Heatmap: Cluster_111 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 260 uE m-2 s-1	Light: 195 uE m-2 s-1	Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 65 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L18D6	Photoperiod: L13D11 (Control)	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C (Control)	Temperature: 25°C	Temperature: 30°C
Spov3_C0009.00073 (MBF1B)	-0.03	0.02	-0.25	-0.15	0.02	0.05	-0.16	-0.4	-0.17	-0.12	-0.16	-0.13	-0.02	0.69	0.17	0.12	0.11	0.2	-0.03	-0.1	-0.07	-0.04	0.58	0.13	-0.15	-0.16	-0.21	-0.06	-0.11	-0.1
Spov3_C0010.00014	-0.12	-0.16	-0.5	-0.64	0.06	-0.05	0.06	-0.31	-0.04	0.06	0.04	0.1	-0.26	0.69	-0.04	-0.07	0.01	0.51	0.02	-0.04	0.15	0.1	-0.01	0.29	0.04	0.05	0.1	0.03	-0.27	-0.53
Spov3_C0019.00049	-0.2	-0.1	-0.47	-1.22	0.16	0.26	-0.01	-0.35	-0.13	-0.11	-0.0	0.03	-0.12	1.05	0.32	0.04	0.11	-0.37	0.13	0.09	0.22	0.1	0.06	0.21	-0.02	0.16	0.03	-0.16	-0.45	-0.66
Spov3_C0022.00022 (RRP41)	-0.41	-0.63	-0.41	-0.49	-0.28	0.05	0.14	-0.55	0.34	0.07	0.6	0.41	-1.14	-0.33	0.28	0.47	0.29	-1.46	-0.04	-0.0	-0.01	0.09	-0.88	0.85	0.6	0.72	0.18	0.22	-0.56	-1.38
Spov3_C0025.00050	-0.2	-0.06	-0.29	-0.34	-0.05	-0.13	-0.06	0.04	-0.28	-0.17	-0.18	-0.29	-0.25	0.91	0.16	0.22	0.18	0.36	0.0	0.05	0.14	0.09	0.44	0.1	0.02	0.07	0.09	-0.43	-0.54	-0.56
Spov3_C0044.00006 (ULI3)	-0.1	0.22	-0.18	-0.47	0.12	0.13	0.03	-0.39	-0.02	0.1	0.03	0.14	-0.11	0.61	0.2	0.33	0.31	0.08	-0.04	-0.09	-0.16	-0.14	-0.03	0.03	-0.06	0.07	-0.08	-0.34	-0.36	-0.41
Spov3_C0245.00003	0.11	0.21	-0.11	-0.26	0.25	-0.01	-0.22	-0.45	-0.44	-0.24	-0.27	-0.18	0.0	0.34	0.08	0.08	0.04	0.69	0.12	0.06	0.14	0.06	0.09	0.33	-0.02	0.06	-0.03	-0.27	-0.34	-0.57
Spov3_C0258.00001 (EER4)	0.05	-0.1	-0.11	-0.04	-0.35	-0.25	-0.16	-0.08	-0.0	0.11	-0.08	0.08	0.09	0.39	0.13	-0.03	0.02	0.08	-0.08	-0.16	0.0	-0.11	0.69	-0.11	-0.08	-0.08	-0.02	0.08	-0.16	-0.11
Spov3_chr1.00269 (UBL5)	-0.28	-0.26	-0.49	-0.58	0.17	0.16	0.02	-0.37	-0.05	-0.08	0.06	0.06	-0.02	0.56	0.09	0.08	0.08	0.17	-0.01	0.09	0.1	0.16	0.4	0.27	0.1	0.07	0.01	-0.28	-0.37	-0.58
Spov3_chr1.00365 (PML3)	-0.06	-0.14	-0.17	-0.18	0.21	-0.06	-0.09	-0.08	-0.07	0.01	-0.04	-0.11	-0.03	0.67	0.24	0.13	0.23	0.51	-0.14	-0.22	-0.12	-0.07	0.1	-0.18	-0.18	-0.05	-0.04	-0.14	-0.2	-0.19
Spov3_chr1.00491	-0.1	-0.03	-0.2	-0.26	0.11	-0.01	-0.18	-0.05	-0.22	-0.13	-0.14	-0.2	-0.06	0.72	0.17	0.23	0.21	0.19	0.02	-0.05	0.13	0.07	0.17	0.09	-0.11	0.06	-0.05	-0.27	-0.21	-0.37
Spov3_chr1.00522 (ZGY1)	-0.28	-0.25	-0.22	-0.59	0.04	0.11	-0.45	-0.33	0.19	0.15	0.22	0.16	0.21	0.79	0.17	0.29	0.27	0.19	-0.08	-0.09	0.13	-0.0	-0.38	-0.01	-0.33	0.14	0.09	-0.26	-0.34	-0.46
Spov3_chr1.00808 (B22)	-0.15	-0.21	-0.24	-0.15	0.01	-0.14	-0.1	-0.04	-0.03	-0.0	0.11	0.04	0.21	0.03	0.02	0.12	0.08	0.15	0.01	0.01	0.13	0.11	0.45	0.06	0.14	0.04	0.08	-0.21	-0.31	-0.55
Spov3_chr1.02187 (GGL25)	0.09	-0.3	-0.64	-1.02	-0.89	0.23	0.57	-0.38	-0.51	-0.27	-0.15	-0.05	0.64	0.71	0.43	0.3	0.08	0.08	0.1	0.12	0.15	0.22	0.73	0.09	0.02	-0.05	-0.17	-0.49	-1.12	-0.91
Spov3_chr1.02422 (ISTL9)	-0.22	-0.04	-0.51	-0.56	0.18	0.04	-0.12	-0.27	-0.15	0.09	-0.06	0.15	0.03	0.62	0.11	0.16	-0.15	0.42	0.09	-0.02	0.15	-0.11	0.43	0.12	0.04	-0.02	-0.04	-0.23	-0.25	-0.6
Spov3_chr1.03614	-0.08	-0.08	-0.02	0.13	0.04	-0.21	-0.09	-0.01	-0.06	0.02	-0.03	-0.12	0.13	0.44	0.21	0.07	0.2	0.22	-0.14	-0.08	0.09	-0.22	0.54	-0.07	-0.13	-0.06	-0.09	-0.21	-0.46	-0.37
Spov3_chr1.03695	-0.23	-0.2	-0.43	-0.36	0.03	0.2	0.08	0.01	-0.23	-0.2	0.07	-0.06	-0.0	0.71	0.16	0.03	0.14	-0.01	0.02	-0.02	0.03	0.11	0.04	0.14	-0.02	0.08	0.07	-0.09	-0.23	-0.32
Spov3_chr1.03915	-1.96	-0.62	-1.28	-1.0	-0.65	0.2	0.12	-0.14	0.37	-0.69	-0.11	-0.36	-1.34	1.74	0.85	0.7	-0.05	0.26	0.42	0.41	0.23	-0.23	1.04	0.94	-0.18	-1.03	-0.47	-1.23	-1.83	-
Spov3_chr1.04135 (EVR1L1)	-0.09	-0.12	-0.21	-0.29	0.01	-0.07	-0.1	-0.18	-0.5	-0.35	-0.36	-0.41	-0.13	0.4	0.13	0.08	-0.01	0.71	0.13	0.18	0.25	0.17	0.56	0.31	0.03	-0.12	0.08	-0.34	-0.35	-0.28
Spov3_chr1.04152	0.12	0.13	-0.16	-0.27	0.2	0.11	-0.03	-0.17	-0.52	-0.43	-0.35	-0.37	-0.42	0.49	-0.22	-0.28	-0.31	0.84	0.17	0.07	0.05	0.03	0.56	0.27	-0.09	-0.01	-0.04	-0.12	-0.03	-0.23
Spov3_chr1.04425 (DSK2)	-0.07	-0.15	-0.18	-0.04	-0.31	-0.29	-0.06	0.04	0.05	-0.04	0.15	0.09	-0.0	0.18	0.21	0.04	0.07	0.24	-0.16	-0.13	0.03	-0.09	0.72	-0.02	0.01	-0.02	0.03	-0.08	-0.28	-0.44
Spov3_chr1.04723 (VPS32)	0.03	-0.2	-0.24	-0.18	0.26	-0.04	0.1	0.2	-0.26	-0.4	-0.19	-0.21	0.28	0.7	0.21	0.04	-0.03	0.06	-0.17	-0.23	-0.15	-0.14	0.62	-0.11	0.03	-0.1	-0.01	-0.12	-0.15	-0.3
Spov3_chr1.04833 (ARPC1)	0.15	0.12	-0.06	0.01	0.19	-0.03	-0.08	-0.15	0.09	0.14	-0.11	0.05	-0.1	0.32	0.08	0.18	0.17	0.01	-0.04	-0.11	-0.01	-0.15	-0.28	-0.12	-0.14	0.05	0.01	-0.11	-0.11	-0.14
Spov3_chr1.04839	-0.17	0.05	-0.35	-0.49	0.31	0.01	0.03	-0.24	-0.15	0.12	-0.17	0.07	-0.16	0.47	-0.08	0.07	0.15	0.55	0.06	-0.08	0.01	0.0	-0.02	0.13	0.1	-0.09	0.15	-0.21	-0.26	-0.29
Spov3_chr1.04842 (CKS1)	-0.41	-0.32	-0.53	-0.44	-0.1	-0.11	0.05	-0.15	-0.07	-0.1	0.02	0.07	0.31	0.7	0.24	0.18	0.04	0.09	0.21	0.25	0.18	0.09	-0.31	0.24	0.07	0.14	0.13	-0.29	-0.48	-0.57
Spov3_chr1.05000	0.01	0.0	-0.34	-0.84	0.25	0.48	0.25	-0.14	-0.58	-0.39	-0.38	-0.13	-0.25	1.14	0.23	0.3	0.14	0.21	-0.22	-0.26	0.03	-0.29	0.76	-0.05	-0.41	-0.22	-0.25	-0.26	-0.17	-0.36
Spov3_chr1.05136 (UBC35)	-0.26	-0.29	-0.24	-0.1	0.08	-0.1	-0.1	-0.08	0.01	0.09	0.11	-0.0	0.31	0.31	0.16	0.07	0.09	0.04	-0.01	0.06	-0.08	-0.13	0.58	0.12	0.03	-0.11	-0.06	-0.2	-0.25	-0.47
Spov3_chr1.05144	-0.12	-0.09	-0.26	-0.24	-0.16	-0.21	-0.34	-0.27	-0.08	-0.17	0.07	-0.01	0.2	0.36	0.18	0.13	0.22	0.37	-0.0	0.08	0.08	0.16	0.76	0.05	-0.05	-0.06	0.02	-0.27	-0.57	-0.54
Spov3_chr1.05169 (GRXC1)	-0.15	0.07	-0.24	-0.53	0.23	0.1	-0.02	-0.24	-0.02	-0.14	-0.16	-0.16	-0.17	0.78	0.08	0.1	0.09	0.42	-0.0	0.04	0.05	-0.02	0.26	0.01	-0.15	-0.01	-0.04	-0.35	-0.31	-0.14
Spov3_chr1.05198 (CSLE1)	-0.17	-0.12	-0.4	-0.39	0.0	0.09	0.05	0.1	0.04	-0.46	-0.24	-0.13	0.19	1.12	0.21	0.11	0.12	0.33	-0.22	-0.2	-0.21	-0.32	0.71	-0.07	-0.21	-0.18	-0.11	-0.26	-0.38	-0.28
Spov3_chr1.05200 (NOI)	-0.29	-0.18	-0.52	-0.56	-0.03	-0.0	-0.06	-0.29	-0.12	-0.25	-0.14	-0.16	0.15	0.78	0.28	0.05	0.18	0.16	0.2	0.17	0.12	0.15	0.61	0.13	0.01	0.06	-0.05	-0.35	-0.5	-0.6
Spov3_chr1.05218	-0.4	-0.23	-0.29	-0.35	0.2	0.18	0.17	-0.22	0.12	0.04	0.15	0.1	-0.02	0.62	0.44	0.33	0.27	-0.2	-0.09	0.05	0.08	0.08	-0.12	0.03	0.06	-0.13	-0.12	-0.47	-0.64	-0.4
Spov3_chr2.00008	-0.04	-0.16	-0.11	-0.03	0.03	-0.22	-0.17	-0.16	-0.04	-0.01	-0.11	-0.08	0.04	0.27	0.09	0.1	0.1	0.31	0.05	0.04	0.1	0.07	0.33	-0.09	-0.09	0.07	0.05	-0.18	-0.13	-0.28
Spov3_chr2.00211 (LSM7)	-0.17	-0.02	-0.36	-0.3	-0.03	-0.12	-0.29	-0.29	-0.2	-0.07	-0.12	-0.12	-0.09	0.67	0.13	0.14	0.25	0.58	-0.01	-0.03	0.1	0.16	0.37	0.29	0.07	-0.07	-0.11	-0.35	-0.37	-0.38
Spov3_chr2.00269 (KRATOS)	0.17	-0.54	-0.68	-0.73	-1.0	-0.35	-0.03	-0.67	0.66	0.28	0.62	0.53	-0.13	-0.68	0.52	0.55	0.66	-0.99	0.13	0.36	0.5	0.24	-1.03	0.49	-0.1	0.19	-0.1	-0.26	-0.94	-0.88
Spov3_chr2.00804 (PVA12)	-0.23	-0.25	-0.32	-0.24	-0.08	-0.41	-0.17	0.35	-0.19	-0.08	-0.1	-0.17	0.31	0.53	0.12	-0.03	0.08	0.37	-0.11	-0.07	-0.02	-0.06	0.65	-0.08	0.07	-0.04	0.1	-0.08	-0.28	-0.25
Spov3_chr2.00979 (AL2)	0.12	-0.03	-0.13	-0.1	0.0	-0.16	-0.05	0.28	-0.23	-0.14	-0.12	-0.16	0.1	0.6	0.22	-0.02	0.05	0.03	-0.15	-0.14	-0.22	-0.07	0.13	0.07	0.04	-0.1	-0.07	0.22	-0.1	-0.2
Spov3_chr2.01353 (ADH2)	-0.02	-0.15	-0.28	-0.36	-0.03	-0.11	0.07	0.17	-0.28	-0.1	-0.11	-0.11	0.19	0.7	0.03	0.01	0.01	0.01	-0.1	-0.09	-0.02	-0.0	0.42	0.13	0.04	-0.04	-0.01	0.02	-0.17	-0.27
Spov3_chr2.01503 (mzm1)	-0.25	-0.22	-0.27	-0.13	0.04	-0.22	-0.19	-0.32	-0.02	-0.05	0.1	0.11	0.31	0.17	0.06	0.04	0.27	0.36	0.01	0.1	0.16	-0.06	0.37	-0.09	0.09	-0.04	0.02	-0.24	-0.24	-0.25
Spov3_chr2.01973	-0.17	-0.34	-0.38	-0.32	-0.09	-0.08	0.11	-0.14	-0.08	0.02	0.12	-0.01	0.19	0.38	0.2	0.12	0.12	-0.15	0.17	0.11	0.12	0.16	0.34	0.19	0.16	0.0	0.0	-0.05	-0.5	-0.87
Spov3_chr2.02005	-0.11	-0.22	-0.14	-0.08	0.09	-0.19	-0.22	-0.02	0.1	0.09	0.12	0.06	0.17	0.07	-0.02	0.06	0.12	0.14	-0.03	0.14	0.05	0.01	0.45	-0.11	-0.06	-0.07	0.01	-0.16	-0.27	-0.24
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Spov3_S08.00010	-0.27	-0.02	-0.21	-0.22	-0.3	-0.06	-0.17	-0.06	-0.12	-0.24	0.02	0.09	-0.01	0.58	0.14	0.06	0.07	-0.3	0.21	0.19	0.15	0.12	0.13	0.16	0.29	0.08	0.08	-0.1	-0.37	-0.44
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.