1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_152 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
0.23 0.07 0.3 0.28 0.05 -0.69 -0.32 0.26 -0.15 0.04 0.1 -0.05 0.19 -1.29 -0.39 -0.2 -0.04 0.01 -0.07 -0.13 0.17 0.03 0.14 0.13 0.37 -0.01 0.35 0.17 -0.08 -0.51
0.03 0.08 0.14 0.45 -0.19 -0.4 -0.26 0.22 -0.09 0.01 0.03 -0.08 0.19 -0.27 0.09 -0.03 0.12 -0.43 -0.18 -0.18 -0.08 -0.05 0.65 -0.12 -0.02 -0.07 0.05 0.13 -0.08 -0.17
0.11 -0.05 0.11 0.28 -0.11 -0.25 -0.04 0.22 0.02 0.02 0.11 0.0 0.13 -0.33 -0.02 0.01 0.07 -0.26 -0.07 -0.13 -0.14 -0.14 0.27 -0.29 0.01 -0.03 0.04 0.24 0.1 -0.11
0.28 -0.03 0.08 0.3 0.13 -0.54 -0.17 0.25 -0.31 -0.23 0.05 -0.21 0.49 -0.75 -0.15 -0.08 0.01 -0.01 -0.24 -0.24 -0.22 -0.19 0.23 0.09 0.29 -0.04 0.13 0.32 0.22 -0.17
0.37 0.12 0.09 0.26 -0.22 -0.84 -0.38 0.16 -0.15 0.1 0.02 -0.16 0.25 -0.5 -0.26 -0.09 -0.06 -0.2 -0.16 -0.3 -0.01 -0.1 0.38 0.15 0.06 0.08 0.23 0.31 0.13 0.04
0.09 -0.01 0.13 0.37 -0.13 -0.22 -0.13 0.37 -0.21 -0.25 -0.17 -0.27 0.25 -0.49 0.15 0.11 0.14 0.12 -0.13 -0.12 -0.02 -0.07 0.41 -0.29 -0.08 -0.09 0.08 -0.02 -0.12 0.12
0.14 -0.02 0.08 0.19 -0.11 -0.38 -0.04 0.27 -0.15 0.04 0.05 -0.01 0.3 -0.13 0.09 -0.02 0.13 -0.49 -0.33 -0.3 -0.09 -0.0 0.29 -0.05 0.05 -0.09 0.11 0.21 0.01 -0.15
0.02 -0.03 0.07 0.24 0.16 -0.95 -0.76 0.07 0.05 0.24 0.11 -0.09 0.44 -1.19 -0.38 -0.19 -0.12 -0.19 -0.13 -0.07 0.02 -0.1 0.43 0.19 0.22 0.12 0.42 0.43 0.04 -0.41
-0.21 -0.27 -0.13 0.22 0.13 -0.52 -0.24 0.43 -0.08 0.13 0.05 -0.11 0.39 -0.32 -0.06 -0.06 -0.02 -0.39 0.05 -0.11 0.09 -0.11 0.08 0.16 0.26 0.08 0.37 0.18 -0.07 -0.51
Spov3_chr1.02862 (ATRBP45C)
 -0.08 -0.09 0.1 0.4 -0.24 -0.28 -0.24 0.16 0.06 0.06 -0.02 -0.03 0.19 -0.2 0.06 0.03 0.08 0.14 -0.25 -0.22 -0.09 -0.12 0.52 -0.37 -0.18 -0.14 0.04 0.12 0.09 0.09
-0.09 -0.03 0.02 0.48 -0.17 -0.38 -0.21 0.24 -0.15 -0.24 -0.08 -0.24 0.5 -0.3 0.25 0.07 0.2 0.09 -0.21 -0.18 -0.16 -0.12 0.46 -0.16 -0.04 -0.17 -0.02 0.0 -0.1 0.17
0.33 0.01 -0.02 0.3 -0.33 -1.56 -0.63 -0.19 -0.24 0.32 0.17 -0.25 0.8 -1.5 -0.46 -0.26 0.13 -0.65 0.21 -0.14 0.07 0.1 0.87 0.03 0.42 -0.06 0.3 0.38 -0.29 -0.43
0.25 0.27 0.25 0.32 -0.16 -0.18 -0.09 0.17 -0.32 -0.23 -0.1 -0.17 -0.07 -0.2 0.06 0.09 0.12 0.01 -0.25 -0.33 -0.15 -0.09 0.44 -0.1 -0.09 -0.04 -0.03 0.12 0.04 0.07
-0.02 -0.05 0.06 0.13 0.02 -1.07 -0.12 0.43 -0.2 0.02 0.06 -0.04 0.45 -1.0 -0.32 -0.22 -0.11 -0.7 -0.08 -0.0 0.0 0.04 0.65 -0.15 0.44 0.06 0.26 0.24 0.17 -0.27
-0.05 0.01 0.05 0.25 -0.07 -0.23 -0.28 0.24 -0.03 -0.01 -0.05 -0.2 -0.07 -0.35 0.03 -0.03 0.05 -0.13 -0.08 -0.16 0.07 -0.08 0.46 -0.15 -0.0 0.08 0.2 0.18 0.04 0.04
-0.11 0.02 -0.05 0.33 -0.1 -0.3 -0.14 0.26 -0.14 0.01 0.03 -0.12 0.27 -0.07 0.01 -0.06 0.08 0.12 -0.32 -0.27 -0.07 -0.14 0.49 -0.01 -0.01 -0.18 0.05 0.16 0.01 -0.1
0.1 0.02 0.05 0.17 -0.03 -0.22 -0.07 0.17 -0.12 -0.12 -0.02 -0.08 0.15 -0.51 0.23 0.16 0.24 -0.32 -0.05 -0.16 0.03 0.01 -0.05 -0.02 0.12 0.08 0.2 0.04 -0.18 -0.09
0.24 -0.06 0.15 0.17 -0.11 -0.48 -0.1 0.17 -0.07 -0.04 -0.02 -0.11 0.08 0.07 0.05 0.01 0.15 -0.18 -0.18 -0.06 -0.1 -0.13 0.21 -0.1 0.05 -0.0 0.08 0.17 -0.01 -0.06
0.31 0.29 0.22 0.54 0.23 -0.41 -0.5 -0.07 -0.13 0.27 -0.16 -0.11 0.22 -0.84 -0.38 -0.14 -0.1 -0.12 -0.38 -0.55 0.03 -0.09 -0.14 -0.16 0.2 0.08 0.29 0.41 0.1 0.11
0.06 0.04 0.12 0.42 0.14 -0.04 -0.2 0.31 -0.29 -0.24 -0.16 -0.25 -0.02 -0.34 0.06 0.05 0.07 0.08 -0.17 -0.26 -0.02 -0.1 0.54 -0.15 0.03 -0.1 -0.04 0.02 -0.02 0.07
-0.49 -0.28 -0.46 -0.19 0.07 -1.42 -0.53 0.14 -0.24 0.21 0.02 -0.14 0.74 -1.34 -0.14 0.01 0.03 -0.07 0.04 -0.16 0.16 0.03 0.64 0.31 0.37 0.43 0.54 0.21 0.03 -0.67
0.2 0.11 0.13 0.21 -0.12 -0.32 -0.04 0.28 -0.19 -0.13 -0.1 -0.17 0.18 -0.08 0.12 0.03 0.12 0.05 -0.25 -0.2 -0.11 -0.08 0.37 -0.22 -0.0 -0.1 0.05 0.08 -0.08 -0.03
0.35 0.06 0.1 0.2 -0.28 -0.35 -0.19 0.08 -0.08 -0.03 -0.01 -0.02 0.41 -0.25 -0.03 -0.23 -0.0 -0.25 -0.18 -0.29 -0.21 -0.2 0.31 -0.08 0.03 -0.02 0.11 0.45 0.05 0.1
-0.29 -0.05 -0.11 0.5 0.02 -0.31 -0.59 0.72 -0.47 -0.27 -0.17 -0.31 0.52 -0.59 0.04 0.16 0.2 0.57 -0.15 -0.14 -0.14 -0.18 0.23 -0.45 -0.22 -0.19 0.12 0.05 -0.17 0.46
-0.25 -0.18 0.15 0.76 -0.31 -0.47 -0.43 0.39 -0.14 -0.06 -0.01 -0.11 0.65 -0.37 0.17 -0.02 0.13 -0.47 -0.28 -0.21 -0.15 -0.12 0.5 -0.27 -0.04 -0.21 0.17 -0.01 0.03 0.15
Spov3_chr2.04733 (ATRBP45C)
 -0.05 -0.08 0.11 0.53 -0.21 -0.35 -0.29 0.22 0.01 0.01 -0.03 -0.14 0.25 -0.11 -0.01 -0.07 -0.09 0.02 -0.19 -0.18 -0.07 -0.1 0.57 -0.37 -0.09 -0.06 0.1 0.13 -0.07 0.13
-0.15 -0.08 0.08 0.36 -0.1 -0.44 -0.13 0.49 -0.33 -0.21 -0.19 -0.34 0.36 -0.17 0.06 -0.07 0.05 0.42 -0.22 -0.22 -0.1 -0.0 0.4 -0.31 -0.03 -0.2 0.07 0.09 0.02 0.24
Spov3_chr3.00030 (MAP70-3)
 0.04 -0.01 0.02 0.22 0.01 -0.38 -0.13 0.2 -0.05 0.07 0.04 -0.07 -0.06 -0.38 -0.02 -0.06 0.03 -0.14 -0.1 -0.24 0.04 0.01 0.11 0.02 0.18 0.12 0.29 0.24 -0.0 -0.24
-0.15 -0.09 0.34 0.79 -0.08 -0.34 -0.39 0.39 -0.13 -0.13 -0.06 -0.17 0.06 -0.87 -0.11 0.12 0.06 -0.1 -0.13 -0.12 -0.12 0.07 0.18 -0.63 0.2 0.1 0.29 -0.09 0.05 0.14
0.0 0.0 0.14 0.41 0.02 -0.25 -0.23 0.15 -0.15 -0.04 -0.1 -0.07 0.27 -0.15 -0.03 -0.04 0.04 0.04 -0.2 -0.13 0.02 -0.07 0.26 -0.22 -0.12 -0.03 0.04 0.12 -0.02 0.09
0.06 0.01 -0.03 0.36 -0.03 -0.15 -0.21 0.24 -0.08 -0.14 0.03 0.03 0.25 -0.28 0.1 0.12 0.1 -0.08 -0.16 -0.12 -0.1 -0.09 0.16 -0.13 -0.02 -0.07 0.03 0.16 -0.07 -0.1
-0.11 -0.1 -0.05 0.05 -0.26 -0.17 -0.01 0.38 0.07 0.1 0.19 0.15 0.13 -0.07 -0.12 -0.1 0.12 -0.73 -0.02 -0.04 0.07 0.03 -0.18 0.02 0.16 -0.01 0.18 0.12 -0.09 -0.05
-0.17 0.1 0.03 0.08 0.41 -0.88 -0.25 -0.29 -0.17 0.2 0.13 -0.02 0.55 -0.94 -0.62 -0.65 -0.19 0.09 -0.03 -0.32 0.05 -0.03 0.34 0.23 0.33 0.08 0.35 0.52 0.18 -0.49
0.03 0.08 0.32 0.88 0.02 -0.66 -0.71 0.51 -0.03 -0.22 -0.1 -0.36 0.51 -0.68 -0.12 -0.02 0.02 0.26 -0.82 -0.28 -0.25 -0.36 0.69 -0.28 -0.19 -0.32 0.02 0.2 -0.02 0.22
-0.02 0.04 0.03 0.35 0.08 -0.18 -0.28 0.16 -0.21 -0.05 -0.07 -0.11 0.28 -0.03 0.02 -0.04 -0.01 -0.1 -0.32 -0.3 -0.14 -0.1 0.47 -0.13 -0.04 -0.06 0.11 0.21 0.09 0.03
0.3 0.25 -0.05 0.06 0.17 -0.12 0.03 -0.14 -0.18 -0.06 -0.23 -0.24 -0.18 0.17 -0.06 -0.11 -0.0 -0.03 -0.09 -0.13 -0.05 -0.01 -0.16 0.08 -0.05 0.14 0.27 0.24 0.07 -0.14
-0.58 -0.57 -0.71 -0.11 0.38 -0.45 0.35 0.04 -0.37 0.33 0.21 0.0 0.55 -2.3 -1.04 -0.64 -0.14 -0.03 -0.04 0.1 0.19 0.25 0.62 0.37 0.51 0.2 0.46 0.32 -0.16 -0.71
0.0 -0.05 0.2 0.63 -0.18 -0.23 -0.2 0.46 -0.37 -0.43 -0.22 -0.39 0.38 -0.26 0.2 0.17 0.21 0.56 -0.39 -0.31 -0.25 -0.19 0.59 -0.28 -0.16 -0.34 -0.12 0.08 -0.08 -0.05
-0.4 -0.28 0.18 0.81 -0.28 -0.33 -0.7 0.52 0.01 -0.21 0.0 -0.16 0.33 -0.4 -0.05 0.09 0.15 0.54 -0.37 -0.27 -0.21 -0.23 0.82 -0.55 -0.18 -0.25 0.04 -0.03 -0.19 0.15
0.13 0.09 0.17 0.23 -0.18 -0.27 -0.19 0.22 -0.14 -0.13 -0.07 -0.11 0.07 -0.21 0.15 0.06 0.13 -0.13 -0.14 -0.1 -0.06 -0.01 0.45 -0.21 -0.09 -0.09 -0.0 0.06 -0.05 0.13
-0.06 -0.07 0.31 0.64 0.07 -0.56 -0.35 0.31 -0.13 -0.05 -0.2 -0.19 0.26 -0.87 -0.17 -0.05 -0.1 0.15 -0.16 -0.25 0.08 0.01 0.56 -0.47 -0.06 -0.06 0.19 0.13 0.02 0.14
0.26 0.16 0.1 0.21 0.41 -0.53 -0.41 -0.2 -0.05 -0.04 -0.02 -0.03 0.02 0.02 -0.12 -0.24 -0.03 -0.15 -0.07 -0.2 0.01 -0.02 0.21 0.05 0.19 0.07 0.23 0.18 -0.17 -0.24
0.17 0.03 0.12 0.1 -0.19 -1.67 -0.44 0.65 -0.01 0.44 0.23 -0.0 0.45 -1.5 -0.91 -0.74 -0.56 -0.84 0.02 -0.17 0.04 0.11 0.24 0.29 0.5 0.09 0.44 0.65 0.18 -0.62
0.06 0.03 0.08 0.4 -0.18 -0.28 -0.29 0.15 -0.09 -0.08 -0.07 -0.05 0.21 -0.25 0.04 -0.01 0.1 0.05 -0.2 -0.27 -0.15 -0.1 0.46 -0.15 0.0 -0.11 0.07 0.23 0.04 -0.01
-0.2 -0.18 0.02 0.57 -0.31 -0.34 -0.3 0.37 -0.15 -0.04 0.13 -0.19 0.35 -0.06 0.06 0.01 0.28 0.12 -0.13 -0.2 -0.15 -0.1 0.55 -0.26 -0.32 -0.19 0.06 -0.03 -0.15 0.14
0.04 0.14 0.06 0.16 -0.05 -0.32 -0.03 0.23 -0.09 -0.02 0.03 -0.07 -0.03 -0.54 0.05 0.02 0.14 -0.47 -0.06 -0.01 0.06 0.04 -0.0 -0.05 0.09 0.14 0.2 0.13 -0.01 -0.07
-0.14 -0.18 0.13 0.31 -0.03 -0.2 -0.07 0.36 0.03 0.0 0.07 0.09 0.02 -0.41 0.06 -0.03 0.17 -0.16 -0.02 -0.17 -0.08 -0.07 0.33 -0.15 -0.0 -0.13 -0.02 0.24 0.01 -0.26
0.19 0.22 0.02 0.0 0.17 -0.11 -0.17 -0.15 -0.11 0.08 -0.03 -0.09 -0.09 0.02 -0.02 -0.02 0.02 -0.09 -0.08 -0.16 0.02 -0.06 0.02 -0.07 0.07 0.02 0.18 0.26 0.03 -0.21
0.04 0.19 0.3 0.81 -0.28 -0.38 -0.39 0.38 -0.46 -0.43 -0.17 -0.45 0.46 -0.37 -0.01 0.01 0.15 -0.1 -0.31 -0.2 -0.23 -0.17 0.67 -0.26 -0.17 -0.35 -0.04 0.24 -0.04 0.36
-0.31 -0.1 -0.02 0.09 -0.15 -0.58 -0.12 0.55 0.23 0.1 0.27 0.09 0.08 -0.63 0.21 0.03 0.24 -0.9 -0.13 0.1 0.19 0.01 -0.6 0.05 0.11 -0.0 0.2 0.14 0.23 -0.31
-0.08 0.09 0.01 0.11 0.09 -0.61 -0.07 0.44 0.06 0.09 0.12 0.12 0.07 -0.45 0.15 0.15 0.18 -0.99 -0.35 -0.2 -0.02 -0.06 0.07 -0.14 0.03 0.13 0.28 0.19 0.16 -0.33
-0.05 -0.07 0.06 0.39 -0.2 -0.4 -0.38 0.32 -0.08 -0.07 0.13 0.02 0.35 -0.28 0.1 0.11 0.25 0.1 -0.29 -0.19 -0.17 -0.08 0.26 -0.08 0.02 -0.1 0.0 0.16 -0.2 -0.07
0.34 0.18 -0.0 0.23 -0.02 -1.28 -0.53 0.51 0.04 0.18 0.16 0.09 0.2 -1.94 -0.45 -0.36 -0.07 -0.0 -0.12 -0.17 -0.01 -0.0 0.4 0.06 0.15 0.1 0.35 -0.22 0.22 0.07
-0.03 0.01 0.12 0.33 -0.21 -0.39 -0.5 0.19 -0.2 -0.02 0.07 -0.11 0.4 -0.02 0.23 0.07 0.05 0.03 -0.19 -0.32 -0.06 -0.13 0.31 -0.05 -0.07 -0.1 -0.1 0.22 0.05 -0.0
-0.02 -0.03 0.1 0.49 -0.32 -0.39 -0.27 0.18 -0.27 -0.15 -0.06 -0.15 0.45 0.02 0.04 -0.01 0.12 0.03 -0.2 -0.17 -0.1 -0.02 0.48 -0.06 -0.04 -0.14 0.08 0.14 -0.16 -0.02
-0.08 -0.12 -0.03 0.33 -0.15 -0.29 -0.33 0.38 -0.0 -0.14 0.03 -0.15 0.24 -0.25 0.22 0.12 0.18 0.21 -0.05 -0.02 -0.02 0.02 0.31 -0.2 -0.17 -0.18 -0.11 -0.11 -0.05 0.05
-0.12 -0.14 -0.03 0.03 -0.06 -0.27 -0.09 0.3 0.2 0.15 0.14 0.03 -0.22 -0.0 -0.14 -0.21 -0.14 -0.5 -0.01 -0.01 0.07 0.1 -0.27 0.05 0.13 0.1 0.19 0.13 0.16 0.15
-0.52 -0.2 -0.32 0.03 -0.4 -2.12 -0.1 1.24 -0.37 0.3 -0.14 -0.15 0.95 -1.27 -0.93 -0.55 -0.34 -1.43 0.15 0.02 0.1 0.1 0.09 0.36 0.39 -0.14 0.35 0.77 0.26 -0.37
0.03 0.09 0.12 0.34 -0.15 -0.26 -0.26 0.35 -0.17 -0.01 -0.0 -0.07 0.13 -0.16 0.04 -0.03 0.12 -0.27 -0.23 -0.23 -0.07 -0.04 0.43 -0.28 -0.05 -0.04 0.13 0.15 0.04 0.0
-0.19 -0.03 0.25 1.11 -0.39 -0.36 -0.6 1.15 -0.76 -0.49 -0.39 -0.31 -0.0 -0.81 -0.06 -0.4 0.03 0.98 -0.69 -0.69 -0.42 -0.39 1.0 -0.79 -0.48 -0.42 -0.0 -0.11 -0.01 0.6
-0.14 -0.18 0.08 0.53 -0.29 -0.43 -0.47 0.28 -0.09 -0.04 -0.03 -0.05 0.39 -0.2 0.19 0.04 0.13 0.3 -0.23 -0.23 -0.01 -0.04 0.38 -0.36 -0.3 -0.13 0.07 -0.02 0.01 0.2
0.26 0.1 0.21 0.34 0.29 -0.58 -0.43 -0.03 -0.11 0.02 0.14 -0.04 0.33 -0.12 -0.22 -0.09 -0.03 -0.35 -0.16 -0.26 -0.12 -0.16 0.17 0.01 0.17 -0.08 0.2 0.26 -0.02 -0.21
0.27 0.16 0.25 0.68 -0.23 -0.45 -0.38 0.6 -0.31 -0.41 -0.31 -0.43 0.32 -0.18 0.07 -0.05 0.01 0.24 -0.4 -0.35 -0.18 -0.15 0.73 -0.32 -0.18 -0.42 -0.1 0.06 0.07 0.18
0.2 0.12 0.12 0.29 -0.04 -0.37 -0.24 0.11 -0.08 0.05 -0.07 -0.09 0.11 -0.13 -0.1 -0.09 -0.04 -0.12 -0.11 -0.18 0.02 -0.02 0.01 -0.08 0.12 -0.0 0.2 0.2 0.05 -0.04
-0.04 0.06 0.26 0.65 0.02 -0.18 -0.21 0.57 -0.33 -0.33 -0.23 -0.3 0.09 -0.14 0.06 0.03 0.2 0.28 -0.23 -0.31 -0.12 -0.08 0.23 -0.24 -0.19 -0.18 -0.02 0.16 -0.08 -0.05
0.05 0.11 0.15 0.29 -0.1 -0.27 -0.11 0.18 -0.06 -0.02 -0.03 -0.1 0.12 -0.16 0.09 0.03 0.13 -0.4 -0.22 -0.24 -0.04 -0.07 0.41 -0.13 -0.01 -0.03 0.06 0.18 -0.02 -0.1

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.