Heatmap: Cluster_138 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
0.06 0.2 0.03 -0.26 0.13 0.1 -0.08 -0.29 0.07 -0.01 -0.04 -0.03 -0.35 0.3 0.37 0.33 0.28 -0.02 -0.07 -0.19 0.06 -0.01 -0.17 -0.14 -0.19 0.04 -0.1 -0.11 -0.14 -0.12
-0.06 0.07 -0.02 0.13 0.04 0.24 0.01 0.15 -0.02 -0.04 -0.09 -0.1 -0.04 0.39 0.09 0.28 0.23 0.04 -0.26 -0.27 -0.06 0.01 -0.25 -0.14 -0.19 -0.1 -0.08 0.07 -0.14 -0.17
0.0 0.21 -0.16 -0.37 0.5 -0.18 -0.25 -0.25 -0.28 0.1 -0.07 -0.17 -0.14 0.73 0.0 0.28 0.1 0.37 -0.09 -0.14 -0.08 -0.1 -0.37 -0.28 -0.1 0.07 0.15 0.09 -0.05 -0.21
0.01 0.24 0.04 0.0 0.12 -0.14 -0.22 0.11 0.06 0.18 -0.07 -0.17 -0.26 0.41 0.04 0.03 0.04 -0.03 -0.03 -0.23 0.03 -0.09 -0.32 0.14 -0.21 0.03 0.06 -0.01 0.09 -0.11
0.18 0.24 -0.16 -0.03 0.24 0.08 -0.07 0.05 -0.42 -0.12 -0.21 -0.28 0.1 0.8 0.21 0.25 0.31 -0.16 -0.09 -0.32 -0.04 -0.16 -0.48 0.02 -0.04 -0.2 -0.06 -0.05 -0.11 -0.13
-0.07 0.07 -0.04 0.19 0.1 -0.01 -0.1 0.29 0.05 0.08 -0.03 -0.06 0.07 -0.06 0.05 0.03 0.17 -0.05 -0.3 -0.31 -0.08 -0.08 -0.15 -0.12 -0.08 -0.03 0.13 0.05 0.08 0.07
-0.2 0.07 -0.05 -0.28 -0.19 0.1 -0.15 -0.12 0.0 0.15 -0.23 -0.22 -0.58 0.55 0.64 0.45 0.36 0.17 -0.42 -0.28 0.03 -0.16 0.24 -0.09 -0.26 -0.19 -0.37 0.04 -0.0 0.15
0.24 0.47 -0.08 -0.01 0.01 -0.04 -0.31 -0.19 -0.03 0.23 -0.12 -0.11 -0.29 0.6 0.01 0.03 0.04 0.12 -0.36 -0.48 -0.25 -0.01 -0.31 -0.1 -0.28 -0.16 -0.13 0.02 0.47 0.33
0.23 0.3 0.02 0.08 0.09 0.18 -0.07 0.03 -0.07 -0.06 -0.1 -0.03 -0.16 0.66 0.22 0.16 0.1 -0.17 -0.42 -0.4 -0.23 -0.09 -0.5 -0.13 -0.22 -0.06 -0.06 -0.03 0.17 0.02
0.12 0.22 0.01 0.2 0.19 -0.05 -0.33 0.1 -0.13 0.01 -0.16 -0.12 -0.01 0.26 -0.0 0.11 0.15 0.08 -0.13 -0.24 -0.06 -0.15 -0.53 -0.14 -0.17 -0.08 0.08 0.13 0.11 0.22
-0.02 -0.11 -0.38 -0.02 0.58 0.52 0.17 0.04 -0.08 0.14 -0.1 0.01 -0.45 1.05 0.58 0.43 0.33 -0.68 -0.33 -0.27 -0.28 -0.2 -1.22 -0.39 -0.21 -0.07 -0.23 -0.21 -0.32 -0.16
-0.8 -0.72 -1.31 -2.26 -0.5 0.48 -0.23 -2.11 -1.18 -0.25 -0.57 0.08 0.59 1.26 1.17 0.8 0.7 -1.03 0.25 0.41 0.19 0.37 -3.05 -0.57 -1.31 0.35 0.26 -1.52 -0.77 1.29
0.03 0.03 -0.14 -0.25 0.02 0.15 0.17 0.09 -0.05 0.01 -0.06 -0.11 0.16 0.35 0.23 0.08 -0.07 -0.13 -0.16 -0.17 -0.04 0.05 -0.23 0.06 -0.1 -0.02 -0.05 -0.03 -0.05 0.02
0.13 0.23 0.03 0.02 0.12 -0.06 -0.13 -0.0 -0.03 -0.01 -0.03 -0.11 -0.03 0.33 0.14 -0.03 0.1 -0.16 -0.06 -0.14 0.02 -0.0 -0.33 -0.13 -0.13 -0.03 0.13 -0.02 -0.05 0.07
0.16 0.24 0.05 -0.03 0.09 0.04 0.01 0.1 0.02 -0.04 -0.05 0.03 -0.11 0.49 0.09 0.14 0.12 -0.26 -0.18 -0.25 -0.08 -0.09 -0.74 -0.12 -0.22 -0.05 -0.04 -0.08 0.02 0.27
0.16 0.29 0.04 0.07 0.23 -0.05 -0.2 -0.07 0.2 0.08 -0.06 -0.08 0.01 0.29 0.02 0.07 -0.06 -0.24 -0.32 -0.33 -0.09 -0.18 -0.26 -0.08 -0.13 0.05 0.08 0.13 0.19 -0.03
0.05 0.26 0.03 0.28 0.52 -0.21 -0.56 0.41 0.13 0.16 0.12 -0.21 -0.43 -0.16 -0.0 0.07 0.25 0.06 -0.39 -0.49 -0.29 0.03 -1.01 -0.29 -0.01 0.04 0.06 -0.06 0.25 0.38
0.05 0.25 0.21 0.46 0.18 -0.04 -0.12 0.11 -0.16 0.03 -0.0 -0.16 -0.08 0.12 0.07 0.04 0.07 0.33 -0.27 -0.26 -0.22 -0.21 -0.73 -0.28 -0.17 -0.17 0.1 0.06 0.17 0.11
0.12 0.22 0.05 0.15 0.04 -0.15 -0.15 0.07 -0.14 -0.08 -0.02 -0.14 0.0 0.42 0.04 0.13 0.27 0.07 -0.13 -0.16 -0.12 -0.14 -0.32 -0.03 -0.05 -0.11 -0.03 0.06 -0.03 -0.1
0.18 0.02 -0.03 0.09 0.21 -0.02 -0.11 0.09 0.04 0.05 -0.02 -0.04 -0.16 0.64 0.11 0.02 0.19 -0.1 -0.2 -0.19 -0.21 -0.18 -0.37 -0.03 -0.03 -0.03 0.02 -0.05 -0.05 -0.17
0.17 0.17 0.02 -0.13 0.33 -0.11 -0.13 0.05 -0.03 0.09 -0.1 -0.06 -0.2 0.45 0.11 0.02 -0.02 -0.09 -0.41 -0.33 -0.04 -0.12 -0.41 -0.12 -0.05 -0.01 0.08 0.31 0.17 -0.0
0.29 0.43 0.22 0.28 0.07 -0.33 -0.69 0.06 -0.12 0.01 -0.1 -0.18 -0.09 0.45 0.13 0.29 0.08 -0.16 -0.48 -0.47 0.18 -0.04 -0.54 -0.15 -0.19 -0.2 -0.08 0.1 0.22 0.22
0.04 0.04 -0.05 -0.11 0.12 -0.02 0.05 0.14 -0.09 0.05 -0.02 -0.0 -0.05 0.52 0.24 0.21 0.19 -0.22 -0.15 -0.12 -0.01 0.01 -0.57 -0.1 -0.11 -0.04 0.07 0.02 -0.0 -0.39
0.3 0.15 0.12 0.08 0.3 0.0 -0.18 -0.2 0.08 0.17 -0.02 -0.11 -0.23 0.36 -0.06 0.08 0.03 0.04 -0.18 -0.28 -0.16 -0.18 -0.76 -0.25 -0.18 -0.01 0.13 -0.03 0.23 0.27
0.18 0.26 0.24 0.18 0.34 -0.04 -0.16 -0.05 0.09 0.14 -0.15 -0.01 -0.23 0.36 0.01 -0.18 -0.1 -0.05 -0.4 -0.39 -0.15 -0.1 -0.28 -0.28 -0.34 -0.08 -0.04 0.19 0.3 0.24
0.41 0.23 0.14 0.07 0.21 -0.14 -0.18 -0.3 0.11 0.03 -0.13 -0.0 -0.12 0.37 -0.02 -0.1 -0.14 -0.21 -0.2 -0.26 -0.04 -0.1 -0.39 -0.2 -0.11 0.02 0.08 0.1 0.25 0.22
Spov3_chr2.02450 (LecRK-II.2)
-0.12 -0.01 -0.18 -0.31 -0.06 0.2 0.2 0.31 0.23 0.39 -0.03 0.14 -1.15 1.37 0.29 0.27 0.26 -0.7 -0.36 -0.12 0.19 -0.02 -2.52 -0.26 -0.67 -0.24 -0.64 -0.59 0.17 0.39
0.12 0.13 -0.17 -0.21 0.04 0.11 0.15 0.05 0.0 -0.08 -0.06 0.01 0.08 0.38 0.14 0.16 0.14 -0.02 -0.24 -0.21 -0.02 -0.08 -0.61 -0.09 -0.08 -0.07 -0.08 0.04 0.16 0.01
-0.23 0.01 -0.13 -0.16 -0.57 0.28 -0.24 -0.4 -0.06 -0.06 0.11 0.11 -0.04 0.66 0.02 0.07 0.13 -0.32 0.11 0.05 -0.06 -0.13 -1.41 0.33 -0.11 0.17 -0.05 0.04 -0.17 0.76
0.12 0.01 0.01 -0.06 -0.08 -0.03 -0.19 -0.23 -0.09 -0.04 -0.14 -0.07 -0.27 0.41 0.28 0.3 0.31 0.12 0.01 -0.09 -0.07 0.02 0.05 -0.11 -0.14 -0.02 -0.03 -0.18 -0.19 0.11
0.26 0.37 0.2 0.17 0.19 0.01 -0.1 -0.2 -0.15 -0.11 -0.18 -0.06 -0.08 0.4 0.08 0.09 0.05 -0.4 -0.34 -0.32 -0.09 -0.05 -0.48 -0.07 0.0 -0.03 0.03 0.12 0.11 0.14
Spov3_chr2.04073 (CYP72A9)
-0.25 -0.25 0.01 -0.55 0.84 0.41 0.27 0.36 0.22 0.25 0.22 0.13 -0.28 0.93 0.09 0.22 0.0 -0.85 -0.33 -0.28 0.01 -0.49 -1.03 -0.17 -0.57 -0.21 -0.1 0.44 -0.34 -0.81
0.23 -0.03 -0.22 -1.03 -0.73 0.11 0.12 -0.24 -0.43 -0.57 0.1 0.25 -0.12 0.44 0.39 0.22 0.12 -1.0 0.2 0.36 0.29 0.46 -1.24 0.46 0.01 0.08 -0.01 -0.68 -0.48 0.72
0.19 0.24 0.01 -0.34 0.29 0.15 0.06 -0.26 -0.08 -0.1 -0.07 -0.17 -0.08 0.36 0.2 0.19 0.1 -0.24 -0.05 -0.06 -0.05 0.03 -0.24 -0.09 -0.15 0.15 -0.05 -0.05 -0.24 0.04
Spov3_chr3.00562 (ZCCHC8A)
0.22 0.39 0.13 0.26 -0.12 -0.14 -0.3 -0.19 0.12 0.02 -0.11 -0.16 -0.15 0.71 0.1 0.11 0.01 -0.05 -0.27 -0.29 -0.04 -0.08 -0.52 -0.11 -0.21 -0.03 -0.01 -0.1 0.04 0.19
0.52 0.29 -0.03 -0.0 -0.16 -0.13 -0.33 -0.39 -0.04 -0.13 -0.14 -0.23 0.02 0.77 0.31 0.17 0.18 0.26 -0.19 -0.44 -0.09 -0.16 0.12 -0.1 -0.21 -0.21 -0.11 0.22 -0.35 -0.21
0.06 0.17 -0.15 -0.04 0.16 -0.01 -0.0 -0.08 -0.04 0.15 0.03 -0.06 -0.09 0.53 0.09 0.18 0.18 -0.04 -0.25 -0.28 -0.05 -0.09 -0.28 -0.14 0.01 0.03 -0.02 0.01 -0.01 -0.25
0.02 0.08 -0.09 -0.16 0.14 -0.02 0.04 -0.02 -0.29 -0.03 -0.09 -0.14 -0.06 0.5 0.18 0.16 0.2 -0.08 -0.18 -0.06 0.07 -0.08 -0.47 -0.12 0.03 0.1 0.04 -0.1 0.0 0.13
0.27 0.4 0.02 -0.07 0.1 0.03 -0.18 -0.06 -0.14 0.16 -0.11 -0.06 -0.24 0.38 -0.08 -0.04 0.16 0.16 -0.41 -0.22 -0.16 -0.06 -0.6 -0.12 -0.23 0.01 -0.01 0.08 0.3 0.22
0.32 0.26 0.12 0.2 0.08 -0.25 -0.24 -0.13 -0.08 -0.02 -0.07 -0.21 0.14 0.61 0.02 -0.05 0.06 0.23 -0.28 -0.33 -0.11 -0.19 0.01 -0.13 -0.23 -0.1 -0.13 0.17 0.03 -0.11
Spov3_chr3.01629 (CYP707A4)
0.14 0.3 -0.6 -1.86 0.24 0.83 -0.14 -1.98 -0.07 0.25 0.17 0.74 -0.72 0.76 0.4 -0.21 0.14 -1.98 -0.01 -0.44 -0.11 -0.1 -1.4 -0.03 0.03 0.05 -0.09 -0.35 0.32 0.9
-0.04 0.2 0.06 0.24 0.15 -0.14 -0.32 -0.02 -0.25 -0.08 -0.23 -0.15 0.12 0.48 0.02 0.13 0.08 -0.03 -0.45 -0.31 -0.14 -0.15 -0.16 -0.23 -0.05 0.01 0.13 0.06 0.26 0.35
0.07 0.11 0.03 -0.02 0.14 0.03 -0.02 0.09 0.04 0.03 -0.01 -0.06 -0.14 0.41 0.11 0.18 0.15 -0.11 -0.14 -0.17 -0.01 -0.07 -0.3 -0.11 -0.09 -0.0 -0.01 -0.03 -0.16 -0.13
0.33 0.34 0.2 0.2 0.08 -0.09 -0.21 0.01 0.06 0.04 -0.2 -0.15 -0.14 0.32 -0.02 0.01 -0.06 -0.33 -0.36 -0.26 -0.1 -0.17 -0.44 -0.23 -0.15 -0.17 0.01 0.27 0.36 0.31
0.28 0.13 0.07 0.06 0.4 -0.2 -0.19 -0.12 0.08 0.14 -0.08 -0.03 -0.08 0.3 -0.01 0.05 0.11 -0.34 -0.39 -0.46 -0.27 -0.21 0.13 -0.06 -0.05 -0.07 -0.08 0.3 0.3 -0.18
0.06 0.19 0.1 0.03 0.31 -0.09 -0.29 -0.05 0.09 0.17 -0.05 -0.12 -0.23 0.29 0.14 0.12 0.14 -0.2 -0.22 -0.27 -0.03 -0.1 -0.14 -0.25 -0.33 -0.11 -0.04 0.09 0.17 0.27
0.51 0.43 0.25 0.05 0.12 -0.37 -0.28 -0.08 -0.11 -0.12 -0.16 -0.25 -0.1 0.78 0.23 0.1 0.11 0.23 -0.24 -0.32 -0.16 -0.14 -0.2 -0.42 -0.27 -0.18 -0.08 0.01 -0.11 -0.06
0.13 0.22 0.05 0.07 0.14 -0.1 -0.18 -0.01 0.05 0.01 -0.14 -0.06 -0.18 0.38 -0.02 -0.03 0.01 -0.06 -0.13 -0.3 -0.06 -0.04 -0.32 -0.16 -0.12 0.0 0.04 0.17 0.25 0.14
0.3 0.24 0.09 0.11 0.1 0.0 -0.13 -0.17 -0.02 -0.01 -0.12 -0.09 -0.22 0.48 0.04 -0.05 -0.01 -0.05 -0.27 -0.35 -0.13 -0.16 -0.3 -0.13 -0.21 -0.06 -0.04 0.14 0.29 0.35
-0.06 0.15 -0.02 -0.14 0.04 -0.05 -0.05 0.1 0.09 0.25 0.06 0.0 -0.2 0.46 0.07 0.02 -0.0 -0.11 -0.09 -0.14 -0.03 -0.09 -0.28 -0.03 -0.06 0.1 0.08 0.04 -0.05 -0.26
0.45 0.39 0.01 -0.1 0.15 0.17 -0.0 -0.22 0.04 0.14 -0.22 0.05 -0.33 0.56 0.16 -0.05 0.07 -0.55 -0.34 -0.45 -0.21 -0.22 -0.07 0.05 -0.44 -0.3 -0.14 0.27 0.35 0.03
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Spov3_chr4.01768 (NPF5.11)
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0.21 0.17 0.08 0.12 0.11 -0.19 -0.17 -0.13 -0.04 0.0 -0.0 -0.0 -0.01 0.26 0.11 0.03 0.05 -0.06 -0.21 -0.12 -0.04 -0.01 -0.16 -0.15 -0.1 0.03 0.08 -0.09 0.0 0.06
0.21 0.19 -0.21 -0.59 0.18 0.03 0.18 0.03 -0.09 -0.01 -0.16 -0.26 -0.19 0.7 0.18 0.22 0.33 -0.37 -0.09 -0.16 -0.06 -0.19 -0.29 -0.06 0.03 0.15 0.01 -0.15 -0.1 -0.09
-0.08 -0.07 -0.07 0.08 0.02 0.03 0.02 -0.08 -0.05 0.08 -0.2 -0.12 -0.49 0.81 0.24 0.32 0.11 -0.72 -0.11 -0.22 -0.0 -0.13 -0.29 0.14 -0.12 0.04 0.03 0.14 0.25 -0.28
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Spov3_chr5.01321 (MAP3KE1)
0.17 0.21 0.11 0.23 0.08 0.04 -0.09 -0.13 -0.01 -0.04 -0.01 0.02 -0.09 0.22 0.05 -0.03 -0.0 -0.35 -0.23 -0.26 -0.09 -0.23 -0.11 -0.12 -0.09 -0.05 -0.0 0.15 0.15 0.26
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0.22 0.19 -0.02 -0.12 -0.01 0.16 0.0 -0.04 -0.2 -0.07 -0.12 -0.09 -0.21 0.75 0.27 0.23 0.21 -0.18 -0.34 -0.29 -0.17 -0.07 -0.39 -0.06 -0.28 -0.08 -0.02 -0.11 0.14 0.13
0.11 0.15 0.15 0.05 -0.0 0.05 -0.01 -0.0 0.0 -0.0 -0.08 -0.06 -0.31 0.67 0.04 0.05 0.1 -0.07 -0.12 -0.23 -0.04 -0.03 -0.26 -0.04 -0.2 -0.02 -0.04 -0.17 0.02 -0.0
0.07 0.02 0.02 0.13 0.16 -0.06 -0.08 0.05 -0.05 0.04 -0.08 -0.06 -0.06 0.33 0.08 -0.05 -0.08 0.04 -0.13 -0.15 -0.01 -0.11 -0.07 -0.14 -0.1 -0.03 -0.0 0.07 0.11 0.02
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-0.01 0.03 0.02 -0.29 0.29 0.06 -0.07 0.09 0.05 0.14 -0.05 -0.08 -0.24 0.73 -0.05 0.31 -0.18 -0.16 -0.18 -0.18 -0.06 -0.02 -0.07 0.03 -0.19 -0.04 -0.15 -0.03 0.17 -0.3
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0.16 0.46 -0.12 -0.57 0.32 0.4 0.1 -0.3 0.11 0.19 0.04 0.15 -0.49 0.92 0.13 0.09 0.13 -0.17 -0.38 -0.29 -0.18 -0.07 -0.94 -0.05 -0.38 -0.1 -0.2 -0.56 0.1 0.16
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-0.2 -0.03 -0.2 -0.33 0.25 0.07 -0.28 -0.58 0.08 0.11 -0.03 -0.11 -0.06 0.52 0.45 0.35 0.41 -0.06 -0.09 -0.1 -0.09 -0.11 -0.15 0.03 -0.02 0.12 -0.01 -0.27 -0.36 0.1
Spov3_chr6.01870 (PP2-A15)
0.18 0.19 0.07 0.07 0.07 -0.13 -0.2 -0.14 -0.05 0.07 -0.05 -0.12 -0.02 0.4 0.15 -0.02 0.09 0.15 -0.24 -0.23 -0.1 -0.06 -0.12 -0.12 -0.06 -0.04 -0.04 0.02 -0.02 0.06
0.26 0.32 0.08 -0.12 0.31 -0.07 -0.19 -0.21 0.07 -0.08 -0.16 -0.2 -0.05 0.24 0.08 0.08 0.1 0.36 -0.22 -0.17 -0.07 -0.16 -0.5 -0.33 -0.23 0.04 0.05 -0.04 0.22 0.16
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0.2 0.37 -0.02 -0.11 -0.05 -0.05 -0.09 -0.07 -0.01 0.07 -0.06 0.06 -0.08 0.45 -0.0 -0.04 0.05 -0.27 -0.29 -0.31 -0.11 -0.09 -0.34 0.11 -0.02 -0.03 -0.07 0.24 0.2 0.04
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0.11 0.11 0.03 -0.12 0.24 -0.08 -0.19 -0.12 -0.16 -0.0 -0.11 0.01 -0.32 0.47 0.19 0.21 0.26 -0.1 -0.03 -0.2 -0.07 0.11 -0.42 -0.13 -0.16 0.15 0.19 -0.07 -0.02 -0.15

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.