1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_133 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
2.0 1.78 1.99 1.97 2.02 1.48 1.46 2.19 1.4 1.95 1.52 1.55 2.84 2.98 1.78 1.51 1.74 6.27 1.49 1.36 1.53 1.91 20.14 1.96 1.7 1.43 1.86 2.52 2.2 2.88
30.87 23.31 9.85 6.38 16.69 12.73 9.61 6.62 11.98 12.79 8.32 9.76 8.49 24.36 14.87 9.75 8.17 107.11 6.32 6.62 8.93 8.6 256.68 8.08 6.27 7.62 6.38 41.59 18.27 19.97
3.56 4.29 2.64 1.66 6.73 1.96 1.96 2.14 2.39 2.87 2.22 1.4 4.21 2.67 0.75 1.76 1.62 94.78 1.28 0.34 0.52 1.71 455.1 2.67 2.1 1.2 1.93 3.24 2.17 4.96
0.23 0.22 0.7 0.36 0.0 0.28 0.68 0.23 0.26 1.01 0.52 0.11 2.59 0.67 0.0 0.41 1.23 20.41 0.0 0.34 0.23 0.0 113.65 0.33 0.73 0.61 0.19 0.23 0.09 0.66
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.66 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
7.23 7.91 3.89 1.99 5.93 2.72 1.72 2.19 1.79 2.13 1.36 1.26 3.35 15.33 3.38 1.83 1.63 14.77 1.07 1.27 1.33 1.22 76.18 1.14 1.17 1.4 1.49 3.39 2.94 1.58
Spov3_chr1.05112 (UGT73B3)
 0.18 0.1 0.09 0.06 0.1 0.03 0.04 0.0 0.02 0.05 0.04 0.11 0.1 0.7 0.06 0.03 0.02 0.61 0.13 0.03 0.07 0.05 4.33 0.02 0.03 0.02 0.02 0.05 0.09 0.05
0.82 0.56 0.68 0.41 0.0 0.38 0.24 0.5 0.0 0.0 0.49 0.22 0.86 2.25 1.5 0.23 2.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.45 24.39 0.0 0.45 0.0 0.2 0.59 0.73 0.73
6.34 1.19 3.2 0.69 6.51 2.83 1.41 5.93 2.09 3.37 0.24 0.23 9.76 26.63 8.8 2.03 0.94 18.8 0.36 0.69 0.3 0.23 161.16 0.3 0.46 0.07 0.09 0.34 1.44 0.04
1.34 0.2 0.62 0.16 2.92 0.94 0.47 2.1 0.6 0.94 0.04 0.11 2.45 7.02 3.3 0.34 0.07 0.92 0.02 0.4 0.15 0.0 62.06 0.06 0.15 0.04 0.03 0.07 0.38 0.04
11.14 11.54 7.82 4.7 12.39 5.68 4.68 5.33 4.91 6.14 4.33 4.52 8.48 22.09 6.37 5.13 5.06 65.76 5.04 4.63 5.87 4.25 217.59 4.9 5.4 5.36 5.45 15.61 10.41 21.38
4.61 2.89 1.98 2.31 3.78 1.26 1.59 1.2 1.85 1.4 2.07 1.35 1.75 6.24 1.76 1.85 1.08 18.1 1.22 1.3 1.75 1.31 38.57 1.9 1.17 1.52 1.53 2.8 3.1 2.21
5.9 4.85 3.87 4.1 5.14 4.3 4.51 4.26 3.68 3.74 3.79 3.83 4.15 7.32 4.33 4.77 3.85 7.77 3.94 3.74 3.66 4.13 24.52 3.89 3.96 4.16 4.11 4.6 3.72 4.08
0.4 0.08 0.23 0.0 1.13 0.07 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.54 0.34 0.16 0.0 0.0 3.43 0.0 0.15 0.0 0.0 14.77 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
13.75 12.43 8.92 9.38 15.13 18.48 15.27 12.67 9.04 9.05 9.36 10.18 19.93 26.34 24.09 18.17 15.58 31.36 8.05 8.84 7.84 9.43 113.88 11.95 9.31 8.47 8.74 8.71 12.48 11.93
1.79 1.59 1.05 0.98 1.08 1.0 1.02 1.06 0.96 1.04 0.83 0.85 0.89 1.39 0.82 0.88 0.78 1.72 0.97 0.87 0.96 1.02 8.74 0.85 0.87 0.83 0.87 1.32 1.41 1.19
Spov3_chr2.02831 (CYP81D4)
 5.62 5.12 1.49 0.57 5.03 1.21 0.92 0.87 0.9 1.21 0.58 0.74 5.63 16.59 1.91 0.86 0.71 35.74 0.69 0.87 0.89 0.72 131.57 0.69 0.48 0.76 0.82 1.13 2.01 1.96
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 1.57 0.0 0.0 0.03 0.0 6.09 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
3.28 3.0 2.24 2.49 3.35 2.43 1.71 2.32 2.16 2.45 2.5 2.21 2.88 4.63 2.96 2.89 2.62 4.65 2.09 2.11 2.58 2.32 19.43 2.45 2.82 2.29 2.8 2.83 2.88 2.21
0.76 0.37 0.06 0.11 0.3 0.11 0.17 0.15 0.06 0.07 0.1 0.01 0.43 0.51 0.29 0.17 0.14 1.02 0.02 0.1 0.05 0.03 6.35 0.08 0.08 0.21 0.06 0.04 0.14 0.04
Spov3_chr3.01546 (AtRLCK VI_A3)
 0.57 0.63 0.55 0.85 1.29 0.57 0.46 0.48 0.43 0.66 0.66 0.52 0.96 1.64 0.58 0.66 0.87 2.54 0.75 0.4 0.51 0.81 7.99 0.89 0.67 0.63 0.65 0.74 0.83 0.44
4.82 3.62 3.84 2.86 6.86 7.62 7.49 6.24 3.55 4.36 5.73 5.09 12.74 11.82 6.71 6.27 6.01 30.55 4.97 5.55 5.03 5.61 118.11 4.77 4.44 5.6 5.47 4.51 4.77 10.92
2.97 2.31 1.65 1.47 3.37 2.29 1.85 2.37 1.83 1.99 1.21 1.27 1.69 4.12 2.31 1.87 1.61 7.31 1.29 1.4 1.51 1.23 15.52 1.58 1.31 1.66 1.68 1.84 1.75 1.23
0.21 0.24 0.44 0.08 0.5 0.33 0.1 0.11 0.02 0.13 0.18 0.27 0.53 0.28 0.14 0.26 0.2 5.32 0.21 0.31 0.08 0.17 19.28 0.29 0.06 0.08 0.04 0.1 0.38 0.4
0.42 0.15 0.15 0.18 0.22 0.07 0.23 0.12 0.23 0.15 0.13 0.06 0.16 0.7 0.26 0.1 0.15 0.2 0.12 0.13 0.05 0.13 4.01 0.13 0.17 0.05 0.07 0.13 0.12 0.12
1.87 1.75 0.46 0.52 2.05 0.38 0.5 0.41 0.34 0.57 0.36 0.3 0.59 3.08 0.79 0.47 0.33 5.76 0.37 0.28 0.45 0.42 16.84 0.5 0.27 0.43 0.5 1.16 1.11 0.57
0.21 0.11 0.0 0.03 0.43 0.05 0.04 0.12 0.07 0.0 0.03 0.08 0.17 0.38 0.06 0.01 0.06 3.52 0.0 0.06 0.0 0.0 13.0 0.03 0.01 0.01 0.05 0.14 0.25 0.09
1.03 0.24 0.08 0.17 1.83 0.2 0.17 0.28 0.28 0.26 0.04 0.15 0.83 1.82 0.34 0.18 0.11 15.67 0.11 0.14 0.15 0.11 50.67 0.15 0.1 0.16 0.27 0.1 0.63 0.09
0.43 0.37 0.23 0.32 0.49 0.36 0.25 0.17 0.25 0.41 0.23 0.18 0.36 1.02 0.49 0.29 0.42 1.14 0.25 0.29 0.33 0.24 5.67 0.28 0.22 0.23 0.23 0.17 0.27 0.24
1.31 1.91 0.43 0.36 1.52 1.13 0.42 0.39 0.31 0.44 0.19 0.17 2.75 6.68 0.88 0.6 1.37 40.95 0.17 1.0 0.34 0.46 114.1 1.6 0.54 0.86 0.25 0.57 0.55 1.27
243.89 287.49 240.97 212.4 240.77 289.18 191.29 123.1 146.56 131.54 143.1 151.28 348.21 469.29 187.23 133.74 172.06 1252.02 227.54 252.3 206.84 190.39 3991.01 179.85 141.62 200.39 169.81 297.88 212.71 701.1
0.66 0.73 0.62 0.84 2.14 0.88 0.42 1.4 0.67 0.68 0.49 0.42 0.63 2.14 0.62 0.5 0.61 5.24 0.39 0.35 0.47 0.5 19.36 0.46 0.24 0.53 0.3 1.69 1.53 1.92
2.09 2.46 1.11 0.5 4.63 3.16 1.9 2.68 1.72 2.69 1.26 1.26 1.09 6.45 1.1 1.17 0.78 6.1 1.5 1.37 1.44 1.59 30.97 1.65 0.81 1.73 1.21 2.89 2.49 1.29
0.5 0.38 0.32 0.22 0.65 0.58 0.42 0.29 0.35 0.37 0.38 0.31 0.37 0.91 0.38 0.33 0.3 1.45 0.25 0.37 0.32 0.31 4.36 0.43 0.28 0.48 0.5 0.56 0.43 0.49
2.41 2.36 1.66 1.38 3.32 2.29 1.89 2.56 1.72 1.77 1.34 1.55 1.17 3.96 1.61 1.36 1.5 5.2 1.2 1.43 1.35 1.16 26.44 1.18 0.91 1.31 1.2 2.87 1.77 1.79
3.52 2.17 4.3 3.37 4.04 1.33 1.05 2.12 3.25 2.7 2.46 1.54 3.52 4.26 1.77 1.79 1.59 2.72 2.82 2.16 1.67 2.03 37.48 2.29 3.04 1.98 2.56 4.72 4.13 4.23
0.4 0.55 0.07 0.11 0.48 0.06 0.06 0.13 0.06 0.12 0.06 0.15 0.19 1.03 0.16 0.09 0.08 1.59 0.04 0.19 0.08 0.08 7.26 0.16 0.2 0.08 0.11 0.17 0.25 0.07
Spov3_chr4.03477 (LRK10L3)
 1.81 1.7 0.6 0.5 1.38 0.4 0.26 0.43 0.3 0.56 0.28 0.32 0.85 3.4 0.8 0.47 0.27 4.95 0.44 0.35 0.33 0.39 11.71 0.46 0.5 0.41 0.48 0.62 0.68 0.53
2.81 3.43 0.44 1.3 3.2 1.37 0.82 0.0 1.75 2.2 1.36 2.08 1.66 3.79 1.32 1.49 0.22 55.57 0.7 0.4 1.03 0.87 186.22 1.3 0.91 1.17 1.08 2.28 1.1 1.86
1.67 1.63 1.48 1.6 1.82 1.14 1.15 1.32 1.25 1.29 1.24 1.14 1.42 2.04 1.33 1.2 1.18 2.69 0.98 1.02 1.28 1.1 8.12 1.26 1.11 1.31 1.25 1.48 1.34 1.64
0.27 0.35 0.08 0.06 0.27 0.05 0.08 0.06 0.04 0.14 0.09 0.04 0.07 0.36 0.07 0.05 0.05 0.55 0.05 0.07 0.06 0.01 2.66 0.05 0.09 0.06 0.07 0.12 0.12 0.06
1.27 1.37 1.08 1.28 2.41 1.66 1.16 0.71 1.51 1.56 0.84 1.22 1.36 3.81 1.03 1.1 0.91 4.67 0.91 1.09 1.36 1.04 13.74 1.09 0.69 1.12 1.17 1.5 1.19 1.17
2.7 1.44 2.57 3.84 1.68 1.08 1.62 0.68 1.94 2.46 1.77 1.35 1.19 1.68 1.65 1.51 1.04 12.17 1.54 2.56 1.52 1.61 64.21 2.05 1.95 1.66 1.6 1.15 3.12 5.03
0.35 0.31 0.18 0.09 0.4 0.18 0.11 0.13 0.17 0.12 0.07 0.1 0.2 0.52 0.12 0.12 0.06 0.8 0.06 0.08 0.06 0.08 3.44 0.07 0.05 0.16 0.05 0.17 0.36 0.14
0.42 0.17 0.07 0.11 0.72 0.0 0.0 0.06 0.06 0.08 0.27 0.0 0.21 1.49 0.25 0.12 0.0 2.75 0.08 0.18 0.11 0.03 5.76 0.05 0.0 0.0 0.02 0.19 0.27 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.06 0.0 0.0 0.0 1.08 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
1.22 1.33 1.11 1.36 0.65 0.41 0.35 0.73 0.65 0.82 0.71 0.65 1.21 2.08 0.7 0.63 0.74 2.45 0.85 0.57 0.67 0.79 10.32 1.05 1.25 0.77 1.23 1.36 1.24 1.71
0.45 0.49 0.24 0.24 0.59 0.57 0.4 0.22 0.23 0.27 0.35 0.35 0.71 1.62 0.53 0.47 0.46 2.56 0.26 0.32 0.31 0.22 7.16 0.38 0.27 0.25 0.35 0.32 0.33 0.38
0.35 0.13 0.18 0.06 0.54 0.06 0.08 0.08 0.1 0.14 0.01 0.05 0.2 0.83 0.26 0.13 0.09 0.77 0.04 0.01 0.03 0.06 5.35 0.07 0.08 0.03 0.02 0.03 0.25 0.06
0.79 0.94 0.27 0.33 0.7 0.34 0.23 0.33 0.12 0.4 0.18 0.13 0.42 2.6 0.61 0.21 0.21 2.29 0.15 0.2 0.27 0.14 18.04 0.23 0.3 0.16 0.23 0.46 0.42 0.2
14.93 10.04 7.68 4.45 11.52 16.67 8.11 17.37 5.54 8.35 5.12 3.45 10.56 8.71 9.17 6.97 3.38 61.85 3.46 4.22 4.66 4.98 246.66 5.81 4.07 4.89 5.58 10.5 7.84 18.62
3.0 2.68 1.03 0.49 2.02 0.65 0.54 0.57 0.87 1.15 0.57 0.56 0.62 1.57 0.68 0.59 0.35 9.26 0.51 0.55 0.67 0.47 22.74 0.78 0.41 0.68 0.44 2.09 1.3 0.65
3.08 2.11 2.8 2.1 2.97 1.49 1.29 2.1 2.37 2.28 1.39 1.59 1.36 2.67 1.14 1.11 1.19 2.21 1.41 1.3 1.13 1.54 21.13 1.33 1.26 1.41 1.48 4.04 3.47 3.11
11.21 10.23 8.93 7.41 12.62 8.22 7.87 6.76 7.25 7.71 6.41 6.77 5.06 14.33 7.66 6.63 6.76 8.17 6.43 6.85 7.29 6.69 58.77 7.12 6.4 7.21 7.23 12.85 10.35 8.67
0.66 0.83 0.71 1.15 0.57 0.24 0.34 0.81 0.34 0.27 0.31 0.2 0.52 1.6 1.19 0.85 1.1 0.68 0.27 0.34 0.51 0.47 10.02 0.44 0.41 0.34 0.4 0.38 0.5 0.45

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)