Heatmap: Cluster_77 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
0.31 0.33 0.6 1.0 0.28 0.26 0.23 0.37 0.34 0.34 0.37 0.34 0.51 0.11 0.34 0.33 0.35 0.33 0.32 0.3 0.38 0.34 0.35 0.25 0.4 0.37 0.5 0.47 0.36 0.36
0.29 0.39 0.53 1.0 0.36 0.17 0.15 0.32 0.23 0.33 0.28 0.25 0.65 0.1 0.22 0.21 0.26 0.44 0.3 0.21 0.32 0.32 0.5 0.28 0.4 0.29 0.46 0.57 0.38 0.26
0.57 0.54 0.73 1.0 0.45 0.3 0.32 0.48 0.46 0.54 0.49 0.47 0.64 0.24 0.4 0.38 0.38 0.49 0.4 0.35 0.5 0.47 0.46 0.39 0.53 0.47 0.65 0.7 0.52 0.45
0.52 0.63 0.65 1.0 0.57 0.34 0.34 0.39 0.36 0.55 0.44 0.42 0.65 0.38 0.35 0.38 0.42 0.61 0.4 0.36 0.46 0.53 0.66 0.43 0.54 0.47 0.66 0.74 0.63 0.58
0.32 0.33 0.55 1.0 0.27 0.21 0.2 0.49 0.24 0.3 0.34 0.27 0.63 0.06 0.37 0.34 0.41 0.36 0.3 0.31 0.38 0.36 0.51 0.26 0.42 0.35 0.52 0.51 0.33 0.35
0.3 0.38 0.63 1.0 0.3 0.2 0.2 0.35 0.3 0.41 0.4 0.38 0.53 0.12 0.22 0.23 0.31 0.49 0.44 0.31 0.52 0.57 0.41 0.27 0.55 0.49 0.66 0.58 0.35 0.28
0.43 0.54 0.57 1.0 0.53 0.22 0.23 0.31 0.36 0.56 0.37 0.34 0.7 0.22 0.22 0.24 0.24 0.6 0.39 0.32 0.4 0.43 0.43 0.38 0.46 0.42 0.68 0.84 0.67 0.54
0.25 0.3 0.64 1.0 0.22 0.08 0.14 0.37 0.27 0.36 0.29 0.32 0.59 0.06 0.21 0.26 0.27 0.46 0.32 0.33 0.44 0.37 0.39 0.19 0.43 0.34 0.63 0.49 0.34 0.24
0.55 0.54 0.7 1.0 0.52 0.35 0.39 0.54 0.37 0.53 0.47 0.5 0.68 0.22 0.52 0.44 0.45 0.57 0.43 0.36 0.49 0.51 0.6 0.42 0.46 0.51 0.67 0.63 0.65 0.53
0.37 0.43 0.57 1.0 0.4 0.27 0.25 0.36 0.34 0.43 0.39 0.39 0.66 0.26 0.4 0.42 0.47 0.56 0.42 0.31 0.49 0.42 0.43 0.35 0.53 0.49 0.6 0.56 0.51 0.5
0.37 0.41 0.56 1.0 0.32 0.2 0.23 0.32 0.33 0.45 0.44 0.35 0.63 0.11 0.36 0.27 0.34 0.37 0.27 0.3 0.37 0.37 0.33 0.29 0.52 0.42 0.54 0.62 0.41 0.26
0.39 0.45 0.7 1.0 0.39 0.17 0.22 0.25 0.34 0.45 0.36 0.36 0.62 0.07 0.22 0.22 0.24 0.42 0.36 0.3 0.46 0.41 0.35 0.27 0.49 0.5 0.65 0.64 0.38 0.28
0.45 0.46 0.65 1.0 0.48 0.39 0.35 0.6 0.37 0.43 0.4 0.38 0.68 0.29 0.51 0.52 0.52 0.67 0.4 0.43 0.52 0.51 0.55 0.4 0.52 0.52 0.65 0.53 0.55 0.54
0.41 0.49 0.72 1.0 0.33 0.19 0.26 0.33 0.35 0.46 0.38 0.41 0.63 0.16 0.26 0.33 0.32 0.51 0.45 0.34 0.53 0.43 0.55 0.3 0.5 0.47 0.66 0.61 0.39 0.39
0.33 0.37 0.55 1.0 0.27 0.28 0.22 0.34 0.29 0.33 0.36 0.36 0.63 0.07 0.34 0.37 0.42 0.38 0.39 0.32 0.35 0.39 0.48 0.26 0.47 0.43 0.5 0.46 0.33 0.26
0.38 0.42 0.65 1.0 0.39 0.25 0.29 0.54 0.38 0.46 0.43 0.42 0.78 0.2 0.37 0.36 0.4 0.84 0.47 0.43 0.53 0.49 0.66 0.38 0.57 0.5 0.65 0.61 0.4 0.29
0.44 0.47 0.66 1.0 0.42 0.37 0.34 0.57 0.4 0.45 0.48 0.44 0.55 0.37 0.4 0.4 0.44 0.47 0.44 0.43 0.54 0.51 0.56 0.39 0.51 0.5 0.7 0.62 0.49 0.38
0.61 0.64 0.71 1.0 0.52 0.34 0.36 0.46 0.49 0.62 0.53 0.48 0.71 0.31 0.42 0.42 0.48 0.56 0.53 0.42 0.52 0.54 0.52 0.45 0.59 0.52 0.77 0.71 0.65 0.47
0.36 0.47 0.63 1.0 0.33 0.45 0.46 0.59 0.41 0.48 0.49 0.46 0.8 0.38 0.64 0.67 0.75 0.53 0.4 0.45 0.54 0.57 0.63 0.41 0.51 0.57 0.67 0.53 0.4 0.45
0.53 0.56 0.66 1.0 0.56 0.34 0.31 0.6 0.48 0.55 0.5 0.41 0.75 0.21 0.35 0.44 0.49 0.62 0.42 0.39 0.55 0.5 0.51 0.41 0.52 0.52 0.68 0.74 0.68 0.58
0.48 0.51 0.67 1.0 0.35 0.37 0.3 0.41 0.3 0.4 0.37 0.39 0.6 0.1 0.4 0.42 0.51 0.44 0.31 0.35 0.46 0.45 0.44 0.33 0.53 0.46 0.61 0.61 0.43 0.35
Spov3_chr3.02494 (CYCA3;1)
0.29 0.31 0.6 1.0 0.29 0.12 0.14 0.27 0.27 0.35 0.33 0.31 0.6 0.02 0.19 0.14 0.22 0.39 0.38 0.3 0.45 0.42 0.38 0.24 0.53 0.41 0.7 0.41 0.31 0.21
0.41 0.43 0.7 1.0 0.43 0.23 0.24 0.38 0.34 0.48 0.41 0.41 0.58 0.2 0.25 0.27 0.37 0.5 0.4 0.36 0.52 0.46 0.38 0.32 0.49 0.51 0.63 0.7 0.46 0.29
0.44 0.48 0.69 1.0 0.43 0.37 0.33 0.52 0.38 0.5 0.45 0.36 0.69 0.23 0.47 0.49 0.47 0.6 0.5 0.46 0.6 0.54 0.52 0.43 0.59 0.5 0.68 0.54 0.45 0.41
0.47 0.48 0.69 1.0 0.34 0.24 0.22 0.3 0.31 0.44 0.35 0.34 0.47 0.19 0.28 0.31 0.3 0.62 0.32 0.26 0.41 0.4 0.41 0.31 0.4 0.38 0.56 0.61 0.41 0.36
0.34 0.33 0.55 1.0 0.24 0.15 0.17 0.41 0.23 0.31 0.34 0.28 0.6 0.05 0.31 0.32 0.36 0.39 0.32 0.26 0.43 0.37 0.33 0.25 0.38 0.37 0.55 0.49 0.29 0.35
0.5 0.57 0.61 1.0 0.49 0.27 0.3 0.42 0.37 0.54 0.44 0.43 0.73 0.25 0.32 0.37 0.37 0.55 0.39 0.35 0.5 0.49 0.64 0.43 0.58 0.5 0.64 0.73 0.55 0.45
0.44 0.54 0.61 1.0 0.54 0.19 0.22 0.34 0.31 0.53 0.36 0.34 0.65 0.1 0.22 0.23 0.3 0.49 0.38 0.33 0.43 0.45 0.56 0.41 0.54 0.43 0.64 0.85 0.56 0.34
0.34 0.35 0.55 1.0 0.31 0.28 0.21 0.4 0.26 0.3 0.33 0.29 0.6 0.08 0.37 0.37 0.42 0.41 0.3 0.27 0.36 0.34 0.43 0.25 0.37 0.37 0.49 0.52 0.31 0.35
0.33 0.38 0.53 1.0 0.27 0.24 0.22 0.42 0.24 0.3 0.31 0.28 0.61 0.12 0.34 0.41 0.39 0.45 0.27 0.24 0.31 0.33 0.44 0.25 0.37 0.3 0.43 0.43 0.34 0.35
0.17 0.29 0.46 1.0 0.2 0.07 0.14 0.39 0.17 0.26 0.21 0.18 0.66 0.03 0.21 0.25 0.25 0.53 0.28 0.25 0.29 0.34 0.41 0.27 0.36 0.29 0.53 0.41 0.31 0.26
0.36 0.35 0.62 1.0 0.28 0.13 0.21 0.31 0.31 0.37 0.36 0.33 0.58 0.05 0.23 0.24 0.3 0.39 0.37 0.33 0.39 0.39 0.36 0.28 0.51 0.43 0.63 0.56 0.34 0.25
0.21 0.26 0.52 1.0 0.22 0.19 0.19 0.41 0.26 0.35 0.35 0.34 0.58 0.03 0.32 0.32 0.39 0.38 0.37 0.31 0.39 0.36 0.34 0.25 0.4 0.41 0.55 0.52 0.29 0.27
0.58 0.58 0.71 1.0 0.48 0.39 0.42 0.62 0.63 0.64 0.7 0.62 0.8 0.38 0.53 0.57 0.58 0.75 0.56 0.57 0.67 0.65 0.76 0.61 0.71 0.67 0.76 0.71 0.68 0.67
0.41 0.42 0.6 1.0 0.27 0.18 0.18 0.41 0.34 0.28 0.41 0.31 0.54 0.08 0.39 0.4 0.34 0.29 0.37 0.27 0.37 0.43 0.45 0.27 0.47 0.48 0.56 0.48 0.32 0.26
0.35 0.35 0.57 1.0 0.32 0.28 0.25 0.55 0.36 0.36 0.42 0.37 0.61 0.13 0.37 0.4 0.44 0.46 0.44 0.42 0.49 0.44 0.67 0.35 0.51 0.49 0.69 0.53 0.39 0.4
0.56 0.65 0.75 1.0 0.47 0.42 0.35 0.6 0.4 0.45 0.52 0.49 0.72 0.38 0.55 0.51 0.58 0.63 0.42 0.4 0.54 0.54 0.66 0.44 0.58 0.45 0.67 0.69 0.5 0.46
Spov3_chr4.04959 (EMB2813)
0.34 0.41 0.63 1.0 0.26 0.3 0.25 0.39 0.29 0.34 0.35 0.32 0.54 0.11 0.35 0.38 0.38 0.35 0.33 0.28 0.46 0.4 0.42 0.28 0.52 0.5 0.61 0.45 0.34 0.32
0.32 0.41 0.6 1.0 0.27 0.11 0.12 0.24 0.25 0.36 0.29 0.27 0.51 0.03 0.14 0.18 0.17 0.53 0.33 0.26 0.37 0.37 0.42 0.24 0.44 0.37 0.58 0.59 0.35 0.21
0.37 0.41 0.5 1.0 0.25 0.22 0.21 0.5 0.26 0.38 0.37 0.3 0.61 0.14 0.33 0.24 0.38 0.39 0.33 0.31 0.46 0.37 0.43 0.35 0.44 0.47 0.66 0.46 0.36 0.36
0.5 0.54 0.59 1.0 0.41 0.35 0.31 0.43 0.38 0.43 0.45 0.34 0.71 0.29 0.51 0.59 0.52 0.63 0.42 0.35 0.48 0.41 0.67 0.33 0.49 0.47 0.57 0.59 0.5 0.48
0.36 0.38 0.61 1.0 0.31 0.27 0.25 0.44 0.29 0.39 0.35 0.33 0.67 0.1 0.4 0.38 0.43 0.49 0.33 0.31 0.42 0.41 0.53 0.29 0.47 0.42 0.57 0.51 0.38 0.35
0.31 0.37 0.53 1.0 0.3 0.32 0.25 0.45 0.26 0.35 0.34 0.33 0.66 0.11 0.45 0.5 0.5 0.42 0.35 0.31 0.41 0.41 0.54 0.34 0.42 0.39 0.52 0.46 0.34 0.38
0.32 0.37 0.66 1.0 0.31 0.19 0.2 0.34 0.3 0.36 0.32 0.32 0.48 0.11 0.23 0.28 0.3 0.32 0.32 0.28 0.39 0.38 0.36 0.25 0.42 0.4 0.56 0.52 0.35 0.31
0.46 0.48 0.7 1.0 0.51 0.33 0.26 0.49 0.38 0.5 0.3 0.42 0.66 0.15 0.25 0.32 0.31 0.61 0.38 0.28 0.44 0.54 0.53 0.3 0.47 0.49 0.71 0.79 0.68 0.54
0.3 0.44 0.55 1.0 0.3 0.12 0.12 0.25 0.27 0.32 0.47 0.34 0.7 0.01 0.12 0.18 0.33 0.35 0.43 0.42 0.45 0.44 0.44 0.33 0.54 0.52 0.62 0.57 0.33 0.19
0.39 0.42 0.6 1.0 0.33 0.29 0.23 0.48 0.26 0.34 0.32 0.31 0.7 0.08 0.41 0.38 0.39 0.46 0.32 0.29 0.38 0.38 0.48 0.29 0.41 0.39 0.52 0.5 0.36 0.32
0.51 0.51 0.62 1.0 0.4 0.18 0.23 0.32 0.35 0.5 0.44 0.37 0.73 0.16 0.32 0.3 0.36 0.54 0.37 0.29 0.42 0.43 0.38 0.35 0.49 0.45 0.69 0.66 0.52 0.34
0.45 0.43 0.66 1.0 0.35 0.14 0.17 0.23 0.27 0.35 0.34 0.27 0.54 0.1 0.16 0.2 0.24 0.47 0.35 0.27 0.37 0.32 0.48 0.27 0.48 0.39 0.6 0.67 0.39 0.25
0.57 0.65 0.72 1.0 0.45 0.33 0.36 0.62 0.45 0.49 0.46 0.43 0.62 0.35 0.44 0.5 0.52 0.49 0.47 0.43 0.5 0.46 0.57 0.43 0.53 0.49 0.62 0.64 0.54 0.55
0.3 0.3 0.54 1.0 0.23 0.11 0.14 0.45 0.24 0.34 0.35 0.31 0.68 0.03 0.29 0.21 0.28 0.39 0.4 0.34 0.38 0.35 0.42 0.3 0.35 0.37 0.55 0.45 0.32 0.34
0.36 0.32 0.6 1.0 0.34 0.15 0.17 0.25 0.3 0.43 0.37 0.33 0.7 0.04 0.13 0.18 0.21 0.56 0.41 0.31 0.47 0.42 0.4 0.27 0.47 0.42 0.71 0.56 0.36 0.21
0.27 0.35 0.61 1.0 0.24 0.13 0.17 0.31 0.27 0.38 0.35 0.32 0.65 0.04 0.18 0.23 0.26 0.47 0.31 0.26 0.42 0.39 0.38 0.26 0.47 0.42 0.61 0.5 0.33 0.23
0.38 0.39 0.64 1.0 0.27 0.17 0.19 0.35 0.29 0.36 0.33 0.33 0.58 0.12 0.28 0.29 0.26 0.43 0.33 0.29 0.38 0.39 0.39 0.27 0.41 0.4 0.57 0.54 0.34 0.27
0.47 0.5 0.63 1.0 0.29 0.18 0.24 0.43 0.27 0.44 0.39 0.32 0.62 0.22 0.27 0.32 0.31 0.54 0.37 0.37 0.47 0.48 0.49 0.28 0.46 0.45 0.7 0.68 0.44 0.39
0.57 0.6 0.73 1.0 0.54 0.45 0.43 0.6 0.49 0.53 0.56 0.53 0.71 0.46 0.46 0.48 0.53 0.64 0.51 0.46 0.58 0.57 0.56 0.48 0.59 0.56 0.69 0.74 0.59 0.53
0.26 0.34 0.6 1.0 0.3 0.14 0.16 0.23 0.27 0.35 0.32 0.28 0.73 0.05 0.18 0.16 0.2 0.55 0.32 0.26 0.36 0.37 0.39 0.24 0.46 0.36 0.57 0.61 0.38 0.3
0.41 0.43 0.65 1.0 0.3 0.35 0.3 0.49 0.34 0.36 0.4 0.34 0.7 0.16 0.45 0.48 0.52 0.48 0.35 0.34 0.42 0.42 0.46 0.31 0.48 0.41 0.56 0.51 0.36 0.43
0.36 0.37 0.7 1.0 0.34 0.14 0.15 0.27 0.27 0.36 0.34 0.27 0.58 0.07 0.17 0.18 0.23 0.45 0.26 0.23 0.31 0.41 0.41 0.2 0.43 0.37 0.55 0.74 0.39 0.28

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)