Heatmap: Cluster_400 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
0.07 0.1 0.07 0.06 0.06 0.1 0.08 0.09 0.11 0.18 0.03 0.05 0.04 0.06 0.05 0.07 0.04 0.04 0.03 0.07 0.08 0.05 0.08 0.09 0.08 0.06 0.07 0.09 0.07 0.08
0.1 0.12 0.1 0.02 0.0 0.1 0.07 0.06 0.16 0.14 0.0 0.02 0.0 0.26 0.16 0.06 0.02 0.05 0.05 0.1 0.03 0.0 0.04 0.02 0.07 0.1 0.04 0.04 0.13 0.07
0.07 0.0 0.07 0.0 0.02 0.0 0.0 0.03 0.05 0.06 0.03 0.0 0.0 0.03 0.02 0.06 0.0 0.04 0.02 0.01 0.02 0.0 0.17 0.01 0.05 0.0 0.02 0.05 0.0 0.0
0.22 0.12 0.11 0.1 0.06 0.12 0.16 0.1 0.19 0.22 0.05 0.13 0.01 0.03 0.05 0.09 0.08 0.09 0.08 0.13 0.16 0.12 0.06 0.16 0.1 0.16 0.17 0.06 0.12 0.1
0.37 0.14 0.29 0.09 0.07 0.18 0.03 0.07 0.24 0.28 0.23 0.1 0.04 0.25 0.07 0.27 0.03 0.06 0.04 0.13 0.17 0.09 0.43 0.07 0.07 0.17 0.13 0.31 0.22 0.23
1.73 1.3 1.66 2.75 0.47 0.63 0.44 1.72 1.51 4.04 0.0 0.95 0.58 0.9 0.24 0.55 1.6 2.32 0.0 2.87 2.29 0.96 2.09 1.95 0.79 1.91 2.28 2.9 2.98 1.35

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)