Heatmap: Cluster_73 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene	Light: 260 uE m-2 s-1	Light: 195 uE m-2 s-1	Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 65 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L18D6	Photoperiod: L13D11 (Control)	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C (Control)	Temperature: 25°C	Temperature: 30°C
Spov3_C0002.00197	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0
Spov3_C0024.00009 (CCR3)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Spov3_C0025.00054	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0
Spov3_C0038.00007	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0
Spov3_chr1.00157	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0
Spov3_chr1.00220 (CPK17)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.13	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.0	0.0	0.0	0.12	0.04	0.04	0.0	0.0	0.0	0.04	0.12
Spov3_chr1.00232 (OLEO3)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.02	0.01	0.01
Spov3_chr1.00574 (XIK)	0.0	0.0	0.14	0.0	0.15	0.0	0.31	0.0	0.0	0.73	0.19	0.32	0.0	0.0	0.0	0.0	0.18	0.0	0.0	0.0	0.0	0.15	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14	0.71	0.0	0.0
Spov3_chr1.00636	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01
Spov3_chr1.01699 (MTP12)	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0
Spov3_chr1.01946 (HAT2)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0
Spov3_chr1.03698	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0
Spov3_chr1.04043	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0
Spov3_chr1.04947	0.0	0.0	0.33	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.28	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.21	0.0	0.0	0.0	0.0	0.38	0.0	0.0
Spov3_chr1.05260	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0
Spov3_chr2.00056	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0
Spov3_chr2.00119 (NRAMP6)	0.0	0.01	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01
Spov3_chr2.00709	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.02
Spov3_chr2.01370 (RID4)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0
Spov3_chr2.01714 (XPB2)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0
Spov3_chr2.01786	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0	0.0
Spov3_chr2.02969 (PUCHI)	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.03	0.0	0.0
Spov3_chr2.04140	0.0	0.01	0.0	0.01	0.01	0.0	0.02	0.0	0.0	0.01	0.0	0.02	0.05	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.04	0.01	0.01
Spov3_chr2.04449 (MadA3)	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0
Spov3_chr2.04497 (PEG9)	0.0	0.04	0.08	0.03	0.02	0.0	0.03	0.0	0.05	0.0	0.05	0.05	0.01	0.03	0.01	0.06	0.07	0.02	0.1	0.01	0.04	0.01	0.04	0.03	0.01	0.01	0.01	0.15	0.02	0.05
Spov3_chr2.04623 (EXO70C1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01
Spov3_chr2.04631 (FRS6)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0
Spov3_chr2.04785	0.0	0.0	0.05	0.0	0.08	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.0	0.09	0.0	0.0	0.0	0.14	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.21	0.0	0.0
Spov3_chr2.05351 (NRT2.3)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0
Spov3_chr2.05693	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.03	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.0
Spov3_chr3.00103 (CHB4)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.02	0.02	0.0
Spov3_chr3.00409 (BON3)	0.0	0.0	0.32	0.0	0.39	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.44	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.37	0.0	0.0	0.0	0.98	0.0	0.0
Spov3_chr3.00671	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0
Spov3_chr3.01133 (FtsZ1)	0.01	0.02	0.0	0.03	0.03	0.0	0.05	0.04	0.0	0.03	0.01	0.0	0.0	0.06	0.0	0.04	0.03	0.12	0.0	0.0	0.01	0.0	0.05	0.0	0.09	0.0	0.01	0.07	0.01	0.05
Spov3_chr3.01184	0.02	0.0	0.0	0.02	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0
Spov3_chr3.01350	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.04	0.02	0.0
Spov3_chr3.01502 (ZIK2)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0
Spov3_chr3.01673	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0	0.0
Spov3_chr3.01958	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0
Spov3_chr3.02039 (ZIP9)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0
Spov3_chr3.02895 (VPS9)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0	0.09
Spov3_chr3.02973	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0
Spov3_chr3.03817 (APM1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0
Spov3_chr3.04017	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0
Spov3_chr4.00505	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.01	0.01
Spov3_chr4.00949	0.0	0.06	0.0	0.06	0.0	0.0	0.06	0.07	0.0	0.37	0.07	0.0	0.23	0.15	0.06	0.0	0.07	0.58	0.06	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.49	0.06	0.12
Spov3_chr4.01066 (ERF15)	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.01
Spov3_chr4.01599	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01
Spov3_chr4.01733 (ZFP3)	0.27	0.15	0.22	0.51	0.48	0.0	0.02	0.13	0.1	0.0	0.25	0.0	0.1	0.0	0.0	0.0	0.09	0.21	0.0	0.07	0.0	0.0	0.3	0.0	0.11	0.0	0.0	0.64	0.3	0.1
Spov3_chr4.01954 (FAR1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0
Spov3_chr4.02450 (RAS1)	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.02
Spov3_chr4.02752 (RLP21)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.01
Spov3_chr4.02944	0.0	0.0	0.0	0.07	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0
Spov3_chr4.03371 (ARP5)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.0	0.0
Spov3_chr4.04143	0.01	0.0	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.02	0.0	0.01	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.01	0.01
Spov3_chr5.00586	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.03	0.0	0.0
Spov3_chr5.02529	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0
Spov3_chr5.04017	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0
Spov3_chr5.04271	0.02	0.02	0.01	0.04	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.0	0.01	0.01	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.01	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.02	0.01	0.02
Spov3_chr6.01034 (DGK1)	0.0	0.09	0.0	0.0	0.06	0.0	0.0	0.16	0.1	0.25	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.0	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.09	0.0	0.0	0.09	0.27	0.0	0.07
Spov3_chr6.02030 (VPS3)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0	0.0
Spov3_chr6.02137	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0
Spov3_chr6.02733	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0
Spov3_chr6.03057	0.0	0.02	0.0	0.03	0.01	0.01	0.03	0.02	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.12	0.0	0.0
Spov3_S01.00054	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.01	0.0	0.06	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.03	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.06	0.01	0.0
Spov3_S02.00028 (ANAC19)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0
Spov3_S02.00048 (SVR9)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.03	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.01	0.0	0.01	0.01	0.0	0.01	0.03	0.06	0.0	0.08
Spov3_S11.00026 (NLM5)	0.0	0.0	0.0	0.02	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.04	0.0	0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)