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Heatmap: Cluster_144 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
0.36 0.23 0.21 0.03 0.39 0.07 -0.35 -0.39 -0.03 -0.09 -0.35 -0.37 -0.12 1.46 0.13 -0.15 0.12 0.37 -0.62 -0.8 -0.29 -0.75 0.33 -0.29 -0.44 -0.31 -0.24 -0.42 0.09 0.04
0.09 0.05 -0.44 -0.52 0.17 0.28 -0.19 -0.26 -0.57 -0.24 -0.28 -0.18 0.1 1.44 0.26 0.09 0.07 0.15 -0.54 -0.54 -0.17 -0.31 0.78 -0.21 -0.36 -0.08 -0.18 -0.01 -0.18 -0.25
0.43 0.43 -0.25 -0.53 0.35 0.25 -0.28 -0.77 -0.39 -0.13 -0.43 -0.27 -0.33 1.35 0.07 0.04 -0.17 0.13 -0.57 -0.51 -0.23 -0.32 0.79 -0.03 -0.41 -0.16 -0.23 0.16 0.03 -0.23
0.25 0.1 -0.07 -0.16 0.13 0.02 0.0 -0.35 -0.09 -0.06 -0.12 -0.08 -0.11 0.63 0.13 0.11 0.02 0.05 -0.03 -0.15 -0.13 -0.09 0.29 0.07 -0.12 -0.15 -0.11 0.06 -0.1 -0.31
0.23 0.28 -0.02 -0.34 0.66 0.05 -0.25 -0.65 -0.42 -0.24 -0.5 -0.41 -0.46 1.18 -0.02 -0.11 -0.28 0.63 -0.44 -0.53 -0.29 -0.3 0.54 -0.07 -0.32 -0.18 -0.32 0.21 0.08 0.32
0.21 0.25 0.16 0.16 0.0 -0.01 -0.22 0.02 -0.03 -0.05 -0.22 -0.16 -0.06 0.7 0.29 0.08 0.09 -0.16 -0.38 -0.31 -0.17 -0.18 0.15 -0.07 -0.28 -0.16 -0.13 0.0 0.05 -0.07
0.05 0.1 -0.14 -0.01 0.24 0.11 -0.26 -0.13 -0.14 0.02 -0.1 -0.09 -0.12 0.99 -0.04 -0.02 -0.0 0.26 -0.12 -0.27 -0.18 -0.16 -0.01 0.05 -0.02 0.04 -0.11 0.03 -0.17 -0.46
0.26 0.26 -0.11 -0.23 0.33 0.07 -0.37 -0.38 -0.23 -0.1 -0.35 -0.31 -0.16 1.32 0.27 0.28 0.11 -0.15 -0.36 -0.44 -0.18 -0.5 0.35 -0.04 -0.32 -0.09 -0.16 -0.0 -0.08 -0.17
0.32 0.33 -0.13 -0.21 0.21 0.04 -0.2 -0.26 -0.29 -0.1 -0.19 -0.19 0.07 0.98 0.11 0.14 0.15 0.03 -0.34 -0.44 -0.18 -0.24 0.12 0.09 -0.15 -0.13 -0.18 -0.02 0.07 -0.27
0.12 0.16 -0.05 -0.1 0.17 0.13 -0.02 -0.03 -0.14 -0.2 -0.16 -0.11 -0.13 0.71 0.19 0.15 0.16 -0.03 -0.26 -0.33 -0.12 -0.1 0.12 0.03 -0.18 -0.19 -0.14 0.08 -0.03 -0.13
0.19 0.11 -0.1 -0.16 0.23 0.03 -0.06 -0.13 -0.27 -0.05 -0.21 -0.2 -0.0 0.81 0.15 0.04 0.06 0.03 -0.31 -0.3 -0.27 -0.19 0.38 0.02 -0.11 -0.15 -0.17 0.1 0.02 -0.04
0.26 0.22 -0.32 -0.55 0.43 0.31 0.06 -0.4 -0.49 -0.26 -0.47 -0.32 -0.29 1.53 0.2 -0.03 -0.08 -0.55 -0.47 -0.62 -0.23 -0.16 0.55 -0.01 -0.41 -0.29 -0.45 0.34 0.08 0.06
-0.07 0.27 -0.54 -0.76 0.48 0.06 -0.57 -0.98 -0.59 -0.24 -0.53 -0.53 -0.54 1.96 0.21 0.33 0.1 0.75 -0.43 -0.5 -0.15 -0.35 0.69 0.05 -0.41 -0.19 -0.32 -0.52 -0.58 -0.46
0.11 0.1 -0.07 -0.01 0.39 -0.04 0.02 -0.29 -0.11 -0.12 -0.2 -0.13 -0.07 0.71 0.28 0.18 0.03 -0.05 -0.17 -0.22 -0.13 -0.12 0.21 0.09 -0.02 -0.11 -0.07 -0.07 -0.14 -0.48
-0.05 0.12 -0.36 -0.6 0.66 0.4 -0.45 -0.69 -0.46 -0.17 -0.43 -0.57 -0.05 1.54 0.11 -0.14 -0.31 0.65 -0.45 -0.75 -0.2 -0.32 0.88 -0.21 -0.68 -0.22 -0.23 -0.11 -0.01 0.05
0.09 0.26 -0.25 -0.5 0.13 -0.04 -0.14 -0.15 -0.31 -0.35 -0.23 -0.18 -0.05 1.25 0.34 0.24 0.25 0.25 -0.25 -0.2 -0.29 -0.15 0.36 0.02 -0.21 -0.22 -0.29 -0.18 -0.23 -0.28
0.11 0.22 -0.07 -0.29 0.45 0.33 -0.06 -0.27 -0.31 -0.12 -0.22 -0.12 -0.23 0.9 0.2 0.11 0.01 -0.26 -0.43 -0.43 -0.25 -0.15 0.47 -0.17 -0.33 -0.07 -0.18 0.11 0.12 -0.02
0.22 0.2 -0.14 -0.28 0.1 0.03 -0.12 -0.12 -0.25 -0.12 -0.25 -0.14 0.05 0.8 0.13 0.12 0.11 0.04 -0.36 -0.33 -0.18 -0.07 0.45 -0.16 -0.11 -0.1 -0.15 0.06 0.03 -0.06
0.27 0.49 -0.07 -0.08 0.35 -0.17 -0.34 -0.15 -0.44 -0.3 -0.49 -0.48 -0.37 1.45 0.22 0.21 0.19 0.5 -0.38 -0.48 -0.13 -0.32 0.07 -0.04 -0.32 -0.23 -0.27 -0.26 -0.24 -0.18
0.21 0.17 0.15 0.26 -0.09 -0.03 -0.38 0.08 -0.22 -0.23 -0.23 -0.2 -0.03 0.85 0.48 0.2 0.29 -0.08 -0.57 -0.56 -0.23 -0.18 -0.06 -0.2 -0.27 -0.27 -0.27 0.11 0.15 0.21
0.11 0.1 -0.1 -0.4 0.37 -0.07 -0.41 -0.58 -0.2 -0.13 -0.31 -0.19 -0.43 1.38 -0.0 -0.04 -0.06 0.91 -0.28 -0.15 -0.11 -0.28 0.41 0.03 -0.34 -0.19 -0.17 -0.18 -0.16 -0.52
0.08 0.16 -0.26 -0.12 0.17 0.06 -0.07 -0.01 -0.24 -0.15 -0.22 -0.1 -0.0 0.84 0.13 0.15 0.09 0.13 -0.28 -0.4 0.0 -0.17 0.15 0.05 -0.25 -0.08 -0.11 -0.02 0.03 -0.1
0.36 0.26 -0.13 0.01 0.02 -0.06 -0.3 -0.3 -0.1 -0.15 -0.21 -0.18 0.07 1.02 0.06 -0.07 -0.03 0.41 -0.13 -0.32 -0.12 -0.26 0.18 -0.19 -0.24 -0.29 -0.19 0.05 -0.05 0.01
0.13 0.08 -0.47 -0.58 0.14 0.18 0.03 -0.57 -0.07 0.02 -0.11 0.09 -0.01 1.28 0.03 0.04 -0.03 0.28 -0.29 -0.27 -0.18 -0.21 0.27 0.05 -0.29 -0.15 -0.29 0.05 -0.03 -0.47
0.08 0.15 0.0 0.04 0.16 0.09 0.01 0.09 -0.19 -0.12 -0.14 -0.07 0.0 0.6 0.1 0.04 0.1 -0.23 -0.3 -0.3 -0.14 -0.1 0.16 -0.11 -0.18 -0.1 -0.1 0.17 -0.01 -0.05
0.19 0.03 -0.03 -0.38 0.35 -0.0 -0.25 -0.24 -0.25 -0.02 -0.42 -0.23 -0.09 1.01 0.21 -0.03 0.07 0.53 -0.24 -0.39 -0.09 -0.34 0.52 -0.19 -0.41 -0.21 -0.21 -0.25 0.06 0.15
0.18 0.12 -0.25 -0.27 0.25 -0.11 -0.2 -0.29 -0.36 -0.19 -0.19 -0.23 0.08 1.24 0.2 -0.05 -0.1 0.5 -0.29 -0.39 -0.31 -0.25 0.81 -0.17 -0.31 -0.27 -0.41 -0.11 -0.02 -0.19
0.25 0.43 -0.18 -0.43 0.39 -0.16 -0.47 -0.56 -0.3 0.11 -0.42 -0.41 -0.15 1.25 -0.04 0.07 -0.2 0.17 -0.16 -0.35 -0.0 -0.22 0.48 0.07 -0.18 -0.02 -0.09 0.06 -0.1 -0.32
0.18 0.27 -0.1 -0.27 0.25 0.03 -0.1 -0.1 -0.15 -0.04 -0.27 -0.2 -0.13 1.1 -0.02 -0.07 -0.09 0.25 -0.25 -0.21 -0.04 -0.17 0.07 0.02 -0.32 -0.23 -0.22 0.07 -0.03 -0.08
0.14 0.13 -0.28 -0.44 0.62 0.07 -0.26 -0.52 -0.33 -0.21 -0.48 -0.41 -0.2 1.53 0.31 0.01 -0.04 0.57 -0.35 -0.45 -0.43 -0.4 1.03 -0.31 -0.48 -0.36 -0.48 -0.28 -0.08 -0.54
0.23 0.26 -0.6 -1.07 0.71 0.18 -0.24 -0.52 -0.5 -0.18 -0.5 -0.61 -0.03 1.46 0.22 0.14 -0.11 0.66 -0.53 -0.58 -0.23 -0.24 0.65 -0.41 -0.47 -0.18 -0.1 -0.15 0.22 -0.45
Spov3_chr1.04686 (NADP-ME4)
 0.31 0.42 -0.05 -0.35 0.28 -0.22 -0.29 0.01 -0.45 -0.19 -0.45 -0.36 -0.13 1.23 -0.04 -0.18 -0.08 0.01 -0.31 -0.33 -0.17 -0.16 0.79 0.02 -0.26 -0.2 -0.12 0.13 -0.04 -0.37
0.02 0.02 -0.49 -0.8 0.18 0.26 -0.12 -0.55 -0.19 -0.0 -0.2 -0.08 -0.28 1.6 -0.07 -0.1 -0.14 0.42 -0.21 -0.28 -0.16 -0.16 0.31 0.12 -0.29 -0.13 -0.23 -0.0 -0.03 -0.51
0.25 0.11 -0.22 -0.2 0.24 -0.15 -0.23 -0.28 -0.31 -0.2 -0.25 -0.21 0.07 1.01 0.3 0.07 0.16 0.35 -0.24 -0.3 -0.22 -0.18 0.53 -0.01 -0.16 -0.16 -0.15 -0.04 -0.15 -0.53
0.44 0.3 -0.16 -0.51 0.3 0.07 -0.1 -0.57 -0.3 -0.11 -0.31 -0.22 -0.3 1.53 0.01 -0.2 -0.19 0.49 -0.45 -0.27 -0.24 -0.53 0.41 -0.06 -0.39 -0.38 -0.3 0.27 -0.04 -0.4
Spov3_chr1.04893 (NTMC2T6.1)
 0.3 0.25 -0.0 -0.24 0.29 0.11 0.05 -0.54 -0.11 -0.02 -0.18 -0.19 -0.47 0.9 0.07 -0.02 -0.13 0.24 -0.14 -0.2 0.01 0.0 0.25 -0.05 -0.19 -0.15 -0.1 -0.08 0.0 -0.46
-0.19 0.04 -0.7 -0.43 0.47 0.47 -0.15 -0.58 -0.38 0.17 -0.32 -0.4 0.09 1.43 0.26 0.11 0.05 0.45 -0.41 -0.41 -0.09 -0.18 0.01 -0.17 -0.46 0.02 -0.25 0.04 -0.06 -0.49
0.42 0.46 -0.24 -0.27 0.19 0.09 -0.35 -0.58 -0.38 -0.25 -0.55 -0.4 -0.29 1.83 0.12 0.1 -0.02 0.4 -0.59 -0.54 -0.3 -0.36 0.12 -0.06 -0.46 -0.29 -0.4 -0.15 -0.13 -0.08
0.34 0.21 -0.08 -0.16 0.08 -0.18 -0.05 -0.3 -0.02 0.08 -0.11 -0.21 -0.01 0.85 0.12 -0.03 -0.12 0.01 -0.27 -0.4 -0.06 -0.07 0.13 -0.01 -0.18 -0.08 -0.14 0.24 0.01 -0.19
-0.53 -0.21 -1.16 -1.88 -0.06 0.09 -1.02 -1.31 -0.78 -0.41 -0.77 -0.88 -0.21 2.7 0.65 0.18 0.54 0.51 -0.78 -0.65 -0.43 -0.71 1.44 -0.69 -1.16 -0.41 -0.6 -1.68 -1.23 -0.17
-0.47 -0.06 -1.06 -1.44 0.6 0.45 -0.59 -0.49 -1.12 -0.16 -1.02 -0.94 0.07 2.13 0.32 0.18 0.13 0.78 -0.63 -1.05 -0.3 -0.43 1.09 -0.37 -0.89 -0.03 -0.21 -0.44 -0.46 -0.34
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-0.02 0.07 -0.03 -0.43 0.8 -0.02 -0.54 -0.58 -0.25 -0.11 -0.47 -0.44 -0.3 1.43 -0.0 0.01 -0.14 0.72 -0.17 -0.22 -0.11 -0.19 0.47 -0.25 -0.38 -0.18 -0.23 -0.13 -0.23 -0.29
0.4 0.27 -0.38 -0.32 0.38 -0.08 -0.34 -0.32 -0.42 -0.39 -0.6 -0.31 0.01 1.43 0.11 -0.03 -0.06 0.48 -0.35 -0.56 -0.19 -0.27 0.38 -0.03 -0.36 -0.21 -0.25 0.22 -0.02 -0.18
0.1 0.03 -0.08 -0.06 0.21 -0.29 -0.19 -0.13 -0.11 0.03 -0.07 -0.14 0.05 0.92 -0.06 -0.03 -0.05 0.26 -0.22 -0.35 -0.12 -0.13 0.21 -0.05 -0.04 -0.1 -0.04 0.23 0.02 -0.46
0.05 0.12 -0.47 -0.5 0.37 0.26 0.0 -0.37 -0.58 -0.18 -0.37 -0.26 0.04 1.48 0.2 -0.01 -0.1 0.37 -0.32 -0.36 -0.18 -0.13 0.16 -0.1 -0.21 -0.14 -0.1 0.02 -0.17 -0.32
Spov3_chr2.01191 (VPS24.1)
 0.3 0.29 -0.13 -0.56 0.38 0.02 -0.22 -0.39 -0.28 -0.19 -0.22 -0.3 -0.27 1.05 0.09 0.02 -0.11 0.53 -0.21 -0.35 -0.18 -0.22 0.49 -0.1 -0.23 -0.22 -0.29 0.19 -0.02 -0.16
0.17 0.2 -0.05 -0.03 0.03 -0.15 -0.27 -0.07 -0.1 -0.11 -0.13 -0.1 0.0 0.76 0.16 -0.02 0.02 0.14 -0.17 -0.26 -0.06 -0.18 0.26 -0.1 -0.19 -0.07 -0.17 0.13 0.01 -0.11
0.17 0.23 -0.21 -0.06 0.05 -0.15 -0.17 -0.23 -0.29 0.03 -0.13 -0.25 0.26 1.42 0.12 -0.05 -0.06 0.5 -0.4 -0.45 -0.24 -0.28 0.09 -0.31 -0.4 -0.24 -0.32 -0.07 -0.03 -0.09
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0.23 0.17 0.03 -0.04 -0.03 -0.02 0.01 0.14 -0.15 -0.09 -0.16 -0.05 -0.01 0.68 0.25 0.13 0.13 -0.3 -0.41 -0.37 -0.17 -0.13 0.15 -0.09 -0.16 -0.12 -0.05 0.14 -0.01 -0.14
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Spov3_chr4.04545 (ALDH7B4)
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Spov3_chr4.04919 (MAP65-8)
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Spov3_chr5.00404 (AUXILIN-LIKE3)
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0.34 0.27 -0.19 -0.47 0.36 -0.03 -0.19 -0.42 -0.26 -0.19 -0.32 -0.3 -0.4 1.28 0.06 0.05 -0.03 0.55 -0.24 -0.31 -0.17 -0.31 0.42 -0.04 -0.33 -0.29 -0.21 0.09 -0.1 -0.2
0.27 0.26 -0.05 -0.01 0.29 -0.05 -0.13 -0.1 -0.11 0.07 -0.09 -0.14 -0.31 0.95 0.07 0.03 -0.07 0.02 -0.31 -0.29 -0.21 -0.22 0.32 -0.04 -0.23 -0.14 -0.08 -0.01 -0.01 -0.44
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0.86 0.7 0.27 -0.35 0.27 -0.07 -0.17 -0.36 -0.47 -0.27 -0.54 -0.4 -0.1 1.59 0.06 -0.37 -0.19 0.34 -0.77 -0.62 -0.69 -0.52 0.77 -0.57 -0.64 -0.5 -0.68 -0.22 0.19 -0.09
-0.09 -0.01 -0.57 -0.66 0.07 0.16 0.03 -0.24 -0.19 -0.14 -0.2 -0.05 -0.05 1.12 0.25 0.11 0.01 0.43 -0.27 -0.16 -0.1 -0.15 0.46 -0.02 -0.27 -0.01 -0.15 -0.29 -0.12 -0.05
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0.21 0.19 -0.09 -0.2 0.23 -0.01 -0.04 0.0 -0.23 -0.08 -0.2 -0.18 0.07 0.77 0.11 0.01 0.04 -0.22 -0.35 -0.31 -0.21 -0.16 0.17 -0.03 -0.14 -0.16 -0.08 0.11 0.12 0.14
0.24 0.06 -0.05 -0.17 0.44 0.01 -0.23 -0.58 -0.38 -0.24 -0.23 -0.26 0.0 1.15 0.1 -0.02 -0.17 0.19 -0.19 -0.29 -0.14 -0.12 0.44 0.01 -0.15 -0.09 -0.02 0.03 -0.04 -0.47
0.22 0.18 -0.11 -0.11 -0.01 0.24 0.02 -0.21 -0.28 -0.12 -0.23 -0.13 -0.09 0.89 0.32 0.18 0.17 -0.15 -0.39 -0.39 -0.21 -0.16 0.13 -0.1 -0.27 -0.17 -0.19 0.1 0.07 0.1
0.18 0.24 0.03 0.06 0.2 0.08 -0.26 -0.11 -0.31 -0.3 -0.27 -0.28 -0.19 1.02 0.41 0.31 0.37 0.03 -0.49 -0.5 -0.21 -0.27 -0.19 -0.12 -0.35 -0.22 -0.39 -0.12 0.1 0.37
0.01 0.18 -0.31 -0.44 0.54 0.42 -0.04 -0.3 -0.36 -0.16 -0.45 -0.3 -0.15 1.19 0.28 0.13 -0.0 -0.15 -0.34 -0.45 -0.09 -0.09 0.14 0.06 -0.22 -0.07 -0.13 -0.01 -0.03 -0.17
-0.06 -0.16 -0.82 -1.92 0.36 0.88 -0.33 -1.49 -0.66 -0.32 -0.99 -0.45 -0.93 2.56 0.17 -0.21 -0.59 0.57 -0.72 -0.91 -0.32 -0.52 1.0 -0.19 -0.84 -0.54 -0.81 -0.24 -0.22 -0.36
0.13 0.1 -0.33 -0.49 0.16 0.11 -0.17 -0.5 -0.24 -0.25 -0.25 -0.23 -0.02 1.46 0.19 0.02 -0.06 0.61 -0.34 -0.35 -0.34 -0.27 0.52 -0.15 -0.4 -0.25 -0.29 0.02 -0.16 -0.1
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0.02 0.1 -0.13 -0.24 0.43 -0.02 -0.14 -0.27 -0.24 -0.14 -0.26 -0.17 -0.04 0.83 0.2 0.07 0.04 0.24 -0.14 -0.22 -0.07 -0.07 0.31 -0.16 -0.23 -0.06 -0.07 -0.01 -0.13 -0.04
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.