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Heatmap: Cluster_179 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
0.0 -0.0 -0.21 -0.17 0.37 0.2 0.05 0.11 -0.07 -0.05 -0.07 -0.14 -0.17 0.74 -0.15 0.06 0.09 0.21 -0.13 -0.37 -0.15 -0.15 -0.34 -0.12 -0.05 -0.08 -0.01 0.13 -0.0 -0.02
-0.09 -0.53 -0.37 -0.38 -0.1 0.28 0.45 0.15 -0.07 -0.07 -0.02 -0.03 0.44 0.85 0.47 0.42 0.42 -0.54 -0.25 -0.17 -0.11 -0.01 -0.42 -0.1 -0.01 -0.12 -0.11 -0.13 -0.47 -0.7
-0.86 -0.78 -0.84 -1.35 0.6 0.66 0.79 0.61 0.48 0.64 0.31 0.51 0.38 1.27 0.99 0.87 0.57 -1.23 -0.29 -0.31 -0.31 -0.16 -1.1 -0.65 -1.2 -1.38 -1.33 -2.2 -0.85 -3.83
-0.06 -0.07 -0.31 -0.57 -0.04 0.23 0.22 -0.31 0.04 -0.04 0.03 0.13 -0.05 0.83 0.29 0.2 0.12 -0.64 -0.07 -0.0 -0.01 0.08 -0.49 0.32 0.07 -0.01 -0.08 0.0 -0.18 -0.53
-0.68 -0.76 -0.47 -0.17 0.16 0.33 0.41 0.34 -0.31 -0.08 0.08 0.03 0.49 0.71 0.56 0.28 0.37 -0.49 -0.25 -0.2 -0.22 -0.26 0.03 0.07 0.14 -0.01 -0.23 -0.45 -0.18 -0.75
-0.15 -0.14 -0.35 -0.33 0.13 0.14 0.19 -0.12 0.03 0.04 0.01 -0.02 0.12 0.39 0.31 0.21 0.34 -0.33 -0.14 -0.15 -0.08 -0.0 -0.06 0.17 0.02 -0.04 -0.04 -0.06 -0.19 -0.27
-0.03 -0.18 -0.17 -0.06 -0.09 -0.03 0.02 0.3 -0.22 -0.04 -0.02 0.1 0.25 0.45 0.29 0.2 0.21 -0.04 -0.26 -0.17 0.01 -0.07 -0.13 -0.18 -0.09 -0.16 0.02 -0.04 -0.14 -0.05
-0.39 -0.48 -0.21 -0.09 -0.41 0.04 0.17 0.38 0.03 0.11 -0.06 -0.04 0.1 0.67 0.77 0.57 0.56 -0.84 -0.08 -0.08 -0.07 -0.15 0.03 -0.1 -0.13 -0.69 -0.48 -0.64 0.08 -0.07
-0.96 -2.56 -1.05 -1.31 0.1 1.07 0.41 -0.36 -0.32 -0.8 -0.44 0.34 0.71 1.8 0.3 0.72 0.15 -0.4 0.08 -0.74 -0.19 -0.89 0.16 -0.24 0.36 -1.0 -0.11 -1.1 -0.98 0.25
-0.26 -0.45 -0.64 -0.83 -0.12 0.55 0.39 -0.41 -0.39 -0.45 -0.21 -0.04 0.44 1.36 0.72 0.43 0.21 -0.36 -0.12 -0.02 -0.17 0.04 0.04 0.1 -0.21 -0.46 -0.44 -0.56 -0.5 -0.04
0.17 0.19 -0.07 -0.24 0.14 0.05 0.13 -0.02 -0.07 -0.13 -0.1 -0.02 0.01 0.48 0.12 0.05 0.09 -0.24 -0.08 -0.1 -0.15 -0.12 0.14 -0.03 -0.1 -0.05 -0.14 0.07 0.02 -0.21
-0.45 -0.39 -0.42 -0.49 -0.11 0.6 0.54 0.34 -0.21 -0.34 0.08 0.0 0.28 0.52 0.35 0.41 0.13 -0.31 -0.05 0.07 0.12 0.08 -0.51 -0.06 -0.18 0.05 -0.01 -0.27 -0.44 -0.48
-0.17 -0.14 -0.48 -0.74 0.05 0.31 0.27 0.33 -0.12 -0.14 -0.08 0.15 0.3 0.56 0.72 0.47 0.41 -0.35 -0.25 -0.2 -0.32 -0.04 0.0 -0.05 -0.39 -0.26 -0.27 -0.45 -0.27 -0.03
0.3 0.09 -0.22 -0.43 0.17 0.09 0.17 0.07 -0.37 -0.41 -0.12 -0.02 0.22 0.77 0.39 0.04 0.19 -0.43 -0.15 -0.08 -0.12 0.0 0.21 -0.1 -0.23 -0.14 -0.14 -0.25 -0.27 0.04
-1.67 -1.54 -0.81 -0.7 0.56 0.47 0.1 0.76 0.06 -0.76 0.15 -0.09 0.92 1.4 1.14 1.26 1.44 -1.56 -0.68 -0.43 -0.65 -0.73 -2.22 -1.48 -1.16 -0.84 -0.61 -0.69 -1.49 -0.22
-0.2 -0.25 -0.22 -0.19 0.3 0.24 0.09 0.32 -0.18 0.1 -0.11 -0.23 0.07 0.85 0.09 0.12 -0.1 0.31 -0.18 -0.27 -0.15 -0.1 -0.52 -0.1 -0.01 -0.28 -0.12 0.15 0.11 -0.28
-0.96 -0.99 -0.59 -0.4 0.31 0.36 0.54 0.32 0.24 0.28 0.23 0.14 0.43 0.86 0.56 0.46 0.65 -0.44 -0.32 -0.22 -0.24 -0.28 0.5 -0.57 -0.3 -0.56 -0.4 -0.49 -0.77 -1.38
0.0 -0.12 -0.23 -0.25 0.12 0.35 0.13 0.23 -0.21 -0.2 0.02 0.06 -0.05 0.65 0.24 0.17 0.11 -0.31 -0.21 -0.11 -0.06 -0.06 -0.27 -0.01 -0.05 -0.05 0.02 0.03 -0.02 -0.42
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-0.84 -1.23 -0.81 -0.59 0.1 0.35 0.41 0.79 0.08 -0.06 0.06 0.12 0.17 1.01 0.71 0.79 0.4 0.35 -0.29 -0.24 -0.24 -0.15 -0.41 -0.36 0.11 -0.41 -0.27 -0.43 -0.86 -2.1
-0.43 -0.5 -0.37 -0.19 0.06 0.65 0.33 -0.2 -0.08 -0.26 -0.04 0.1 0.58 1.03 0.5 0.33 -0.0 -0.41 -0.11 -0.13 -0.25 -0.1 -0.09 -0.09 -0.37 -0.15 -0.33 -0.4 -0.31 -0.24
-1.72 -1.42 -0.89 -1.02 0.53 1.14 0.59 0.56 -0.22 -0.01 0.0 0.11 0.5 1.35 0.37 0.58 0.59 -1.36 -0.15 -0.31 0.01 0.05 -2.17 -0.43 -0.4 -0.17 -0.31 -0.51 -0.47 -1.01
-0.16 -0.28 -0.32 -0.35 -0.05 0.24 0.2 0.19 0.08 -0.1 0.11 0.09 -0.04 0.74 0.18 0.13 0.16 -0.64 0.03 0.13 0.17 0.1 -0.51 0.05 0.02 0.03 0.15 -0.21 -0.38 -0.57
-0.04 -0.24 -0.26 -0.13 -0.37 0.03 0.08 0.37 0.01 -0.0 0.13 0.11 0.27 0.2 0.17 0.2 0.25 -0.28 -0.0 -0.0 -0.06 0.01 -0.57 -0.06 0.07 -0.18 -0.05 0.03 0.02 -0.1
-0.11 -0.14 -0.33 -0.23 -0.11 0.24 0.24 -0.08 -0.31 -0.24 -0.18 -0.1 0.24 0.72 0.4 0.21 0.13 -0.45 -0.13 -0.18 -0.19 0.01 0.37 0.06 -0.06 -0.1 -0.12 -0.24 -0.08 0.09
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-0.08 -0.26 -0.24 -0.07 -0.31 -0.21 0.24 0.4 -0.1 -0.24 0.19 0.08 0.31 -0.28 0.4 0.32 0.58 0.15 -0.18 -0.02 -0.17 -0.05 -0.34 -0.33 -0.0 -0.1 0.12 0.08 -0.26 -0.26
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-0.02 0.01 -0.12 -0.15 0.22 0.11 -0.03 -0.12 -0.04 0.02 0.04 0.08 0.06 0.76 0.29 0.07 0.06 -0.45 -0.03 -0.03 -0.03 -0.03 -0.31 0.09 -0.08 -0.04 -0.02 0.04 -0.22 -0.71
0.06 -0.15 -0.19 -0.1 -0.09 0.2 -0.13 -0.49 -0.07 -0.01 0.07 0.01 0.08 0.75 0.41 0.36 0.42 -0.22 -0.25 -0.2 0.04 -0.08 -0.17 -0.08 -0.02 0.05 0.1 -0.22 -0.5 -0.31

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.