Heatmap: Cluster_126 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 260 uE m-2 s-1	Light: 195 uE m-2 s-1	Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 65 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L18D6	Photoperiod: L13D11 (Control)	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C (Control)	Temperature: 25°C	Temperature: 30°C
Spov3_C0001.00158 (SNC2)	0.12	-0.43	0.41	0.99	-0.6	-1.09	-0.31	0.42	0.33	0.02	0.36	0.02	0.39	-1.74	-0.25	-0.19	-0.05	-0.07	0.08	0.1	0.06	0.01	-0.39	-0.16	0.13	-0.05	0.27	-0.04	-0.35	-0.15
Spov3_C0008.00095	-0.18	-0.13	0.51	0.99	-0.65	-0.6	-0.47	0.13	-0.23	0.16	0.21	-0.11	0.24	-1.89	-0.6	-0.3	-0.2	-0.11	-0.11	-0.36	0.18	0.17	0.05	-0.16	0.3	0.32	0.48	0.55	-0.07	-0.45
Spov3_C0022.00037	-0.17	-0.27	-0.04	0.2	-0.05	-0.26	-0.01	0.26	0.05	0.07	0.2	0.03	0.13	-0.87	-0.07	-0.11	0.13	-0.11	-0.07	0.03	0.15	0.26	0.0	-0.15	0.16	0.05	0.21	-0.04	-0.01	-0.11
Spov3_C0033.00010 (GAMMA CA1)	-0.05	-0.13	0.1	0.34	0.03	-0.29	-0.2	0.12	-0.0	0.05	0.09	0.06	0.13	-0.31	0.01	-0.02	0.08	-0.03	0.03	-0.07	0.06	-0.04	0.17	-0.14	-0.02	0.02	0.11	0.04	-0.08	-0.22
Spov3_C0084.00007 (RALF34)	-0.51	-0.67	0.0	0.39	-0.04	-0.82	-0.45	0.22	0.26	0.26	0.3	-0.08	0.34	-1.4	-0.24	0.02	0.08	-0.05	0.17	0.05	0.11	0.13	0.07	-0.02	0.44	0.18	0.42	-0.04	-0.16	-0.42
Spov3_C0092.00013	-0.13	-0.31	0.27	0.96	-0.11	-0.92	-0.69	-0.19	0.18	0.17	0.25	-0.08	0.56	-1.93	-0.52	-0.43	-0.04	0.03	0.12	-0.15	-0.02	-0.05	-0.02	-0.05	0.45	0.14	0.49	0.22	-0.29	-0.2
Spov3_chr1.00243 (TUB3)	-0.32	-0.22	0.11	0.6	-0.07	-0.8	-0.54	0.43	0.1	0.28	0.18	0.04	0.31	-1.23	-0.26	-0.2	-0.04	-0.24	0.01	-0.16	0.15	0.11	0.07	-0.3	0.12	0.15	0.45	0.32	-0.06	-0.24
Spov3_chr1.00335 (Tic20-V)	-0.24	-0.15	0.33	0.49	-0.46	-0.48	-0.51	-0.04	0.16	0.11	0.35	0.24	0.04	-1.29	-0.01	0.06	0.21	-1.02	0.07	0.01	0.12	0.08	-0.24	-0.17	0.31	0.25	0.27	0.28	0.0	-0.13
Spov3_chr1.01148 (BZIP61)	0.25	-0.15	0.21	0.6	-0.43	-1.1	-0.35	-0.09	0.19	0.13	0.5	0.08	0.36	-2.09	-0.25	0.04	0.19	-1.08	-0.05	-0.11	-0.06	-0.13	-0.05	0.2	0.37	0.06	0.3	0.33	-0.08	-0.05
Spov3_chr1.01204 (PSF1)	-0.31	-0.13	0.16	0.85	-0.08	-0.63	-0.47	0.23	0.08	0.11	0.15	-0.15	0.36	-0.73	-0.31	0.04	0.08	-0.53	-0.12	0.06	0.01	0.1	0.06	-0.4	0.32	0.03	0.33	0.24	-0.27	-0.19
Spov3_chr1.02305	-0.64	-0.56	0.04	0.23	-0.24	-0.5	-0.13	0.25	0.07	0.09	0.07	-0.03	0.42	-1.25	0.07	-0.02	0.17	-0.15	0.27	0.11	0.22	0.19	0.29	-0.11	0.29	0.16	0.3	-0.18	-0.22	-0.28
Spov3_chr1.03791 (DGL1)	0.09	-0.02	0.19	0.39	-0.01	-0.4	-0.17	0.23	0.13	0.14	0.12	-0.12	-0.08	-0.97	-0.11	-0.08	-0.02	-0.07	0.04	-0.07	-0.01	-0.01	0.3	-0.14	0.12	0.12	0.21	-0.08	-0.08	-0.16
Spov3_chr1.04430 (SMD3B)	-0.24	-0.22	0.11	0.64	0.06	-0.19	-0.5	0.47	-0.09	-0.01	0.04	-0.1	0.17	-0.81	-0.04	0.12	0.26	0.02	-0.24	-0.26	-0.01	0.06	0.04	-0.29	0.08	-0.0	0.08	0.09	0.01	0.04
Spov3_chr1.04934 (MEF26)	-0.6	-0.83	-0.06	0.7	-0.44	-0.97	-0.23	0.62	0.34	0.21	0.39	0.18	0.3	-0.92	-0.06	0.11	0.29	-0.5	0.04	-0.04	-0.07	0.21	-0.39	0.08	0.42	0.04	0.39	0.02	-0.51	-0.62
Spov3_chr1.05155	-0.61	-0.13	0.66	1.28	-0.34	-1.44	-0.97	-0.38	-0.51	0.2	0.1	-0.03	0.55	-4.08	-1.12	-1.07	-0.58	0.23	0.16	-0.13	0.38	0.21	-0.1	-0.49	0.22	0.5	1.01	0.62	-0.09	-0.78
Spov3_chr2.00025 (KAS III)	0.18	0.06	0.21	0.4	-0.2	-0.31	-0.15	0.2	0.07	0.02	0.1	0.05	0.09	-0.63	-0.14	-0.12	0.04	-0.28	0.0	-0.11	0.02	0.11	0.02	-0.24	0.08	-0.04	0.16	0.13	0.06	-0.18
Spov3_chr2.00031 (SKU5)	-0.26	-0.33	0.0	0.68	-0.25	-0.88	-0.31	0.4	-0.09	0.03	0.27	-0.03	0.65	-1.51	-0.25	-0.19	-0.15	0.13	-0.01	-0.22	0.03	0.07	0.01	-0.09	0.32	-0.02	0.48	0.35	-0.13	-0.34
Spov3_chr2.00301	-0.14	-0.25	-0.0	0.21	-0.28	-0.38	-0.03	0.54	0.06	0.09	0.12	-0.0	0.29	-0.65	0.09	0.05	0.11	-0.25	-0.11	-0.13	0.05	-0.03	-0.0	-0.09	0.13	0.08	0.28	0.09	-0.07	-0.26
Spov3_chr2.00345 (NPSN11)	-0.21	-0.25	-0.05	0.31	0.06	-0.47	-0.02	0.25	0.04	0.11	0.12	0.09	0.2	-0.9	-0.11	-0.1	0.03	-0.17	0.0	0.09	0.18	0.14	-0.09	-0.23	0.18	0.05	0.43	0.04	-0.1	-0.18
Spov3_chr2.00715	-0.36	-0.21	-0.02	0.26	0.1	-0.52	-0.08	0.14	0.04	0.23	0.28	0.05	-0.11	-0.78	-0.09	-0.04	0.06	-0.49	-0.01	0.03	0.01	0.13	-0.46	0.08	0.41	0.12	0.4	0.22	0.11	-0.24
Spov3_chr2.00871 (PGD3)	0.13	-0.04	0.33	0.6	-0.15	-0.42	-0.18	0.32	-0.07	-0.15	0.14	-0.11	0.44	-1.24	-0.02	-0.08	0.11	-0.53	0.03	0.03	0.06	0.09	0.14	-0.35	0.13	0.03	0.25	0.07	-0.42	-0.22
Spov3_chr2.00950 (B5 #6)	-0.61	-0.46	-0.03	0.54	-0.37	-0.54	-0.39	0.75	0.0	-0.21	0.09	-0.31	0.5	-1.12	-0.28	-0.03	0.14	-0.38	0.04	0.25	0.2	0.28	0.5	-0.24	0.24	0.11	0.18	-0.14	-0.26	0.03
Spov3_chr2.00960 (PIP1D)	-0.09	-0.9	-0.03	0.55	-0.16	-0.45	-0.38	-0.85	0.01	-0.25	0.34	-0.26	0.77	-0.71	0.35	0.36	0.64	0.25	-0.07	0.05	-0.04	0.02	0.42	-0.36	0.22	0.17	0.3	-0.41	-0.99	-0.53
Spov3_chr2.01187 (HTH)	-0.17	-0.23	0.08	0.38	-0.1	-0.67	-0.47	-0.19	0.12	0.27	0.33	-0.03	0.08	-0.32	-0.18	-0.14	0.07	-0.23	0.25	-0.12	0.0	0.13	-0.09	0.22	0.51	0.1	0.33	0.28	-0.43	-0.62
Spov3_chr2.01215	-0.63	-0.13	-0.12	0.74	0.38	-1.46	-0.75	-0.34	-0.61	0.25	-0.49	-0.31	1.34	-2.08	-1.2	-0.81	-0.53	0.69	0.05	-0.36	-0.1	0.4	0.1	0.11	0.49	-0.08	0.64	0.57	-0.12	-0.25
Spov3_chr2.02541 (mMDH2)	0.01	-0.02	0.14	0.32	0.12	-0.09	-0.16	-0.05	0.0	-0.04	0.04	-0.03	0.1	-0.73	0.1	-0.01	0.15	-0.25	0.05	-0.03	0.01	0.05	0.14	-0.39	-0.07	0.02	0.18	0.07	0.02	0.03
Spov3_chr2.02999 (SRF3)	-0.05	0.08	0.16	0.22	-0.09	-0.63	-0.19	0.44	-0.08	0.01	0.39	0.17	0.2	-0.81	-0.17	-0.11	-0.1	-1.12	-0.12	0.0	0.03	0.06	-0.02	0.14	0.27	0.1	0.37	0.48	-0.12	-0.73
Spov3_chr2.03986 (TIM50)	-0.35	-0.3	-0.0	0.52	-0.08	-0.47	-0.21	0.46	0.11	-0.02	0.2	-0.03	0.43	-1.25	0.13	-0.07	0.15	-0.5	0.02	0.0	0.11	0.02	0.35	-0.16	0.1	0.15	0.31	0.0	-0.43	-0.31
Spov3_chr2.05147	0.07	-0.18	0.12	0.47	-0.15	-0.39	-0.18	0.06	0.04	-0.17	0.24	0.05	0.56	-1.21	-0.11	-0.17	-0.15	0.18	-0.07	-0.05	-0.09	-0.02	-0.15	-0.18	0.18	0.02	0.3	0.18	-0.04	0.03
Spov3_chr2.05565	-0.23	-0.18	0.15	0.63	-0.2	-0.67	-0.64	0.18	-0.06	0.14	0.22	0.08	0.16	-0.7	-0.13	0.18	0.12	-0.43	-0.07	-0.16	0.15	-0.07	0.19	-0.26	0.21	0.14	0.18	0.09	0.1	0.04
Spov3_chr3.00420	-0.06	-0.3	0.04	0.7	-0.65	-0.79	-0.24	0.51	-0.22	-0.12	0.04	0.05	0.39	-0.64	-0.08	0.01	0.07	-0.47	0.05	0.11	0.08	-0.03	0.08	-0.03	0.26	0.06	0.32	0.12	-0.22	-0.07
Spov3_chr3.00604	0.29	-0.51	0.2	1.25	-0.34	-1.3	-0.75	0.1	-0.33	-0.07	0.41	-0.23	1.22	-1.0	-0.46	-0.74	-0.33	0.02	-0.19	-0.14	-0.37	-0.17	0.5	-0.23	0.17	-0.41	0.23	0.15	-0.02	-0.1
Spov3_chr3.00991 (SWIB2)	-0.16	-0.14	0.27	0.54	-0.4	-0.58	-0.21	0.2	0.31	0.29	0.39	0.29	0.15	-1.49	-0.3	-0.02	0.09	-1.25	-0.01	-0.09	-0.0	-0.07	0.02	0.02	0.28	0.08	0.18	0.27	-0.11	-0.15
Spov3_chr3.01089 (UBP4)	-0.45	-0.33	-0.14	0.17	-0.27	-0.36	-0.01	0.63	0.01	0.06	0.06	-0.07	0.36	-0.23	0.03	0.08	0.15	-0.08	0.16	-0.09	0.12	0.08	0.37	-0.32	-0.04	-0.01	0.15	-0.16	-0.26	-0.16
Spov3_chr3.01746 (DF1)	0.16	-0.17	0.26	0.75	-0.15	-0.25	-0.57	-0.23	-0.15	-0.01	-0.16	-0.22	0.37	-0.54	-0.23	-0.09	0.23	0.34	-0.02	-0.29	-0.12	-0.4	0.74	-0.31	-0.16	-0.11	0.13	0.03	-0.02	0.14
Spov3_chr3.02181 (RAD23D)	-0.11	0.02	0.06	0.33	-0.25	-0.55	-0.36	-0.02	-0.0	0.25	0.19	0.01	0.32	-0.81	-0.21	0.01	0.21	-0.34	0.07	0.0	0.16	-0.2	0.01	0.02	0.28	0.08	0.35	0.13	-0.11	-0.19
Spov3_chr3.02276 (MGP1)	-0.01	0.02	0.14	0.3	0.12	-0.17	-0.11	0.07	-0.03	-0.06	0.02	-0.02	0.14	-0.5	-0.04	-0.07	0.15	-0.03	0.01	-0.02	0.04	-0.0	0.12	-0.14	0.05	0.03	0.13	0.08	-0.14	-0.3
Spov3_chr3.02624	-0.14	-0.09	0.13	0.58	-0.13	-0.33	-0.38	0.17	-0.04	0.04	0.04	0.01	0.11	-0.57	0.02	0.18	0.22	-0.29	-0.2	-0.18	0.1	-0.0	0.09	-0.19	0.04	0.08	0.23	-0.07	-0.06	0.14
Spov3_chr3.03316	0.09	0.02	0.18	0.7	-0.33	-0.47	-0.34	0.5	0.21	0.23	0.08	-0.01	-0.08	-0.4	-0.35	-0.08	-0.13	-0.42	0.03	0.05	-0.1	0.03	-0.12	-0.44	-0.01	-0.01	0.33	0.24	-0.01	-0.16
Spov3_chr3.03578 (bHLH48)	0.03	-0.39	0.17	0.7	-0.21	-0.59	-0.34	0.4	0.35	0.11	0.14	-0.09	0.17	-0.54	-0.28	0.01	0.14	-0.05	-0.15	-0.11	0.02	-0.07	-0.25	-0.21	0.19	0.1	0.18	0.14	-0.08	-0.24
Spov3_chr3.03670 (SOL2)	-0.36	-0.1	0.48	1.13	-0.39	-1.71	-0.96	0.41	-0.13	0.3	0.0	-0.15	0.68	-1.98	-0.81	-0.69	-0.42	-0.13	0.07	-0.34	0.03	0.26	-0.09	-0.16	0.44	0.05	0.63	0.63	0.01	-0.61
Spov3_chr3.04159 (BIO2)	-0.12	0.07	0.06	0.41	-0.12	-0.42	-0.35	0.25	-0.12	0.15	0.14	0.08	0.16	-0.63	-0.21	0.08	0.15	-0.47	-0.01	-0.12	-0.0	-0.01	0.0	-0.03	0.19	0.19	0.25	0.3	-0.13	-0.31
Spov3_chr3.04599 (DHDPS2)	0.03	-0.01	0.2	0.41	-0.11	-0.37	-0.28	0.12	0.1	-0.01	-0.01	0.04	0.08	-1.1	-0.04	-0.06	0.0	-0.34	-0.04	-0.06	-0.03	-0.1	0.46	-0.11	0.1	0.06	0.09	0.14	0.07	0.1
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Spov3_chr4.03124	-0.07	-0.1	0.14	0.57	-0.1	-0.35	-0.34	0.2	-0.06	-0.04	0.08	-0.06	0.08	-0.68	0.05	-0.09	0.17	-0.33	-0.02	-0.24	-0.04	-0.02	0.14	-0.1	0.23	0.11	0.29	0.18	0.01	-0.1
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Spov3_chr4.03514	-0.13	-0.05	0.14	0.36	0.04	-0.21	0.01	0.39	-0.1	-0.09	-0.04	-0.15	0.13	-0.77	-0.24	-0.07	-0.09	-0.02	0.04	0.04	0.16	-0.06	0.25	-0.06	0.04	0.01	0.2	0.0	0.01	-0.15
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Spov3_chr5.00915 (TUBG1)	-0.15	-0.08	0.08	0.34	0.07	-0.29	-0.37	0.17	-0.02	-0.02	-0.09	-0.07	0.3	-0.17	-0.13	0.11	0.08	-0.19	-0.17	-0.22	0.0	-0.12	0.0	-0.09	0.15	0.18	0.25	0.25	0.03	-0.17
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Spov3_chr5.04309 (HMR)	-0.08	-0.02	0.19	0.51	-0.29	-0.68	-0.28	0.35	-0.49	-0.14	0.04	-0.2	0.63	-1.43	-0.31	-0.24	-0.06	-0.72	0.08	-0.16	0.08	0.07	-0.02	-0.07	0.35	0.0	0.4	0.6	0.16	0.13
Spov3_chr6.00285 (FBL17)	0.38	-0.1	0.57	1.18	-0.34	-1.25	-0.75	0.4	-0.47	-0.07	0.01	-0.17	0.52	-2.79	-0.64	-0.82	-0.71	-0.38	0.07	-0.09	0.38	-0.0	0.0	-0.13	0.43	-0.11	0.55	0.74	-0.18	-0.62
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Spov3_chr6.01653	-0.2	-0.15	0.08	0.18	-0.07	-0.46	-0.14	0.36	0.01	0.03	0.02	0.0	0.29	-0.62	0.04	-0.06	0.02	-0.21	0.07	-0.01	0.07	0.11	0.43	-0.16	0.02	-0.05	0.26	0.06	-0.2	-0.21
Spov3_chr6.01775 (CHR4)	0.07	-0.13	0.04	0.18	0.2	-0.26	-0.06	0.06	0.01	0.06	0.07	-0.01	-0.01	-0.38	-0.21	-0.06	-0.02	-0.22	-0.06	-0.1	0.01	0.0	0.03	-0.04	0.21	0.07	0.24	0.24	0.06	-0.26
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Spov3_chr6.03204 (sks5)	-0.07	-0.44	0.02	0.43	0.14	-0.76	-0.42	-0.27	0.13	0.13	0.3	-0.06	0.42	-0.75	0.05	0.0	0.06	0.23	0.09	0.06	0.03	-0.08	-0.1	-0.18	0.3	0.14	0.41	-0.08	-0.33	-0.29
Spov3_S07.00032	-0.36	-0.32	0.02	0.78	-0.04	-0.54	-0.49	0.05	-0.07	0.1	0.02	-0.2	0.66	-0.04	0.01	0.07	0.3	-0.0	-0.13	-0.17	-0.32	0.22	0.29	-0.24	0.08	-0.11	0.11	-0.1	-0.34	-0.14

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.