
0.01 -0.0 -0.06 0.09 0.15 -0.26 -0.21 -0.0 -0.12 0.06 -0.06 -0.19 0.02 0.45 0.04 0.01 0.05 0.19 -0.1 -0.15 -0.01 -0.1 0.34 -0.15 -0.12 -0.01 0.07 0.03 -0.04 -0.19
0.17 0.14 -0.01 -0.13 0.15 -0.24 -0.22 -0.01 -0.14 0.06 -0.13 -0.19 0.04 0.69 -0.0 0.11 0.06 -0.29 -0.16 -0.27 -0.05 -0.12 0.12 0.15 0.08 -0.05 -0.02 0.34 -0.09 -0.49
0.04 0.01 -0.07 0.02 0.25 -0.08 -0.1 -0.01 -0.05 0.12 -0.07 -0.16 0.09 0.41 -0.01 -0.07 -0.14 0.01 -0.05 -0.07 0.01 -0.06 0.17 -0.06 -0.1 0.03 0.1 0.03 -0.11 -0.28
Spov3_chr4.00654 (MAP70-2)
 0.2 0.16 -0.1 0.13 0.83 -0.25 -0.64 -0.34 -0.38 -0.09 -0.32 -0.36 0.02 0.5 -0.1 -0.19 0.0 0.44 -0.24 -0.4 -0.22 -0.2 0.09 -0.02 -0.14 -0.2 0.07 0.35 0.2 0.19
0.07 0.14 0.07 0.01 0.5 -0.11 -0.38 -0.26 -0.12 0.02 -0.21 -0.22 -0.2 0.44 -0.0 -0.07 0.14 0.39 -0.18 -0.28 -0.09 -0.08 0.12 -0.06 -0.22 -0.12 -0.03 0.29 0.21 -0.29
-0.03 -0.03 -0.03 0.02 0.25 -0.23 -0.21 -0.1 -0.05 0.09 -0.01 -0.09 0.09 0.23 -0.06 -0.16 -0.14 0.29 0.06 -0.09 -0.06 -0.03 0.25 -0.06 -0.07 0.05 0.08 0.12 -0.03 -0.26
0.25 0.25 -0.34 -0.54 0.32 -0.58 -0.67 -0.28 -0.32 0.33 -0.26 -0.47 0.19 1.17 -0.49 -0.47 -0.3 0.92 -0.34 -0.5 0.03 -0.17 -0.07 -0.1 -0.26 0.08 0.25 0.54 -0.09 -0.22
0.24 0.32 -0.04 -0.07 0.09 0.17 -0.02 0.01 -0.17 -0.07 -0.13 -0.17 -0.01 0.49 0.14 0.08 0.06 -0.38 -0.18 -0.17 -0.1 -0.09 -0.14 0.1 0.01 -0.08 -0.04 0.17 -0.05 -0.31
0.13 0.19 -0.09 -0.16 0.53 -0.11 -0.33 -0.24 -0.26 0.13 -0.15 -0.15 0.08 0.55 -0.12 -0.02 -0.12 0.42 -0.11 -0.24 -0.26 -0.13 0.26 -0.1 -0.21 -0.09 0.02 0.13 -0.03 -0.05
-0.06 -0.03 0.01 0.1 0.29 -0.08 -0.34 0.22 -0.03 0.19 -0.11 -0.22 0.16 0.68 -0.21 -0.15 0.03 0.04 -0.18 -0.11 0.03 -0.18 -0.03 -0.08 -0.06 -0.03 -0.04 0.16 0.01 -0.43
0.02 -0.03 -0.02 0.08 0.25 -0.16 -0.18 -0.08 -0.08 0.07 -0.02 -0.05 0.02 0.37 -0.06 -0.15 -0.09 0.27 -0.11 -0.17 -0.06 -0.09 0.3 -0.13 -0.08 -0.08 0.02 0.14 0.04 -0.17
0.24 0.39 -0.45 -0.84 0.64 -0.61 -0.51 -0.81 -0.5 0.23 -0.09 -0.27 0.23 0.95 0.01 0.05 0.11 -0.59 -0.05 -0.33 0.08 0.08 0.04 0.06 0.18 0.24 0.3 0.14 0.0 -0.76
0.39 0.36 -0.15 -0.67 0.77 -0.7 -0.71 -1.03 -0.55 0.02 -0.64 -0.55 0.08 1.33 -0.78 -0.82 -0.57 1.51 -0.4 -0.48 -0.17 -0.02 -0.18 -0.16 -0.06 -0.14 0.33 -0.03 0.03 -0.09
-0.07 -0.16 -0.1 -0.03 0.04 -0.46 -0.19 0.28 -0.19 -0.02 -0.18 -0.45 -0.01 0.09 -0.14 -0.13 -0.05 0.73 -0.08 -0.28 0.08 0.01 0.86 0.02 0.07 0.01 0.05 -0.26 -0.09 -0.18
0.07 0.06 -0.02 -0.0 0.18 -0.07 -0.08 0.03 -0.11 0.02 -0.13 -0.14 0.04 0.4 -0.01 -0.08 -0.1 -0.09 -0.09 -0.1 -0.01 -0.09 0.31 0.0 -0.02 0.01 -0.01 0.07 -0.01 -0.19
0.1 0.03 -0.04 0.02 0.23 -0.14 -0.08 0.04 -0.14 0.04 -0.13 -0.17 0.01 0.37 0.04 -0.11 -0.09 0.15 -0.03 -0.09 -0.1 -0.08 0.31 -0.11 -0.1 -0.11 0.02 0.17 0.02 -0.28
-0.03 0.29 -0.07 -0.42 0.42 -0.41 -0.27 0.06 0.47 0.72 -0.16 -0.09 -0.6 0.7 -0.23 -0.2 -0.28 0.52 -0.23 -0.4 -0.14 -0.12 0.48 -0.22 -0.55 0.0 -0.01 0.2 0.05 -1.12
0.25 0.35 -0.19 -0.08 0.34 -0.51 -0.27 -0.48 -0.01 0.09 -0.25 -0.42 -0.61 1.16 -0.08 -0.24 -0.37 -1.31 -0.11 -0.22 -0.3 -0.02 1.03 0.71 -0.17 0.17 0.23 0.07 -0.19 -1.58
-0.22 -0.18 -0.37 -0.25 0.47 -0.17 -0.31 -0.18 -0.21 0.1 -0.29 -0.33 0.26 0.59 -0.06 -0.11 -0.07 0.67 0.03 -0.02 0.16 0.07 0.48 -0.06 -0.13 -0.06 0.04 -0.12 -0.15 -0.4
0.13 0.21 -0.05 -0.08 0.18 -0.22 -0.22 -0.19 -0.11 0.05 -0.11 -0.11 -0.03 0.53 -0.16 0.04 0.03 0.07 -0.1 -0.22 -0.05 -0.16 0.14 0.13 0.22 0.04 0.04 0.13 -0.07 -0.39
0.14 0.08 -0.0 0.04 0.43 -0.08 -0.14 -0.11 -0.11 0.06 -0.08 -0.15 0.01 0.33 -0.01 -0.07 -0.1 0.18 -0.08 -0.16 -0.09 -0.16 0.1 -0.09 -0.07 -0.03 0.02 0.14 0.05 -0.26
-0.08 0.15 0.12 0.01 0.26 -0.42 -0.49 0.4 0.24 0.31 -0.09 -0.14 -0.25 0.52 -0.44 -0.51 -0.5 0.29 -0.01 -0.13 -0.04 -0.23 0.35 -0.32 -0.16 0.07 0.13 0.31 0.12 -0.34
0.16 0.08 0.0 -0.02 0.22 -0.16 -0.17 -0.14 -0.2 0.06 -0.1 -0.19 0.03 0.48 0.02 -0.16 -0.05 0.21 -0.02 -0.06 -0.07 -0.06 0.27 -0.13 -0.12 -0.08 0.07 0.01 0.02 -0.18
0.02 -0.03 -0.04 0.0 0.19 -0.19 -0.08 -0.06 -0.02 -0.09 0.03 -0.21 -0.02 0.41 0.12 0.11 0.07 -0.27 0.1 -0.16 -0.05 -0.06 0.38 -0.14 -0.07 0.04 0.06 -0.0 -0.1 -0.18
0.19 0.16 -0.02 -0.11 0.3 -0.18 -0.13 -0.05 -0.18 -0.15 -0.06 -0.2 0.03 0.54 0.09 -0.02 0.1 -0.06 -0.21 -0.18 -0.02 -0.17 0.04 -0.03 0.1 0.04 0.01 0.09 -0.06 -0.14
-0.12 -0.07 0.04 -0.1 0.41 -0.09 -0.26 0.23 -0.02 0.03 -0.16 -0.23 -0.11 0.38 -0.07 0.03 -0.06 0.11 -0.0 -0.15 -0.03 -0.06 0.38 -0.19 -0.05 -0.07 0.11 0.04 -0.01 -0.25
0.3 0.24 -0.03 -0.29 0.25 -0.3 -0.21 -0.32 -0.3 0.03 -0.3 -0.19 -0.41 0.67 -0.04 0.04 -0.05 -0.2 0.04 -0.26 -0.01 0.07 0.38 0.4 0.17 -0.1 0.13 0.27 -0.05 -0.83
0.02 0.17 -0.15 -0.11 0.17 -0.67 -0.92 -0.26 -0.28 0.22 -0.2 -0.31 0.39 0.63 -0.43 -0.3 -0.29 0.88 0.01 -0.1 0.1 -0.0 0.44 -0.02 -0.08 -0.05 0.14 0.16 -0.2 -0.29
-0.05 0.07 -0.09 0.01 0.11 -0.3 -0.28 -0.17 -0.24 0.06 -0.07 -0.16 0.12 0.7 0.06 -0.04 -0.05 0.46 -0.08 -0.21 0.04 -0.08 0.15 -0.09 -0.13 -0.04 0.11 -0.02 -0.07 -0.15
0.02 0.23 0.28 -0.09 0.26 -0.34 -0.41 -0.1 0.11 0.51 -0.11 -0.13 -0.05 0.95 0.24 -0.1 -0.13 -0.1 -0.11 -0.51 -0.15 -0.07 -0.21 -0.06 -0.17 -0.46 -0.26 0.08 0.32 -0.46

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.