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Heatmap: Cluster_164 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
-0.18 0.02 -0.26 -0.64 0.38 0.41 0.67 0.23 0.14 0.21 0.0 0.23 0.1 -0.06 -0.03 0.12 -0.03 -1.56 0.17 0.14 0.1 -0.01 -1.12 -0.02 0.13 0.19 0.07 -0.06 -0.28 -0.81
-0.04 -0.0 -0.14 -0.01 -0.26 0.23 0.18 0.45 -0.17 -0.14 0.03 0.05 0.02 0.59 0.16 0.08 -0.03 -0.81 -0.25 -0.22 -0.2 -0.05 -0.17 0.22 0.04 -0.06 -0.12 0.12 0.07 -0.15
-0.2 -0.09 -0.14 -0.0 0.06 -0.03 0.04 0.5 -0.28 0.07 -0.08 -0.11 -0.12 0.61 -0.04 0.05 -0.0 0.17 -0.35 -0.05 0.09 -0.03 -0.14 -0.12 -0.06 -0.07 0.15 0.0 -0.13 -0.07
-0.18 0.16 -0.25 -0.07 0.43 -0.05 -0.54 0.11 -0.3 -0.37 -0.12 -0.44 -0.19 0.51 0.35 -0.23 -0.39 0.74 -0.01 -0.3 -0.15 0.28 -0.25 -0.18 -0.97 0.45 -0.16 0.02 0.29 0.45
0.0 0.03 0.03 0.05 0.05 0.17 0.11 0.34 0.09 -0.04 0.03 0.01 -0.14 -0.07 0.15 0.16 0.14 -0.35 -0.15 -0.05 -0.12 -0.01 -0.32 -0.08 0.08 -0.01 -0.09 -0.07 -0.03 -0.1
-0.64 -0.33 -0.75 0.03 -0.93 -0.51 -0.18 0.62 -0.58 0.3 0.45 -0.07 -0.24 -1.67 -0.05 0.4 0.36 -1.17 0.31 0.22 0.75 -0.0 -0.17 0.19 0.36 0.57 0.46 0.47 -0.4 -1.0
0.07 -0.03 0.02 -0.15 0.35 0.19 0.1 0.14 0.05 0.08 -0.07 0.03 0.07 0.09 -0.05 -0.09 -0.17 -0.25 -0.18 -0.21 -0.1 0.01 -0.12 -0.17 -0.11 -0.09 -0.07 0.19 0.27 -0.01
-0.16 -0.29 -0.26 -0.35 0.38 0.33 0.23 0.21 -0.17 -0.27 -0.03 -0.09 -0.12 0.32 0.47 0.31 0.39 -1.12 -0.15 -0.14 -0.12 -0.11 -0.3 0.32 0.17 -0.03 0.04 0.12 -0.14 -0.46
1.01 -0.21 -0.1 -0.81 0.85 0.03 1.0 -0.48 0.83 0.14 -0.54 0.12 -1.26 -0.9 0.21 -0.83 -0.75 -1.1 -0.45 -0.46 -0.48 0.32 1.05 -0.17 0.24 -0.2 -0.44 -0.0 0.43 -2.51
0.52 -0.05 0.22 -0.1 0.65 -1.4 0.43 -1.11 0.57 0.44 -0.45 0.44 -1.41 -1.7 -0.66 -2.05 -1.32 -1.04 -0.12 -0.43 -0.57 0.04 1.47 0.45 0.09 -0.7 -0.84 0.86 1.44 -3.23
0.62 0.01 0.16 -0.67 0.49 0.28 0.06 -0.33 0.09 -0.27 -0.17 -0.83 -0.28 -0.63 -0.67 0.2 0.57 -0.24 -0.39 -0.92 0.38 0.18 0.6 0.2 0.12 0.2 -0.25 0.37 -0.11 -0.65
-0.04 0.18 -0.1 0.22 -0.08 -0.33 -0.11 0.25 -0.17 0.01 -0.05 -0.28 0.19 0.11 0.22 0.02 0.12 0.05 -0.03 -0.2 -0.02 0.1 -0.32 -0.01 -0.06 0.07 0.02 0.05 0.07 -0.12
0.71 0.6 -0.76 -4.89 0.58 0.77 0.7 -5.07 -1.21 -1.73 -0.49 -1.25 -4.48 1.39 0.04 0.19 -1.01 1.32 0.23 -1.56 -1.0 0.8 0.77 -0.98 -0.7 -0.05 -1.02 0.15 -0.66 0.92
-0.92 -2.53 -1.19 -2.47 2.01 1.21 1.26 1.73 -0.93 -1.05 0.13 1.01 -0.44 1.36 -0.1 -1.51 -0.97 -1.36 -1.12 -0.7 -2.09 -0.21 -1.62 -0.07 -1.44 -1.61 -1.46 1.04 -1.2 -5.59
-0.06 -0.06 -0.04 -0.13 0.07 0.03 0.24 0.27 0.12 0.02 0.0 0.02 0.12 0.16 -0.14 -0.12 -0.06 -0.56 -0.12 -0.03 -0.08 -0.0 -0.33 0.01 0.03 -0.05 -0.08 0.2 0.34 -0.06
0.8 0.52 0.48 -0.39 0.91 0.14 -0.22 -0.2 -0.29 -0.15 -0.42 -0.04 -0.5 0.4 0.36 -0.55 -0.29 -0.59 -0.73 -0.21 -0.1 -0.82 0.09 0.06 -0.5 -0.67 -0.25 0.5 0.63 -0.29
0.2 0.16 -0.13 -0.28 -0.06 -0.2 0.2 0.09 -0.25 -0.08 -0.03 0.0 0.3 0.73 -0.22 -0.15 -0.3 -0.43 -0.12 -0.09 -0.03 0.0 -0.15 0.31 0.1 0.01 0.04 0.2 -0.02 -0.4
0.15 -0.22 -0.04 -0.18 0.15 0.16 0.19 0.0 0.13 -0.04 0.16 0.13 -0.08 0.45 0.15 0.21 0.18 -1.17 -0.08 -0.08 -0.15 -0.07 -0.76 0.04 -0.11 -0.02 -0.04 0.02 0.05 0.09
-0.02 -0.16 -0.12 0.02 0.3 -0.06 -0.12 0.22 0.22 0.23 -0.15 -0.05 -0.08 0.46 0.2 0.01 0.06 -0.54 -0.23 -0.28 -0.13 -0.32 0.22 0.02 -0.09 -0.03 0.01 0.19 0.12 -0.39
-0.11 -0.05 -0.14 -0.07 0.14 -0.12 -0.03 0.38 -0.07 -0.03 -0.02 -0.14 0.14 0.03 0.08 0.05 0.09 -0.04 -0.05 -0.19 -0.07 -0.07 -0.33 0.09 0.08 0.1 0.19 0.16 -0.01 -0.16
0.02 -0.12 -0.13 -0.4 0.07 -0.07 0.3 0.16 -0.05 -0.04 0.1 -0.01 -0.05 0.16 0.05 0.05 0.06 -0.46 0.07 0.06 0.02 0.16 -0.42 0.15 -0.05 -0.01 0.05 0.07 0.11 -0.14
-0.08 -0.08 -0.17 -0.38 0.31 0.02 0.28 0.11 -0.03 0.15 0.05 0.16 -0.46 0.08 0.09 0.1 0.09 -0.79 -0.02 -0.01 0.12 0.12 -1.01 -0.01 0.14 0.22 0.34 0.27 0.12 -0.68
0.14 0.17 0.01 -0.4 -0.16 0.27 0.37 0.07 0.03 -0.02 -0.2 -0.09 -0.42 0.33 0.32 0.02 -0.12 -0.07 -0.2 -0.24 -0.16 -0.06 0.09 0.06 -0.05 -0.11 -0.05 0.06 0.25 -0.29
-0.25 -0.14 - - 0.65 1.59 1.34 - 0.76 -0.18 -0.15 -0.33 0.84 - - - -0.24 -0.44 - -0.43 1.3 0.6 1.13 -0.05 - -0.41 0.42 0.89 -0.12 -0.4
-0.11 -0.11 -0.14 -0.26 0.09 0.12 0.15 0.08 -0.05 -0.13 -0.06 0.08 0.06 0.15 0.18 0.24 0.24 -0.82 -0.06 0.02 -0.03 0.05 -0.4 0.06 0.08 -0.0 -0.03 0.08 0.08 0.03
Spov3_chr2.05459 (NADP-MDH)
 -0.07 -0.1 -0.18 -0.5 0.13 0.15 0.3 0.11 -0.02 -0.03 0.0 0.02 -0.06 0.21 0.11 0.11 0.08 -0.87 0.08 0.03 0.06 0.05 -0.18 0.11 0.1 0.16 0.13 0.09 -0.13 -0.37
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0.1 0.07 -0.06 -0.21 0.1 0.08 0.07 0.16 0.07 0.15 -0.05 0.09 -0.05 0.03 0.07 0.05 0.08 -0.4 -0.12 -0.18 -0.18 -0.09 0.05 -0.0 -0.13 -0.13 0.04 0.21 0.17 -0.19
0.15 0.06 -0.09 -0.2 0.19 0.06 0.16 0.09 0.04 -0.01 -0.13 -0.06 -0.28 0.27 -0.09 -0.06 -0.26 -0.28 0.1 0.14 0.05 0.03 0.0 0.12 -0.01 0.06 -0.01 -0.08 0.06 -0.22
-0.04 -0.09 -0.14 -0.1 0.19 0.15 0.08 0.24 0.01 0.01 0.01 -0.05 -0.04 0.31 -0.01 0.09 0.02 -0.35 -0.08 0.03 -0.1 0.06 -0.39 -0.1 0.05 0.03 0.03 0.02 -0.06 0.01
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0.15 -0.02 -0.18 -0.22 0.82 0.12 0.61 0.16 0.06 0.0 -0.21 0.06 -0.52 0.29 0.11 -0.08 0.03 0.3 -0.42 -0.2 -0.4 -0.26 0.02 -0.17 -0.22 -0.16 -0.25 0.07 0.05 -0.44
0.03 0.01 -0.02 -0.09 0.14 0.15 0.22 -0.06 -0.01 0.0 -0.01 0.09 0.09 0.18 0.06 -0.0 -0.03 -0.36 0.04 -0.03 0.01 -0.04 -0.06 -0.06 -0.02 -0.03 0.05 -0.03 -0.04 -0.32
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-0.64 -0.33 -0.75 0.03 -0.93 -0.51 -0.18 0.62 -0.58 0.3 0.45 -0.07 -0.24 -1.67 -0.05 0.4 0.36 -1.17 0.31 0.22 0.75 -0.0 -0.17 0.19 0.36 0.57 0.46 0.47 -0.4 -1.0
Spov3_chr4.04117 (UGT85A3)
 0.32 2.29 - 1.75 -1.71 - - - - 1.83 - -0.24 - - - - 1.05 - 1.0 - 0.7 - - - - 1.32 0.7 2.57 - -
-0.54 -0.2 0.02 0.49 0.61 -0.31 -0.16 0.4 0.56 0.81 0.29 0.02 -0.53 1.06 -0.13 -0.46 -0.37 0.1 -0.91 -0.61 -0.63 -0.5 -0.38 -0.49 -0.43 -0.43 -0.06 0.28 0.42 -0.45
-0.29 -0.26 -0.06 -0.28 0.28 -0.33 -0.25 0.54 0.49 0.22 0.0 0.01 0.09 0.67 0.29 0.12 0.27 -0.24 -0.34 -0.17 -0.12 -0.21 -0.6 -0.28 -0.06 -0.07 -0.23 0.24 0.02 -0.39
-0.15 -0.04 0.06 -0.04 0.24 -0.0 -0.14 0.39 0.08 0.2 0.03 -0.03 -0.01 0.48 -0.13 0.0 -0.09 -0.41 -0.08 -0.12 0.02 -0.05 -0.46 -0.11 -0.04 -0.1 0.25 0.16 0.12 -0.47
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0.12 0.0 -0.1 -0.16 0.04 0.29 0.15 0.24 -0.1 0.01 -0.26 -0.28 -0.31 0.39 0.14 -0.07 -0.07 -0.41 -0.16 -0.05 -0.19 -0.09 0.66 -0.04 -0.35 -0.08 -0.25 0.21 0.2 -0.08
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.