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Heatmap: Cluster_132 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
-0.01 0.03 -0.09 -0.19 0.07 -0.08 -0.13 0.01 -0.06 -0.03 -0.06 -0.06 0.02 0.76 0.28 0.22 0.21 0.29 -0.16 -0.31 -0.23 -0.17 0.04 -0.1 -0.06 -0.1 -0.0 -0.03 -0.29 -0.24
0.23 0.14 -0.14 -0.29 0.07 0.05 -0.22 -0.45 -0.09 0.12 -0.21 -0.17 -0.19 1.15 0.09 0.0 -0.04 0.87 -0.44 -0.35 -0.16 -0.21 0.12 -0.13 -0.43 -0.17 -0.22 -0.18 -0.0 -0.09
0.13 0.24 -0.18 -0.19 0.1 -0.09 -0.15 -0.1 -0.24 -0.14 -0.22 -0.12 -0.15 0.83 0.23 0.2 0.19 0.6 -0.15 -0.18 -0.17 -0.25 0.26 0.01 -0.24 -0.12 -0.2 -0.13 -0.16 -0.38
-0.19 0.01 -0.26 -0.46 0.08 0.03 -0.31 -0.43 -0.23 0.02 -0.34 -0.18 -0.13 0.99 0.12 0.07 -0.02 0.85 -0.01 0.03 0.13 -0.01 0.34 0.09 -0.13 -0.05 -0.08 -0.4 -0.42 -0.36
0.16 0.04 -0.18 -0.15 0.33 0.11 -0.23 -0.3 -0.29 -0.16 -0.2 -0.11 -0.17 1.1 0.04 -0.03 -0.04 0.67 -0.24 -0.24 -0.17 -0.22 -0.1 -0.02 -0.24 -0.1 -0.13 0.12 -0.08 -0.21
0.09 -0.07 -0.47 -0.52 0.12 -0.04 -0.04 -0.75 -0.08 -0.02 -0.08 -0.11 -0.21 1.25 0.01 0.1 -0.22 1.08 -0.39 -0.32 -0.07 -0.3 0.57 0.01 -0.39 -0.16 -0.33 -0.24 -0.03 -0.42
-0.36 -0.18 -0.71 -1.09 0.59 0.43 -0.23 -0.95 -0.57 -0.23 -0.46 -0.38 -0.22 1.89 0.18 0.03 0.05 1.33 -0.57 -0.48 -0.15 -0.36 0.01 -0.75 -0.69 0.03 -0.16 -0.23 -0.64 0.06
0.09 0.06 -0.14 -0.25 0.11 -0.14 -0.12 0.02 -0.17 -0.08 -0.25 -0.24 0.01 0.71 0.1 0.0 0.01 0.87 -0.21 -0.23 -0.27 -0.14 0.5 -0.2 -0.31 -0.25 -0.19 0.0 -0.05 -0.13
0.06 0.14 -0.29 -0.45 0.55 -0.19 -0.4 -0.21 -0.53 0.02 -0.39 -0.36 -0.12 1.08 -0.01 -0.0 -0.2 0.9 -0.18 -0.33 0.08 -0.13 0.43 -0.13 -0.31 -0.14 -0.03 -0.14 -0.01 -0.26
-0.14 -0.03 -0.77 -0.69 0.03 -0.02 -0.06 -0.24 -0.71 -0.3 -0.43 -0.39 0.27 1.57 0.24 0.01 -0.01 1.1 -0.47 -0.48 -0.3 -0.21 0.49 0.13 -0.29 -0.28 -0.31 0.01 -0.12 -0.62
-0.03 -0.05 -0.44 -0.56 0.05 0.03 -0.34 -0.76 -0.41 -0.34 -0.36 -0.31 -0.21 1.29 0.38 0.39 0.34 0.62 -0.0 -0.13 0.02 0.02 0.44 0.17 -0.16 -0.19 -0.2 -0.37 -0.51 -0.32
0.37 0.41 -0.56 -0.99 0.17 0.05 -0.45 -0.77 -0.79 -0.2 -0.64 -0.49 -0.09 1.2 0.08 0.0 -0.11 1.37 -0.43 -0.71 -0.31 -0.42 0.84 -0.17 -0.37 -0.21 -0.37 0.18 -0.0 -0.02
0.07 0.49 -0.12 -0.88 0.37 0.13 -0.44 -0.74 -0.2 -0.37 -0.25 -0.31 -0.27 1.75 -0.05 0.15 0.14 1.23 -0.3 -0.5 -0.17 -0.81 0.17 -0.15 -0.69 -0.73 -0.47 -0.58 -0.36 -0.04
0.14 -0.07 -0.56 -0.65 0.0 0.23 0.17 -0.3 -0.44 -0.21 -0.31 -0.19 -0.2 1.05 0.18 -0.07 -0.16 0.91 -0.28 -0.42 -0.33 -0.1 0.9 -0.09 -0.19 -0.16 -0.29 -0.13 -0.04 -0.22
-0.27 -0.01 -0.91 -0.99 0.18 0.03 -0.18 -0.27 -0.7 -0.38 -0.43 -0.46 0.12 1.95 -0.03 0.01 0.1 1.39 -0.22 -0.52 -0.37 -0.34 -0.21 -0.21 -0.62 -0.19 -0.41 -0.27 -0.23 -0.03
0.01 0.0 -0.45 -0.53 0.17 0.19 -0.05 -0.21 -0.45 -0.25 -0.38 -0.34 0.01 1.06 0.37 0.16 -0.01 0.61 -0.16 -0.24 -0.03 -0.2 0.53 -0.05 -0.2 -0.16 -0.11 -0.17 -0.24 -0.15
0.28 0.19 -0.21 -0.15 0.28 0.13 -0.2 -0.22 -0.31 -0.26 -0.2 -0.29 -0.22 1.15 0.04 -0.08 0.1 0.43 -0.15 -0.33 -0.38 -0.15 0.3 -0.15 -0.3 -0.16 -0.17 0.07 -0.07 -0.07
-0.07 0.05 -0.18 -0.28 0.23 -0.09 -0.38 -0.19 -0.2 0.01 -0.18 -0.24 -0.17 0.84 0.16 0.2 0.06 0.56 -0.08 -0.19 0.12 -0.06 0.14 0.01 -0.14 0.01 0.03 -0.33 -0.12 -0.25
Spov3_chr1.02477 (CYCLASE2)
 0.12 0.15 -0.22 -0.13 -0.0 -0.27 -0.32 -0.34 -0.17 -0.09 -0.21 -0.22 0.05 0.68 0.17 0.12 0.1 0.86 -0.24 -0.26 -0.14 -0.26 0.71 -0.05 -0.17 -0.12 -0.09 -0.16 -0.19 -0.34
0.16 0.28 -0.1 -0.53 0.23 -0.03 -0.14 -0.27 -0.39 -0.4 -0.18 -0.06 -0.31 1.0 0.1 0.03 0.04 0.55 -0.36 -0.11 -0.13 -0.12 0.34 0.08 -0.01 -0.04 -0.16 0.09 -0.12 -0.52
0.06 0.01 -0.6 -0.92 0.51 0.05 -0.18 -0.5 -0.59 -0.2 -0.43 -0.37 -0.34 1.41 -0.11 -0.06 -0.33 1.36 -0.36 -0.28 -0.21 -0.41 1.0 -0.1 -0.46 -0.3 -0.46 -0.3 -0.21 -0.18
0.37 0.28 -0.03 -0.07 0.21 -0.03 -0.12 -0.29 -0.16 -0.01 -0.2 -0.2 -0.16 0.69 0.22 0.07 0.07 0.13 -0.24 -0.36 -0.06 -0.22 -0.15 -0.02 -0.18 -0.14 -0.15 0.18 0.09 -0.05
0.02 0.17 -0.19 -0.31 -0.07 -0.0 -0.12 -0.12 -0.14 -0.12 -0.13 -0.07 -0.19 0.95 0.19 0.14 0.11 0.95 -0.22 -0.17 -0.05 -0.15 -0.32 -0.07 -0.24 -0.11 -0.13 -0.21 -0.27 -0.19
-0.06 -0.08 -0.45 -0.68 0.04 -0.21 -0.6 -0.58 -0.14 -0.18 -0.02 -0.29 0.11 1.33 0.33 -0.0 0.37 0.65 -0.2 -0.19 0.01 -0.05 0.07 -0.01 -0.14 -0.18 -0.12 -0.33 -0.23 0.13
0.12 0.03 -0.29 -0.61 -0.07 -0.44 -0.61 -0.44 -0.01 0.04 -0.06 -0.09 -0.03 1.29 0.13 -0.3 0.04 0.99 -0.16 -0.29 -0.29 -0.33 0.64 -0.33 -0.15 -0.0 -0.16 -0.18 -0.17 -0.26
-0.04 0.09 -0.86 -1.76 -0.21 0.26 -0.1 -1.37 -1.18 -0.18 -0.74 -0.5 -0.14 2.06 -0.39 -0.14 -0.14 1.91 -0.29 -0.12 0.03 -0.07 -0.43 -0.22 -0.59 0.11 -0.33 -0.54 -1.13 -0.51
0.35 0.45 -0.25 -0.74 0.12 -0.05 -0.15 -0.55 -0.55 -0.24 -0.38 -0.3 0.08 1.14 0.41 0.15 0.19 0.76 -0.35 -0.27 -0.13 -0.09 0.38 -0.27 -0.4 -0.27 -0.35 -0.22 -0.28 -0.02
0.01 -0.08 -1.09 -2.45 -0.2 0.21 -0.12 -0.65 -0.24 -0.48 -0.63 -0.5 -0.03 2.06 0.47 0.45 -0.22 1.71 -0.97 -0.77 -0.32 -0.01 -0.28 0.03 -0.76 -0.09 -0.55 -0.47 -0.63 -0.9
-0.08 -0.09 -0.1 -0.07 -0.02 0.02 -0.1 0.05 -0.06 -0.06 -0.11 -0.11 -0.11 0.55 -0.01 0.04 -0.02 0.56 0.04 -0.0 -0.0 -0.1 0.08 -0.06 -0.16 0.06 -0.03 -0.1 -0.09 -0.21
0.15 -0.01 -0.16 -0.04 -0.03 0.02 -0.18 -0.13 -0.36 -0.32 -0.05 -0.21 0.15 0.41 -0.0 0.14 0.11 0.64 -0.29 -0.26 -0.16 -0.18 0.64 -0.14 -0.15 -0.22 -0.19 -0.02 -0.12 0.28
-0.3 -0.25 -0.45 -0.63 0.28 -0.12 -0.17 0.05 -0.33 -0.01 -0.12 -0.25 -0.2 0.97 -0.17 -0.12 -0.27 0.94 0.03 -0.04 0.15 0.02 0.3 -0.17 -0.05 0.09 0.26 -0.22 -0.26 -0.29
0.18 0.19 -0.71 -1.0 0.61 0.08 -0.55 -0.91 -0.65 -0.45 -0.81 -0.51 -0.55 1.54 0.42 0.07 0.13 1.53 -0.41 -0.4 -0.12 -0.49 0.99 -0.61 -1.04 -0.24 -0.42 -0.84 -0.45 0.08
-0.23 0.02 -0.53 -0.79 0.86 -0.0 -0.19 0.2 -0.83 -0.29 -0.49 -0.49 -0.04 1.55 -0.02 -0.24 -0.42 1.02 -0.31 -0.62 -0.39 -0.33 0.68 -0.2 -0.67 -0.31 -0.55 -0.04 -0.17 0.33
0.18 -0.08 -0.34 -0.72 0.06 -0.0 -0.26 -0.49 -0.14 -0.02 -0.26 -0.19 -0.01 0.84 0.13 0.06 -0.14 0.92 -0.31 -0.23 -0.1 -0.16 0.8 -0.04 -0.16 -0.18 -0.14 -0.24 -0.0 -0.19
-0.15 -0.22 -1.0 -1.43 0.22 0.55 0.07 -0.62 -0.98 -0.39 -0.39 -0.24 0.11 1.39 0.21 -0.24 -0.09 1.03 -0.29 -0.34 -0.19 -0.11 1.31 -0.15 -0.52 -0.02 -0.11 -0.35 -0.6 -0.64
Spov3_chr1.05111 (CCoAOMT1)
 -0.18 -0.31 -0.87 -1.12 0.04 -0.0 -0.15 -0.27 -1.01 -0.6 -0.45 -0.48 0.16 1.6 0.25 0.03 -0.0 1.29 -0.33 -0.35 -0.27 -0.32 1.43 -0.31 -0.47 -0.24 -0.24 -0.51 -0.57 -0.64
-0.57 -0.31 -0.84 -1.65 -0.83 -0.74 -1.13 -0.64 -1.51 -1.77 -1.63 -1.36 -0.62 2.32 -0.09 -0.39 -1.07 2.9 -0.82 -1.57 -0.96 -0.72 1.94 -1.44 -1.37 -1.27 -1.56 -1.99 -1.21 -0.54
-1.15 -0.41 -1.21 -1.78 0.02 -0.41 -1.21 -0.59 -1.51 -1.19 -1.31 -0.71 0.47 2.77 0.26 -0.29 -0.29 2.43 -1.28 -1.08 -0.99 -0.6 0.56 -0.92 -1.09 -1.02 -0.6 -1.18 -1.46 -0.9
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0.04 -0.02 -0.5 -0.51 0.37 0.1 -0.2 -0.01 -0.26 -0.09 -0.33 -0.02 -0.12 1.33 0.33 0.29 0.21 0.37 -0.45 -0.19 -0.12 -0.16 0.15 -0.14 -0.14 -0.23 -0.23 -0.42 -0.53 -0.08
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-0.02 0.18 -0.51 -0.87 0.32 0.08 -0.36 -0.56 -0.1 -0.0 -0.24 -0.28 -0.4 1.32 0.01 -0.15 -0.05 1.11 -0.27 -0.43 -0.02 -0.19 0.6 -0.23 -0.35 -0.0 -0.14 -0.24 -0.11 -0.5
-0.13 -0.06 -0.36 -0.45 0.26 0.1 -0.12 -0.28 -0.02 -0.0 -0.08 -0.09 -0.21 1.01 0.31 0.28 0.25 0.32 -0.11 -0.11 0.0 -0.07 0.21 0.02 -0.22 -0.02 -0.17 -0.54 -0.41 -0.31
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0.11 0.21 -1.07 -1.52 -0.04 0.54 -0.27 -0.71 -1.09 -0.83 -0.72 -0.73 0.19 2.16 0.38 0.04 -0.08 1.16 -0.36 -0.74 -0.47 -0.63 0.5 -0.36 -0.8 -0.42 -0.69 -0.18 -0.28 0.17
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Spov3_chr3.03933 (CYP86B1)
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-0.28 -0.23 -0.53 -0.98 0.56 0.03 -0.5 -0.63 -0.23 -0.09 -0.19 -0.21 -0.57 2.03 0.2 0.05 0.1 1.02 -0.3 -0.46 -0.16 -0.41 -0.47 -0.29 -0.4 -0.07 -0.11 -0.23 -0.4 -0.5
-0.07 -0.0 -0.21 -0.31 -0.13 -0.14 -0.17 -0.19 -0.08 -0.03 -0.03 -0.03 0.05 0.74 -0.07 -0.06 -0.03 0.67 -0.02 -0.13 -0.07 -0.07 -0.07 0.17 0.14 -0.1 -0.09 0.08 0.03 -0.35
-0.94 -0.16 -1.64 -1.79 0.5 0.33 -0.13 -0.71 -0.91 -0.22 -1.13 -0.79 0.92 2.37 0.09 0.09 -0.11 1.68 -0.94 -0.6 -0.34 -0.55 0.04 -0.56 -0.93 -1.01 -0.77 -0.44 -0.47 -0.74
-3.54 -3.42 -4.22 -6.88 -0.94 0.77 -5.17 -2.77 -2.54 -0.26 -4.11 -2.6 1.46 3.59 0.13 -0.35 -1.47 2.64 -2.57 -2.26 -1.42 -2.86 -2.8 -3.05 -4.19 -3.2 -3.05 -4.14 -2.78 0.29
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0.02 0.15 -0.37 -0.51 0.17 -0.07 -0.28 -0.33 -0.45 -0.41 -0.43 -0.37 -0.36 1.5 0.39 0.15 0.12 0.79 -0.28 -0.4 -0.26 -0.32 0.24 -0.04 -0.35 -0.18 -0.25 -0.51 -0.09 0.42
-0.03 -0.08 -0.26 -0.31 0.32 0.12 -0.08 -0.42 -0.15 -0.19 -0.2 -0.19 0.23 1.16 0.23 -0.03 0.14 0.74 -0.32 -0.35 -0.18 -0.26 0.08 -0.05 -0.37 -0.21 -0.29 -0.08 -0.13 -0.12
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0.07 0.13 -0.18 -0.2 0.22 -0.16 -0.22 -0.2 -0.13 -0.08 -0.05 -0.18 0.1 0.85 0.19 0.21 0.14 0.58 -0.23 -0.19 -0.13 -0.18 0.02 -0.32 -0.19 -0.03 0.01 -0.22 -0.23 -0.11
Spov3_S04.00014 (NRPB12)
 -0.0 0.08 -0.25 -0.35 0.37 -0.11 -0.24 -0.45 -0.31 0.01 -0.37 -0.35 -0.18 0.82 0.07 0.06 -0.28 0.79 0.07 -0.11 0.05 -0.08 0.06 0.2 -0.08 0.03 -0.01 -0.29 -0.03 -0.1
Spov3_S05.00063 (DELTA-OAT)
 0.05 0.02 -0.12 -0.06 0.15 -0.07 -0.13 -0.06 -0.09 -0.03 -0.24 -0.19 -0.1 1.07 0.14 0.14 -0.15 0.45 -0.18 -0.16 -0.15 -0.16 0.13 -0.19 -0.29 -0.22 -0.09 -0.18 -0.06 -0.03
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.