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Heatmap: Cluster_57 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
0.53 0.34 -0.09 0.1 0.08 -0.15 -0.33 -0.48 -0.56 -0.27 -0.5 -0.19 0.31 0.44 -0.06 -0.29 -0.09 0.36 -0.6 -0.6 -0.06 -0.43 1.62 -0.25 -0.18 -0.42 -0.44 -0.01 -0.28 0.02
-0.13 -0.11 -0.16 -0.18 0.63 -0.06 -0.26 -0.06 -0.55 -0.19 -0.41 -0.42 -0.02 0.22 -0.24 -0.41 -0.45 0.78 -0.38 -0.43 -0.3 -0.32 1.32 -0.05 -0.15 -0.35 -0.18 0.08 0.67 0.03
0.15 0.03 0.04 0.27 0.11 -0.12 -0.07 0.11 -0.21 -0.21 -0.14 -0.24 0.07 -0.05 -0.07 -0.03 0.01 0.04 -0.21 -0.28 -0.1 -0.11 0.93 -0.15 -0.07 -0.14 -0.02 0.06 0.02 -0.21
0.37 0.2 -0.12 -0.22 0.17 -0.26 -0.36 -0.33 -0.17 0.16 -0.39 -0.35 -0.21 0.43 -0.42 -0.42 -0.35 0.16 -0.31 -0.39 0.05 -0.47 1.7 -0.39 -0.22 -0.27 -0.5 0.35 0.12 -0.01
0.4 0.05 0.09 0.44 -0.24 -0.31 -0.15 -0.24 0.05 -0.14 -0.07 -0.09 -0.02 0.22 -0.12 -0.1 -0.17 0.27 -0.15 -0.35 -0.3 -0.36 1.14 -0.29 -0.18 -0.17 0.03 0.08 -0.25 -0.16
1.72 0.3 0.8 0.73 -0.63 -1.39 -1.15 -1.49 -0.09 -1.06 -0.42 -0.88 -0.62 -0.01 0.12 -1.05 -0.97 1.41 -0.91 -0.79 -1.15 -0.84 2.45 -1.25 -1.13 -1.36 -1.32 -0.54 -0.0 -2.32
0.78 0.3 -1.9 -1.99 0.38 -0.74 -1.98 -2.21 -2.23 -1.64 -2.16 -1.57 -1.32 1.13 -1.01 -1.42 -1.35 0.75 -1.83 -2.13 -1.03 -1.5 3.27 -1.31 -2.4 -1.71 -1.69 1.55 -0.35 0.69
0.07 0.07 -0.15 0.0 0.19 -0.05 -0.06 -0.07 -0.3 -0.03 -0.16 -0.27 -0.03 0.11 0.26 0.08 0.12 0.33 -0.13 -0.1 -0.12 -0.14 0.59 -0.17 -0.16 -0.04 -0.01 -0.06 -0.15 0.03
0.56 0.65 0.28 0.29 0.6 -0.82 -1.42 -1.31 0.02 0.47 -0.17 -0.96 -0.34 -2.17 -0.26 -0.03 -0.11 1.08 0.07 -0.62 0.08 -0.33 1.73 -0.86 -0.55 -0.15 0.22 -0.72 -1.35 -0.29
-0.29 0.07 -0.59 -1.05 0.54 -2.2 -2.66 -1.69 -1.02 0.21 -1.26 -1.24 0.2 -0.15 -2.13 -2.48 -2.34 2.66 -0.21 -1.13 -0.26 -0.57 2.14 -0.76 -0.4 -0.54 0.22 0.39 0.46 -1.94
-0.01 -0.29 -0.1 -0.05 1.41 -0.88 -1.28 -0.32 -0.41 -0.51 -0.92 -1.01 -0.46 0.23 -0.32 -0.77 -0.62 2.27 -0.95 -0.81 -0.84 -0.93 1.74 -0.87 -0.75 -0.86 -0.77 -0.08 0.49 -1.06
0.19 -0.04 -0.42 -0.95 0.51 -0.33 -0.51 -0.35 -0.24 0.22 -0.35 -0.28 -0.63 -0.01 -0.31 -0.42 -0.36 1.54 -0.36 -0.4 -0.16 -0.2 1.29 -0.22 -0.38 -0.1 -0.19 0.16 0.35 -0.25
0.64 0.36 -0.08 0.94 0.9 -2.3 -1.58 -0.18 -0.11 -0.27 -1.15 -1.13 -1.12 1.02 -0.62 -1.45 -1.23 0.38 -1.63 -0.62 -0.92 -0.54 2.37 -1.07 -0.07 -0.99 -0.19 0.53 -0.03 -0.94
0.66 0.41 0.25 0.24 0.79 -0.77 -1.05 -0.94 -0.1 -0.51 -0.79 -0.63 -1.28 -0.81 -0.68 -0.82 -0.86 1.9 -1.31 -1.4 -1.18 -1.22 2.21 -1.24 -1.18 -1.01 -0.9 0.43 0.72 -0.15
0.14 0.16 0.17 0.03 0.18 -0.3 -0.19 -0.05 -0.22 -0.01 -0.09 -0.23 -0.09 -0.11 0.01 -0.18 -0.06 0.26 -0.31 -0.43 -0.04 -0.18 1.04 -0.19 -0.11 -0.14 0.08 0.24 -0.01 -0.19
1.37 0.11 1.12 0.89 -0.79 -3.24 -2.93 -2.29 0.55 0.01 -0.93 -1.32 -3.13 -2.02 -3.07 -3.8 -4.15 1.72 -2.82 -2.31 -3.01 -3.48 3.3 -3.9 -3.44 -3.04 -3.01 0.33 0.5 -0.97
-0.44 -0.22 -0.04 -0.09 0.71 -0.03 -0.61 0.13 -0.25 -0.27 -0.43 -0.43 -0.33 0.18 -0.13 -0.21 0.01 0.55 -0.32 -0.39 -0.12 -0.42 1.72 -0.52 -0.57 -0.43 -0.12 0.17 0.06 0.09
0.49 0.42 -0.03 -0.48 0.79 0.25 -0.38 -0.56 -0.46 -0.28 -0.54 -0.36 -0.84 0.72 -0.42 -0.55 -0.54 0.41 -0.56 -0.53 -0.54 -0.58 1.38 -0.17 -0.72 -0.61 -0.93 0.41 0.6 0.73
0.32 0.32 0.16 0.09 0.66 -0.79 -0.95 -0.56 0.23 0.39 -0.43 -0.32 -0.3 0.5 -0.58 -0.9 -0.6 1.02 -0.52 -0.55 -0.33 -0.57 1.46 -0.59 -0.53 -0.41 -0.17 0.09 0.41 -0.3
1.0 0.51 0.55 0.49 0.23 -1.07 -1.16 -0.8 -0.14 0.04 -0.28 -0.42 -0.14 0.27 -0.59 -1.13 -1.1 0.75 -0.49 -1.08 -0.91 -0.62 1.92 -0.81 -0.28 -0.27 -0.06 0.31 -0.02 -0.85
Spov3_chr2.03270 (A/N-InvB)
 -0.23 -0.24 -0.05 0.27 0.38 -0.6 -0.44 0.19 0.06 0.08 -0.24 -0.57 -0.05 0.03 -0.42 -0.41 -0.38 0.34 -0.3 -0.64 -0.23 -0.39 1.75 -0.51 -0.19 -0.25 0.03 0.25 0.2 -0.08
0.18 -0.06 0.29 0.49 0.7 -0.88 -0.71 -0.36 0.19 0.43 -0.24 -0.38 -0.31 0.01 -0.54 -0.69 -0.78 0.73 -0.56 -0.58 -0.19 -0.38 1.56 -0.35 -0.25 -0.34 -0.13 0.25 0.17 -0.59
0.59 0.68 -0.1 -0.66 1.54 -0.4 -0.65 -0.85 0.02 0.29 -0.72 -0.64 -1.08 0.64 -1.53 -1.26 -1.36 0.39 -0.61 -0.69 -0.72 -0.87 1.87 -0.54 -0.82 -0.56 -0.76 0.31 0.59 0.16
-0.12 -0.13 0.05 0.43 1.11 -1.76 -1.52 -0.04 0.07 0.21 -0.22 -0.78 -0.35 -1.89 -1.53 -1.51 -1.5 0.63 -0.71 -1.15 -0.54 -0.73 2.56 -1.0 -0.53 -0.74 -0.01 0.27 0.74 -0.36
0.16 0.3 0.04 0.23 0.21 -0.55 -0.68 -0.28 -0.03 0.05 -0.08 -0.04 -0.79 0.34 -0.43 -0.41 -0.59 0.31 -0.26 -0.47 -0.11 -0.34 1.22 -0.4 -0.32 -0.11 -0.19 0.13 0.52 0.56
0.12 0.22 0.07 0.04 0.23 -0.09 -0.24 -0.21 -0.2 -0.09 -0.19 -0.29 -0.08 -0.02 0.12 0.1 -0.02 0.47 -0.15 -0.26 -0.14 -0.22 0.68 -0.16 -0.16 -0.07 0.02 -0.07 0.12 -0.04
0.09 0.3 0.08 -0.31 0.93 -0.22 -0.39 -0.85 0.09 0.24 -0.26 -0.4 -0.35 0.16 -0.36 -0.18 -0.28 1.05 -0.58 -0.67 -0.47 -0.44 1.27 -0.33 -0.42 -0.02 -0.05 -0.07 0.04 -0.28
0.12 0.26 -0.08 -0.34 1.27 -1.33 -2.12 -1.35 -0.33 0.69 -0.36 -0.57 -0.66 0.64 -1.12 -0.82 -1.49 0.54 -0.76 -0.66 -0.57 -0.65 2.09 0.06 -1.0 -0.16 -0.03 -0.46 0.26 0.62
-0.15 0.31 0.21 0.2 1.85 -1.04 -2.05 -0.25 -0.28 0.05 -1.27 -1.13 -1.26 -0.21 -1.55 -1.38 -1.49 1.0 -1.35 -1.34 -1.39 -1.7 2.24 -1.62 -1.63 -1.19 -0.99 0.88 1.21 0.42
0.2 0.19 -0.5 -0.69 0.46 -0.16 -0.25 -0.24 -0.21 -0.11 -0.37 -0.11 0.0 0.35 0.06 -0.39 -0.26 0.03 -0.45 -0.7 -0.19 -0.37 1.59 0.07 -0.26 -0.05 -0.13 0.09 0.3 -0.11
-0.56 -0.45 -0.02 0.21 0.5 -0.65 -0.69 -0.06 -0.24 0.06 0.07 -0.23 0.41 -0.09 -0.51 -0.54 -0.63 0.18 -0.08 -0.45 -0.05 -0.2 1.73 -0.19 -0.01 -0.05 0.26 -0.0 -0.2 -0.21
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0.44 0.33 -0.19 -0.04 0.62 -0.37 -0.76 -0.64 -0.73 -0.1 -0.59 -0.46 -0.05 0.42 -0.47 -0.16 -0.53 0.02 -0.27 -0.68 -0.62 -0.34 1.91 -0.28 -0.54 -0.24 -0.15 0.48 0.19 -0.0
0.26 0.43 0.12 -0.08 0.6 -0.17 -0.39 -0.23 -0.08 0.1 -0.23 -0.24 -0.53 0.28 -0.4 -0.41 -0.29 0.55 -0.31 -0.39 0.05 -0.33 0.93 -0.24 -0.26 -0.01 -0.02 0.04 0.09 -0.12
0.54 0.81 -0.09 -0.36 1.5 -0.87 -1.39 -0.77 -0.42 -0.07 -1.01 -0.78 -0.44 0.48 -0.3 -1.48 -0.86 0.92 -1.03 -1.14 -0.18 -0.4 1.78 -0.35 -0.49 -0.5 -0.4 0.39 -0.02 -0.11
0.15 0.07 0.18 0.1 0.32 -0.22 -0.24 -0.11 0.25 0.09 -0.18 -0.27 -0.35 0.26 -0.25 -0.21 -0.2 0.11 -0.25 -0.25 -0.08 -0.31 0.94 -0.38 -0.2 -0.08 -0.07 0.08 0.26 0.01
-2.5 -2.18 -2.82 -1.02 2.88 -0.75 -3.35 -0.2 -1.95 -1.12 -2.52 -1.56 -1.82 -2.28 -1.59 -3.21 -2.16 0.78 - - -4.6 -2.86 3.25 -2.27 - -2.46 -3.4 1.06 0.99 0.79
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0.19 0.1 -0.32 -0.18 -0.02 -0.14 -0.27 -0.08 -0.17 -0.15 -0.06 -0.21 0.22 0.34 0.45 0.08 0.14 0.46 -0.25 -0.35 -0.16 -0.15 0.79 -0.23 -0.34 -0.25 -0.23 -0.02 -0.02 0.05
0.5 0.24 0.18 -0.49 0.44 -0.15 -0.96 -0.5 -0.58 -0.83 -0.42 -0.45 -0.18 0.17 -0.3 -0.31 -0.33 0.37 -0.51 -0.88 -0.48 -0.15 2.1 -0.23 -0.22 -0.15 -0.21 0.26 0.13 -0.48
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-0.03 -0.14 -0.13 0.65 0.32 -1.08 -1.75 -0.84 -0.39 -0.06 -0.77 -1.0 -0.72 -0.46 -0.82 -0.96 -0.82 1.86 -0.8 -0.84 -0.38 -1.07 2.2 -0.4 -0.52 -0.26 -0.67 0.5 0.52 -0.2
0.12 0.13 -0.14 -0.06 0.19 -0.21 -0.27 -0.27 -0.03 0.09 -0.13 -0.05 0.02 0.46 -0.16 -0.18 -0.21 0.43 -0.32 -0.27 -0.16 -0.09 0.97 -0.19 -0.23 -0.04 -0.05 -0.08 0.04 -0.13
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0.26 0.25 0.21 -0.1 0.62 -0.41 -0.87 -0.12 0.07 0.1 -0.61 -0.44 -1.0 0.65 -0.67 -0.65 -0.58 -0.03 -0.83 -0.87 -0.57 -0.67 2.05 -0.7 -0.88 -0.55 -0.65 0.87 0.61 -0.16
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.