Heatmap: Cluster_14 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 260 uE m-2 s-1	Light: 195 uE m-2 s-1	Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 65 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L18D6	Photoperiod: L13D11 (Control)	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C (Control)	Temperature: 25°C	Temperature: 30°C
Spov3_C0001.00027 (MAN1)	-	-	-	-	-	2.47	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.61	-	-	-	-
Spov3_C0003.00121	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_C0005.00040 (AtAVT3)	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_C0005.00052 (ABF3)	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_C0007.00032	-	1.72	-	0.68	-	0.68	-	-	-	1.53	-	-	-0.16	-	-	-	-	2.25	-	-	-0.61	-	-	-	-0.11	3.22	1.9	-	-	-1.75
Spov3_C0013.00022	1.9	-	-	-	-	0.61	3.75	-	-	-	-	-	0.66	-	-	-	-0.16	-	-	-	1.59	-	2.47	-	-	-	-1.83	-	-	-
Spov3_C0015.00027	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-
Spov3_C0019.00021 (APG6)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.61	-	-	-	1.62	1.61	-	-	-	1.59	2.51	3.6	-	-	-	-
Spov3_C0019.00041	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_C0021.00015 (RPB5D)	-	-	2.72	1.52	1.43	2.54	-	-	-	-	-	-	-	-	1.17	1.68	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.92	-	1.48	-	-
Spov3_C0021.00025 (RWA4)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-
Spov3_C0028.00037	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.32	-	-	-	3.32
Spov3_C0104.00003	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-
Spov3_C1191.00001 (ISD11)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.93	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.88	-	-	-	-
Spov3_C1196.00003 (MAPKKK14)	1.63	-	-	-	-	-	4.28	-	-12.51	-	-	-	1.75	-	2.05	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_C1523.00001 (CYP705A28)	-	-	-	-	-	4.0	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.66	-	-	3.44	-	-	-	-
Spov3_chr1.00668	-	2.12	-	-	-	-	4.0	-	-	2.08	-	-	0.82	-	-	-	-	1.86	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr1.00871 (AGL83)	-	-	-	-	-	3.24	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.36	-	-	-	-
Spov3_chr1.01082	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr1.01306 (UGT76D1)	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr1.01483 (COQ6)	-	1.67	-	-1.34	-	-1.15	-	0.71	0.78	0.64	1.29	-	-	-	-	-	0.04	2.89	0.11	-1.14	-	-0.15	-	0.5	-	1.53	-	-	1.34	-0.19
Spov3_chr1.01499 (SMC3)	0.55	-	-	1.18	0.36	-	2.52	-	-	0.48	-	-	-	2.14	0.36	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.32	1.51	0.68	0.41	0.47
Spov3_chr1.01624 (RIC7)	-	1.04	2.03	-	-	0.64	-	-	-	-	-	1.74	-	-	0.74	2.03	-	-	-	-	0.84	2.25	-	0.77	0.67	1.75	-	-	-	-
Spov3_chr1.01910 (NZZ)	-	-	0.93	2.77	-	-	0.67	1.01	-	-	2.46	0.75	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.08	-	-	1.04	-
Spov3_chr1.02170 (MAN1)	-	-	-	-	-	2.47	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.61	-	-	-	-
Spov3_chr1.02383	-	-	-	-	-	-	3.95	-	-	-	2.91	-	-	-	2.82	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr1.02580	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-
Spov3_chr1.02733 (MAP1D)	-	-	-	-	-	-	3.94	-	-	-	-	3.88	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr1.02821	-	-	-	-	-	-	4.18	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.56	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr1.02903	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr1.03937 (PAP25)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.97	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.54	4.28	-	-0.16	-	-
Spov3_chr2.00281 (KAO2)	-	-	-	-	3.15	1.92	-	2.32	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.62	-	-	-	-
Spov3_chr2.00862 (PLIM2b)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-
Spov3_chr2.02064 (ASK1)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-
Spov3_chr2.02358 (MAN1)	-	-	-	-	-	2.47	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.61	-	-	-	-
Spov3_chr2.02405 (ATL24)	-	-	0.32	-	-	-	0.45	1.34	0.42	-	2.02	0.28	-	-	1.26	1.44	0.53	0.15	-	-	-	-	1.87	-	-	2.56	-	-	-	0.04
Spov3_chr2.02484	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-
Spov3_chr2.02550 (LOS1)	-	-	-	-	1.5	-	-	-	-	-	-	-	-	2.9	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.26	1.62	-	1.79	1.84
Spov3_chr2.03111 (BBX14)	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr2.03155 (MIPS3)	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr2.03161	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr2.03564 (EDA34)	-	-	-	-	-	-	3.96	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.86	-	-	-	-
Spov3_chr2.03580 (SR1)	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr2.03704 (ACYB-2)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.26	-	-	-	3.44
Spov3_chr2.04132 (NHX2)	-	-	-	-	-	3.22	-	-	-	-	-	-	-	3.48	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.25	-	-	-	-
Spov3_chr2.04858 (CYR1)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-
Spov3_chr2.05282	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.44	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.76	-	-	-	-3.28
Spov3_chr3.00176 (GRXS6)	1.13	0.72	-	-1.26	-1.27	1.15	1.79	-1.08	1.51	0.61	-	-0.04	-0.89	-1.04	-	0.1	-	-	-	-1.2	-	-0.99	2.74	-	-	-	0.44	0.77	-0.92	-0.97
Spov3_chr3.00438 (GER3)	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr3.00500	-	-	-	-	-	-	-	1.66	-	-	2.36	-	-	-	-	-	-	3.45	-	0.36	-	-	-	-	-	2.18	1.73	0.72	-	-
Spov3_chr3.01045	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.37	-	-	-	-	4.3	-	-	-	-
Spov3_chr3.01140	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr3.01171 (ATG3)	-	-	-	-	-	-	4.36	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.25	-	-	-	-
Spov3_chr3.01284	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr3.01473 (BOP1)	0.03	-1.05	0.93	-1.62	-0.4	-1.81	-1.89	0.92	-	0.87	-1.58	-	0.71	-0.23	0.09	-	-0.69	-1.91	-0.98	-1.84	-	-0.95	1.14	-	-	2.74	0.79	0.86	-6.86	1.45
Spov3_chr3.01496	3.94	-	-	-	-	-	3.87	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr3.01577	2.72	-	-	-	-0.35	-	2.35	-0.42	-	-	-	-	-	-0.26	1.51	-	-	-0.08	-0.46	1.81	-0.11	-	-	-	-	1.66	1.49	-	0.03	-
Spov3_chr3.01871	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-
Spov3_chr3.01950 (SAR1)	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr3.02605	-	-	-	3.11	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.78	3.86	-	-	-	-
Spov3_chr3.02711	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.96	-	-	-	3.85
Spov3_chr3.03070	-	-	-	-	-	-	4.66	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.22	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr3.03247	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr3.03618	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr3.04220 (RBP47C)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-
Spov3_chr3.05029 (DDR1)	-	-	-	-	-	-	2.92	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.84	-	3.02	-	-
Spov3_chr4.00657	-	-	-	0.87	1.78	-	-	-	-	-	-	-	0.91	-	-	-	0.8	2.98	-	-	-	-	0.79	-	-	3.31	-	-	-	0.65
Spov3_chr4.00717 (REC8)	-	-	2.07	0.53	-	0.33	-	-	-	-	0.43	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.13	-	1.36	-	-	3.33	0.52	1.73	-	-
Spov3_chr4.00746 (CPK9)	1.3	-	2.19	-	-0.62	1.28	-	0.61	-0.57	-0.46	-	0.42	-0.57	-0.45	-0.71	-	1.09	-	-	-	2.0	-	-	0.61	-	2.39	-	-0.46	-	-
Spov3_chr4.00970 (LecRK-VII.1)	-	0.66	0.12	1.82	0.36	-1.71	-	1.34	-	-	1.47	-	-	0.54	-0.77	0.61	-	-	0.95	-	-	-	-	0.35	0.95	3.04	-	-	-	-
Spov3_chr4.01630	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-
Spov3_chr4.03086 (MHX)	-	0.17	-0.05	-	-	-0.07	-	-	-	-	0.45	-	-	-	-	-	-	3.44	-	-	1.27	-	1.79	-	-	2.49	-	0.21	-	1.06
Spov3_chr4.03723	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr4.03808 (WAKL6)	-	-	4.04	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.76	-	-	-	-
Spov3_chr4.04507	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-
Spov3_chr5.01501 (MAGL12)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.81	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.0	-	-	-	-
Spov3_chr5.01593 (ECH)	-	-	3.34	-	-	3.46	-	-	-	-	-	-	-	3.14	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr5.02962	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr5.03086	-	-	3.1	-	1.94	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.75	3.41	-	-	-	1.83
Spov3_chr5.03508	-	0.59	-	0.47	1.69	0.27	-	-	-	-	0.37	-	-	1.85	1.85	1.56	1.49	-	-	-	-	-	-	-	-	3.08	-	-	-	-
Spov3_chr5.03930	-	-	3.47	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.26	-	-	-	3.22	-	-	-	-
Spov3_chr5.03965 (MUL)	-	-	-	-	-	-	3.57	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.18	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr6.00457	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-
Spov3_chr6.00790 (LecRK-VII.1)	-	-	-	-	-	-	3.75	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.05	-	-	3.05	-	-	-	-	-
Spov3_chr6.01243 (KIX8)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-
Spov3_chr6.01848	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.27	-	-	-	-	4.35	-	-	-	-
Spov3_chr6.01921	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr6.02403	-1.12	-0.46	-	0.48	0.99	2.33	0.74	-	-	-	-	-	-0.18	2.52	-2.27	-	-0.36	-	1.97	-	-	-	-0.07	1.26	1.19	-	-	0.43	-1.96	-
Spov3_chr6.02575 (MRP8)	-	-	-	-	-	2.2	4.33	-	-	-	-	2.42	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr6.02770 (WES1)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-
Spov3_chr6.02856	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr6.02960	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_S06.00015	2.99	-	2.92	-	-	-1.63	2.93	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.94	1.42	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_S15.00016	-	-	-	-	-	-	-	1.64	-	-	-	-	-	-	2.32	1.66	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.68	2.55	-	-	-

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.