Heatmap: Cluster_18 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 260 uE m-2 s-1	Light: 195 uE m-2 s-1	Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 65 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L18D6	Photoperiod: L13D11 (Control)	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C (Control)	Temperature: 25°C	Temperature: 30°C
Spov3_C0001.00036	-0.14	-	-	0.9	-	-	1.78	-	-	-	0.07	1.78	-	2.19	1.39	-	0.96	-	-	-0.4	0.84	0.72	-	-	-	-	-	2.08	0.81	-
Spov3_C0001.00230 (ACS1)	-	-	-	-	3.51	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.38	-	-	-	-	3.11	2.26	-
Spov3_C0003.00085	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-
Spov3_C0004.00111	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-
Spov3_C0006.00005 (PERK6)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-
Spov3_C0024.00004 (LAC11)	1.51	-	2.1	-	1.12	0.26	-	-	0.28	-	0.39	0.3	0.56	-	-	-	-	-	-	-	1.38	0.33	0.24	-	1.22	1.43	0.24	1.6	-	-
Spov3_C0025.00043	-	0.2	0.23	-0.47	-0.19	0.58	0.13	-0.09	0.41	1.07	-0.75	-0.36	0.98	0.9	0.04	-	-0.62	0.29	-	-	-	-	-0.88	-	-0.24	0.34	-	0.88	-0.2	2.5
Spov3_C0026.00022 (OBGL)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.54	4.2	-	-
Spov3_C0032.00036	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.01	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.46	-	-
Spov3_C0057.00011 (cPT6)	-	2.32	-	-	-	2.12	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.25	-	-	3.48	-	-
Spov3_C0061.00014 (TBL31)	-	-	-	-	-	-	-	-	2.12	2.53	-	-	-	-	-	1.29	2.48	-24.76	-	-	-16.97	-	-	1.52	-	-	-	3.02	-0.24	-
Spov3_C0251.00001	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.34	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.31	-	-
Spov3_C0494.00002 (RLK7)	1.5	1.36	-	-0.5	1.17	-0.17	-	-	-1.07	-	-	-1.5	-	0.42	-	-	0.66	0.05	-	-1.99	-1.81	-	1.58	-1.65	0.54	-0.85	-	2.98	0.95	-1.6
Spov3_C0560.00001 (QKY)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-
Spov3_C0633.00001	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-
Spov3_chr1.00466 (DDF1)	-	-	-	-	1.94	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.12	-	-	-	-	-	2.97	-	-	3.8	-	-
Spov3_chr1.01397 (APD2)	0.36	-	0.26	0.5	2.06	-0.02	-0.69	-0.77	-1.0	-0.78	-0.76	-0.98	1.47	0.67	1.01	-	-	1.53	-	-1.03	-0.91	-	-0.96	-	0.94	-1.14	-	-	0.16	1.72
Spov3_chr1.01926 (ABI2)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.53	2.56	-	-	-	-	-	-	2.26	-	-	-	2.56	-	-	-	-	-	2.93	-	-
Spov3_chr1.02653 (ESP4)	2.6	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.57	-	3.01	-	-	-	-	-	-	0.87	1.93	-	-	-	-	-	2.1	-	-
Spov3_chr1.02785 (PAL2)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-
Spov3_chr1.02935 (RRT1)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-
Spov3_chr1.03528	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-
Spov3_chr1.04333 (ZCW7)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-
Spov3_chr2.01026 (BBX12)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.03	-	2.81	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.74	-	-	-
Spov3_chr2.01363	-	-	-	-	-	-	2.72	-	-	1.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.56	-	-	-	-	-	3.72	-	1.8
Spov3_chr2.01545	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.5	-	-	-	2.42	-	-	-	2.6	-	-	-	-	-	-	-	-	3.69	-	-
Spov3_chr2.01892	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-
Spov3_chr2.02362 (AtDOB10)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.04	-	-	-	-	-	4.44	-	-
Spov3_chr2.03615	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.26	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.44	-	-	-	-
Spov3_chr2.04005 (PIRL3)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-
Spov3_chr2.04220	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.74	-	-	4.06	-	-
Spov3_chr2.04961 (CEP2)	-	-	-	-	3.48	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.18	3.84	-	-
Spov3_chr2.05209	1.53	-	-	-	2.13	-	-	-	1.06	-	0.3	-	1.23	-	-	-	-	2.0	-	-	-	1.64	-	-	0.95	0.03	1.22	-	1.25	1.18
Spov3_chr2.05435	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.14	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.63	-	-
Spov3_chr2.05692 (PDR5)	-	-	-	-	-	3.27	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.35	-	-
Spov3_chr3.00357 (CYSB)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-
Spov3_chr3.00594 (CHL1)	-	-	-	-	-	-	-	2.85	-	-	-	-	2.3	1.85	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-0.01	-	-	-0.0	3.62	-	-
Spov3_chr3.00652 (WYR)	-	-	-	-	3.15	-	-	-	-	-	-	-	-	3.36	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.43	-	-
Spov3_chr3.01111 (VIM4)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-
Spov3_chr3.01193 (BZIP24)	1.73	-	-	0.46	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.78	-	0.85	0.58	-	-	-	-	-	-	-	-	1.71	1.56	1.97	0.82	1.7
Spov3_chr3.01580 (FAR1)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.77	-	2.64	4.08	-	-
Spov3_chr3.01915 (E2FB)	-	-	3.81	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.99	-	-
Spov3_chr3.02036	-	-	-	-	3.71	-	-	-	-	-	-	-	4.08	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr3.02129 (PCP-Bgamma)	-	-	-	-	2.72	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.92	-	-	-	-	-	0.91	-	-	0.86	3.77	1.17	0.94
Spov3_chr3.02384	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-
Spov3_chr3.02652 (WRKY42)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.32	3.19	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.45	-	-
Spov3_chr3.03767 (BGLU42)	-	-	-	-	1.67	1.36	-	-	-	-	-	-	3.67	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.46	1.38	-	2.63	-
Spov3_chr4.00147 (DUF2)	-	-	-	-	2.68	-	-	-	1.67	-	-	-	1.72	-	-	1.74	-	1.66	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.97	2.74
Spov3_chr4.00272	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-
Spov3_chr4.00410 (mTERF35)	-	-	-	-	3.4	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.28	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr4.01341	-	-	-	-	3.14	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.31	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.49	-	-
Spov3_chr4.01808	-	-	1.72	-	-	2.05	-	0.58	-	-	0.86	-	-	-	-	-	-	0.66	0.83	-	-	-	1.52	1.86	-	0.58	-	2.98	-	-
Spov3_chr4.02179	0.47	1.4	-1.49	0.9	-	-1.95	-	1.13	-	-1.7	-	0.35	-	2.14	-0.8	-	-	-	-0.68	-	-0.41	0.35	-0.12	1.36	-	0.43	-0.31	2.18	0.42	-0.7
Spov3_chr4.02276	0.87	-	1.78	-	-	-	-	-	-	-	1.87	-	-	-	-	-	0.65	-	-	-	-	1.51	0.88	-	0.56	-	0.57	3.57	-	-
Spov3_chr4.02691 (PFA1)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-
Spov3_chr4.03553 (BAS)	-0.52	-	-0.51	1.04	1.86	0.22	-0.48	-	0.93	-	1.02	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-0.75	3.18	-	-	-	-	2.43	1.03	-
Spov3_chr4.04227 (VAC1)	-	1.58	-	-	-	-21.09	-	2.21	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.57	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.04	-	-
Spov3_chr4.04511 (HSFA2)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.72	-	-	-	-	2.24	-	-	-	-	3.6	-	-
Spov3_chr5.00211 (BGLU46)	-	-	-	-	3.08	-	-	-	-	-	1.8	-	3.88	-	-	1.76	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr5.01110	-	-	-	-	1.54	-	-	1.71	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.36	-	-	-	2.32	1.47	-	-	-	-	3.39	-	1.6
Spov3_chr5.02063	-	0.45	-	0.04	-	-	-	-	1.53	-	-	-	-	1.55	0.42	-	-	2.58	0.5	1.37	-	-	-	1.29	-	0.18	-	2.78	-	-
Spov3_chr5.02598 (CARK6)	-	-	-	-	3.01	-	-	-	-	-	1.67	-	3.12	-	-	-	-	2.31	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.36
Spov3_chr5.03129	-	-	-	-	3.36	-	-	-	-	-	-	-	3.42	-	-	-	-	3.17	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr5.03458 (PII1)	-	-	2.96	-	-	-	-	-	-	-	2.83	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.66	-	-	3.14	-	-
Spov3_chr6.02134 (FRO3)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-
Spov3_chr6.03010	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.69	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.1	-	-
Spov3_chr6.03194	-	-	-	-	3.29	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.34	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_S01.00141 (NLP3)	-	1.36	-	1.37	1.8	1.11	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.22	-	2.65	-	-	2.53	-	1.32
Spov3_S04.00077 (NPC4)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-
Spov3_S08.00071	-	-	-	-	3.96	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.85	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_S10.00007	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-
Spov3_S11.00015	-	-	-	-	-	-	0.88	-	-	2.04	-	-	-	-	-	-	-	0.86	-	-	-	-	2.0	-	-	-	2.57	3.33	1.18	-

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.