1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_222 (Brassica rapa (Bra) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
Bra001449 (LNK3)
 0.12 0.11 0.08 0.16 0.48 0.78 0.72 0.48 0.49 0.32 0.34 0.33 0.35 1.0 0.8 0.23 0.38 0.22 0.4 0.39 0.35 0.32 0.18 0.66 0.64 0.24 0.49 0.54 0.66 0.17 0.22
Bra004034 (G2)
 0.34 0.31 0.39 0.3 0.72 0.52 0.35 0.33 0.65 0.6 0.54 0.51 0.29 1.0 0.69 0.53 0.54 0.77 0.54 0.54 0.41 0.45 0.26 0.52 0.58 0.52 0.64 0.53 0.76 0.62 0.64
Bra004507 (TL1)
 0.11 0.08 0.04 0.07 0.35 0.59 0.79 1.0 0.58 0.39 0.31 0.58 0.31 0.67 0.68 0.2 0.18 0.31 0.44 0.28 0.27 0.41 0.28 0.79 0.6 0.16 0.51 0.87 0.98 0.42 0.35
0.46 0.35 0.3 0.21 0.57 1.0 0.44 0.53 0.58 0.35 0.44 0.49 0.33 0.8 0.97 0.45 0.4 0.36 0.46 0.37 0.42 0.37 0.62 0.49 0.48 0.37 0.47 0.65 0.8 0.74 0.85
Bra005004 (PROT1)
 0.14 0.07 0.08 0.06 0.57 0.65 0.23 0.19 0.43 0.23 0.34 0.38 0.45 1.0 0.61 0.51 0.22 0.35 0.61 0.49 0.48 0.35 0.27 0.66 0.65 0.41 0.48 0.69 0.56 0.41 0.49
0.39 0.3 0.28 0.18 0.59 0.7 0.43 0.26 0.66 0.41 0.49 0.44 0.41 0.75 1.0 0.5 0.36 0.46 0.53 0.45 0.42 0.44 0.54 0.66 0.66 0.42 0.55 0.59 0.76 0.76 0.86
Bra006752 (TL63)
 0.07 0.1 0.17 0.13 0.52 0.55 0.35 0.29 0.49 0.33 0.47 0.33 0.23 1.0 0.86 0.63 0.42 0.68 0.66 0.64 0.34 0.59 0.16 0.51 0.4 0.31 0.59 0.32 0.52 0.36 0.5
Bra009034 (AtDTX28)
 0.5 0.36 0.23 0.16 0.93 0.9 0.47 0.35 0.51 0.47 0.51 0.4 0.52 1.0 0.89 0.72 0.55 0.71 0.52 0.42 0.49 0.49 0.51 0.82 0.83 0.65 0.69 0.88 0.84 0.63 0.8
Bra009277 (EXS)
 0.23 0.21 0.16 0.11 0.66 0.58 0.3 0.29 0.4 0.49 0.37 0.36 0.26 1.0 0.6 0.6 0.51 0.63 0.44 0.37 0.34 0.74 0.1 0.41 0.39 0.26 0.5 0.52 0.68 0.61 0.66
Bra010595 (PIPL3)
 0.06 0.02 0.0 0.03 0.65 0.8 0.3 0.05 0.26 0.07 0.18 0.16 0.21 1.0 0.66 0.31 0.27 0.5 0.56 0.27 0.43 0.36 0.26 0.51 0.27 0.17 0.22 0.28 0.23 0.17 0.28
0.13 0.17 0.07 0.04 0.22 0.56 0.24 0.04 0.24 0.08 0.11 0.16 0.3 1.0 0.37 0.14 0.11 0.27 0.25 0.16 0.21 0.18 0.28 0.32 0.25 0.08 0.25 0.12 0.14 0.17 0.43
Bra011753 (PIPL3)
 0.12 0.05 0.07 0.11 0.31 0.36 0.23 0.14 0.19 0.08 0.22 0.11 0.22 1.0 0.55 0.27 0.17 0.46 0.53 0.38 0.32 0.15 0.17 0.64 0.45 0.17 0.31 0.32 0.47 0.28 0.37
Bra011799 (CHR)
 0.03 0.03 0.02 0.02 0.53 0.66 0.31 0.19 0.44 0.24 0.26 0.27 0.38 1.0 0.8 0.43 0.3 0.71 0.41 0.31 0.32 0.31 0.18 0.59 0.63 0.27 0.44 0.63 0.79 0.36 0.72
Bra011922 (SMR10)
 0.2 0.16 0.24 0.17 0.58 0.6 0.42 0.32 0.75 0.51 0.53 0.49 0.29 1.0 0.6 0.63 0.4 0.52 0.66 0.64 0.49 0.56 0.11 0.73 0.68 0.48 0.68 0.61 0.68 0.45 0.57
0.03 0.03 0.03 0.02 0.06 0.21 0.29 0.76 0.32 0.19 0.28 0.16 0.7 1.0 0.75 0.26 0.19 0.63 0.36 0.23 0.23 0.19 0.53 0.4 0.34 0.18 0.28 0.38 0.42 0.17 0.28
Bra013080 (PCH1)
 0.51 0.37 0.39 0.43 0.74 0.79 0.8 1.0 0.55 0.54 0.59 0.52 0.44 0.69 0.73 0.57 0.61 0.71 0.72 0.76 0.69 0.78 0.57 0.78 0.72 0.51 0.75 0.94 0.79 0.54 0.6
0.05 0.01 0.01 0.02 0.48 0.49 0.17 0.08 0.39 0.39 0.43 0.35 0.1 1.0 0.95 0.26 0.23 0.27 0.6 0.23 0.18 0.16 0.3 0.91 0.77 0.28 0.8 0.42 0.96 0.42 1.0
Bra014219 (BDR5)
 0.44 0.28 0.29 0.29 0.68 0.58 0.73 0.67 0.7 0.53 0.52 0.55 0.6 0.63 0.83 0.34 0.46 0.41 0.48 0.64 0.57 0.59 0.32 0.69 0.56 0.48 0.63 0.86 1.0 0.82 0.69
Bra014661 (SIP2)
 0.03 0.05 0.05 0.03 0.38 0.68 0.42 0.36 0.49 0.26 0.36 0.31 0.21 0.91 1.0 0.18 0.3 0.2 0.59 0.38 0.31 0.42 0.32 0.65 0.58 0.3 0.49 0.52 0.59 0.27 0.29
Bra014779 (PGPS2)
 0.35 0.18 0.24 0.16 0.85 0.63 0.59 0.66 0.93 0.51 0.46 0.53 0.33 1.0 0.92 0.22 0.14 0.41 0.76 0.34 0.33 0.37 0.41 0.61 0.55 0.24 0.49 0.94 0.84 0.55 0.39
0.25 0.32 0.14 0.33 0.34 0.66 0.89 0.72 0.58 0.45 0.56 0.53 0.58 1.0 0.82 0.46 0.57 0.33 0.54 0.54 0.48 0.49 0.27 0.6 0.55 0.47 0.48 0.53 0.53 0.27 0.31
Bra015067 (RFA3)
 0.36 0.35 0.3 0.25 0.7 0.88 0.33 0.3 0.65 0.39 0.51 0.43 0.31 0.87 1.0 0.42 0.46 0.34 0.46 0.33 0.45 0.33 0.49 0.47 0.52 0.32 0.43 0.54 0.84 0.54 0.7
Bra015304 (PH2)
 0.16 0.06 0.02 0.04 0.36 0.82 0.07 0.06 0.29 0.1 0.18 0.15 0.21 1.0 0.55 0.2 0.1 0.2 0.73 0.34 0.36 0.38 0.06 0.65 0.5 0.16 0.23 0.26 0.28 0.2 0.23
0.31 0.3 0.37 0.25 0.89 0.73 0.5 0.48 0.61 0.68 0.46 0.47 0.34 1.0 0.84 0.68 0.67 0.84 0.65 0.47 0.48 0.44 0.22 0.54 0.44 0.38 0.47 0.59 0.73 0.71 0.75
Bra016965 (CYSA)
 0.25 0.23 0.15 0.12 0.62 0.84 0.33 0.22 0.36 0.37 0.44 0.39 0.18 0.95 1.0 0.32 0.35 0.52 0.74 0.59 0.29 0.68 0.6 0.71 0.64 0.41 0.56 0.46 0.64 0.49 0.45
Bra017815 (PIPL3)
 0.06 0.0 0.0 0.0 0.42 0.46 0.04 0.02 0.1 0.08 0.14 0.06 0.19 1.0 0.49 0.13 0.13 0.43 0.42 0.13 0.18 0.14 0.11 0.31 0.02 0.02 0.04 0.07 0.09 0.03 0.07
Bra018922 (PROSCOOP1)
 0.64 0.33 0.4 0.24 0.78 0.91 0.28 0.22 0.55 0.37 0.52 0.47 0.27 0.98 1.0 0.38 0.32 0.46 0.75 0.63 0.47 0.52 0.18 0.93 0.83 0.48 0.83 0.76 0.78 0.59 0.62
Bra020103 (PHT4;5)
 0.46 0.36 0.4 0.45 0.66 0.97 0.98 0.97 0.69 0.49 0.62 0.64 0.62 1.0 0.88 0.66 0.61 0.73 0.88 0.78 0.69 0.69 0.53 0.8 0.77 0.62 0.75 0.88 0.77 0.5 0.66
Bra020592 (SFP2)
 0.13 0.14 0.17 0.21 0.23 0.41 0.27 0.58 0.38 0.25 0.31 0.27 0.41 1.0 0.93 0.17 0.27 0.29 0.33 0.18 0.17 0.16 0.29 0.18 0.2 0.15 0.19 0.34 0.36 0.25 0.4
Bra020650 (GATA16)
 0.19 0.19 0.26 0.2 0.64 0.75 0.37 0.39 0.52 0.34 0.52 0.49 0.66 0.94 0.77 0.48 0.32 0.54 0.44 0.58 0.42 0.53 0.73 0.65 0.77 0.57 0.69 0.39 0.67 0.75 1.0
0.22 0.24 0.24 0.18 0.79 0.71 0.45 0.31 0.5 0.62 0.59 0.6 0.15 1.0 0.74 0.54 0.47 0.78 0.61 0.5 0.47 0.49 0.05 0.48 0.5 0.32 0.43 0.29 0.54 0.33 0.35
0.31 0.18 0.1 0.09 0.87 0.54 0.26 0.56 0.86 0.42 0.54 0.74 0.32 0.77 0.96 0.24 0.16 0.33 0.62 0.28 0.35 0.37 0.08 0.44 0.47 0.19 0.48 0.75 1.0 0.7 0.47
Bra024273 (LNK1)
 0.28 0.18 0.14 0.23 0.56 0.63 0.63 0.56 0.72 0.42 0.53 0.62 0.49 0.97 1.0 0.38 0.44 0.48 0.48 0.48 0.39 0.41 0.31 0.67 0.62 0.43 0.57 0.7 0.77 0.47 0.53
Bra024521 (AGL87)
 0.07 0.11 0.05 0.04 0.44 0.6 0.06 0.04 0.23 0.1 0.25 0.13 0.23 1.0 0.6 0.13 0.1 0.18 0.24 0.12 0.2 0.2 0.19 0.5 0.28 0.1 0.39 0.46 0.52 0.34 0.39
0.48 0.27 0.25 0.2 0.66 0.8 0.43 0.26 0.5 0.37 0.28 0.37 0.21 0.62 0.75 0.33 0.3 0.47 0.55 0.4 0.26 0.35 1.0 0.52 0.54 0.27 0.45 0.45 0.79 0.63 0.68
Bra025846 (ATL80)
 0.17 0.05 0.06 0.07 0.58 0.67 0.35 0.3 0.43 0.3 0.36 0.3 0.42 1.0 0.49 0.32 0.22 0.59 0.58 0.28 0.31 0.22 0.5 0.67 0.41 0.38 0.34 0.52 0.66 0.34 0.51
Bra026514 (ABCG21)
 0.2 0.06 0.08 0.1 0.82 0.75 0.25 0.2 0.35 0.26 0.24 0.27 0.49 1.0 0.69 0.44 0.37 0.81 0.76 0.27 0.4 0.36 0.14 0.39 0.35 0.26 0.35 0.28 0.39 0.4 0.44
Bra027320 (CYP72A11)
 0.13 0.11 0.21 0.09 0.4 0.78 0.24 0.18 0.31 0.24 0.2 0.24 0.16 0.57 0.99 0.38 0.2 0.52 0.33 0.4 0.3 0.27 1.0 0.48 0.45 0.33 0.45 0.82 0.81 0.65 0.76
Bra028326 (IPT7)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 0.22 0.0 0.02 0.02 0.0 0.05 0.08 0.09 1.0 0.5 0.31 0.0 0.47 0.18 0.06 0.29 0.02 0.21 0.37 0.39 0.09 0.26 0.19 0.22 0.18 0.06
0.05 0.05 0.0 0.01 0.15 1.0 0.09 0.02 0.02 0.09 0.33 0.07 0.04 0.7 0.52 0.15 0.16 0.23 0.3 0.27 0.21 0.1 0.26 0.28 0.34 0.08 0.16 0.11 0.23 0.1 0.23
Bra028491 (GSTT2)
 0.68 0.67 0.68 0.52 0.84 0.88 0.58 0.56 0.78 0.71 0.75 0.77 0.81 0.97 0.97 0.7 0.66 0.76 0.78 0.67 0.63 0.76 0.88 0.98 0.91 0.72 0.9 0.89 0.97 0.86 1.0
Bra031145 (EPF1)
 0.15 0.34 0.22 0.14 0.75 0.78 0.54 0.34 0.69 0.47 0.42 0.42 0.32 0.84 0.67 0.59 0.56 1.0 0.84 0.6 0.78 0.84 0.16 0.72 0.92 0.48 0.81 0.57 0.82 0.64 0.8
0.19 0.11 0.06 0.1 0.78 1.0 0.19 0.06 0.48 0.18 0.31 0.24 0.26 0.63 0.75 0.52 0.3 0.46 0.42 0.43 0.5 0.33 0.24 0.51 0.53 0.56 0.4 0.65 0.62 0.42 0.44
Bra031636 (THA1)
 0.06 0.04 0.06 0.04 0.34 0.33 0.27 0.26 0.22 0.28 0.25 0.26 0.15 1.0 0.75 0.28 0.33 0.52 0.32 0.29 0.18 0.26 0.13 0.21 0.17 0.2 0.21 0.21 0.31 0.28 0.52
Bra032801 (KCR2)
 0.17 0.11 0.17 0.11 0.49 0.61 0.62 0.43 0.48 0.39 0.49 0.42 0.36 1.0 0.95 0.57 0.55 0.71 0.53 0.4 0.41 0.42 0.08 0.48 0.47 0.46 0.49 0.58 0.75 0.59 0.82
Bra034762 (LNK3)
 0.36 0.36 0.28 0.63 0.57 0.84 0.9 0.74 0.61 0.41 0.7 0.5 0.41 1.0 0.8 0.35 0.55 0.55 0.73 0.62 0.5 0.56 0.35 0.98 0.92 0.62 0.73 0.75 0.91 0.39 0.4
Bra035010 (ATL23)
 0.2 0.14 0.14 0.09 0.53 0.67 0.2 0.29 0.36 0.18 0.31 0.2 0.46 1.0 0.53 0.45 0.45 0.64 0.4 0.31 0.3 0.36 0.28 0.66 0.69 0.49 0.56 0.72 0.63 0.29 0.55
Bra035740 (UCNL)
 0.4 0.28 0.43 0.21 1.0 0.6 0.35 0.43 0.6 0.4 0.59 0.49 0.45 0.84 0.95 0.43 0.27 0.6 0.72 0.48 0.49 0.4 0.37 0.68 0.55 0.31 0.51 0.7 0.7 0.53 0.56
0.2 0.24 0.16 0.13 0.8 0.62 0.48 0.36 0.5 0.47 0.45 0.34 0.45 1.0 0.78 0.66 0.61 0.62 0.69 0.51 0.5 0.37 0.26 0.6 0.65 0.27 0.69 0.58 0.67 0.6 0.63
0.05 0.02 0.0 0.07 0.44 0.69 0.83 0.48 0.47 0.45 0.35 0.23 0.69 1.0 0.94 0.62 0.5 0.86 0.48 0.61 0.57 0.56 0.74 0.53 0.55 0.32 0.47 0.66 0.6 0.27 0.21
0.12 0.14 0.23 0.16 0.84 0.65 0.35 0.35 0.42 0.56 0.39 0.32 0.14 0.78 1.0 0.37 0.51 0.74 0.51 0.44 0.31 0.33 0.15 0.37 0.3 0.24 0.43 0.41 0.55 0.53 0.64
Bra040484 (TL1)
 0.18 0.23 0.3 0.21 0.43 0.8 0.93 0.86 0.63 0.42 0.43 0.47 0.53 1.0 0.87 0.38 0.51 0.61 0.55 0.46 0.46 0.46 0.98 0.69 0.65 0.24 0.54 0.81 0.76 0.34 0.37
0.05 0.08 0.04 0.05 0.63 0.35 0.07 0.0 0.38 0.25 0.32 0.23 0.03 0.84 1.0 0.82 0.3 0.96 0.3 0.2 0.13 0.29 0.03 0.33 0.18 0.08 0.37 0.15 0.36 0.17 0.39

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)