Heatmap: Cluster_36 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
Spov3_C0001.00165 (PICALM5B)
2.36 1.86 - - - 0.58 - 1.86 - 0.81 - - - - 0.62 - - - 0.63 1.56 0.68 - 0.62 - - - 0.35 1.97 - -
- - - - 1.94 - - - - - 2.49 - - - - 2.57 2.31 - - 2.11 - - - - 2.42 - - - - -
0.25 0.62 0.28 0.19 0.12 -0.55 -0.22 0.2 0.31 0.36 -0.22 -0.5 -0.07 0.59 -0.07 -0.15 -0.13 0.51 -0.2 -0.1 0.09 -0.33 -0.11 -0.02 -0.5 -0.36 -0.35 -0.32 0.01 -0.43
- - - - 2.85 - - - - 2.91 - 2.86 - 3.0 - - - - - - - - - - - - - - - -
0.94 1.08 1.22 0.49 0.09 0.28 -2.03 0.27 -0.54 -0.39 -2.58 0.25 0.39 0.74 0.54 -0.91 0.06 -0.44 - -1.41 -1.8 0.82 - -2.86 -0.7 -1.0 -0.48 0.03 0.63 1.0
- - - - 0.17 -0.82 - 0.3 -0.2 1.84 0.43 0.2 1.02 1.74 - - -0.79 1.93 - -0.83 - -0.32 1.46 0.2 - -0.81 0.13 -0.62 0.6 0.36
1.23 0.27 - 1.17 1.16 - 1.0 1.54 - 0.43 0.39 0.27 - 0.09 0.14 0.39 2.0 - - 0.48 - -0.05 - -0.04 - - - - 0.3 0.19
0.58 0.01 - -1.44 -0.63 1.56 0.07 1.39 0.39 -0.8 -1.85 0.69 -0.7 1.31 -0.22 -1.46 -0.72 0.95 - - -0.17 -0.91 -0.05 0.22 -1.94 0.97 0.92 -1.34 -1.42 -0.33
0.43 0.19 0.24 1.19 0.56 -0.48 -0.07 0.89 0.51 -0.22 -1.37 -0.86 0.52 0.06 0.48 -0.55 -1.11 0.52 -0.93 -0.03 -0.07 -0.59 -0.08 -0.59 -0.93 0.14 -0.54 0.1 -1.45 -0.14
- - - - 2.38 - - - - - - - - - 1.72 - - 3.21 - 2.85 - 2.33 - - - - - - - -
- 0.04 0.9 -0.15 1.37 -4.0 1.59 1.86 - - 0.64 - - 1.85 -0.26 0.75 - 1.25 - - - - 1.11 - - 1.91 - - -0.11 -
0.39 -0.36 - 1.49 - - 0.46 - - - - -0.4 1.78 2.58 1.03 - - - - - - -0.54 - 1.86 - -0.5 0.82 -0.47 - 2.01
0.26 0.5 0.37 -0.11 -0.76 -0.2 0.01 -0.03 0.84 -0.13 0.05 -0.04 0.96 0.35 -0.06 -0.61 -0.5 -0.87 0.03 - -0.92 0.33 0.85 -0.18 -0.47 -0.83 -0.04 -0.17 -0.41 0.61
-0.92 0.91 -4.49 -0.62 -0.79 -1.01 0.27 -0.18 0.3 -0.38 -0.09 -0.27 0.51 0.67 0.42 -0.06 0.19 0.46 0.29 -1.4 -1.06 0.46 0.15 -0.07 -1.19 -0.03 -0.26 -0.91 0.62 1.2
- - 1.45 - - - - - - - - - - - 3.42 - - - - - - - - - - - - 1.84 3.7 -
-0.99 0.66 - 0.44 -0.21 0.31 -0.13 - 1.43 0.46 - 0.79 -1.16 0.48 -1.29 1.56 - 2.13 - -0.36 -1.57 -1.4 - -0.31 -1.19 0.67 -0.26 0.05 0.58 -1.07
- - - - - - - - 4.36 - - - - - - - 2.36 2.1 - - - - - - - - - - - -
0.45 0.16 -1.16 -2.34 -0.03 0.57 -0.76 -0.41 0.99 -1.54 0.47 -0.51 -0.92 1.9 -0.4 0.14 -1.02 0.52 0.28 -0.25 0.41 0.51 -0.59 0.57 0.88 -1.01 -1.15 -1.41 -1.03 -
- 0.74 - 0.65 0.69 - - 0.71 - 0.75 - 0.69 1.88 - - - - 0.56 0.7 - - 2.13 0.68 - - 0.82 - - 0.65 2.04
0.1 -0.34 -2.28 -0.19 0.98 0.2 -0.47 -2.12 0.36 0.32 -0.23 -0.1 -1.29 1.14 -1.43 -0.51 0.28 1.87 -1.07 0.86 -0.21 0.17 -0.98 -0.9 -1.99 -0.19 -0.63 -0.37 -0.53 0.63
0.44 0.67 0.67 0.51 0.68 - 0.57 0.4 1.75 0.64 -5.98 - 0.9 1.65 - -4.54 - 1.6 - 1.28 0.37 - - 0.66 - -5.23 - - -5.97 0.36
1.7 - - 1.75 1.58 - - - - - - - - - 2.07 - - 0.45 0.78 - 2.2 - - - - 0.53 - 0.93 2.37 -
-0.81 -0.61 -0.42 -0.84 0.77 0.92 0.5 -0.3 0.58 -1.03 -1.53 -1.49 -0.51 1.22 0.29 -0.54 -0.32 -0.24 -0.83 -1.01 0.78 -0.17 0.22 0.15 -0.12 0.15 0.05 0.32 -0.23 0.33
- - - - - 0.29 - 0.5 - 1.35 - 2.29 - 2.09 - - 0.47 - - 2.43 - 1.32 - - - - 0.05 0.49 - 1.99
0.02 -0.51 -0.35 0.97 -1.0 0.08 0.19 -0.11 -0.33 0.2 0.05 0.53 0.05 0.9 -0.58 -0.31 -0.18 -1.28 0.37 0.1 -0.12 -0.04 -0.28 -0.07 0.01 -0.2 0.03 0.05 -0.98 0.44
0.47 0.32 0.27 -0.17 -0.02 0.57 0.26 -0.22 -0.28 -0.05 -0.08 0.23 -0.27 0.71 -0.91 -0.82 0.49 -0.59 0.02 -0.67 -0.13 -0.13 -0.28 -0.46 -0.46 0.3 0.17 -0.18 0.47 -0.28
-0.28 0.91 0.03 0.1 -0.51 0.09 0.1 0.81 -0.52 0.49 -0.29 -0.17 -0.02 1.12 -0.29 -0.94 0.26 -1.53 -1.32 -0.34 0.75 0.11 -0.63 -0.19 -0.18 0.12 -0.24 -1.35 0.45 -0.52
0.97 0.84 0.16 -0.28 0.41 0.44 -0.39 0.13 -0.0 0.57 0.06 -0.26 -0.33 0.17 0.06 -0.5 -0.04 -0.02 -0.41 -0.49 -0.55 -0.37 -0.52 -0.78 -0.6 -0.33 -0.76 -0.23 0.07 0.71
- 0.29 - - 0.64 - - - 0.42 - - 1.79 1.11 1.88 - - - 2.98 - 2.73 - - - - - 1.05 - - - -
0.08 -3.11 0.21 0.71 0.46 0.74 -0.08 -0.66 0.11 1.31 -0.33 -1.3 -0.88 0.79 -0.76 -1.16 -1.13 1.22 -1.71 - -1.25 0.49 0.95 -0.77 0.39 -0.68 -0.31 0.43 -0.22 -0.06
-2.07 0.33 0.78 -0.0 -0.72 0.36 0.84 0.37 -1.0 -0.96 -0.5 0.82 0.32 1.75 -0.18 -0.94 -0.53 -0.27 - 0.46 -0.53 0.02 - -2.19 0.71 -1.2 0.63 -0.93 -0.48 0.71
-0.5 0.83 0.93 0.13 1.45 - 0.35 -1.01 1.85 - - - 0.38 0.48 -0.53 - - 2.44 0.96 1.46 0.85 - - - - - - - - 0.12
0.32 -0.79 0.15 -1.83 1.33 0.2 -1.15 -0.78 0.13 1.7 0.38 -0.02 - 0.94 - -0.82 -1.88 1.95 0.7 0.65 -0.98 -0.61 - - - -1.06 - 0.14 0.15 0.85
0.16 -0.25 -0.21 -0.3 0.06 0.3 0.14 0.49 0.4 -0.68 -0.27 0.14 0.11 0.58 0.38 -0.24 -0.64 0.11 -0.59 -0.24 0.24 0.21 -0.76 -0.26 -0.2 -0.14 -0.39 -0.16 0.03 0.61
-0.18 0.2 0.31 0.16 0.45 -0.21 -0.32 0.35 0.38 0.89 -0.01 -0.16 -0.75 0.45 -0.39 -0.73 -0.53 -0.15 -0.31 -0.79 -0.25 -0.26 -0.22 -0.46 -0.84 -0.42 -0.07 0.62 0.49 0.57
1.14 0.8 1.37 -0.43 0.95 1.33 -0.38 0.6 -0.7 - -0.6 0.31 1.85 1.13 - -0.49 0.91 - - - -0.36 -0.83 0.35 - - 0.16 0.46 - - -
- -0.75 - 1.04 1.3 1.47 -1.04 -1.67 - 1.66 0.54 - 0.03 -0.24 -1.26 -0.17 -1.1 1.14 - - 0.08 1.07 -0.14 - 1.27 -0.04 -0.36 0.73 - -0.07
0.11 1.06 -0.46 -0.32 1.17 1.2 0.27 -0.41 0.41 -0.57 -1.27 -1.07 -0.06 -0.0 -0.1 -1.23 -0.22 -2.03 -1.21 -1.56 -0.57 0.67 -0.52 0.21 -0.35 0.36 -0.69 0.78 0.04 0.21
0.92 - 1.18 1.37 2.15 -0.32 1.74 1.23 -0.05 - - - - 2.17 1.08 - - - - - 0.8 - -0.37 - - 1.15 - - - -
0.72 -0.09 -0.25 -0.28 -0.24 0.07 -2.0 0.61 -0.89 0.8 -0.44 0.31 -0.2 0.63 -0.88 0.29 -0.46 -1.69 -0.5 0.46 -1.18 -0.15 0.26 0.01 0.74 -0.37 -1.64 0.87 1.1 -2.12
- - 1.75 0.99 - - - - 1.82 - - 2.48 - 0.8 - - 0.82 1.69 - 1.78 - 0.84 - - - 0.94 - - - 0.74
0.42 0.3 -0.03 0.11 0.8 -0.06 0.02 0.48 -1.42 -0.42 -0.92 0.63 -1.15 1.3 -0.56 -1.76 -0.61 -0.25 1.33 -1.1 0.16 -0.67 0.01 -1.7 -0.5 0.7 -0.27 0.04 -0.1 -0.93
1.42 - 1.83 - - - - -0.01 0.39 - - 2.4 - 2.82 - - 1.22 - - - - - - - - 0.14 - - 1.3 1.69
0.5 0.29 -1.16 -0.09 -0.35 0.59 0.17 0.2 0.19 -0.03 0.04 -0.43 0.51 0.81 0.53 0.46 0.54 -0.31 -1.04 0.37 0.22 -0.48 -0.96 -0.88 -0.71 -0.94 -0.5 0.03 -0.25 -0.23
0.51 -0.73 - -0.18 1.21 - -1.82 0.54 0.26 -0.51 - - -0.66 0.52 1.8 - - 0.92 0.62 1.99 1.77 - - 0.43 - - - - 1.26 0.08
- - - -0.18 0.67 - - - 0.67 - - - 1.89 - 1.17 - -0.16 1.2 -0.5 -0.41 1.71 -0.28 - -0.36 0.69 -0.53 - 1.08 2.31 0.07
0.63 -0.4 -0.62 1.02 0.15 0.02 -0.5 0.6 0.95 - - 0.26 -0.13 2.19 - -1.3 0.65 - 1.24 -1.51 0.99 -1.48 - - - - -0.57 0.26 -0.29 1.24
0.32 0.06 0.21 0.1 0.15 0.1 -0.11 -0.09 0.06 0.34 -0.36 -0.42 -0.18 0.28 -0.08 -0.01 0.11 -0.2 0.18 -0.99 0.34 -0.25 -0.63 -0.18 -0.22 -0.1 -0.16 -0.24 0.48 0.51
-0.21 -0.17 0.19 0.71 0.14 -0.42 0.27 0.35 0.16 -0.38 -0.66 -0.45 0.47 0.05 -0.17 -0.24 -0.01 0.92 0.14 0.2 0.22 -0.52 0.56 -0.57 -1.05 -0.33 -0.53 -0.33 -0.4 0.09
-0.36 0.48 -1.01 0.13 -0.16 0.84 1.16 -0.59 0.84 0.06 -0.48 -1.15 -1.21 1.95 0.1 1.24 -1.05 0.54 0.08 -2.13 -0.32 0.09 -0.1 -0.69 -0.73 -0.14 -3.08 -1.96 -2.12 -2.59
-0.17 1.02 -2.07 -0.13 1.41 0.1 -0.88 -0.33 1.42 0.49 - - 0.5 -0.8 0.91 - - 1.72 0.63 1.19 1.05 - -1.21 0.27 - - - -2.21 0.15 -0.35
0.51 -0.73 - -0.18 1.21 - -1.82 0.54 0.26 -0.51 - - -0.66 0.52 1.8 - - 0.92 0.62 1.99 1.77 - - 0.43 - - - - 1.26 0.08
0.02 0.39 0.08 -0.01 -0.02 -1.16 0.09 0.18 0.67 0.34 -0.25 -0.41 0.06 0.56 -0.29 -0.16 0.07 0.29 -0.36 0.21 -0.06 -0.48 -0.18 0.02 -0.22 -0.49 -0.42 -0.06 -0.01 0.32
- 0.04 0.4 1.34 -1.01 -1.17 -0.02 -1.14 -0.87 0.7 - - 2.11 - - - - - 0.69 -0.94 1.14 1.94 - - 1.48 0.18 - 0.14 1.61 -
- 2.16 - - - - - 2.13 - - 2.17 - - 2.1 - 2.2 1.89 - - - - - - - - 2.02 - - - -
-1.22 -0.02 -1.1 -0.13 1.17 - -1.0 1.56 -0.13 0.42 -0.09 0.83 0.51 1.58 -0.23 -1.08 0.47 -1.3 -0.8 - -0.14 - -0.24 - - -1.09 - - 1.91 1.31
-1.22 -0.02 -1.1 -0.13 1.17 - -1.0 1.56 -0.13 0.42 -0.09 0.83 0.51 1.58 -0.23 -1.08 0.47 -1.3 -0.8 - -0.14 - -0.24 - - -1.09 - - 1.91 1.31
Spov3_chr4.03488 (UGT73B1)
-0.31 -1.11 0.25 0.43 -0.01 0.16 0.85 -0.7 0.87 -0.98 -0.32 0.06 0.67 0.83 -0.06 -1.9 -0.46 -2.75 0.21 -0.52 0.94 -1.15 -0.67 -1.25 0.61 0.71 0.42 -1.44 -0.04 -0.14
0.92 0.65 0.08 0.86 - -1.72 -0.04 1.4 -1.48 0.91 - 0.89 1.28 -1.59 -0.59 - -0.41 -0.51 -0.55 -0.39 -0.3 1.63 - -1.15 0.71 -1.45 -1.63 -1.36 0.22 0.13
0.44 -0.51 -0.64 -0.63 0.88 - - 0.35 0.17 -0.45 0.16 0.52 -1.31 0.91 -0.06 2.16 0.21 0.89 -1.46 - -1.52 - 1.18 0.04 -0.59 -1.46 -0.6 -0.43 0.43 -0.65
-0.52 0.33 0.19 -0.15 0.06 0.07 0.43 0.26 0.59 -0.38 -0.44 -0.1 0.4 0.42 0.7 -0.65 -0.17 0.62 -0.45 0.57 -0.23 -0.4 -0.6 0.39 -0.64 -1.02 -0.52 -1.19 -0.19 0.18
1.67 1.56 -1.76 0.23 0.68 - 0.15 1.98 -0.54 1.07 -1.86 - - -2.71 1.21 -4.26 -0.29 -2.19 - 1.06 -1.58 0.57 -1.03 -1.73 0.94 0.1 -0.9 -1.48 - -0.89
-0.92 0.1 -0.32 1.42 1.43 -0.59 -0.64 0.14 0.25 0.53 - -0.53 - 0.2 0.4 - 0.77 -1.22 - - 2.05 -0.11 0.7 - -0.17 - -1.19 -0.15 1.57 -
-1.11 -1.09 -0.07 0.05 1.4 0.52 0.6 0.05 -1.53 -0.02 0.25 0.31 0.79 1.0 -0.21 0.44 0.22 0.92 -0.47 -0.46 -1.35 0.05 -0.98 -0.16 -0.73 -1.26 -0.06 -1.19 -0.83 -1.26
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Spov3_chr6.02734 (NF-YC13)
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.