1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_3 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
- - - 3.25 2.14 - - - - - - 2.13 - - - - - - 3.55 - - - - - - - - - - -
0.63 -1.16 - - -0.35 - - -0.39 -0.09 -1.12 - - 1.21 - - 0.13 0.77 -0.44 0.09 0.93 -0.23 -0.35 2.1 -1.4 1.31 -0.5 - 0.77 -0.47 2.12
- - - 2.04 - - - - - 2.42 - - - - - - - - 2.92 2.07 2.18 - - 2.08 - - - - - -
- - 1.39 2.74 - - - - - - - - - - - - - 3.03 2.95 - 1.22 - - - - - - - - 1.31
- - - - - 2.75 - - - - - - 3.11 - - - - - 3.49 - 1.76 - - - - - - - -5.36 -
- 2.06 0.43 - - 0.12 - - - 0.52 - 1.28 - - - - - - 2.39 - - - - - 1.9 - - 2.1 1.35 1.88
-0.48 -2.41 - 1.16 - 0.28 -1.22 -1.95 -0.24 0.01 -3.1 0.61 0.06 1.25 -0.57 -0.35 -1.56 - 2.21 0.1 - 1.18 -0.18 0.24 0.87 0.5 - -0.4 -0.01 0.24
- - - - - - - - - - - - - - - - 2.66 - 4.57 - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.91 - - - - - - - - - - -
-0.84 -1.87 -0.59 -0.17 -0.28 -1.89 -1.08 -0.9 0.92 -0.28 - 0.73 0.1 0.86 -2.11 -0.53 0.13 0.72 1.72 0.8 -0.49 -2.57 0.94 -0.73 -0.09 -0.07 0.37 0.23 -0.22 -0.1
- - - - - - - - - - - - - - 2.61 - - - 4.14 - - - - - - - - - - 2.65
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.91 - - - - - - - - - - -
- - - - 3.07 - - - - - 2.17 - - - - - - - 4.1 - - - - - - - - - - -
0.83 - 1.71 1.75 - 0.51 1.25 - - - -0.71 - - 1.46 1.56 - 0.28 - 0.99 - 1.03 -0.34 - - - 2.12 -1.89 - -0.25 -
0.23 - 0.65 2.17 1.31 - - -0.52 - 1.83 - 0.95 - - -0.46 - - 0.4 1.52 - - 0.36 - - - - 0.64 2.01 -0.19 0.51
- - - - - - - - - - 2.58 - 2.53 - - - - - 3.26 - - - - - - - - - - 3.12
0.77 - 0.85 0.29 - - 1.13 0.39 - - - 0.31 -0.35 2.06 1.26 0.61 -0.66 - - 1.64 -0.6 - -0.2 -0.74 - 1.26 0.01 0.34 -0.73 -0.96
- 2.87 0.78 0.76 - - - 0.61 - - - - - - - - - 2.14 2.78 0.47 - - - - 1.76 0.77 - - - -
- - - 2.81 - - - - - - - - - - - - - - 3.75 - - - - - - - - 1.03 - 2.91
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.49 - - - - - - 2.9 - - - -
-0.0 0.11 0.1 0.73 2.13 - - - - - - -0.17 - - - - - 2.05 2.65 1.37 - - - - 0.75 -0.33 1.17 0.22 - 0.02
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.25 - - - - - - - - 3.46 - -
- 1.76 - - 1.62 - - - - - - - - 2.72 - - - - 4.09 - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.91 - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.91 - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.91 - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.91 - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.91 - - - - - - - - - - -
-0.05 - - - - - - - - - - - 1.1 - - 1.94 - - 2.65 - 0.9 -0.37 - - - 2.66 - 2.96 - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.91 - - - - - - - - - - -
1.68 1.53 - - 2.29 - - - 0.23 - - - - - - - - - 2.87 - 1.93 - - - - - - - - 2.75
0.88 1.98 - - - - - - - 0.7 - - 1.73 - - - - - 2.78 - - - 1.89 - 0.7 - - - 0.79 2.41
-0.08 - -1.29 - 0.13 0.97 0.39 -0.21 -0.12 - -1.19 -0.84 0.61 1.81 0.57 0.41 -0.68 1.09 0.91 0.32 -0.01 -1.55 -0.01 0.25 0.0 -1.41 -0.33 -2.01 -1.26 0.52
- - - - - 0.63 - - - 0.89 - - - 2.44 - 0.86 2.35 - 3.16 - - 0.6 0.69 - - - - 1.13 - -
0.7 -1.01 - - -1.28 -0.26 - - 0.28 - - - -3.26 1.26 -3.74 - 0.23 -1.41 3.11 0.8 0.48 1.11 - - 0.86 - -1.61 -0.98 1.54 0.87
- - - 2.78 - - - - - - - - - - - - - - 4.53 - - - - - - - - - - -
- - 3.06 3.07 - - - - - - - - - 3.01 - 0.45 - - - - - - - 1.95 - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.91 - - - - - - - - - - -
- - - - - 2.86 - - - - - - - 2.92 - - - - 3.23 - - - - - 2.54 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - 3.03 - 3.81 - - - - - - - - - 2.97 -
- - - 2.92 - - - 0.4 - - - 1.74 - - - - 2.72 - 2.58 1.87 - - 0.64 - - - - - - -
- - 2.88 - - 2.9 - - - - - - 2.07 - - - - - 2.76 - - - - - - - - 2.09 - -
Spov3_chr4.02125 (UMAMIT32)
 - - - - - - - - 1.45 - - - 1.81 3.33 - 0.75 - - 3.17 - - - - - - 0.65 0.55 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 2.58 - - 4.59 - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.32 - - - - - - 3.33 - - - -
3.95 - - 3.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.91 - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - 2.68 - - - - 4.13 - - - - - - - 2.6 - - -
- - - - - - - - 1.34 - - - 1.71 3.23 - 0.64 - - 3.07 - - 1.03 - - - 0.54 0.44 - - -
-0.54 -0.55 -1.9 0.33 -1.45 -0.12 -3.83 1.66 - - -1.17 - 0.09 1.05 0.6 0.69 -1.32 - 0.74 2.22 0.11 - 0.06 1.85 -1.32 -0.12 - 0.59 - -0.73
- - - 3.55 - - - - - - - - - - - - - - 3.77 - - 2.22 - - - - - - - -
0.42 -1.86 0.58 1.93 - - - -1.09 - -0.6 - - -2.9 1.24 - - 0.71 2.07 1.48 - 0.42 0.49 1.58 0.69 0.65 - -0.51 - - 0.26
-0.7 - -0.64 -0.62 0.01 0.12 0.71 -0.81 - - 0.92 0.31 0.93 1.53 0.23 2.04 0.41 1.12 - 1.5 0.28 - - - -0.66 -0.8 -0.88 -0.46 - -0.87
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.91 - - - - - - - - - - -
- - 2.86 - - 1.79 - 2.09 - - - - - 2.03 - - - - 2.75 - - - - - - - - - 2.06 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - 2.77 4.27 - 1.96 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.91 - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.91 - - - - - - - - - - -
3.0 - - 3.07 - - - - - - - - - 2.85 - - - - 2.68 - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.91 - - - - - - - - - - -
Spov3_S14.00033 (AK-HSDH)
 -0.38 1.17 - - - 0.25 - 0.58 -0.64 - 1.11 -0.63 - - 1.68 - - 1.61 2.0 - - - -0.69 0.52 -0.71 2.33 - -0.43 0.59 -0.56

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.