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Heatmap: Cluster_32 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
3.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.43 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.91 -
- - - 1.35 2.72 2.07 - - 1.27 - - - 1.53 1.42 - - - - - - - - - - - - 1.58 - 2.51 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.5 - - - - 4.22 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.91 -
- - - - - - 3.93 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.88 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.91 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.91 -
- - - - - - 3.0 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.46 -
- - - - - - - - - - - - 3.87 - - - - - - - - - - - - - - - 3.94 -
- - - - - - 3.2 - - 2.35 - - - 2.39 - - - - - - - - - - - - - - 3.39 -
- - - - 2.73 0.63 - - - - 0.8 - - - - - - - 1.71 - 1.76 - - - - 2.2 - - 3.14 -
- - 2.62 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.54 - 3.61 2.54
Spov3_chr1.03601 (AtEAF1B)
 - - 0.28 0.43 - 1.04 - 2.38 - 1.04 - - - 0.94 - - - - - - 0.73 - 2.29 - - - - - 3.05 0.47
0.61 0.65 - 0.95 -1.61 - 0.33 0.39 -1.59 0.7 - -1.43 0.36 0.07 -1.39 -1.38 - 1.83 - - - - 2.35 - -1.24 1.57 - -0.37 1.77 -1.17
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.91 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.91 -
- - - - - - - - - - 2.62 - - - - - - - - - - 2.42 - - - - 2.58 - 3.64 -
- - - - 2.75 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.54 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.88 - - - - - - - 3.93 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.91 -
- 3.28 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.37 - - - - - 3.31 -
- - - - - - 2.65 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.57 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.25 - - - - - - 4.79 -
- - -2.55 - 1.87 - - 0.96 2.34 1.95 -2.54 -2.69 - -1.66 - - - - - - -2.68 -2.89 - -0.79 -2.85 - - 1.96 3.24 -1.73
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.91 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.91 -
- 2.68 - - - - - - - - - - - - - 3.17 - - - - - - - - - - - - 3.87 -
- - - - - - - - - - - - - - - 2.28 - - - - - - - - - - 2.11 - 4.38 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.91 -
1.19 - - - 2.25 1.85 - 1.09 1.32 - - - - - - - - 1.04 - - - - - - - - - - 3.11 2.02
2.78 - - - - - - 2.5 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.41 - 3.6 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.91 -
- - - - 3.73 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.07 -
- - - 2.58 - - - - - 2.61 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.16 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.23 - - - - 3.34 3.39 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.91 -
- - - - - - - - - - - - 2.55 - - - - - - - - - - - - - - 3.62 3.56 -
- - - - - - - 3.89 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.92 -
- - - - - - - - - - - - - - 2.31 - - - - 2.16 - - 1.37 - - - - 1.72 3.88 -
- - - - - - - 2.25 - - 3.22 - - - - - - - - - - - - - - - 2.74 - 3.21 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.8 - - - - 4.01 - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.91 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.81 - - - - - 4.0 -
Spov3_chr5.03121 (KINESIN-13A)
 - - 3.92 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.9 -
- - - - - - - 2.93 - - 2.88 - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.91 -
- - - - - - - - 3.24 - - - - - - 3.34 - - - - - - - - - - - - 3.39 -
0.28 0.11 0.53 -1.41 0.53 -0.65 0.07 -1.29 -0.39 -0.81 -0.42 -0.54 -0.25 -0.33 -1.01 -1.86 -1.3 0.9 0.02 0.23 -1.22 0.52 -2.6 1.06 -1.0 0.39 -0.53 -0.21 2.1 -0.08
-0.22 -0.22 -0.16 -2.07 0.99 -0.24 0.61 -0.84 0.27 -0.44 -0.04 -0.16 0.14 0.24 -0.12 -0.92 -1.01 0.94 -0.39 0.25 -1.02 0.46 -2.69 0.64 -1.14 0.1 -0.59 -0.81 1.65 -0.27
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.91 -
- - 2.35 - - - 3.23 - - - - - - - - - - - - 1.16 - - - - - 1.6 - - 3.35 -
Spov3_chr6.02070 (CYCD4;1)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.91 - - - - 3.91 - -
- - - - - - 2.41 - - - - - - - - -6.0 - - - - 3.2 - - -5.14 - - - - 3.95 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.91 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.91 -
- - - - - - 2.65 - 2.63 - - - - - - - - - - - - - - 1.68 - - - - 3.84 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.79 - - - - 4.02 -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.